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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000108_pilon:718341..726637- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044489 ID=XLOC_044489|Name=XLOC_044489|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8297bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:718341..726637- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTAAACCCTGTCTCACGTGTAGTATTTCTACTTCTGCTTAACGT
TGTCTTCACATATGGCATGCCACCGATGTATGAGGGAATCCAGCATTTTT
CTGAGCATTATAATTTGCCACCGCTGCCATTCAAATTTGGAAGCATGGAA
CCACAATTTGATGCACCGACAATGAAAATCCATTACATTGAAGTTCATTC
AAATTTCACTAAAAATATGAATAGGTTACTAAAAGATTGGCGAAAAAAGG
TATATGATCCCGGGGGGGGGGGTACTACCCTTGTCGACCCACGGGGGTGC
TCCGCTGAGGTTCGAAAAATGGACCCTACGTGGGACTCGAAATTTGCGAA
AAAAGTGACCCTGAATGGGACTGAAATTCCAAAATTTTCTCAAATTTTCT
ACTTTTTCCCCAAATTTTCCAAAAAAAGGCACCCTACGAGGGACTGATTT
TTCTGTTTTGGTGTTTTTGCGACCCTACCTAAAACTTGTGGAGGTTAAAG
AAGGTACCCTGACCAGCGGAGCATCCCCGTAACCCATCTTGCCCTAGTAC
CCCCCCCCCGGGTATATGATTTTGTAATTTAACGTTTTTACATTTGAGAC
TCAATCGTTCCAATGTAAACATTTTTCCACTAGCATTGTAACATTTTCGA
CTCAATTTTTTCAATGTTAATATTTTCCTACTAAACATTGTAACATTTCA
AGCTCAATAATTTGGCATTTGTGGTAACATTTTCTTGATTCTATGTACAT
TCTATTAGCATTTTTTGTGAAAACTCTGGACAATTGGAAATTTTAAGGTA
AAAATTGACATTCATAGGTTCAGTTGCCAAATTCCCTGATGGTGTTATTC
TTAGTTTTGCAAATTTTATCATGAATATTTTTATAAAGTATTTTCTTATT
TATTTTTACTGTTTCACCTTCCCCCTGGCTTTCACCAGAATTTTGAAGGT
TCCATAACTTCAAACCTTGAAAAATATATTTGAACCATCAAGATTGAATC
ATTTTATAGGACAAAGACAATCCGTTAACAAAGAAGTCGTTATTGGACGT
CATTCGAAACATTGCTCAAGTTCCTCATCAAATGAAATATGACCTGGAAC
AACAAATAGGAGGGTAAGAGGAAATCTCTGGCTCAGTATTCCAATAGATC
TTATCGGAATTTTTGATTTTTCTAAAAAAAGCAATGCATTGTGGGATTGT
TTCGGGAGTATTACAATAGAATTCCCTCAAGGAATTCGTACTAAGAGATT
TCTATTGTAATACTTCCGAAACAATCCCACAATACATCGCTTTTTAAGAA
AAATAAACTTTGAAAAGGTTTTTCTTAAGGTATGTGTTCACCTTCCTTGA
CACATTCTCTTTAATTGATCATATCTTTAGAACAACAAATTTTTATATAT
CAAAAGTATATATTTTCTGAAAGCCAATAATATTCTCTTTCTAATGGTAA
AAGTTTCAGCTGAATTTAAAAAACTGGGCACGATATAATTAAAATCTTAA
GAATTTTAACCTTACCTACTTCAAAGAAGTTAAAGTCACCCATAGCTTTT
GAAATTTGAAAAAATAATTTCGATACTATGTTGCCAATAGATTGAACCAA
AAAAATGTCTTAGGATTTTTTTTTGGATCGACTTTAACTCGAGAAAACTT
AAAAATTGTTAAAATTTGGAAAAAAATTATTCATTTCTCGAGTTTTTTCA
ACTTAACCTGAAATTGTGAAGCTTTAACTCGATTAGAAAAAAAATCCTAA
GACAGTTTTTTAGTTCAATTCTTTGCCGAAAATATCAAAAAAAAATTAAG
