XLOC_044520 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044520
Unique NameXLOC_044520
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000160_pilon:575465..586025-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044520 ID=XLOC_044520|Name=XLOC_044520|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10561bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:575465..586025- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGCAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAATCACTAAAAAAGACTT AAAGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTGCTGGCATCAACAGTA TGACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCCGCCAGTGAAGACGCC AACGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAACAGTATCCGTGTTAAA AGGACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCAATAACGATTTCGTGT TCACCGCCTCAGCCGATAAAATGATCCGGAAATGGCGTATAGATACAGGC ATGTGCTCCAAAACAATGCGTGGCCACACATGCGCCGTAAATCGTCTCAT GCTTGTAGACAGCTTACTTTTTTCATCATCATACGATCGAAGTGCAAGAT GTTGGCATATCGATACTGGTGAATGCCTTGCAGTTTTTAACGGTCACAAA CTCGGTGTCTACCCATTGTTATACATTCCACAATCAGATGATTCCTTCGA AAGAGATATCACAGACCTCAATAATAACCACGATATATTAATCACTGGGT CAGCAGATACTACCGCTAAATCCTGGGCACTTAACACGAATGAGGTCTTA TTGACGTATAAAGGCCATAATGGAGCAGTTTTATCTATGGCATGTGACAA CAGTGGGAAATATTTGTTCACAGGAAGTCAAGATTCAACTATCCGATCAT ATGTCTTGTCTACAGGAAAGCCTGTCAATGTATTCAGTGGACATGCCGCT TCAGTGCTACAGTTACAGGTGAGATAATGATAAGTTTTTTTCCAGACATA CTGTATTTTGTGATGTTTGTGACATTCGCACATGTAATATTTGTAGCTTG GTTTAAATTACACCCCTTCTCACAGACCCGGCAGGATTTATTCAGCCAGT GCGGATAAAAATAACGGACAGAAACTCGATGGCATAGATATCTTTTTTGA CTGGGATTTCAATTCTTTCGGTTTCAAGTTAGAAAATTCAGTGGGAATGG GAAAAATAACATAATATTTTCCAGTGAGGATTGGTTTATTTGATTATTTT CATCGGGGATAAAAATTGGCGGATAGTTCTCCACCGGGGACGATTTTTTG GCCAAGTTTTCCAGTGGGAAGGGGCCCGTAAGGGTCTGTAAGAAAGGGGT ATTAAATAACTCATTAAAGAGTCTCAGCATGATTTAAGGACCCAGATCCG CAACCGTAAGTACCATCTACTTTGTTTGATCCATATTAAAAACATGGTTG GTATTCTGCCATAGGATTTAAATAGCTTAATCATTCAAAACTTTTAAATA TTCCAAGAATGAAAGGCACCTATGATTTTTCTTCCTAGAGATGGTTTGTA TTATACATTGTGTCCCGAAAAAAAAGTGGACAAATTTCCATATAAAGTAA AATCCACATTATTTGTGTCAAATTGATAACTTGTATGCTTGACATTTCAA TCTAAAAAACTTATTCAATCAGCTTGGGAACGGAAAATTGTAATATTATT