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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000026_pilon:175486..180154- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044533 ID=XLOC_044533|Name=XLOC_044533|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4669bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:175486..180154- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAGAAAGCATTGGACGTTGGTGATCTCAGCATTCAGGGTATTGTTGACTT
CCTCCGACGTTTTTACGGTATTGTAGGTTGTGAAACAGTCGGAGAAGTCA
TTGAAGAACAGGAGGAACAAAAGTGGTTCCAGAAAGCTTCCTTGAGGAAC
ACTACAGTTAACAACACTGGGATCAGAGGTCTCTTTATCGTATACTACAA
ATTGCTGGCGATTAAACAGGTAGTCTTGGAACCAACCTAGCTCGGTATCT
TTTATTCCGTGTACGATGGAAGTTTTTGTAGTAGTGATCCATGACTTATG
GTTGGATAAGTCTAAGAACAATGCACCGATGTACTTCCCTTTGTCGACAT
CAGATGCTGTCAATGAAAAGGTTGACTGCCATTTCGTTTGAATAGTTAGT
TCAAATACGAAAGTTAATTTTCTATAACCGAACTGCTGATCAGTAAGAGG
TGGTTTTCTTCGAGGTGGTGTGTTAATTGTTTTTTTACAATTTTTTCTGC
GATTTTGGAAATCACCGGAAGGATGGAAATGGGACATTAGTTTCCGCTGA
AAAGAAAGAACCGGGTTTGAAGAGTGGGGTGATTTAAGCTTGCTTCCACT
CGGTTTGAATGTTGATGATGTGTGCTAGTGAATTGTCAATCACTGGTGCA
GAATCTTTGAGTAGGTTTGAAGAGAGCTGATCGATACCAGCAGCTTTTTT
GCGTTTTGAGTCCTTGGAGGAGTTGAAGATTTCGTCGCTTTCTACTGGAT
TACAAGTGAAAGTTTTGTCGGTGCCGATCGGAAATCTTTTGATTGGTCTC
CAGACGAAGTCGACGAGGGGCATACAAAATCAAAATAAAAATCAAACCAA
ATAGGGCTAATTTTGATTGTTCAATTGTTTTACAAGTTTGTTTTGGACAC
GTGATTTTAATTGTTCTCTTTAATGACATGTGGTTCGCACAATGTTTACA
TTTTACTACCTTCATGCCCCTTTAAGTTAACAGTTCTTTGCGATAATTAT
TTCTGGCTTGTCTGACACAATCGGTGCACCGGTTCTTTTTACGGCGGTAG
ATGTTCCTGTCACCTTCGTCTTTTGTGCGTCTGTATCTGCGTAGCGCAGC
ATCGCGGTCGTTTAACTTCGCTCTGACGTTCGAGGTTAACCATGGACATT
GACGACCTTTGATTCGTTTTGCGATTAACGGAGCGTGACGATTGAAAATG
TTTGAAGTGATGATTTTGAATATTTCCCAGGCTTTGTTTGGGCTATCTTG
TTCATAAACAAGGTTCCAGCCTGCTTGGCGAAGATCTTCATTAAATCCGG
GTTATACCTGGAAAAGTTGCGACATTTGATTGTTTTCGGTTCGTACCGTT
GATGGTGTCTCTTTTGGACAATACCAATCCTGTCATGATTGGGTATATAT
ATGGCATGAGGGATAGCGGGATGACGATTTCATCAGATATTTTTTCTTTA
TCGGTGGTCAAGGCAAGGTTGATTAATATTGAAGATGTCTCCGTAATCCT
CGTTGGCTTTGAGATCATCTGATCGAACCCCGATAAGTTTATAAAATGTT
TCTCATCTTTGTGATCATTTCTATCAAGGTAGTTTATGTTGAAGTCACCC
ATCAAAATAACTTACTATCGATAGTAATGTCATCAGCAAAATTGCAAATG
TCGCATTGCTCTACAAATTTAATTATATCATTAATATAATATTGAATAGT
AAAGGACCTAAGATTGAACCCTGTGGTACTCCTGAAAGTCTCTCGAGCCA