TTCATAGCTAAATGATATGGGTGACTTTAACCTCGTTAAAACTAGTATGG
TGTGGTAAAATTTCGTTTTTTTCTACATCAATTTGAAATTTTTAACGAGA
TGATTGTTGTTAATTTGCGTAATCAGTGAAATGTGTCAAAAATATTACTA
TTCAATAGAGGTGAGAATAAACATCAGCTGAATTCTCTCTTTTGTCTTTG
TTGTTTCCGAAAGAGACAATTATTTGAGTAAATAATCCATCATAAGACGA
ACTTTGTTTTGAAATTTAAATGGTTATAACTCTGGATCTAAAAAAGATTT
TAAGATCGCGATTTTACCAAAATGAAATCCAGTAACTTTTCTTCCACTTT
GACTGAAAATTTTTTTTTTGACAAAAAATCGGAAAAAAGGTGTACACATA
CCTTAAAGAGAAATGAAAAAAAAACTAATTTTGTAGTGGTGATATTGAAC
TTTAACAATCACGTACCCAGAGCCGCTTGCGTCTCTTTTTAATTTTACTG
ATGACTTGATACAACCGTGGTCGCTATCAGAATCGTAAAAATGTTAACTA
AGGGAAGTTAACTAAGGGACTGCGCTCAAGTTTGAAACTTCAATTAAATC
TTTGTTCGATTGTTTTTTAGCTTTAAAATCTAATTTTTCTAATTTGATCA
ATTTTTAGTCACTTGAACCATCTGTTCTACTTTGCTACACTTCGAGCGAA
CCCAAAGAACGAAACAATGGAAATACCGAAAAAATTACAAAGAGCTTTCA
AACGATCTTTTGTCAATATGACTTTATTTGAGACACAATTTAAAGAATCG
ATAGATAAAGTATCGAGTGTCGGTTTTGTTTGGTTATGCCGTGTACCGAA
ACGAGACTACCTAACAGTGTAAGAATGATGCATTGGGATTTTCCAGAAAA
AAACCGTGCACCCCCTATTGAGCAGTATATTTCCATTCTTAGGGGGTATG
GTTTGAAATGCAGTGGAATTCCATAGCAGTAGACAAAAGCCCGTCATAAA
TAAGTGGAATTCCATGGGGGTAATGAATGAAAATCTGTAAAAATTCGGAA
TTCCAGAGGGGTATGATCCTAAAATTGCCTGGAATTCCAAGGGGGTAATT
CACAAAAGGTTGGAGCTCCTCAACAGGGGGTGTTCGATGTTTTTCTGGAA
AAGCCCATTTTTGAACATTTTGAAAATAGACCTTTTTGACCGTAGTCGCG
CGGGCATTTTTTCGTCCGCTTTATCCCACTAAAACCGTCCAAACTCTTTT
TTGACGCATTCTTATAATGTCTTTTGGTGCGAAAAAAGGACTGGGACGGT
TTTAATGGGATAAAGCGGACAAAAAAATGCCCACGCAGCAATTGGTGGCT
ACGGTCGAAAAGATGTATAGACCCTGGTGAAAGGAGGCGGTAACTTCAAT
TTATTATTGTACGGGAGGCAGTAGGAGGCGCAGCCATCAAGGTTTGCACG
GATGGGAAAATTTTAAGCATTTACTGATGGGCTATTGTTGAATGCGTTAT
CAATACTTTCTGTATTTTGTATCTCTCTTTGTCAGTCGGAGCCACTTCAT
AGAAATGGCAACTATTGCCTTAACGGGAAGTATTTCCCGAAGGGGGAGGT
GAAAAACTTTCCGAAATGGATAGAGTTTCTGAATTAGGAAGTTAACCAGT
TTTCCGATCGGGAATGTGACCTCTGCGCACTCCGGAAATGGTTGGTGGGT
AAATAACTGATGCCTATTGTAAAAGAGGGTAAATAAATACCTTTCACCAG
GTAGTTAAGAAATCCACCGGGTGATCGCTTCTTAATTCTACTTTCCCCAT
TCCCAATTAAAAACTTTCCTATTTGGAAGCTTCTTCTCGATCGGGAAACA
AAAATCTGCTTTGTTTACAAAAATTCAACTTCCCGTTCGGAAACAATGAA
AAGTTCTTGACCAAGGCGGTGGTTACACGTAGCCGGGGTGAAATTCACCC
CGGGGTGAAATAGAAAAATAATTCACCCCGGGGTGAAAATCATTTTGGGA
TACACGTCAACGAAAGGCGGGGTGAAAACCCTTTTTTTCAGTCCGGGGTG
AAAATTTTAACTTATTTTCACCCCGGCGTGAAAACGTAAAGTCTGTTCAC
GATAAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTACCTATAACTTTTGAAGGAATTCT