TCAATTATTAGTCCAAGTTTTGATTATTAGTTTAGAGGATTTTACTCCAT ATAAAATGCCTAGAAAATAGTCCACTCTTGTTTGGGACACGCTGTAAGAG GTTTATTCCTAATTGCCTTATTCAATTGTAATACCTATAAAAGCAATTCT TTTAGGTTGTTAACCGATTGCTATTTTCATCAAGTGCTGACCATACCGTT CGATGTTGGGTATACGAGTTTGGGGAATGCACGCGTGTCTACCGTGGACA CACGCACACTGTTGGTTGCATGAAAGTTGCCAAAGGATTATGTAAGTTCA GATATTGATTTTGTCCTTCCTTGTTCAGGGGTTTTGCTTTGTTTTTGGTA GGCTGGCGAATGAAAAAATTAACCCTGGCGATTTCTAGATTCTAGGCCGA 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AGAGACGAGAAAAAACGAAATTAAATTCTTTTTGTAAAATTTTTAACTCA CTCAGCAAAGCTATACGATACCTGACACTGGTAATTCGAGGATCAAAATC CAAAAAATTACTTGAGTTTTTATAACTTTCAAGTCACCCTTAGGATGTAG AAAAAACTATAAAGTGTCGTCAGTGATTTGCTGGGTGCGTCCAGCACAAA ATATGCATTTCTATATCAGATTGTATTGTTTATAAAAAAAGTGTTTCGAA GTATTTCTGAGACAATTAATTATTTCAAGGGTTTATCGAATTTAATGTAA TGAATCTAAAGGTGGCCTGTCGCAAAATTTTGCTGCTTTGACGATAAACA TGACCCAATGGAAAAGGATTTTAACGGCTTAATCTTCTCTTTGAAAATTT ATTTGTATTTACCTACAACAATTATAATGGGGAAAAAAGCTGAAACAATA TTTCGCAATAATTGAAATAATTCGTGTTTAATTAGCATTTTAGTGCAAAG ATTTTTATATGGTATTTAAAGGTTTATTGTTGTAAATTTAAAATAAAAAG TAATTTATACATAACTCAGTTCTTTAGTTTAGTGGTTTTACAACGTTAAA AAACTATGAAGAATATCAAAATATTCTTGAGATCTTAAGCACCTAGAAGA TGACCATAAGACGAGGTCAATTTTATGTGTTGTTTTACGGGCCGGCCAAA ATATCCAAAAAAGAGGGTCGGATAAAACTAAAAGTAGAATTTCACCTTTT ATAAATCTCCTTAAAAGGCAGCAAAAACTACTACATCTTGACAAAAATGC GAAATAGAAAAAAAAGACACAAAAAGCTCAAATTCATGGATACAATATTC ATTTCGATTTTAGGAATTTTCAGGGTCGGTCGGACCCATAAAATAAATTG GTGTCGCCTAAATCCGAATAGACAATAATTGTTTGTGCTTTTTTTGGAAC TTTCTCGAACGTTCTTAAAATAACAACACAGACGCAGTGACCGGACAGAG ACATTTAGTCAGTGTGGATGAACGGGTCTAAATAAAAAAAAAACTAATCT AAATTATTTTGAATAATGAGTGCTGACATTAGAAACTAATTTTTACAAAG TCCCAGAGACTTTCTTTGGTCAAAAACCCATTTTCAAATTTGAAGAGAAA TTTTCCCACTTTCTTTTCAGTGTGAAATTCCATCATTATTTGACAAAACA AAGCTAAAACTTTTCGGATATTGTTGGAAAACGAAAGACAAGAATTATAA AACATAAGGAAGAATAAAATGTTCATAAAAAAATGTCATTCTGAGAAAAA TTCAGGCACGACCGGAGTCTATGACAATTGAACCTACGGATTCTATCAAA TGGTATATAGGCCACGGCGCTCCTAGTTCCCTATTGATGATGTGATGAAC GAACGAACCGCCAGCTTTGGCAGTTTGCCGGCCCAAATAACAAGAGAAAT TATGATTTGAATGGTGTCGAGTTACGTAGGGTATACAAAACCCAACGAAT TTTGATAATGTAATGCCGGTTAGAATTCCAAGAAGGAAGACTAGAATACA AGAGTTAATTTGGACCTCCAAAACAGAGAATGTATGTTTTTTATTTCTGG