TTCACTGAAAATGGATCCAATTTTAACCCTTTGCTTTCGTTTTTTAGATA
ATCATAGATAAGAAAAGCAAAGCTGAACCTCCGATTCCATAGGCTTGTAA
CTTTGCAATGAGTAACTTGTGGTTCAGACAATCATAAGCTTTTGAAAGAT
CCATGAGGACAGTGCCTACAATCTCATGTTTATCTAAACATGCTTGCCAC
CTTTTGAGAAGGCATAGCATAGCATGTTGTGTGCTGTGGCCTCTCCGAAA
TCCACAGAGAAGTTTGCTAAATTCAGGTTCGATAAATGTGTTAAGTTGAT
TGAAAAGCACACGTTCAAAAACTTTTGAGACTGCTGGCAGTATGCTTATG
GGTCTGTAATTCACTTTATCCATCTCGTCTTCCTTCTTAAAGACGGTACT
GATGTCAGCAAATTTTAGTTCATTTGGAAAAACGTTGCTCTCTGGATTGA
TGAATTAATAAAATTTGTTATAAAATCTAAATAAATATCGACTGATAATT
TTAAGATATTAATCGGTAAATCACCACTGACAGATTTTCTAGGATTTAGC
GAGAGGATGATTTTACGAACCTCATTATTATCTACACATCGAAATTGATA
TCATTAAAAGTCTCTGCTTTAATCTCAATGATACTGGGGTGATCTGAAAA
GTGATTAAGGGCTTCGAGAACTGGCTCAGAGAATTTGTCAAAATTCTTTC
CAGTATGTTTAATGGGCAGAGTTCTTGTAATGTCTCTAAAGTATTTATTA
AATATGTTAACAATCTTTTGATCGTCAGAAACAATGTAATTTTTCTCAGG
TAGCACAATTTTGCCTTGGTAACAGCCGTTGTTGGTAAAATAAGGCTTGC
ACATATTCCAGAGGGATTTCTCTTTGGTAGTATCTATACTCTCAAAATAA
GATATTTTTTGTTTTTCATTTAATTTTACTACCAGATTCCTCTGTTTATG
ATAGGCTTGGATATCCTCAGGAAGTTTTGTTTTTCTTGAAATATTTTTTA
AGCGAGAGCGCTTCATGATTTGCTTCCTAAGTTCCTTTGTCATGTGAGAT
TTGTCATTGCCTCTGATAGTCTTACGTCTGTCTCCTTGATCTTGACCCAG
ATACATTATAAGCGTTTGTGTTCGAGGTCCTTTGGTCTTTCGAAATTGAT
ATGATCGGAAATGAACATAGCAACACCACTGTATGAATCGTCCGATCGAA
ATTTATTCATCAGTTTTTTAGTCTTCAAATGAACACTTATCGGTAACATC
ATGAAGGTAATAAAGATATAGATGGAGAGAAAACGTCTCGGTAATGACCT
AAATGGTCGTTGAAATCTTTTATAAATCTATTCAAAGCGGCTTTTCTTTG
ATGTACCATCATTGGAAGCAAAAAAACATCAATTTATAACTTTATAAGAA
CAGAAAGAGGCTGGTCCGTTGATTTTGAAAAACTTAATTTTGCGAGAAAT
CTTAGTTAAAATGCGATTCGAAATAGTTTCAACTGATTTAAGGATAAAAG
AATATATTAATTTCATAAGGACACATTTTTGGGCTGGCATTTTGTGAACA
TTGAGAGTCGCATCACATTATCATTGAAAGTTTTTTATCTTAAAATCTTC
ACGTCTAAGTGGGCAGCGGTTTACATACTCTGACAAAATGATAGATACAA
GGCTCCTAATCGTAACACGTAATTCTTTTTTAAAATCGATCGATGGCTTT
ATGGGCAGCTTCCCCTAGAAGCTTAGAGTATTGTGCTTATTATGTGAAGT
TTTTTTCAATTTTTTATGACAAGGCTATTATATTTCAATTTACTTGTTAA
AAAATGTAATGTCTTTTCATTTATCTTAAATATTCCCACGAGTATACCCA
AAATTAATTATTTTATTCCCAAAGCAACCAAACAGCTGTTTGCTTCCGAT
GATAAATCAGAATAGAACAAAAGGCATTGATTACCTTCATGGTTTTACTA
AACAATCCTCGGATGTTTGACTGAATGTTTGGTGTCAAGAGGCTCGGTGC
TGTCGATTCGGATCTTCCTAACCTGATAACAGATGTTCGTAATTTTCTTA
CGCACACGGTAAACCTCTGAAGGCGCTTGAAAATTATACATCTGAGGAAA
ATAATCCTCCAGCGGAAGATTTTACAACAAGAATCTTGTTGTGCGCCGGA
