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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000020_pilon:818841..825055+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044350 ID=XLOC_044350|Name=XLOC_044350|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6215bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:818841..825055+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCAAAAGAAGAGGCTTCAGTTGTCCAGTGTGTGATTCCCTTTATGA
AGAAAATGAACTAGAAGAACATGTTCAAAGTCACTTCAATGATAACCACA
GATGGAATGAAGTTGGTAATTGTCCtatacattttgttttgttatttaca
aaatttacaagTTTTACATTTCTAGGACGAAAGATTTGAATGATGAATAT
GATAATCCTCTTTAATGTACCTTTTATCTTTACACACATTAATTTTGGTT
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AGATTAAATTAGacaaaaataagttaaaaattGCGCTGTAGGTCCACCTC
CATGTGTATTACAGCCAAATTGTACATTTTAGAGGTTTTCTTTTAACAGT
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TGTCTTGAAGATCACTTACTTGCACATGAGTTTGGAGAAAAAGCTGACTC
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TTAGATTCTTTGCTGGCAGCTGCATTGCAGGAAGAAGAAACTAATGACTT
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acttacaaaaacaagcagagaaagagcttgaggaaaaagaattcaaaaaa
ttacaGGTTTAGAAAAGTTATCCAGTGTTGCCTGTAACCTGTTGCTACAC
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aaaattaaccatctgaggaaaatagtcttCCCGTGTAAAATTCTACAGTA
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CATGGAccttaagaaaatgagattgcATCTAAAAAAGTATGAACTTTCAA
TGCATCCTTATCCTTGGAATTCTTATccagtttgttttcttttttcgttt
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AATGAAAAGATGGGTAAACAAGTTGGAAGGAATGTTTCAATTGGAGATTA
CTTTCAGAAGAAAGCAAACATGATGTGTTCAATGATGACTGGAGAAGATA
CTAATGAAACAAGAACTACTGGTATTTTAATGATACCCCACaaaattttg
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CtgacttttttcattcaatatttGGTTTGTttaaaatcgaacaaaattct
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CTCTGACACAAATCATTATGCAGCTGATGTATCAGATAATGGTTGGGGCT
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ATGAATATATTATGTTCCCCCAAAACTTTAACCTTGTTAAAAATTGGTAT
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AGTccgtccagatataattggcagtggaaacaagaatgcctgtaactttt
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ggttagaTTTGCGAttacaaaaattgagctttttttctacttatgcttta
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Gaagtgttaagtgttggtgcattggtattattggtatcattgattatttc
gaaacaaagtgaaatcacagtataattgtttttattgaaaagataagcat
gaacttatattgcctttgttatttttggacctaccccggtggagtggagg
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agacatgaaattttggttgcttggcgttttcttatagaaaaactgaccaa
attcgatatttttttataatcacattatcaattacttaggtattagcttt
tctcgagattggctctttcatcctttatgattttttgcacaaatatgcat
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tttggctaaatttgggccaaaaaatggctaaaaacgggttttttggactt