TCAATCTTTATAAATTTGGTATCGTTAGAGAGATATTTGTGAGTGGAACA
ATTTGAAATAAAAAAATCTTTAAAAAAATTCTAAAAATGAAGATGAAAAT
AAAGAAGATGAAGATCTTGTAGAAAATTGCTATAACTTTCTTATTGCCGA
CCCAAAAAAATATCAGCGTTTTGATTGGTCGAGAGCATCGAGATATTTGC
GATATTTCATATTTCTTTAGTCTGGAAATATGACCGCGTTGACTTTGGGG
GACTGGGTAAGCGGCGGGAGAAAAATCAAAACAAAACAGGACTTGGCTGG
GAATCAAAGGGAAAAACGCAACAAAAATATGTTCAGATTAACTTTTACTT
TGGAGTTCTTCCATAAAAGACACTAAAATCAAATCTGATGAACAAAGAAT
TAATTATAAAACTACTTGACCCGACCCAAATATTTTCAACTTTTGGCAAA
TTTGTCCGTGTGATAACCAAACAGTTTTTATCAATGCATACAAAAAAACT
TGAGATTCTTCAATATTTGTCAATAAAATTTCTCATAACATAACAAGGAA
AGTGTAATGTCTTGTATTAAACCAAATGACGAGTGATTTTTATAAAAGTT
CTCTCCTAATTCTCGTTCTCCACAACAACGTACGTCATTGACTTTTCAAC
TCAACAATCATTACAGTACATCTTTCTTCTAAAATTCGAAACATTAAGAG
CTTGACGATAATCAAGAAAGCATCCAAATTGTTTTGCTGTTGAAAAAATG
TTGTTCTTTAACCATTATTACAAGCATACATTTCCATCGTGGGACTTCCT
TTCCTCTGCTATTCTTTCCCATGGCCATGTCATCGAGACAAAAACATAGA
AAAAGACTGAATGTTATCAATCTGATTAATCCAATGATGGAGGGTTTTCT
CTCTATCGAAACAATACTGTACGTCATCTGCATTTTGAATTATCAATCTA
GAAACTTTCAAATACATTTCTGAAAAATCTGCAACTCTTCAAAACAAAAC
TTCTGGATCGAAGATGATCGAAAAATGTTTCTCTATTTTGTTTTTGTGTG
AACATTTTCAGCGGGAAGTTATCGAATGTTTTTGTTCGAATCTAACGTTC
GAATTAGATTTTCGAATAAAAACATTCGAATCTACACAGAAGCAGAAGAA
GGCGGAAGTAATTTTTGAAACAAAAAGAGGACAATTTTTTTGAGTCGACA
ATAAATTAGTTATCACATGACTTCTCGTGCAATACTCAATATTTTACTCG
TTCCGAGATTTTACCGATATTTTTCCTCGCCTAAAGGCTCGGAAAAATAT
TACGGAAAAATCTCGGAACTCGTAAAATATTTCTCGTATTGCACTCGAAG
TCATGCGATAACTAGTACATATTCACTGGAGAGATTGTTTGATCTTAGGA
GGTCATCACTGTGAAGAAATTTCACTAAAATATTTATTCAATATAAAGTT
ATGATGCAAAGTTAATAAGTGATTGACCTCAAAAAACAATAGAAAACAGC
AGAAAACAAAGTTTTTAGACGTCAATCAGCTTATAACTTTGTTTGATATC
TTTTGACTGAATGATTATTTTGAGAAAATTTTCCACAGTGATGATCAAGG
ATTCACTTCAGTGAAAATCATAGTTACAGCACTTTTCTACAAGATCTTCA
TTTTTTTCTTTTTCATTTTCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTAAAGATT
TTTTTATTTTAAATTTTTTCCACTCACTGATATCTTTCTAATGATACCAA
ATTTATAAAGATTGAAGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAA
AGAGTGCACACTTATCGTGAACAGACTTTAATCGTGCATAATTTTTAGAT
TCAACCCGGGGTGAAAAAGAAATTGTGTATACATGTAAAAATCTGCAAAA
ATTTGCAAAAAAAATCCTCAAAAAGATTTTCACTCCGGTCCTCAGGACCG
GGGTGAAATCAACCCCGGGGTGAGTTCTACCCGCCTAAAAACGATTTCAC
CCCGCCTAAATACGTGTATACAGAAACAGTGTTTTCTTTATAGACCGGAG
TGAATTTCACCCCGGGGTGAAATATTTTTTTATTTCACCCCGGGGTGAAT
