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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:468826..475553- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044692 ID=XLOC_044692|Name=XLOC_044692|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:468826..475553- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGATTGCAGTGACCTGGACAGGTTTGTGCTAAAAATTAGTTAAAC
CCCAGTAGACGTAGTTAGTGATTCCAAAGGGATCAAGTATTGGGGAATCA
AACTGGTTTTTAGAAGGGCTGGTAAATGTTTGGTAAAATTTACAAAAGGT
CCAAAAGTCCAATTATTTTAACGGCCATTTTGAAGCATCTATTTCAACTA
ACCCATACCAGTCCAGACTTTAAAATAAGGCCTGCAGACCGACCTAAAAC
TAAAATTAGATTGCCAATAGATTGCTCATAATACCCTACAAGGATTAGTA
CAATCTTCAGGTAGTTTTAATTACTTGGGACTCACATAATAGTCATTATA
AAAAATTGTTCTATTAATTTATTTTGGTGAACAAAGCGTCAGCCTGGGTT
TAGGTCCCAGGCAAAAATTAGGTCCCCCCTGAGTTTTAAGTCCCCCCAAA
GATTTATGAATTATTTGTTAGCCTCCAGGACTTTTGACCCTAGACGCTTT
CAAAAAATTGATTCAGTAAAAAAGGGTTTTCCAATGTAATTGCGCTCAGT
TCTAAGTTTAAGATAAAATATTTTGCACACTTTCTATAAAAATATTGTGG
CGCAGGCGAAAATTTGAGTAATTGAAGCCAACTATTAAGCTGAATTATTT
TAGACCCCACGTTAAGTGATGAGATTTTAGCTCCCCCAAGTACATAGGTC
CCCCCAAAAAAGTGGTGTACTTTCAGCCCCCTCCTTTTTGGGGAAAAATT
TAGGGTGTAACCCCCCCCCCCCAACGAGCAGGGGGGCTGACGCTTTGAGG
GAATTTGCAACAGTTGATTGGATAAAATTTAAGATGAGGATTTTTGTTTT
ATTTTAGGCAAATTGAACAACTAAGAAGATGTGAAATAATTTCTGAACAA
GAAGTCAAAGCTCTCTGTGCAAAAGCTAGGTAAGTTAATAACATTAACAG
GGCATTAAGTTTAATAAATCTTTTATTTTTGTCAAATCATTAAAATCAAT
TTAAACTTTTGCCATTATTTTAATGCCAGAAATATTGTGGCTGCTGTGAA
ACACTTTGTTTAAACCAATCACCTGTAGAATCTGGGTTGAATGTTATTAC
AATGATATTTTTGTTAACTTAAAATGTTTAAAAACCTCTTCATTTAGAGA
AATCTTGATAGAGGAGAGCAATGTTCAACGTGTGGACTCTCCAGTCACAG
TATGTGGAGATATTCATGGACAGTTTTATGACTTAAAAGAGTTATTTAAG
GTAGGTCCATAGATATACAAGATTCCAAGTCAGTTATGTGTCAATCGTTT
ATCCATTCACTGTCAACAACAAGTATGCTATACTCTGTAGTAAGGTATTC
CCAGTGGTCATTTTGGAAAATTTATTGTTCCTTTTGCTCATGATGAATTT
GTACATCTCTTTTGCTGACATGGTTGATTCTATTTATTAGCAACAACCCC
GAGAGTTAAAGGGACAAGGCTCAAATCTTGATTTCCCAGTATCTTTATTT
CTGTTGTGTTAAGTTTATTGATTTAAAGTGTTTCTTTGCCATGAGCCCTG
AGAAAAAAATCGAAACATGAATACTACATATTTATGAAATATCTGGAAAT