AAGTTAAAAACCGATACGGCGCCCTATTCATAAACACAATCACGGAACTT
TGTTGTCGTTTCTAGTCCTTTTAGACGAACGCGGTCCTTACGTTTTCGAG
ATTGCATATTCGTCAGATTGTTTGTTTTCACACATCCCTTTAGAGCTTCA
GCGTCGTGTACAGAAAATATTCACAATCTGATCTCAGGTTAGATCTTCCC
AAAACAAATAAGAGCACGAAGATGTGAAACTTGACATTTGTTTGTCTCAT
CTTGCCAGTTTTCTTCTTTCTCCGCACGAAAAAAAAATATCAGCATGTGC
AGAATCAGTTACTCTTCAATGTCGAACGAAATCTAAATCAATTACACTGT
TTATTTCGATTATTTCTAAGAAAAGCTTTTTAAAAAACCAAGAGAATTTC
TCTGGAGTTGCAGCCTGTTTTGTCTCCACTTCAGATAATATTGAGACGGA
CTTTAGTTCTATACATTTAATTTAAATAATGAAAATGATTTCCTGTTAAT
GGTTAGAGAGCGCGTCAAATGAAAGAAACAACAATATTCTACTTTTCAGG
GATATGGACCGGTACATTGGACTAACAGCAGAAACACTTTCTAACCCAGC
AGTGCCATCCGACTTTAAATGGATCAATGGTGCCCCACTGACTCTCGACA
TTTTTTTCGACGATCTTCCGTCCTTCAGTGATTCAGTCCCAAGATGTGTC
GAGTTAGATAGGAGTCCAATTAAACTCCAGCCACAAAGTTGTGGATTTAA
CGAAAATGTAATTTGTGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000026_pilon:175486..180154- >XLOC_044533 ID=XLOC_044533|Name=XLOC_044533|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026_pilon:175486..180154- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAGAAAGCATTGGACGTTGGTGATCTCAGCATTCAGGGTATTGTTGACTT
CCTCCGACGTTTTTACGGTATTGTAGGTTGTGAAACAGTCGGAGAAGTCA
TTGAAGAACAGGAGGAACAAAAGTGGTTCCAGAAAGCTTCCTTGAGGAAC
ACTACAGTTAACAACACTGGGATCAGAGGTCTCTTTATCGTATACTACAA
ATTGCTGGCGATTAAACAGAGAAAGCATTGGACGTTGGTGATCTCAGCAT
TCAGGGTATTGTTGACTTCCTCCGACGTTTTTACGGTATTGTAGGTTGTG
AAACAGTCGGAGAAGTCATTGAAGAACAGGAGGAACAAAAGTGGTTCCAG
AAAGCTTCCTTGAGGAACACTACAGTTAACAACACTGGGATCAGAGGTCT
CTTTATCGTATACTACAAATTGCTGGCGATTAAACAGGATATGGACCGGT
ACATTGGACTAACAGCAGAAACACTTTCTAACCCAGCAGTGCCATCCGAC
TTTAAATGGATCAATGGTGCCCCACTGACTCTCGACATTTTTTTCGACGA
TCTTCCGTCCTTCAGTGATTCAGTCCCAAGATGTGTCGAGTTAGATAGGA
GTCCAATTAAACTCCAGCCACAAAGTTGTGGATTTAACGAAAATGTAATT
TGTGAAGGATATGGACCGGTACATTGGACTAACAGCAGAAACACTTTCTA
ACCCAGCAGTGCCATCCGACTTTAAATGGATCAATGGTGCCCCACTGACT
CTCGACATTTTTTTCGACGATCTTCCGTCCTTCAGTGATTCAGTCCCAAG
ATGTGTCGAGTTAGATAGGAGTCCAATTAAACTCCAGCCACAAAGTTGTG
GATTTAACGAAAATGTAATTTGTGAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000026_pilon | genome | sc0000026_pilon:175486..180154 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 220-438:220 |
| Aaloc | 1-216:4670 |
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