AAACTATTAGTTGAAAGAAGGTCAACAAAACAAAATGGCTACAATATCAG GCCCAAAAATCGTCATACGAAAAATACTTACAAAAAGGTTCAATCAGTGA CAGATCCACAGAGTTCTTCAATCGATGTTTATAAAAACAAAATCTTGCAG TTCATAACATTAAATGGAACTGATAATTTTCAAAGGTCACGAAAAGCTTG TAGAAATCCAGGGGGTACTTAGGCAAGTGAAGGGTACGGGTATGTGACGC CCTTAAGGGTGTCTTTTTTGGCACTTTAAAGTCCCTGTAAGGTTTTGAAA AACCAGAAAATTAAATTTCAGTCCCAACATTTTCAACTTTTTGCTTCTTG AAAGATGAAAATTTGGTCAAATTAGTCCCAATAAGGGTCGGAAAAGTTTT CCTATTTTTTCTCTTTTTAGTCCCGCTAAGGGTCCGAGGGTCGAAGTCAG GCGGCATATACCCGTCAGCTCGCAACCCTGGTACCCCAACCCCCCCCACC CCCGGTGTAGAAATGAGGGAAATCGATAATGGATATATTCCTGTTGTTGG TGTATACGTCAAAAATGGGCGCAATGATGATCGCACGCGCCCTTAAATTT CTTTTTATCATTAATCTTACATATACCGGTGTACTGCACAAACAGGGAAT TAATTTTACGAATGTTGAGATGAATCCCTGAATTTTCTTTTTGAGATTAA TGGGATGTGAAAAATGAAAGCTTTGCAAGAGACGTTGGCCCCGTACTATT CTTAAATTGCAATGATAAGCTTTTCGAAGAATCTTCGAAGGTTCGAAACA TAAAAAATACACCAATATCACAAAATTTCTTCTTGAAACTTAAACCTATA TCAAGGGCGAGGGCCTGGCCGCTATCGATATATCAGATAAGGGCGGTATA TGTACCGCCATCGGTATATCTTAGGGGTCCATTTTTATCAAAATGGTGTA ATAACACAGCAAGACAAAAGAACGGCATACATTGAAAACAAATTGTGGTT CCGAATGGATTGATTGATTTGAAAATCAAAGTAACACGATATGAAATAAA ATGAATATCAAAAGCCATGAAACTGAATCAAACATTATACATCACTCAAA ACAGACATCTTTATTGAAAAACAAACTCATGCATAAATTATCAAAGAAGG TTACTAAATTTAACAAATTGTTTTCATTGATAAACGTCTATGATCGGCAG GACGGCACAGTACTCTATTAAAACAAACTTTTGATTGTGAAATTGTAAAC AAATCCCCTGGAACCCATCAGTAAGTGTCATGATAAAAAGTACTTGTTTC TAACAACATACAAAACATAACATAATTCAAAATTTTTATAATGTAAATTT CAATCAGTTTTTGGATTATAGTTTGATGAAAATGGCGTGTGTCTGGCAAA ATTTCTATAAACCACGAAATGCTTAAAAAAGAAATATTTTATCAATTTCG ATAAAATTTTGATTACATTCTTTAGCTGCTAATAGACTGGTAAGGTGGAA AAGTCATAAATTTAAGGGGCTTAAGAAGACTAAATTAGTGAAAATGTCTC GAAAAAAAAAAAACATTTCAAGAGGACAAAGCTTCAAAGCATATATATGT CTTCAGCGTCACTTTAACAATTTAACTGGATGCTTTTTAGCATACCCATG GAGTGCTGGAAACAAAAACGAGTTAAAATTTTCAATAATTTTAAGAAATA GTGTAAATTTTCCTCTGTTTCCTAGAAAAATTTTTCAATGAAATTAAAAA ACAGTGTAAACTTTTCTCTGTTTCCTAGAAAATCTAACCCAATTTAGGTT TCGGATTTGTGTTTACCAAGCTCTTCCCTTCCTCCGCCGGAGCTGTTTTA GAAATCTGACAGACAAGCTAAATTTCATTACGTTTTCAAATCAAAAAATA AATTTTAGAAAAAGAAAATTAACAGTGTTACTACATCAACCGAAGAACTA CAAAACTTTACAAAACGCACCAAAATGGGATCTGGATCGAGTAAAAACGA TCCACACAAAATGACGAAGAAAGATTTAAGACATTTCTTGAAAGAGATCA