XLOC_044492 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044492
Unique NameXLOC_044492
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000052_pilon:226540..242075+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044492 ID=XLOC_044492|Name=XLOC_044492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052_pilon:226540..242075+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CCGGCAAGttcaattcctttgtttatacAATCGCTGCAAATCGAACTCGA TCAAATAGGACAGCAAATTGACGTTGCCACATACTCGACAGTAATTCTTG GTGATTTCAACTTGCCTGTTAACAGAAATGATCTGAATGAATTATTACCA CCGCATATCTTTCACCAGCGTTGTCATTATCCCACTCATATtgatggaaa tattttagatcTTATCTTCCAAAATAATTGCTCCGATGCAGCAGGGTGGA TGCCATCTCCTTTCAGTGATCACTTTGCTATTTTTGTTAACCTCATTCCA TACTCTTAGAATTTTCATAATTGATAATTAAAAATTCGGTAATTCAACTG TATATTTATGTATATTTTGTTTAAATGTAAAATGTAATATAGGactttgt aaataaatagaATTGAGTTTGTAATCTTATTGCTCCCCCCTTCCCCATCC CCAACTCCGCCACATGAAACGCAatctatgatgaaatgaaaactgaaaaa tgaaatcaagTTTGTTCTTActtcagttttgatttatttctgaatgattg tttacagtgtcagtatttttttgcttttaataAACATTGTTTGTCTCTTT CAAGATTTAATCACTTTATGCTATGTGGATTTATACTTTTCATACTTTAA AGAATTTATTGCTGCcttaaattttcattctttcattaTAATATGTTCAT AGATAGATATACATGTTttaccaggtaggtccataaaagtatcgcttgtt ccttacaacccttccctctcccccaccatcaatcaatgataaatttcttg cgttatgcattttcgctaaacgctatgttttctgactgatttttttcatt tttctccttgcattgctatctaactttcatcatcaggtaggtccattcag catctagcttgttactgatgtttttattacaaaaacataaaaaaaacttc CATATTCATCTTATCATGTAAGTTCCACAGTCAGTGGAAACAAAGAAAGC ATCTTTTTCTAATCTTCAGCCAACATCACAGTAGAGGACTGCGTTTTGGG GTAATTCGATTGTGCCAGTGCATAGTACACGTTCGGGAGACTCTGCAAAA AGCATAGTCATAAAAAAGTTCATCTAAGCTGGACTTTCTCTCCAATCCCA TTCCTTGTATTTATTTTAGGCAATATAACAGCAGAGGACAAATGTGGACG ACCTTTAGGTTTACAATTTGATCGTGACCAGGAAAATCTCATCATTTGTG ACGCTTACCTTGGTTTACTAAAATACAACTTAAAAGCTGGGGAACTTACA ACGTTAATTTCTGCTTCCAAAGGAGTCAACGATGTTCCATTCAAATTTGT CAACCACTTAACCATCTCAAGTAGTAATAAGGTCTATTTTACAGACTCAA GTTGGAAATGGCAGAGGCGTGATTTTCCATACATGATCTTGGAGGGCGGT GGTCAAGGGCGTTTAATCAGTTATGATATAGAGACAAAACAAAGTGAAGT ACTGATGGATGGGTTGTTTTTCCCGAATGGAATTGCGTTATCCCCTGATG AGGAATTTGTTGTAGTATGTGAAACCACAGCTAGTCGAATTATGAGGTAT AGTTTATTCTTGTacttttttgtttgaatttgcCCTAAAATGTCAAATAG AACTATTTTCAACATTCTTTGGACTGAGGTAGCTAAGGGAAATATTCATT CTCGAGCTTGAGGAGTTTACAAGGCTCCCACAGctcctcaaatctcctca attctccttaaatttcaaatttctcctcaattctcctcaaatctcctACT TTTTCTCgattttctccaatattttcttcaaatctcctcaattaaatttg accaaaattaaaaaaacgttCAAGGTAGTATCGCTGGCCTTTGAAATATG tttcgaaaattgattttcaagaaTAACATGGAAAATCTtccgctcgctgc gctcgcacgtctctttattgtttttcaataaCTCAACATCAATGGCGTTC TGGCAGGGAAAGGGGCCACGACCCCCCAACAGAGttttttttGAGGGGGC GCTAAAGAGCAAGCAGCACTACATGGGGTTTTTAAAACGCCCCAATGTTA AAAATTACTTTATGCCCCCTTAATTGccgcccaggaccaattttactaaa attattttaacttacttgcaatttttcttgcttgaaaatCTCCTTGGAAA ATCTcctcaatttttctaaaactaTATGAAAAACTCCTCAAATTTTAACA GATTTCTcctcaaaaaagtaaaaaatcctcCTTAATTCTCCTCAATTCtc cttaaatttaaaattttgaaagctgtGGGAACCCTGATTACTATCTTTTC TATTCTATTCCTTACTGCAGTGAAATTTCAACAATTCAACTGGGGTTAAT TAGACTCACTTGGTCACTGAGAAAGGattgatttttgttgtattcaGCAT TTTATCGATAAATTCACAACACTGAAAATCCTTCAAAAATGGGCGGTGCG TTCTTTTTACAAGGAGTGTTGGTCAGAAAAGGTAATTTGTATGTTTTTCA GAAATAAACAGCCGAGTATTAACTTAATACTCTTTACTCTCATTCTAGGT TATTTTTGAAAGGCTCAAGAAAAGGAATTTATGATCTCTTCTCCGACAAT