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tgttaagtcattaaagaactttgctaattcccaaaacactaaacacagtt
tggctatgaggtcattaaacgagatcgtaaaatgtgttatgatcgacaaa
ctgttttatcatatcactacccccgtttttagtaataagttggagatttg
atatttcacagaaaaatgCTACCAAGGAGTATTTcaggtcccatatcttc
cgaaggacttttcggttcgccttgaaatttaacaaacttcttaacctaag
gttgaactaccactggtgtaaaaataaacgttatagcataagtagaaaaa
aagctcaatttttgcaatcgcaaatttaaccgctaaaaatcgcgaatctt
tcaacaaaaaatacattcaaatatagcgcttttgattctctgaaacaaac
aaaaaaaattccataattatatttgtctatcaaaagttacaggcattctt
gtttccactgccaattatatctggacagactttaattaaaatggttgatt
taatttttaatctgtccattgaaatatttgaatgcACACACAGCATGGCT
TCAGATATCACACAACATTGTGTCATTCACTTGaaattgcatttttcaaa
tattacacTACGAAATTGTATtctaaatttttatcattttaggaTTTGAT
CAAAGTGGCAAAGAACAGTTGGGTGGTAAGTTatccaaaacaaagaaatg
gatCGGTACAACTGAAGTTGCTGCATTGTTTCGGTGGATGAATATAAGGT
TAGATGATAAAAGGTTGTTGTGAACAATTTTTGTGTGCTGCTAAAAATAA
ACCGATACTTAGTGAATGAATTTAGTGTTCTCgggaaattttcatgaaac
atGCCTTTAGCTGTTTGACAAAAGTAATCAAACTGTTACTTACTATTTCC
TTCTCTTTAAGAGCGCGGATTGTGGACTTTCACAAGTCTCAAAACAACTT
GCATCCTCTGATGTTTCAATGGGTTAAAGATTACTTTACACAAAACTCTG
ATGAACAAATACCACCATTGTACATCCAACATCAAGGTTAATGTTTCTTA
CAGGAAAAGATTTTCCATTTGTTAAATGAATCTCTACAATAAGGCTCAAG
GCTCAATGCCTTGTATTTTAGAGCGCTGCATGATTTAGTCTCAGACTCGt
gaatatttcaatattttgaatcgattttaaaaCTCGTTTAACAGCAGTTT
GCCCTTAACCACGAAGGTTAGGGTTATaacgattttaccaaaataaatGC
GTGTAATTTGTCTTATATCTTCAGCTAACTAACGCAACTGCTTGACTGCT
TTTTACCTACTTTTAGGCCACAGTAGAACAATTATTGGTCTGGAGGAATA
TTCTGGATCAGCAGAAAACCAACTCTTAATATTCGATCCGTCTAGCCATA
AAATGCAATTAATAAAAAGCATTAAACCACCTTACACCAAAATACAAACA
AAAGCTTTGAGGAAATCCTTACACCAAATGAAGTATAAACAATTTCAACT
TGTTTTCATTGATGGTGTTTATAAATCAGAATGTGATAGAAATGTAAGTA
GAATTGTTCAGTTTTTCATAAGCTTGAGTATGAATTGCAAATAGCATATT
TCACTTCTTTTGTCTTTCTATACTTTATAGGGGTtattacttgttttttt
tattcaccACCTTATCAATATCAACAATCCAGTGTTGCAGATTGTTAAGA
AATTTTGCCCCAATAATAATCCCTGAAAAAACAAACTTAAATGAAAACCT
AATTTTAGATGTTTCGTATAGATTCAACAAAGCTGTGTTGTAGCGCTGTT
AATTTAATCTCTTCATATTTCAGGCAGGCAAGATTCTATCTTCAATCAGG
ATCCCACCGGATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:818841..825055+ >XLOC_044350 ID=XLOC_044350|Name=XLOC_044350|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2640bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:818841..825055+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCAAAAGAAGAGGCTTCAGTTGTCCAGTGTGTGATTCCCTTTATGA
AGAAAATGAACTAGAAGAACATGTTCAAAGTCACTTCAATGATAACCACA
GATGGAATGAAGTTGATGTCCAAAAGAAGAGGCTTCAGTTGTCCAGTGTG
TGATTCCCTTTATGAAGAAAATGAACTAGAAGAACATGTTCAAAGTCACT
TCAATGATAACCACAGATGGAATGAAGTTGAATATGAAGAAGTACAATGT
CAGTTTGATGGGTGTGGTTTGTTGGAATATGAAGAAGTACAATGTCAGTT
TGATGGGTGTGGTTTGTTGGttgATATGAAATGTCTTGAAGATCACTTAC
TTGCACATGAGTTTGGAGAAAAAGCTGACTCAAGCCCCATTAATGATGtt
gATATGAAATGTCTTGAAGATCACTTACTTGCACATGAGTTTGGAGAAAA
