XLOC_045409 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_045409
Unique NameXLOC_045409
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1676085..1692171+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045409 ID=XLOC_045409|Name=XLOC_045409|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16087bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1676085..1692171+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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cttttaatattCTCAGGAattattttcattgcattttttattgtgcaatc tctcggcttgttttatttttgttttttttttgaaaacttaaccttgaaat tttgtacGTGTTTTCAGCAATAAAATATTCCTAAAAttgctcaaattgca gatgtagaacgatagaATACGATACATTCACTCACCATTTAGATAAGGCT TTCACTGTGTCTCACTATCCTCTCGATCACGGACTTGCACTGCAATgaac tgtgttcgaatcccaagcacttctaggcagggtgttagggaaatatgatg atagactctctaccttaaTTCATATGAAATAttcctttttattatttttc tggtaTCTAGGTAACCGAATCACTGTTAGAAATGGGTTGTTATGAAGTTT CATTAGCTGATACCATTGGTGTAGGGAACCCTGGTAAGCCTATAGTGTGT CTGGAAAAAGCTTTTGGCGTATCACGGACCTCCAggcattaaaaaaaatt tttcgacaaaCATTTACTTTTGTGAGACAGAAAATATTACGACTTACTTT TCGAGGTATGAGAAGGGGCCCGCGAATAAGGCTGGATATAGCTTATCAAT TGCCAAAAGAGTGgtgttaaaggttttttttttacataaggTTCCTGTTA CATATTcgtttttctgaccaatcttgctccacatttgtgTCAAACGTGAA ttaattgatgagtaagcaaacgatttcactcttatttaaacGCAAAACCT TTAAACGCGAAAACCCTTAAccctaaaaaaagataaaatgacaattgCTT CAGCATGATTTGGTCTGTTAAAATTGTTGCTATTATTTTATTCTCCATTT ATAGAATCGATAGAGAGGATGCTTGGCGAAGTGCTTGCTGTTTGTCGACC CGAAGTTCTGGCTATTCATTGTCACGATACCAACGGTAAAGCTGTCCAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1676085..1692171+

>XLOC_045409 ID=XLOC_045409|Name=XLOC_045409|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1878bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1676085..1692171+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAACGACCTTGACAACAATAGTTAAAAGaagtgcaaaatttcatcc
acGTTTTTCTACAATGGCAACGACCTTGACAACAATAGTTAAAAGaagtg
caaaatttcatccacGTTTTTCTACATGTAGACATAGGAGCTCTGGATCA
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CAGTTATCCTGTTTTAGTTCCAAACCTCAAAGGATATCAACAAGcaGTAG
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ATCGTGTACCGTGGGTTGCCCCTATGATGACCGAGTCGCCCCAAAACAAG
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GCTGTTTGTCGACCCGAAGTTCTGGCTATTCATTGTCACGATACCAACGG
TAAAGCTGTCCAAAATATCGCAAAATCCTTAGATAATCGATAGAGAGGAT
GCTTGGCGAAGTGCTTGCTGTTTGTCGACCCGAAGTTCTGGCTATTCATT
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TCTTATCCACTCAAGGCGTTGAAACGttGGGTGTTCGTGTAGTTGATAGT
TCTGTTGGCGGTCTTGGAGGATGCCCCTATGCAAAGAATGCCACTGGTAA
TGTTTCAACAGAAAAAGTATTGCAATTCTTATCCACTCAAGGCGTTGAAA
CGGGAGTGAATTtagaagaaatcaaagaaattggAGAGTGGATCAGAAAA
AGTCTTGGAAAATGAGGAGTGAATTtagaagaaatcaaagaaattggAGA
GTGGATCAGAAAAAGTCTTGGAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045409XLOC_045409-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000044_pilongenomesc0000044_pilon:1676085..1692171 +
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