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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000250_pilon:162492..169006+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044385 ID=XLOC_044385|Name=XLOC_044385|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6515bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:162492..169006+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGACAGGAAAGATTTCTGGACATTGTCGTAACCATGCTGGTTGCCA
TGGATTACTTGCTGTTAGtttcgttacattttttacatatgttttatatt
attcatatatttttaAAGGCGTAGTGGTGTGGTGGTCATCGCTTTCGACT
CCCATCTTAGAGGACCTGACTTCGATTCCCATCATATGCTACTACGATCC
ATTTtgcaagtgaatataccttcgTCGAGACCAAACCCACTATTCCATTT
GAGTGGAATCGGGTGCCACTACCCTAATATACCGAGTGTACCGGGTGTGC
CAGAAAAAAGTCCCCatctttgaaatgaattttatcgAGTTCTATAAACT
GTTAAAGAATCAATCCTTTTGCATTagaaagaggaaggataaacttaagg
GGTCGATTGCCAACTTTGGTcacctagatcaaaagttatagtctaaatgc
taaaacattacttttcaaaaaatatcgaaaaaaggcgaaaaatgcaaaaG
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TAAGGGGAtttttttCTGGGACATCTCCGCGGTAAGAGTATGGTTATAGA
TGTTGCAGGCGTTGTGACACTCGCTACATATTCAGGTGAAGAACACTGTT
CTCCCAGTGCTGTTCGAGTGTCAGGGTATACGCCATGAATCGACAGCTCG
CATGTTTCAATGGCTATCTGCACAGAGATTCATTCCCCCGCTCCCCGGTG
GTTAGAATCCATTCTGTAGGGCATGAAATCATTTCAATATCTCTTTTTCG
TACTTTGATTTCTGCAGTGAACTTTAACCAATAATAAAACTGGTGGCGAA
CCTACGGTGAATTTTCAGGTGTTCCGTATAAAATCTTATAACGATAACTC
TCTTATAAATTCCTAGCAAGAATACTTTGGTATTAGCCTTTAGattgaaa
ataagtttgaaaGATGAGTGCCCAATAGTCCTGATCCTTTCCAATCTTTA
ATGTTGAATTCGACCAAAGCCACTGATCAACCGTTGGCGGGGGGTCAGAT
CAACCGTTgggggggTCATCGATAATCTGGTCTTATAATCGATAATAAAT
TTAGAAAGAATCTATGGTTCACACCCCTATTCTTTTATTTAGGAATTTTA
TTTCAAGTGTGAGTCACGACACGCTGGGAACACGTTGGTCACACCTTTGA
CACTGCTAAGGACGAACACTTTAGATGTACCTTGTCTTGCATGTACAGAT
GTTTGGTAAGATTGATCAACTTTCGTCTTATGCCCGAGTTACCAGGTTTG
CGAAATGATGGCAGGTGccgcccgatttttgaaaatcagaaatcTTAAGG
GGGGTCTAAAATCCTGGAAAAGAccgaaatgtaaaaaaaacgtaaaaatt
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TTTAAGGATAAATATTGtagtttttgtaacccttagggGGTACCGAGATT
AGATTTTGTGACCTTTGAGGGACTTTGAAGGCCTAAATAAGGCACCCTAA
AGagtggcacatacccgtaccctccatttgcctaattATcccccccccGG
GTCTAATGTTGATTTTTACGTCTACTTTATACTTGAATTTTATTTGAATC
CGCTTGATTTCTTGAATCATCTTTTAATGTTGTTATGTTTCTATGGTTAC
GCGTTTTCTACTCCAACGTAGACTTGTAGGGGAAAATAGCCTTACTTCCT
GAAAACAAATAAGGAGTTCAAAATAAAAGAGTAAAAATTTCACCGTTCTC
ACAACATGCTGtgcttatttttattttcaatttccagCGAGATTGTATTG
GTTTTCCCATGCGAAGAAACGCACGTCATTTGTGTGGAATGTTTTGCCAG