AGCTGACTCAAGCCCCATTAATGATGATTCTTTGCTGGCAGCTGCATTGC
AGGAAGAAGAAACTAATGACTTGACAAGAAAAAATGATAGACGCGCAGAA
AATGACATTCAGCTTGcaaaagacttacaaaaacaagcagagaaagagct
tgaggaaaaagaattcaaaaaattacaGATTCTTTGCTGGCAGCTGCATT
GCAGGAAGAAGAAACTAATGACTTGACAAGAAAAAATGATAGACGCGCAG
AAAATGACATTCAGCTTGcaaaagacttacaaaaacaagcagagaaagag
cttgaggaaaaagaattcaaaaaattacaGGAAAAATATGGAATGACTAG
TAATGGTGGTTACACTGAGCAATTCAATGAAAAGATGGGTAAACAAGTTG
GAAGGAATGTTTCAATTGGAGATTACTTTCAGAAGAAAGCAAACATGATG
TGTTCAATGATGACTGGAGAAGATACTAATGAAACAAGAACTACTGGAAA
AATATGGAATGACTAGTAATGGTGGTTACACTGAGCAATTCAATGAAAAG
ATGGGTAAACAAGTTGGAAGGAATGTTTCAATTGGAGATTACTTTCAGAA
GAAAGCAAACATGATGTGTTCAATGATGACTGGAGAAGATACTAATGAAA
CAAGAACTACTGGAACAATTACAGTATTAACAAATTACTATCAATCAGGA
AATATAAAGGGTATTTCACAAGTCCATTTAAGCTCTGACACAAATCATTA
TGCAGCTGATGTATCAGATAATGGTTGGGGCTGTGGTTATCGAAACACTC
AGATGCTTCTTTCCTCTCTCCTGTTAAATCCTTTATATAAAGATCACATA
GAACAAAAACTGGGCATGTTGACACTACCTTCGGTCCCAAAAATTCAATC
GTGTATAGAGGAAGCTTGGAAAGAAGGAACAATTACAGTATTAACAAATT
ACTATCAATCAGGAAATATAAAGGGTATTTCACAAGTCCATTTAAGCTCT
GACACAAATCATTATGCAGCTGATGTATCAGATAATGGTTGGGGCTGTGG
TTATCGAAACACTCAGATGCTTCTTTCCTCTCTCCTGTTAAATCCTTTAT
ATAAAGATCACATAGAACAAAAACTGGGCATGTTGACACTACCTTCGGTC
CCAAAAATTCAATCGTGTATAGAGGAAGCTTGGAAAGAAGgaTTTGATCA
AAGTGGCAAAGAACAGTTGGGTGGTAAGTTatccaaaacaaagaaatgga
tCGGTACAACTGAAGTTGCTGCATTGTTTCGGTGGATGAATATAAGgaTT
TGATCAAAGTGGCAAAGAACAGTTGGGTGGTAAGTTatccaaaacaaaga
aatggatCGGTACAACTGAAGTTGCTGCATTGTTTCGGTGGATGAATATA
AGAGCGCGGATTGTGGACTTTCACAAGTCTCAAAACAACTTGCATCCTCT
GATGTTTCAATGGGTTAAAGATTACTTTACACAAAACTCTGATGAACAAA
TACCACCATTGTACATCCAACATCAAGAGCGCGGATTGTGGACTTTCACA
AGTCTCAAAACAACTTGCATCCTCTGATGTTTCAATGGGTTAAAGATTAC
TTTACACAAAACTCTGATGAACAAATACCACCATTGTACATCCAACATCA
AGGCCACAGTAGAACAATTATTGGTCTGGAGGAATATTCTGGATCAGCAG
AAAACCAACTCTTAATATTCGATCCGTCTAGCCATAAAATGCAATTAATA
AAAAGCATTAAACCACCTTACACCAAAATACAAACAAAAGCTTTGAGGAA
ATCCTTACACCAAATGAAGTATAAACAATTTCAACTTGTTTTCATTGATG
GTGTTTATAAATCAGAATGTGATAGAAATGCCACAGTAGAACAATTATTG
GTCTGGAGGAATATTCTGGATCAGCAGAAAACCAACTCTTAATATTCGAT
CCGTCTAGCCATAAAATGCAATTAATAAAAAGCATTAAACCACCTTACAC
CAAAATACAAACAAAAGCTTTGAGGAAATCCTTACACCAAATGAAGTATA
AACAATTTCAACTTGTTTTCATTGATGGTGTTTATAAATCAGAATGTGAT
AGAAATGCAGGCAAGATTCTATCTTCAATCAGGATCCCACCGGATTAAGC
AGGCAAGATTCTATCTTCAATCAGGATCCCACCGGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000020_pilon | genome | sc0000020_pilon:818841..825055 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1279-1320:6174 |
| Aaloc | 1054-1278:5669 |
| Aaloc | 928-1050:5263 |
| Aaloc | 823-924:4995 |
| Aaloc | 559-819:2333 |
| Aaloc | 391-555:1456 |
| Aaloc | 241-390:957 |
| Aaloc | 163-237:692 |
| Aaloc | 118-159:433 |
| Aaloc | 1-114:1 |
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