AGCCGCATGCAGCAGGGATAAATGATATGGCAATGACGCCTGACTGTTCA AAATTACTGACGGTAAGTGTATTTAGTGGGCCCTTAATGAAAAAGGGAAC GCGCACATCTGAGAGTTTGTGATATTTTTAACAATGACCTGTGTCAAAAT CTCTGGAACAAGCTATGTTCACCAAATTTGATCAGAGTTTTTTATAAGGA ACTTTAACTTTGCTCTGAGCCTTGAGTTCCTGATTTTATCAGAGAGTTTC AGCCTCAAAGTTCCTTATCGAGCTCCTTATTTACTTCACTGTTAAGTTGG AATTTGATATATTTTCTTTTTGTCACATTGAATGTCGTTTCAGCAGTATT TTTCGTCTCGAGTTCCTTGTAAACGTGCTCCTTATAAAAAACGTGTAAAG GATGGGTTCTCCGTTGATAAAAGGTATTGACTAGACGATGCTATCGTCCG TTTAAAGGTCAGTAAACGCGAGAAAGAGTTAGGGCGTCAGGGCGGTTTAC GGGAAAAAGTGGCGGTAGAGTTTTGGAAAAAAACATGTAAACATCTCCGC CACTGCTTACTCCACCCGAATTTATCACGCCTCTCCTAAACTATTCCCTT TTTTAGTGATCTTGTGTAGACGATAGGATCGTCTAGGTATTGACCTGAAT TAAGTGTTGATTCCATTAGGGTACAAAATTCAAACAACATATATCAAAGA TCTTTGATTGCCAGGATTGTGGAGCTGTTCCAGGGTTTTGATTAAACTCA GTGGTTTCCGAAACAGTGGTCTTCGATCATCTTCAGTTTGATTATTCTTT TGAAACTGTGATGCTCGTCATGAAAATGTTCTTTCCTATTCCACATCAAT TTTATAAGTTGGAGAAGACACCAAGAGGCCGATTTTCACTTTGAGTTAAA GCTTTCAATCTTTGCTGATATCTTCTTCTTTCGAAACAACGATTATCCTC CGTAAATGATTTATATTTCCAAATCAATTTACAGGTTGGGGAAGACACAG ATGCTCGTCTTATCGTTAGTGAAGGTCGAGATATTCACGAACTGGAAGGC CACGAAAAGTACATCAACTGTATAGTTTGGACCAATAAATGGATGGAAGT ATTCGTAAATGGTCACTAGATATTAGTTCTCCAGATCTTGGCAAAAGCTG CCTAGATCTTAAAGGCCATAACGGGTCTGTCAACAGACTACAGTTAGAGG GTAGTCTACTTTTCTCATCGTCATACGACCGTACGGCCAAATGCTGGAGC GCAGACACAGGAGAATGTTTACGTACGTTTAGCGGGCATCGAGGTAGCAT CTATCCGCTTCTCTATATGCCAAAGTCTACGGAAGACACCGAGACAGACC AGACAGACCTACAAAACAACCATGATTTTTTGGTAACTGGAAGCGCAGAT TGCAATGCACGTCTATGGGCTTTGAGTAGCAAGAAAACGATCAGAATATT TACCGGTCACGATGGTACCATTTTGACCCTGGGGTCGGATAGTGCGCATA AGACACTATATACGGGAAGTACAGATCACACTATCTGCGCTTACAATATG CTGAATGGTGAAAAAATTTGCAAATTCACAGGACATAAAGGGATCGTTGT TGAAATTAAAGTAAGGGCTCACTTTTCTAACAATACATTAAAGATCGAGT TAGAGAAATAATCGACTGTACCATAAATCTTTGATTCTTTACATTATTTC AGATCGTAAATCGATTGATGTTTTCATCAAGCGCTGACCATACTGTCAAA TGTTGGTTGATTGGGGACGGTGAATTTCAGGGCCATTTGATGAGGACATA CGTCGGCCACACCCATACCATAAGTGCCTTGACCCTTTTTGATAAATATC GTAAGTCAAATTCCCTTTACAATGACAGGTTTGTGCTGAGAAATTGAAGT GAAGATTTAGAAAGCTCTCTGATCTTTCAACATGGAAAGCTTGTTATTTA CAGTTAAGATTTTTGTAACATCGCTTATTGGCCAGGATGGAGTCCTATAA GTTAGCAAGCTTTGACTCCCTTCGCTAAATATCGTAAGTCATATGTGAGG