ATCAGATCAACGTTCGTTCAAAAAGATTTAAAGAATAGATGGTAATTTTC
TGCAAATTTCTTTTATTAGGTTGGTGGGCTGGTACCCGACACCAATTATT
TATTTATGGGTGATTTTGTTGACCGTGGATTTTACAGTGTTGAAACCTTT
CTTCTATTGTTAGCGCTAAAGGTAAACATTTGGTAATTTTTGGTATTATT
GATCAACATTTTACTTTGCAAGCACTACCTACCTGCTCACTAAAAAAATA
TAAATAGAGACAAAATATTAATTAGAGTATTATTAATTAGAGTATTAATG
GGTTCAACTACCTCATAGGACTGACCAACTACAGCTCCTTGTCAAACCCA
TTTAAATTCAAATCCAAAGCTTTATTTTGTCATTGCAAATTTATTGCTCT
TTCGTTTCTTCAAGGTTCGATATCCAGACAGGATCACTTTGATTAGAGGG
AATCATGAAAGCAGACAAATCACTCAAGTATTTATTTAAAATTTCTTAAA
ATTAATCTTTGTACCATTTGAGTATGTTTCGTTATACCTAAAACTAATTT
CAAGGTTAGATCTTAGCCCTAAAACTGATAAATTTTAATAATCAGACTGA
GAAAAGAACCTTTGAAAAGAACCTTTCTCACCAGGTCATATTCTAAAATA
AGCAGGGTCCACTGAAGAAAACCAAAGCTAACACTCTTAATGTTTTTCCC
AAAAAGGCTATTGTTACCACAATTTCAGTGATTTCAAGAAGCACAGTATC
TGATAACCAGTTGGTTAAAAAGCATGAAAATTAACCTGGTCACCTAACCA
GTGACTTTACATTTTCAGGTTTATGGGTTTTATGACGAATGTGTGCGGAA
ATATGGATCAGTCACTGTATGGCGTTATTGCACAGAAGTGTTCGATTATC
TTAGTCTTTCAGCAATTATTGACGATAAGGTATTTGTTTATGACGATCCT
AGCTACTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTTTAAATCTACATATTTG
AGTAAATTTAAAAGGAGAAATATTGCGTTTATTATTTTGGAATATATTTT
CGTGTAGTTTTTTTTTGACACAGGAAAAAGTCATCAGATCCTACGGGTGG
GAAAACCCCATTTCCAGTGCTGGAAATTTTAAAAATTATTTGCTTCGCAG
AATTTTTCTCAAGCTGTAAAGTGGAATTTTTTAAGCCAGAGGATTCGCAA
AATCCCACTGCGGACTTTTTTCAAAAAATATTTTAGTCTGAAGTTTTAGA
CGTGTGTAATATTGAAATAAACCCTTCTTACGAGAAAAAGCACATCACGC
TAGTGTGAAACGTAATTCCCCCCATTGGAATTTCCCTGCAATAAAATTCG
GGTACAAATTTGAATATTTAGGATTTCCGATTTCACACCCTGGACTTTAT
CTAAAATATTTTGATACATCGATACATCGGTATTACTAATATCACACTGC
GGAAACCCCTTTAGAGTCTTTTTGATATATCTTAGGTGTGAATTTCAAAT
AAACACTTAGCAATGTCAATTGACCTTCGATTCCTTATAAATTCAAAAAA
AATCAAAGAAGCACTCTTTTACTTCTTCATTATAGATATTCTGTGTACAT
GGAGGTTTATCTCCTCATATCAAGACACTTGATCAGGTAATTATAATATT
AATAATGTGCAGTAATTGTATAAAAAATATTGATTTTTAGGCTCTTTATA
CTGGATTCAAAGTCTGATAGATAGATCAGGAAGGTTCATCTGATGCGGTT
GAGATACCATCAAATCGCTGATTTTTTCTGACCTGCCTTACTGCCTTTTT
TGTTGTAACTATTTGGTAGCTTTTCTCGAGATTTTCCCAATCCTTTTTAA
GTCTGTTCATTGTTGACAATTCTTTTTGACAATTTTTATCGCTATTTTAC
