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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:1660611..1667074+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_045407 ID=XLOC_045407|Name=XLOC_045407|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1660611..1667074+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaattttatgagAATCTATTCACGAAGTCAACTAGCAAGAAACATTTG
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ATCATGCAGCTTCATGTGTGGTAGGCGCCCAACCCGAACGAATATTGAGT
TGTTGTTCTAAAACACATTAttttactctaaggtcccgaataaacgtccc
taacctgttattaattttcgaaaaattttcagacacccccccccccccgt
ttttttaattttcatctttaccattttgtgagtattttgtgcAATTGCTT
AAGAACTTAGGTGTTTTAGAGGCCATGAAGCCCGTCCTCGTGTTTCTTAG
TAATATTTCTAGAGTTTTTATTAATAGGTTTTAACGCTTAATAgaagcaa
atttttttcattcccCGTTTATTCAGACATACAGAAAGAATTTCGGTCCC
CttactattcgggaccttagcgTACGTTTCATTTTAGCTACAAAGCATCT
TCAGATGATACACAGCTAGACTTTTCATAAACAATATTTTCTCCATCAGG
ATGGTACTGGTACGTTTGCGAGCTGAAGGAAGTTCCGGTAAAAACCTCGC
ATACACCATGGTCGAAATTATGTGGCAAGATATCGAAGCTAGAATCAAAT
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ACTTATTAGAGATAGGTTTGAAGGTTAATCTGGAACTCgtttcatgatat
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CCACTAACTTTGGCAAAAAGCCTTGAAGTAAGGAAATAAAAGATGGCAAA
ACTGAATCTCGCGGTGAATTATACTTTCTCTTTCACTTTCCAAAGATTTT
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CTTCGTTTCTTGGCGGGAAGATGGCTTGTAATTTTACTTGACCTATGGCC
TTTGCCACAGAGGAAAGCCCAGTAACAGCCCGCTTCCTTCTTCTCAGACA
CCCTGATAGCACCCAGAGACCATCGATATAATCGGGTATAGATCATCTTA
TTCTTGGGTGACAATTTCTCGGAATGACcctaaattagaaaaattacagG
GGAAAGAGATGATAACTTTGACACCatagttatttttttctgtgttCATA
TCACAGGTTGTTGACACGAGCCAGAAGAAAGAAACTATGGAAGAATTTGG
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ttgattgattgattgattgattgattgattgattgatttattgattgatt
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ttgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattGcttgatt
gattgattgattgattgattgattcttcaTCTAAAAGAATGCTTTCTTAG
ATATACAGCTGAACACTACGATCaaaatctttggaaagaaaatacaaTCA
CTTTTTCGAACAACGgacattcgaattatggaaagcATTTTAGGAGTGTT
TCTTCTTGTCGGGAACCGATAATTAGTTCGAACTATTGAAAGATTTGAAC
AATAGAAGTTCGGATTAGCGAAAGCCCACTGTAGTATTCTTTTCAAGATG
CTTCATACTATTTTGCTCACTGATCGGTCTGTCTAGGTTGGTTTttcggt
caaaaattgatttaggTTCTCAACATGAAACGATTTTAATGTATACTACT
GTGTTTACTTTTGGAAAATTGCTTTATTTGTTGATGTCTTCTTTTAATTT
CCAGGGCTTATTGGGTCACGACAGAGTATTAGCATCTGCTCTATGGAGGT
AAATTATGATATCTGTTTTGGCTCCTTCATCTTCTCCATAAACCTATTAT
ACTCTTGAAAGAGAAAATTAAACCGCcagttttcaacttttaaaaattgc
taaaaattagcaaaaaacttttatcaaaaccGCGTTCGTCCGGTACAGAC
TATCGAGTTTAAGTATCTACgtttttttctgcgacggagacggtaagatT
TTAGTTTGTCTAGATTCTGAATGGCTGAGGAACAGTAAATCAGTACCTTT
ACCGTTCCTTCTTCCCGAGTCAAAATACTCATACTTTAGGTATGTGGCCT
ATATGTATGCCCTTTATAGGGTAGGTTTAATCTTtcttattccaaatcgc
ttcagtcacccCGTCTTCCTCAAAAGCGTCAATACATAATTGTGCTACTA
GCTCCTACCAACGGAAATCACGCTGCTTTGCCTACTATACAGGCTAACTG
CTTTTATGAAGGTGTATTCAGCGAAATAAAGCCGTCGCCTGTGAACGACG
TCTCTAAGTATCATTGTGATGtcccattttttctttttcttacagAAATC
TATTCTACAACAAGGCAAACACGGATGCTGAAAAGTTAGCCTTGATGGTA
GAGTATGTTAGGAAACAGGTAAAATTTAAATACTTTCATTTCACAAGGCT
AGAAAAACATTCTAGGCTTCCTACTGTAAGAAAGCTGACGTCAGGTGGGG