TTCACCCCGGCTACGTGTAACCACCGCCAGACGGGAAACAGAAAAGTTAT
GAAATTTTCAATCTGGAAACAGTTTCCTTTTGGGTTGTTTTCACCTTCCC
GTTCGGAAAATATTTCTCGTTAAAGCATAAGTTGCCACTTCTATGAAGTG
GCTCCAACTGTTTGTTGTGTTATCTTTTCACTGGGACAGATTGGACTATG
TCACTGATGCAATATTGTTTGAAAATTACTCAGCACAAAAAATAGGCAGA
CACGGTCCTGATATGAAATATGTGACTGATATGAAATGGGGACACTTAAA
CAAAAATAAAACCAAACTTCTGACTTGTTAATTTCAGATACCAGACAGTG
GAGAACACGACCCCGTTAACATTAGCTGGTGGACTTCAACCTGTTCTTGG
GATTGACTTATGGGAGCACGCGTACTGGATCAAACACCCAAACAGAAGGT
GATTCATTAACCTGTACCAACTTTCTAGGATCCACTGACCCATACATACC
TGGACCAATTTTCTATATCCCAGCCAGGGAAAACCTTTTGATTTGATGAG
TTTTTTTAACCCTAATGGTAGCACTATTCGATAGTGGTGCAAACCAAATG
CGTCCAGGGTGCTAGATCTACTTTTGGTGATATAGCACCGTTAGATCTTA
ATATTTTAACACTGTAATGGCTTTTTTTCGGGTGCCGCTTTTAAAAAAAA
TTGAGGATGGTCCAGGGTGTAAAAATTTCAGTGCTTGCATCGGTTCAAGA
AAATTAACGATAACTAAATTGACCTCGCGTTTGTATGTAGACTATGCTAT
AGTCTAAGACAAATCACTATCTAAGAAATAAGATCAAAGTCGAAGATAAT
TCGCAAACGGGCTTTTTTGCCTAAAAGAGTTTACCAGTCTTCGAAACTCC
ACAGCTGTATTTTCTCCCGTATACAGCCATTGCACCATACGGCCATATTT
TCCTGCCTTTACTATGATTGTAACGGACGATAACATCATCTAGTTTGTAT
ACTACAGTTTTATGTATTAGCTACAGTTTTATGTATCTTGAGTTTTACAG
ACTGTTCACAACCCAGTTGGCACACAACATTGTTTCAACGTCCATGTGAT
ATTCACAACGTCCAAATAACATTGTATGAACGTTAGAACAACGTTATGTG
CCAGCTGGGAAAAAAATTATTCAAATCTCTTTAAATAAATTTCAAGGTTT
TAGCCCCTTCTTCACAATTCTAGGTACAGTAAAACCTCAAACTAGCGGAC
ACTCTAAAAGGCGGACACCTCTGATTAACGGACAAAATATTTTTCCCCGG
CTTTTTCCTAGTTCAAATCCTTATGAAAATGTCTCCAAAAGGCAGACACT
CAATTAGCGGTCAACTCTATTTAGCGGACAAACATTTTTGCACGGAATGT
TCAAAAACCTGTTTTTTCCCTCCAATTAGCGGACACCGAGGAAAACACAA
TTTCAGACATTAAGATACAAGTAATAAGTGATTTTAAACCATTTATTTCA
AGCATATTTTTGTTTGTTTTTTCCAAATTTTGTTTACAAAGATTCAGTTT
TTCCTTTACCCAGTTGACAAGTTTTCCTGGGCCAGTAAAATAGTAAATAA
CTGACACTTCAAGTCCAAACAGACTTGAGGTTGTTAAAATCAACAACAAA
AAACAAAAAACAATCAAGCATTTTTTTAGATAATGGAAGTAACGATTACA
GCTCTTCAAGCTCTTTCTCAACCCTGAAGTTGACTTTGCTATTTTTAGTA
TAATTTTTAGACTTTTCTATAACGATTGAAAAAAAGTAGTTTGCCGGTGT
TTAAATAACTTTTCTCGAGTCTTTTCATGTTCCTATGTCTTTAGGGAAAT
GCTTAAAACCATAATTTCATGATCGCGACCCCCTAAGTACGGTTTAATTT
TGAAATTTGAGCCTGAAACTCAAAACCCTCCAAAAGGCAGACACCTCTAA
TTAGCGGACACTAATCCGATTCCCCCAATGGTGTCCGCTAATCAGAGGTT
TCACTGTATTCCCCTCTTATATGATGGATCAAGAATATGTAGAGAAGTTC
AGTGGCACTCTCCTCTACTTTCTCGTCGACTGCGGTCAAGAACTTACTCA
CTTTTTACGCAATCAAATAAATCTTTATGTACATTTTCTCTATATAGAGA