AATAAAAAGGGTCCACCGAAGTAAGTTGTTAGGTTTTAATAAAGCCTAAC
TTCAAGAAAAATTGGCCTAAAATGTTTGTATATATATGTATTTTGGAAAA
TGTATTAATTACATTCAATATACACAACCACAATAAAACTACTTCGCCTC
GAGAATGAAAAATATATTTTTCTTATTTTACAGATCAGGCTGTTAGACCG
TAAGCAAGAAGTACCACACGACGGACCAATGTGCGATCTCCTATGGTCTG
ATCCCGAAGGTACAAACATTAATTTCCATATGTCATTTATGACCTCAAAT
TTTGTCGAAAATTCATTTTAAATAGTGAAAGTTGAGAGATGCTTTATTTT
GCCAAAACTTTTTACTATCAAAATATTTTTATTGCACAGGGCTGACTCCA
AATTGTTGTATTCTTCGTTCGTTATCCCACTCCCAATGAAATATTGTTAC
TTTTGATTTGATTGTTTTCATTATTTTATCCATTTCTTTCTCAAAGATAT
CAAAAGCGAAAGTTTTGGAACAAGCCCAAGAGGTGCAGGTTTTCTTTTTG
GAGCTCCCGTCGTTCAAGAGGTATAATTTTGAATTATTTTCAAAGTCTTT
GAGATGTTATTTTCATGGAACGGACTTTATATTATACGTCATCTGATCTC
TCAAATTTTCCTCTTCCCAATTCGAAGTCTTTTAGTTAATAGATAGAACT
TATCAAGAGATTTGATTTTCAGACCTCGAAAAAAAACTTCTTGTTTAATC
ATCTTGAATTAAAGAACTTGTACCCTTCGGTTTGAGAAAATACATGTCTG
GAAAATAACAATCTTATTTTGCTGGACTTTGTAATGATGATTTAAAAATA
CAACTTTTCATGTAAATTGGATAAACGTTTTAGTTCTTCCAAGTAAAAGT
ATTTTCTCGATTAAGTCGAACCAAATCTGTCCTGAAATAAGTATATGTAA
TCACATGATAACGAGTGCAATTCGAATATAATTGCACGAGTGATTTTTTT
GTTATTAATTTTCCGAGTCCGAAAGGACGAGGAAAATTCGAAACAAAAAA
ATCACGAGTGCAATTTTCGAATTGTACGAGTTATCATGTGATTACGAGCT
AATCGCACAATGGCTGTCACTACTTTATCCCAGTTAGGAAAGTAAATTAC
AGAAATTACACTGAGAGTTTTATATTTTTCTCTTCTCTCTGTGTCTTTCT
TTTATTGTTGTTTATTGATTTTCCTTCTCACAAAATAAATTTCGAATGCA
ATTAAAACGTTCGAAGCAAAAAAAATGTAAGAAAAAACATTAAAATCAAT
TTTGTAAACATTGGCGCGGCATTGGAGAGTGTGATTAACGATTAATTGCT
CTCTACAGGATGCAATTAACGATTAATTGCTCTCTTTGAAGGCGTGCCAA
GTAAGAAAAAATAACCCATCGTGCGATTAAGAAGCAAAATTTCTCCTGTG
AGTCACTCTTTTAATATGCATACAGTTCTTTGTAAAAAGATTTGTTTGAA
CGCTCTACTGCGTGCCTTAAAACATTTCGGACGTGAAACTCCTTTTCCGT
TGAAATTGACATTTTGCAATAATCAAATTAATTCTATTATCTCATAATGA
ACATTCAATGACAACTTTAATTGCTACCTCATCAACACCACTAATTGCAC
ATTCCAATGCCTGCTCGTTATCATTATCGAAGAATTTGGAATATTTAAAA
AAAAAATTTAATTCTGCGAATTTACTTTTTTCAACAGTTATTAAACTTAT
TTGGAATTAAAGTCAAATGAACTATTAACGACATTATTCTTAGTAATGTC
TAACAAGCACCCCCTCCGTTTGTTAATTAATTGCAAATTTTTCACGACTG
ACTAATTCTTTAAAAAACGATTGGCCATATAAAAAAAAAAGACATTAATA
CTTTAATATTAGGTACTTCCGGTCTTAAACCCTATGCTAACGTTCTTTTC