CTTCCAGGGGCGCCGGATAATATCCGCCCTTCTAAAGATGGTGGTTATTG GGTAGCCTTGCCATCTATTAGAAAGTGGCCGTTCTCGTTTTTGGACTCAG TTGGACCTTATCCCAATTTGAAATCAGCTATTGCTAAGGTATGAGAAAAA TCTAATATTTTCATCAACTCTCTAGTCAATTCCTTTAAAAGATGATAGAT ATCTCAGCTACGATAAATATCTTTGTAATCGTTTCAAAATGAGGCAAGTG TTTTATTTGGCGTTAATCAAGTTAATCAAATACCCgtacttttactaatt atttcctagactttgattttttaaagttcaaatatgtatgaaaaatatta tataaaaatattcaatattgCACTTTCTTTCTTTAGCTTTTACCTAAAGA GACGTTCCACGGTCTAATCAAGAAATATGGGTTGATGATTAAGCTTGATT ACTACGGCGATATCATTAAGAGTTATCACGACCCCGATGGTTCGGTCATA ACGCATATTTCGGAAGTTTATGAAGATCCTAACGAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000052_pilon:226540..242075+

>XLOC_044492 ID=XLOC_044492|Name=XLOC_044492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2160bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052_pilon:226540..242075+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAGTATTTCAAGTGGTGGGTGCGGTCGTTGGATTGTTGGTTTTCTA
TCTATTTGTCACTCCTTCACCTATTAAACCTGTCCCCATAAAATGATAGT
ATTTCAAGTGGTGGGTGCGGTCGTTGGATTGTTGGTTTTCTATCTATTTG
TCACTCCTTCACCTATTAAACCTGTCCCCATAAAGAGTCAAGACCTGCCC
TACTTCGATGGCATCTTACAACCAAACAATGCATTGCAGCAGGTCATCAA
AATCTTACCAGGAGAACTCAATGGACCAGAATCTATTCAAGTTGACAAAG
ACGGAGTCAAGACCTGCCCTACTTCGATGGCATCTTACAACCAAACAATG
CATTGCAGCAGGTCATCAAAATCTTACCAGGAGAACTCAATGGACCAGAA
TCTATTCAAGTTGACAAAGACGGAAATATATATACGGGATTACACGACGG
AAGAATCATAAAGATCTCACCGTCCGGCAAAATAGTTCATTTAGTGCGAA
CAGGAATGGATCTTCCCGAATGTGGAAATATATATACGGGATTACACGAC
GGAAGAATCATAAAGATCTCACCGTCCGGCAAAATAGTTCATTTAGTGCG
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GACTCAAGTTGGAAATGGCAGAGGCGTGATTTTCCATACATGATCTTGGA
GGGCGGTGGTCAAGGGCGTTTAATCAGTTATGATATAGAGACAAAACAAA
GTGAAGTACTGATGGATGGGTTGTTTTTCCCGAATGGAATTGCGTTATCC
CCTGATGAGGAATTTGTTGTAGTATGTGAAACCACAGCTAGTCGAATTAT
GAGGCAATATAACAGCAGAGGACAAATGTGGACGACCTTTAGGTTTACAA
TTTGATCGTGACCAGGAAAATCTCATCATTTGTGACGCTTACCTTGGTTT
ACTAAAATACAACTTAAAAGCTGGGGAACTTACAACGTTAATTTCTGCTT
CCAAAGGAGTCAACGATGTTCCATTCAAATTTGTCAACCACTTAACCATC
TCAAGTAGTAATAAGGTCTATTTTACAGACTCAAGTTGGAAATGGCAGAG
GCGTGATTTTCCATACATGATCTTGGAGGGCGGTGGTCAAGGGCGTTTAA
TCAGTTATGATATAGAGACAAAACAAAGTGAAGTACTGATGGATGGGTTG
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ATGTGAAACCACAGCTAGTCGAATTATGAGGTTATTTTTGAAAGGCTCAA
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AATATCCGCCCTTCTAAAGATGGTGGTTATTGGGTAGCCTTGCCATCTAT
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TGAAATCAGCTATTGCTAAGGTTATTTTTGAAAGGCTCAAGAAAAGGAAT
TTATGATCTCTTCTCCGACAATCTTCCAGGGGCGCCGGATAATATCCGCC
CTTCTAAAGATGGTGGTTATTGGGTAGCCTTGCCATCTATTAGAAAGTGG
CCGTTCTCGTTTTTGGACTCAGTTGGACCTTATCCCAATTTGAAATCAGC
TATTGCTAAGCTTTTACCTAAAGAGACGTTCCACGGTCTAATCAAGAAAT
ATGGGTTGATGATTAAGCTTGATTACTACGGCGATATCATTAAGAGTTAT
CACGACCCCGATGGTTCGGTCATAACGCATATTTCGGAAGTTTATGAAGA
TCCTAACGACCTTTTACCTAAAGAGACGTTCCACGGTCTAATCAAGAAAT
ATGGGTTGATGATTAAGCTTGATTACTACGGCGATATCATTAAGAGTTAT
CACGACCCCGATGGTTCGGTCATAACGCATATTTCGGAAGTTTATGAAGA
TCCTAACGAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044492XLOC_044492-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000052_pilongenomesc0000052_pilon:226540..242075 +
Properties
Property NameValue
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