GTTTTGCATTATTTTTGATAGGTCGGTATGAATGATAAATTATGAATTAG CTTCAGACGAACTCTAATTTTTCAACATAAAAGCTTCAGTATTGGCAACC AGTTGTTGTATTTGATCTGTAAAAAAGTTTCAATTTTCAATCTTAATAGG CCGGGAAGATCTGACAAGAATACAGTGTGTCCCAAAAAAAGGGGACAAAT CTTGTTAATTTATACGAAATTTTATGACTTGTATACTTAACATTTCAATC AGCTTGGCAATTCAACATCTATTAACTGAAAAGAGAATTTTAATCGAATC TATATTTTTCTTTCTTAGTGATAACAGGCTCTGGAGATACAACAGTAAGA GTTTATGATGCCAAAGACGGAAGGTGCAGAAAGGTATTAAAAGGACATAC TGCAACCATTAACAAAATTATTGTAAGTATTTTTCAATTGAAATCTTGAA GTTAAACTCTGTGTATCTTGATAATACTCTAGAGTAAAGTTTTAACTTAA TTTTTCAAAGTTTTAGCTTAAGGATAAACCACTGACACCGCAGGCTGGAG TCGTTTATTACCAGATGATACGATAATTGTTGCGAGATAAGTTTTTAGAC TACGAAAGACCTTTTCATAAATTACGTTACGAATATCACTTGCCTCGTTT TTAAATTATTGCTATGGCGACTCACGGCGGGAGAAGACTACTTCTATTCA TAAAAAACATCAATTAATATTGGTAATAGGGTACAATGGTAATTGTTTGA ATACGAGGCTAGCGATGTTCGTGACGTAATTTGTGAAAAGGTCTATTTGC CCATTCTATTACTTTTTGCTTATTTTTTATCTTGTTTGAATTAGTCGCTA AGGATGCTAGACTTCTGGGAAACGAGAAAAGCGTCAAGGTGAAAATCGCA GAGAGGTTATTTTATCTCTTTTGTCTCTTTGGTTGACAAAAACTGATAAT AACTTTTGTTTTTGCTAGGTGAACGAGCTTGAGGAGAAATTATACAGCGC ATCAAATGATAGTACAGTCCGTGTATGGAATTGGAAAACAATTGTCGATG ACATTACTAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000160_pilon:575465..586025-

>XLOC_044520 ID=XLOC_044520|Name=XLOC_044520|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2256bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000160_pilon:575465..586025- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGCAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAATCACTAAAAAAGACTT
AAAGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTGCTGGCATCAACAGTA
TGACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCCGCCAGTGAAGACGCC
AACGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAACAGTATCCGTGTTAAA
AGGACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCAATAACGATTTCGTGT
TCACCGCCTCAGCCGGGCAAGGAACAAGATGGCAACAAAAAACAAAAAAT
CACTAAAAAAGACTTAAAGTTTTTCTTAAAAGAAATTAAAGAGCATACTG
CTGGCATCAACAGTATGACATTAACGCCCGATGGCTCCATGCTGGTGTCC
GCCAGTGAAGACGCCAACGCCCATATCCTAGACACAACCAGTGAACAAAC
AGTATCCGTGTTAAAAGGACACGAAAAATATATAAACTCTGTGGTGTGCA
ATAACGATTTCGTGTTCACCGCCTCAGCCGATGGAAGTATTCGTAAATGG