GATTTTCATTCGTTTTCTCTTATTTCAAAGTGGCTGTACCACAGCACAAT
CTGAATTTTTGTCAGGCTGGACTTGGTTTGAAAttcttggtttgccgtca
cccgaccctagattttgaaggtgggtcggtcggaaatttttttatcttgg
tcattttgattattttgtttacattttgtaatttttgaagaagaaaaaat
tctcttcgtcgaaatagcaataaaagtttttaggTCGGCAAGTTTAGAGA
AGAGTCggtcggctgacggcaaaccagcattttttaaagtttgactagcg
agcacctcactaaaaaccgggatttttcatctcgtttcttagggagttcc
actttgacgatcttcgaaaaatagaagcctttcaagtgttttgacgcaag
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aaaatcgaatgtttagagcccgaaaacctgggctcaaaacgttcgaaaaa
gtcgcaaagtggaatagacgttacagcgtagaaaaaaagccgtgacgtct
agtataggctacatTTTGACGCGTTTGAATATTAAGAAAACTTTTTGGAT
AGTTAACCGTAAGTACGATAGCCTAGGAATTGAAAGCGAATGTTATTATA
GTGTTGTTTTGGTTACTTTAGATGCAACATCTTGAAATGCAATCTTCTGA
AGATCTTGTTATGACCGGACGAGTTGATTGGCTACCTTTGCACGAAGTAA
ATGACCAGAAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:1660611..1667074+ >XLOC_045407 ID=XLOC_045407|Name=XLOC_045407|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1530bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:1660611..1667074+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaattttatgagAATCTATTCACGAAGTCAACTAGCAAGAAACATTTG
GAAAGGCAGagtaaaaactcaaaatttagcAGCAGTTCAAAGATgtcaag
aaatttcaaatgagatgaattttatgagAATCTATTCACGAAGTCAACTA
GCAAGAAACATTTGGAAAGGCAGagtaaaaactcaaaatttagcAGCAGT
TCAAAGATgtcaagaaatttcaaatgagGCACCCAGTAGCACAACACCAC
CTACAACAGTAGCGACTGGCGAGAAACGAGACGATTCTGTTGGCTTCATG
TTCGGTTCAATCGTTGGTAACATCAAAAAGAACATTGCTAGACAAATGGC
ACCCAGTAGCACAACACCACCTACAACAGTAGCGACTGGCGAGAAACGAG
ACGATTCTGTTGGCTTCATGTTCGGTTCAATCGTTGGTAACATCAAAAAG
AACATTGCTAGACAAATGGCCAAGAGTTTGGCGTCGAAGAATTTATACGA
AGCATGCGCAGATCAAGTAAATTATGAAGAGTTCTTTGTTGGCCAAGAGT
TTGGCGTCGAAGAATTTATACGAAGCATGCGCAGATCAAGTAAATTATGA
AGAGTTCTTTGTTGCTTGTGAAATGCCTGACACGTTCCAGTCTTGGTTTT
ACATCATGCAGCTTCATGTGTGCTTGTGAAATGCCTGACACGTTCCAGTC
TTGGTTTTACATCATGCAGCTTCATGTGTGGATGGTACTGGTACGTTTGC
GAGCTGAAGGAAGTTCCGGTAAAAACCTCGCATACACCATGGTCGAAATT
ATGTGGCAAGATATCGAAGCTAGAATCAAATTACTTGATGATGGTACTGG
TACGTTTGCGAGCTGAAGGAAGTTCCGGTAAAAACCTCGCATACACCATG
GTCGAAATTATGTGGCAAGATATCGAAGCTAGAATCAAATTACTTGATGT
TGTTGACACGAGCCAGAAGAAAGAAACTATGGAAGAATTTGGCCAACAAT
TCTTTGGTCTCATCGTGGCCTACGACGAAGTTGTTGACACGAGCCAGAAG
AAAGAAACTATGGAAGAATTTGGCCAACAATTCTTTGGTCTCATCGTGGC
CTACGACGAAGGCTTATTGGGTCACGACAGAGTATTAGCATCTGCTCTAT
GGAGGGCTTATTGGGTCACGACAGAGTATTAGCATCTGCTCTATGGAGAA
ATCTATTCTACAACAAGGCAAACACGGATGCTGAAAAGTTAGCCTTGATG
GTAGAGTATGTTAGGAAACAGAAATCTATTCTACAACAAGGCAAACACGG
ATGCTGAAAAGTTAGCCTTGATGGTAGAGTATGTTAGGAAACAGATGCAA
CATCTTGAAATGCAATCTTCTGAAGATCTTGTTATGACCGGACGAGTTGA
TTGGCTACCTTTGCACGAAGTAAATGACCAGAAGTAAATGCAACATCTTG
AAATGCAATCTTCTGAAGATCTTGTTATGACCGGACGAGTTGATTGGCTA
CCTTTGCACGAAGTAAATGACCAGAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:1660611..1667074 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 673-765:6372 |
| Aaloc | 601-672:5547 |
| Aaloc | 556-597:4955 |
| Aaloc | 475-555:4157 |
| Aaloc | 367-474:3251 |
| Aaloc | 310-363:2765 |
| Aaloc | 235-306:1424 |
| Aaloc | 115-234:812 |
| Aaloc | 1-114:1 |
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