TGACTACTACAAAGCGTGGTGGTCAACTATTGATTGGAATAAAGTTGAAC
AACTCTACCAATGGTGGAAGAATATGGAACCACGTGATGAACTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:718341..726637- >XLOC_044489 ID=XLOC_044489|Name=XLOC_044489|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1548bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:718341..726637- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTAAACCCTGTCTCACGTGTAGTATTTCTACTTCTGCTTAACGT
TGTCTTCACATATGGCATGCCACCGATGTATGAGGGAATCCAGCATTTTT
CTGAGCATTATAATTTGCCACCGCTGCCATTCAAATTTGGAAGCATGGAA
CCACAATTTGATGCACCGACAATGAAAATCCATTACATTGAAGTTCATTC
AAATTTCACTAAAAATATGAATAGGTTACTAAAAGATTGGCGAAAAAAGA
TGAAATTAAACCCTGTCTCACGTGTAGTATTTCTACTTCTGCTTAACGTT
GTCTTCACATATGGCATGCCACCGATGTATGAGGGAATCCAGCATTTTTC
TGAGCATTATAATTTGCCACCGCTGCCATTCAAATTTGGAAGCATGGAAC
CACAATTTGATGCACCGACAATGAAAATCCATTACATTGAAGTTCATTCA
AATTTCACTAAAAATATGAATAGGTTACTAAAAGATTGGCGAAAAAAGGA
CAAAGACAATCCGTTAACAAAGAAGTCGTTATTGGACGTCATTCGAAACA
TTGCTCAAGTTCCTCATCAAATGAAATATGACCTGGAACAACAAATAGGA
GGGACAAAGACAATCCGTTAACAAAGAAGTCGTTATTGGACGTCATTCGA
AACATTGCTCAAGTTCCTCATCAAATGAAATATGACCTGGAACAACAAAT
AGGAGGTCACTTGAACCATCTGTTCTACTTTGCTACACTTCGAGCGAACC
CAAAGAACGAAACAATGGAAATACCGAAAAAATTACAAAGAGCTTTCAAA
CGATCTTTTGTCAATATGACTTTATTTGAGACACAATTTAAAGAATCGAT
AGATAAAGTATCGAGTGTCGGTTTTGTTTGGTTATGCCGTGTACCGAAAC
GAGACTACCTAACAGTTCACTTGAACCATCTGTTCTACTTTGCTACACTT
CGAGCGAACCCAAAGAACGAAACAATGGAAATACCGAAAAAATTACAAAG
AGCTTTCAAACGATCTTTTGTCAATATGACTTTATTTGAGACACAATTTA
AAGAATCGATAGATAAAGTATCGAGTGTCGGTTTTGTTTGGTTATGCCGT
GTACCGAAACGAGACTACCTAACAGTATACCAGACAGTGGAGAACACGAC
CCCGTTAACATTAGCTGGTGGACTTCAACCTGTTCTTGGGATTGACTTAT
GGGAGCACGCGTACTGGATCAAACACCCAAACAGAAGATACCAGACAGTG
GAGAACACGACCCCGTTAACATTAGCTGGTGGACTTCAACCTGTTCTTGG
GATTGACTTATGGGAGCACGCGTACTGGATCAAACACCCAAACAGAAGAG
ATGACTACTACAAAGCGTGGTGGTCAACTATTGATTGGAATAAAGTTGAA
CAACTCTACCAATGGTGGAAGAATATGGAACCACGTGATGAACTATAAAG
ATGACTACTACAAAGCGTGGTGGTCAACTATTGATTGGAATAAAGTTGAA
CAACTCTACCAATGGTGGAAGAATATGGAACCACGTGATGAACTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:718341..726637 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 676-774:100 |
| Aaloc | 565-672:1910 |
| Aaloc | 355-561:5839 |
| Aaloc | 250-351:7289 |
| Aaloc | 1-249:8298 |
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