TCACTAGATATTAGTTCTCCAGATCTTGGCAAAAGCTGCCTAGATCTTAA
AGGCCATAACGGGTCTGTCAACAGACTACAGTTAGAGGGTAGTCTACTTT
TCTCATCGTCATACGACCGTACGGCCAAATGCTGGAGCGCAGACACAGGA
GAATGTTTACGTACGTTTAGCGGGCATCGAGGTAGCATCTATCCGCTTCT
CTATATGCCAAAGTCTACGGAAGACACCGAGACAGACCAGACAGACCTAC
AAAACAACCATGATTTTTTGGTAACTGGAAGCGCAGATTGCAATGCACGT
CTATGGGCTTTGAGTAGCAAGAAAACGATCAGAATATTTACCGGTCACGA
TGGTACCATTTTGACCCTGGGGTCGGATAGTGCGCATAAGACACTATATA
CGGGAAGTACAGATCACACTATCTGCGCTTACAATATGCTGAATGGTGAA
AAAATTTGCAAATTCACAGGACATAAAGGGATCGTTGTTGAAATTAAAAT
GGAAGTATTCGTAAATGGTCACTAGATATTAGTTCTCCAGATCTTGGCAA
AAGCTGCCTAGATCTTAAAGGCCATAACGGGTCTGTCAACAGACTACAGT
TAGAGGGTAGTCTACTTTTCTCATCGTCATACGACCGTACGGCCAAATGC
TGGAGCGCAGACACAGGAGAATGTTTACGTACGTTTAGCGGGCATCGAGG
TAGCATCTATCCGCTTCTCTATATGCCAAAGTCTACGGAAGACACCGAGA
CAGACCAGACAGACCTACAAAACAACCATGATTTTTTGGTAACTGGAAGC
GCAGATTGCAATGCACGTCTATGGGCTTTGAGTAGCAAGAAAACGATCAG
AATATTTACCGGTCACGATGGTACCATTTTGACCCTGGGGTCGGATAGTG
CGCATAAGACACTATATACGGGAAGTACAGATCACACTATCTGCGCTTAC
AATATGCTGAATGGTGAAAAAATTTGCAAATTCACAGGACATAAAGGGAT
CGTTGTTGAAATTAAAATCGTAAATCGATTGATGTTTTCATCAAGCGCTG
ACCATACTGTCAAATGTTGGTTGATTGGGGACGGTGAATTTCAGGGCCAT
TTGATGAGGACATACGTCGGCCACACCCATACCATAAGTGCCTTGACCCT
TTTTGATAAATATCATCGTAAATCGATTGATGTTTTCATCAAGCGCTGAC
CATACTGTCAAATGTTGGTTGATTGGGGACGGTGAATTTCAGGGCCATTT
GATGAGGACATACGTCGGCCACACCCATACCATAAGTGCCTTGACCCTTT
TTGATAAATATCTGATAACAGGCTCTGGAGATACAACAGTAAGAGTTTAT
GATGCCAAAGACGGAAGGTGCAGAAAGGTATTAAAAGGACATACTGCAAC
CATTAACAAAATTATTTGATAACAGGCTCTGGAGATACAACAGTAAGAGT
TTATGATGCCAAAGACGGAAGGTGCAGAAAGGTATTAAAAGGACATACTG
CAACCATTAACAAAATTATTGTGAACGAGCTTGAGGAGAAATTATACAGC
GCATCAAATGATAGTACAGTCCGTGTATGGAATTGGAAAACAATTGTCGA
TGACATTACTAAAGTGAACGAGCTTGAGGAGAAATTATACAGCGCATCAA
ATGATAGTACAGTCCGTGTATGGAATTGGAAAACAATTGTCGATGACATT
ACTAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044520XLOC_044520-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000160_pilongenomesc0000160_pilon:575465..586025 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1069-1161:94
Aaloc967-1068:742
Aaloc817-963:1410
Aaloc301-816:2018
Aaloc202-297:10394
Aaloc37-201:10562