ATACGTCGATACCAATTTGAACAGGCGACAATTCATTCTGTCGGAAAGAA
TTGGATACACCTTGGCTTGCCCTGGTCTTGGAGGTAAGTAAAAAGTAAGG
TTGTTCAAATGAGTGATTTAATTCTataacatccccttctcacagactta
CTTACCCCTTCCCACaagaaaaattagccaaaatatcatccccagtTGAA
AATTATACCCTTTTCTTGCCCGTGGAAAATAATCAGAtattctcactgca
aaatattgtgctatttttttttgcccaaaaacgatgtaattcaaataaaa
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taccgggtctgtgagaagggggtgtattccATTTGTCAGTTTTAGTGTTT
CTTTACTTTTATCGGCTCaatactttttctaaattttattttcaatcgtG
TGGTTTAGCGTGGATTTCCTTTAGAAAGTTAGTTTTAAATAAGCTGAAAA
TGACCATAAAGATGGTGATTTTCACCGAATATAGTATGTTTGGATTTTGT
TTTTGTCGAAAACATCAATTTCGCATCAGTTGTAATTTCATGAAAAGGCA
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GATTACTAATTGGCTAGTTGATAATGTAAATACTTTCACCTATTTCAGAT
GGTTGCGAAGAAAGTTATATACAAGATATTCATCATTTTCTTTTGGCCGG
TAAAAACCAGGTGAGGCCTAAAACTCTTCCTCCATGTTAAAATACAGTCT
GTACCGTGGCGTACTGAAAAAAGTGGACACGTTTTTATAATTTATGCGAA
GTTTTATGATTTGTATTATTAAATATTCCAATCTTAAAAAACTTTATTCA
ATCATATTTGGAATTGAATATCTCTTGGTTGAACAGATAATCttaatctt
atttcaatcaTTCAGCCcagttactcttaggtgccgaATAAAACGGGGTg
gggttgaaaattttcaaaattttaataaaccaTAGTCACAAGAAGAGTCT
CtatgaataaacgggggggttggaaattatcGCTTCACATATTTCACTTA
CACCTACATAATTATAGTAAAGATAATTTATATTTGATATTTGCTATTTG
ATGataaatttctgaattttaataaacggggggttggaaaatgttcgaaa
aattaacaagtggggggggtgtttatttggcacctaagagtaagataatg
agttttttcaaaaatgtgaatttttttgttgaaattcaaaacttcaaatt
CGCATAAAAGCTTTTAGCTTGAGACTTAGACAATGGTTTTAGTgctattc
caaaaatattttataatatttctaaaagcattcggttAATGGCCGTTTGA
TTCAAGTGGTCAAAGAGTTATATCCTTAAGTCTGGGACTTGGTATATTGG
CCACTTTTGAACGTATAATACATGTCATTCGGGTTTGAAGGGTTGAAAAG
GCAAAAGGTCTCTATACAGAGGACCACCTCTTTGATattaacaccccctt
ctcacagacccactgggacctcttcccactgaaaaaattagccagaatat
cgtccccagtgaaaaatatactcaaatttttgcccatgctgaaaataatc
agataagcaaatcctcactgcaaaatattgtgcaaTTTTTTCAACCCCTG
ATGAACTTTtgggctcgaaaacaatggaattaaaatccccagccatcaaa
acaatgaaaatatcaatcaCCATTgagtccattatttttatctccactgg
ctgaaaagatcctaccgggtctgtgagaagggggtgtatattAGGATGGT
CCTAATTGGacgcaaaatatttcaatttgatcatttaaaattatattcaa
cttatattgtttttcaaaaatcatttataTTATACAGTACGAGCGATTTA
AGAACTTTGCAACGGAAGAATTTGTGTTACAGAACGGTGGTATTTTATGT
CCTGGTGAAAATTGTGGTAATGGATTGATGTTGGATGATGATTCAAGGAG
AATTGTGTGTTATCGAGGTAGAGGTGGCTGTGGAGTAAGGTTATATTTTC
CATTTGTTaactcttaactttttcaggGCGACGAAAACcgaaaaaatcaa
agtttttgaaagctCCAACTTCAGATGCAATTATCTCAGCTTTGGAGCAA
TCTAAATATAGGTCATGTTTGagttcgttggaaagctctttttatgCTCT
AtttttttAGCGTGCTAGATTTTTAAATAAGGTCCTCaaaaaaaTTCGAA
CGGAATTAGCTGGGGCCGTCCTGAAAGAGTTAATTGTGGAATAAATTATC