TGTCCATATTATTATTTTAAATGTAAACGTACTTATAATAAAAGGCAAAG
CCTTTTTTACTAAGAATACTTTTTCTTGCATATTCATCATTCGGAAACAT
ACATTCATTTTAGTTCAACGAGACGAATAGTTTAGACTTGATATGTCGAG
CACATCAACTCGTAATGGAAGGTATGAAGTGGCATTTCAACGAGTCAGTA
CTCACTGTATGGTCAGCACCTAATTATTGCTACAGGTATGAATTTTCGTT
CTTCTGCCTAAAGGTGGAGTTTAAAGGTTTTGTTTGAACATAAGAACATA
AGGACGGTGTACCCCCCAGCGGACGATTTTTTTGGGGGGCGCCGAAATAC
AAAGGGCGCAAAAAGACGCCTCTGATTACTAATTTCAGCGCCCCTTTGCT
CTTTTACACCTTAGAAATGGCAGTTTTCAGCCAAAAAGAGAGAAAATACC
CAAAAAATTTCATGCTCGCTTCGCTCGCATAGTTTTTACACAGCTATTTA
CTTTTAGTAGGGGGCACTAAAATCAAAATCCTTTAAAAACTGCCTCCCCA
GTTTGCCCGAATTTTGGTCGACCCACCACGCAACTGCGTGGGACGCGCAT
AATCGGGTAACCGTAAGTTATGCGATTTTAATGTATATATCAGTAAAAAC
GAGCATTTCTCTCTTCCTTTCGCTTTAGGTGTGGTAATGTAGCGGCTATC
TTGGAACTGGATGAGAATTTACGGAGGAGGTTTATCGTGTTTGAAGCAGC
TCCACAGGTAAAAATAAACGTTGACTTCTTTTGGCTTAAGGTCTGGGTCA
ACTTAAAACAAATTTCATCAAAATGAAACATAATTAAGTTGCAGCTCAAT
CGCTACACTTTGTTTCAACTGGCCCCAGCCGCCTCAGAGAAATCTCAACA
AAACCATTTTTGTCACCGTCACGTAACTGCAATGAAAGGTTTTCTGCAAC
TGTTTCTGCCTAAACTGTTGATGAATTTTACAAAAAGCCAGAAACTTATT
TGTATCTTTTGTTTCCGTCCGTCATTCCGTCATTAATTTGAGGTACTACT
AGTAACTTTTTTATCAAATTGTGACACTTTTTGTGTTTCAGTTTTCAAAT
GTTTCTATTTGATTATAAGATGTTTCAAGTGGCCCCCGATGACCTTTAAA
ATGACACAATTACTTTTTCAATAAGTATTCCCCTTCAATTCTCAATTAAT
TTGAAATCTTGGTTCTTTTTTTTTCAGAATGCTCGAGGTATCCCGGCTAA
ACGACCGCAAGCTGATTATTTCCTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:468826..475553- >XLOC_044692 ID=XLOC_044692|Name=XLOC_044692|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1860bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:468826..475553- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGATTGCAGTGACCTGGACAGATGGGTGATTGCAGTGACCTGGAC
AGGCAAATTGAACAACTAAGAAGATGTGAAATAATTTCTGAACAAGAAGT
CAAAGCTCTCTGTGCAAAAGCTAGGCAAATTGAACAACTAAGAAGATGTG
AAATAATTTCTGAACAAGAAGTCAAAGCTCTCTGTGCAAAAGCTAGAGAA
ATCTTGATAGAGGAGAGCAATGTTCAACGTGTGGACTCTCCAGTCACAGT
ATGTGGAGATATTCATGGACAGTTTTATGACTTAAAAGAGTTATTTAAGA
GAAATCTTGATAGAGGAGAGCAATGTTCAACGTGTGGACTCTCCAGTCAC