CAACGTATAGACCTTTCTAATATTTTACACTTTGTCACCTCgaataaaaa
gaaattatttttctaaacaGATATGTAGTCGATTTTTGTAGGCGCACTTC
ATATCAATTGGGGAAATACTTTTGAAAgaatccaataaaaacaataagcT
TTATTTTTCGATCTGGAATTATTGATTATTGGAAATAAttctaaatttgt
tctttttttagcTGGTATTTTGTCGGCAATGTCGAAACCAATACCACGAT
GGTGAATGTAGGGCTAATATTCAAGAACGAGCACAAGCTACAAACGAGGT
AAATAGTCGAGCagacaaactttttttataagaataacttctataagaat
atcatggTGAGATTTCggagttagaacaataggccttttgtttagaacaa
tagaaaaacaagaataatgctcacccctAGTCAAAGTACACTtgttctca
ttaaaaaaagcaTGTACCGTTCTTTACTAATGACAAGATTGAATGTATTT
CACGTCTATCACTCGTTCTATAGCCTGTGAAATTTTCGCAGAAACCGGGT
CTGTTTAAGaaaaactacagttgacgcCCTTATccgacattctactattc
gataggctcccttattcgatgaaaatccgattccccttgaagatcgaatt
agagagcgtcaactgtattcttGTTATTTGTCTATTTTCGAAAACACCTG
CCAATCCTTTAATAAAATGTGAAGAGAATGTTTAAGAGTTTCTCAGGAAA
GATTGACGCTAAATTTCCGTGCCTTTGAAAATATCAATGCAAGGGCTTCA
GTCATTTGGCCTTAATTATGGCGTTAAATCTACATTTTGAAGGAAATGGC
TTCAATCCTTACTGGTAAAGCATAACCCAGTCTCCTCATGTTTCAAGGGT
TGAAAGCACGAACTTCATAGTTGTACAGTTGTACAGTCTCttcaactcga
atgtctcctaaacttgaacaagttttctttACCCTTCTTTGAACAATGCC
TATCCCATAACTCGAACGAATTTGTGTTCCCGTttgggttcgagttatgg
agactccattgGATTTCTATACAAGCCTATATTGttatttcatgattttc
agTCTTATCAAATCGATCGAAACCAAGCACAACAAGCACGTTGGTTAGAA
GAGGCTCACACTTCGGCTGCTATCGACCGATTCACAAAACGATGTCCTGG
ATGTAGTACACCAACTGAAAAAAGCGGTAAGCTATCAGCTACTAAATTTA
TTTCTTATCTTTTGACCGTAACTGCACCATCAACACTAAAACAGCgacat
aattttttgtcttATTTGCCTCTAGAGACGTCAAGTACCgcacatatttt
tttataagcaaccaggttgctaaggctcAAGGACTCAAACTATAGCCGgg
tctttttcaatttctccGAAAGCTTTCTAAGTAATCTAAAGATGGCGAAC
GAAAGCCCTTGACCTAATAAGCAAAAATAttgtataatatcaggggtgat
caaatcaaatttttcaaataacaaaacatggaaaaaaatgagtaatACTG
ACACACCGTCAATAGGCAAGGGTTCCCTTTTTACATTCTCGCTTCTTCTA
TGTTTTCTGTTACTCTTggatacctaatagccggggtttggaataagcga
gttggttggaaaaattctcaaaacttgatAAGCTGGGTGGATTTGGAGTa
aaaaaaGTTCTGGGTGGAGAATCTTTGAAACGGAGGccaatacagcagaa
ttagggtaATAGAGtcaaagagggaactttcaaaaacattttcccaaaaa
ttaataaccggtggggtttggaataagaatgtcctgggtggaaaattctc
gaaaaattaattattagcGGAGGaacgcttattaggtacccgagagtctA
TAGAGATAACTAGGACGCTATTTCTTTTCGACCTACGATACTGCTTCAAC
AATTCAACTCTGCTGGATTTAAAGTGAACTGTCagttcatgatatgcacc
attacaatttcttctaacattacattacgggcccaacagctgattggttg
caagtgacgtattgactgattttacgtcacttacaaccaattcTCTTGTG
TGATGTCAAAGacatgcatatcatgaatacaataaaatatcaaatttatg
tttaatttttctGACAGGTGGTTGTAACCACATGACATGTACACGATGTC
GTTACGAGTGGTGTTGGTTGTGTCTTATCAAATGGGGACGAAATTGTGAA
TCTGATCATTGGTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000250_pilon:162492..169006+ >XLOC_044385 ID=XLOC_044385|Name=XLOC_044385|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1680bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:162492..169006+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGACAGGAAAGATTTCTGGACATTGTCGTAACCATGCTGGTTGCCA
TGGATTACTTGCTATGATGACAGGAAAGATTTCTGGACATTGTCGTAACC
ATGCTGGTTGCCATGGATTACTTGCTGAATTTTATTTCAAGTGTGAGTCA
CGACACGCTGGGAACACGTTGGTCACACCTTTGACACTGCTAAGGACGAA
CACTTTAGATGTACCTTGTCTTGCATGTACAGATGTTTGGAATTTTATTT
CAAGTGTGAGTCACGACACGCTGGGAACACGTTGGTCACACCTTTGACAC
TGCTAAGGACGAACACTTTAGATGTACCTTGTCTTGCATGTACAGATGTT
TGCGAGATTGTATTGGTTTTCCCATGCGAAGAAACGCACGTCATTTGTGT
GGAATGTTTTGCCAGATACGTCGATACCAATTTGAACAGGCGACAATTCA
TTCTGTCGGAAAGAATTGGATACACCTTGGCTTGCCCTGGTCTTGGAGCG
AGATTGTATTGGTTTTCCCATGCGAAGAAACGCACGTCATTTGTGTGGAA
TGTTTTGCCAGATACGTCGATACCAATTTGAACAGGCGACAATTCATTCT
GTCGGAAAGAATTGGATACACCTTGGCTTGCCCTGGTCTTGGAGATGGTT
GCGAAGAAAGTTATATACAAGATATTCATCATTTTCTTTTGGCCGGTAAA
AACCAGATGGTTGCGAAGAAAGTTATATACAAGATATTCATCATTTTCTT
TTGGCCGGTAAAAACCAGTACGAGCGATTTAAGAACTTTGCAACGGAAGA
ATTTGTGTTACAGAACGGTGGTATTTTATGTCCTGGTGAAAATTGTGGTA
ATGGATTGATGTTGGATGATGATTCAAGGAGAATTGTGTGTTATCGAGGT
AGAGGTGGCTGTGGATACGAGCGATTTAAGAACTTTGCAACGGAAGAATT
TGTGTTACAGAACGGTGGTATTTTATGTCCTGGTGAAAATTGTGGTAATG
GATTGATGTTGGATGATGATTCAAGGAGAATTGTGTGTTATCGAGGTAGA
GGTGGCTGTGGAcTGGTATTTTGTCGGCAATGTCGAAACCAATACCACGA
TGGTGAATGTAGGGCTAATATTCAAGAACGAGCACAAGCTACAAACGAGc
TGGTATTTTGTCGGCAATGTCGAAACCAATACCACGATGGTGAATGTAGG
GCTAATATTCAAGAACGAGCACAAGCTACAAACGAGTCTTATCAAATCGA
TCGAAACCAAGCACAACAAGCACGTTGGTTAGAAGAGGCTCACACTTCGG
CTGCTATCGACCGATTCACAAAACGATGTCCTGGATGTAGTACACCAACT
GAAAAAAGCGTCTTATCAAATCGATCGAAACCAAGCACAACAAGCACGTT
GGTTAGAAGAGGCTCACACTTCGGCTGCTATCGACCGATTCACAAAACGA
TGTCCTGGATGTAGTACACCAACTGAAAAAAGCGGTGGTTGTAACCACAT
GACATGTACACGATGTCGTTACGAGTGGTGTTGGTTGTGTCTTATCAAAT
GGGGACGAAATTGTGAATCTGATCATTGGTTTGTGGTTGTAACCACATGA
CATGTACACGATGTCGTTACGAGTGGTGTTGGTTGTGTCTTATCAAATGG
GGACGAAATTGTGAATCTGATCATTGGTTT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000250_pilon | genome | sc0000250_pilon:162492..169006 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 745-840:6420 |
| Aaloc | 619-741:5353 |
| Aaloc | 532-618:4462 |
| Aaloc | 385-531:3838 |
| Aaloc | 325-384:2601 |
| Aaloc | 178-321:1839 |
| Aaloc | 64-174:1143 |
| Aaloc | 1-63:1 |
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