AGTATGTGGAGATATTCATGGACAGTTTTATGACTTAAAAGAGTTATTTA
AGGTTGGTGGGCTGGTACCCGACACCAATTATTTATTTATGGGTGATTTT
GTTGACCGTGGATTTTACAGTGTTGAAACCTTTCTTCTATTGTTAGCGCT
AAAGGTTGGTGGGCTGGTACCCGACACCAATTATTTATTTATGGGTGATT
TTGTTGACCGTGGATTTTACAGTGTTGAAACCTTTCTTCTATTGTTAGCG
CTAAAGGTTCGATATCCAGACAGGATCACTTTGATTAGAGGGAATCATGA
AAGCAGACAAATCACTCAAGTTCGATATCCAGACAGGATCACTTTGATTA
GAGGGAATCATGAAAGCAGACAAATCACTCAAGTTTATGGGTTTTATGAC
GAATGTGTGCGGAAATATGGATCAGTCACTGTATGGCGTTATTGCACAGA
AGTGTTCGATTATCTTAGTCTTTCAGCAATTATTGACGATAAGGTTTATG
GGTTTTATGACGAATGTGTGCGGAAATATGGATCAGTCACTGTATGGCGT
TATTGCACAGAAGTGTTCGATTATCTTAGTCTTTCAGCAATTATTGACGA
TAAGATATTCTGTGTACATGGAGGTTTATCTCCTCATATCAAGACACTTG
ATCAGATATTCTGTGTACATGGAGGTTTATCTCCTCATATCAAGACACTT
GATCAGATCAGGCTGTTAGACCGTAAGCAAGAAGTACCACACGACGGACC
AATGTGCGATCTCCTATGGTCTGATCCCGAAGATCAGGCTGTTAGACCGT
AAGCAAGAAGTACCACACGACGGACCAATGTGCGATCTCCTATGGTCTGA
TCCCGAAGATATCAAAAGCGAAAGTTTTGGAACAAGCCCAAGAGGTGCAG
GTTTTCTTTTTGGAGCTCCCGTCGTTCAAGAGATATCAAAAGCGAAAGTT
TTGGAACAAGCCCAAGAGGTGCAGGTTTTCTTTTTGGAGCTCCCGTCGTT
CAAGAGTTCAACGAGACGAATAGTTTAGACTTGATATGTCGAGCACATCA
ACTCGTAATGGAAGGTATGAAGTGGCATTTCAACGAGTCAGTACTCACTG
TATGGTCAGCACCTAATTATTGCTACAGTTCAACGAGACGAATAGTTTAG
ACTTGATATGTCGAGCACATCAACTCGTAATGGAAGGTATGAAGTGGCAT
TTCAACGAGTCAGTACTCACTGTATGGTCAGCACCTAATTATTGCTACAG
GTGTGGTAATGTAGCGGCTATCTTGGAACTGGATGAGAATTTACGGAGGA
GGTTTATCGTGTTTGAAGCAGCTCCACAGGTGTGGTAATGTAGCGGCTAT
CTTGGAACTGGATGAGAATTTACGGAGGAGGTTTATCGTGTTTGAAGCAG
CTCCACAGAATGCTCGAGGTATCCCGGCTAAACGACCGCAAGCTGATTAT
TTCCTGTAAAATGCTCGAGGTATCCCGGCTAAACGACCGCAAGCTGATTA
TTTCCTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:468826..475553 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 880-930:52 |
| Aaloc | 802-879:600 |
| Aaloc | 679-798:1166 |
| Aaloc | 607-678:2731 |
| Aaloc | 529-603:3046 |
| Aaloc | 478-528:3544 |
| Aaloc | 367-477:4311 |
| Aaloc | 304-366:4715 |
| Aaloc | 202-303:5060 |
| Aaloc | 100-201:5581 |
| Aaloc | 28-96:5871 |
| Aaloc | 1-24:6729 |
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