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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000250_pilon:296573..302294- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044315 ID=XLOC_044315|Name=XLOC_044315|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5722bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:296573..302294- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGCTTTTATAAAAGTAGAAATTTATAAAAAAGAAAAGGAAGATTTGTC
GAAGACCAAAATAATAATGGATGTAAACATATCAGAAAATGTCCTTGAAA
AATTAAGTAATCTTTACAAGTTGAAAAAGGTACAATTGATTGATTTTTAA
ATTTTCTTCATGAATTGTAGTCTGTTCCAAAAAGATTGGCAGTCTGTACT
TTTTTAAACAACTTTTGCTTATCCAAATACACTTTTGAAATTAAAGCTTT
AGGAAATTATGAAATAAGAATTGTTAATTGACTACCCGGTGTGCCACAAA
AAAGTTTCTCTCTTTAATTTTTAACGTTTTCGAGCACTTTCTGAAAGTAA
CTATTTTATTCAATTGAGCATAACTTTTGATCTAATGAATCGAATTTATT
AAATGACCCATCAAAATTTAAGTCTGTCTTTCTTCTTTCCAATAAAATAG
GAATAGTTCTTTTAAAATTTTTAGATTACGAGAAATTTAGTTTCAAAGAG
AGAAACTTTTTTTGTGGCGCACCCAGTAGAAAATTCTTCTATTTTTTATC
TTAATTTGCAAATTTTTCAAACTGCTCTCCAAAGCTTAAATCATAATCTG
CTTAAAATTACTTTTCCAAAGAGGTATTACTTTTGATTGAATTTTTCTTC
TCTCAAAAGTAATACTCAAACAATTTTTTTGGAATAGACTTTAATGTAAT
TTTTATTTTTTCTTATTTTCGTAGAATTTATGATCTATTAATTTTCACCA
AATTTGTACTAATTGCTTTAATGTTTTTATTCGCATGTTTTTAATTGTTT
CAGGATGAAGTTAAGAAAATTCTTTCAACACCACCTCAATCAGCAGTTAT
AAGGGTCAATATAAATTTGATAAATATAAATGATGCTATTGAAGTTTGCA
AATCCTTTTTAAAGGTTAGTTTTTCTGAGACTCCTCTCAGCTTGTATTCA
TTTATTCTAAAGTCAGGTTAAGAGAAGTTTTCAGAAGCGGTCATTTGCCT
TGTAAAGGCAGTAAACTCAAAAAGTTGTTTGTCAATTTTATGAAGGGAGC
TTTTTCTTGATTTTTCAGTAAAATTTTGCTGAGGCTCAGCTGGAGACTTC
AAAAATTATCCAATTTTGTTGAAATTTTTGCACACATGATCCTTGGGTGA
ATCTCTGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTCAAAATTCTCATTTTTAAGGCA
GTGGTCACAATATTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGTGGCAGGCTGG
AGACTTCAAAAATAGTAGGATTTGGCTGAAATTTTGCACACTTGTTCCTT
GAGTGAATACCTGGGGGTTTTTTAAAAGTTTTCCATTTTAAGGGCGTGGT
CACAATAATTCTCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGGTAGGCTGGAGACT
TCAAAAATAGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTTCCTTGGGTG
AATATCTGGGGGGTATTTTTCATGTTTTCAAAATTTTGATTTTTAGGGGC
GTGCTTACGCGTTTTAGCCTCAAAACAAGGCTAAAACCTATTTAAGAAAT
GCTAAAATTTTAAAAGCTATTAAGTTTACAATTGTGCCTACAAACGATTT
CAAAGATACTGAAGTTGAGCCAATGCGGTTAGTACGTTCGACAGTTCTTA
TCTTTAAGGTGTAATTGAGGTATATTATTATACCCAAGTTTTACTACTTC
GAGCTTCATTGATCTTATAAAATTGTTCTTAAATACTATATATATCATTT
TTTAAATGAAAAAAGGTGGAATTTTCTCCAATTTCTTCACAACAGATAGA
AACATAAGATTGACCAAGACTACATTTTTTTCATAATTATTGGGAGCAAG
AAGGAGAAACTTTTTTTCAATTAGCAATCATTTCAGTTCTGCCTGTTCTC
CACCCTTTCTATATCTTTCTTATCTCTAAAGAATAGAAGAACTCAAGAAA
TTTTACCTCAAAAGAGGATAAATTATTTCTGGCACACCGGTATTAAAAAA
TTATTTATTCCCTCTGTTTTTTAAGAACTGTGACACTCATTACTCTGTCA
AAATTCATCCACAAATCAAAGATGCATTGATCATTGAACCAAAGAACTTT
GAAAACAAACCAGAACCACTACAGAAAGAAATCATTGTCGATTCTAGTTG
TGGTACAGCTGTTCTTAGAGGAGCTGATATCTTTGTACCTGGAGTATTAG
CAGCAAATTCAAGTAAATTCTTATTGCTTCCGTTATGCATTTGAAATGTA
TTTTGAAATGTGTTTACTAGATATTTTTTAAAACGATACTGGTGTTTTAA
CATACTAATCACATTGATTAATTATATACTACCGAATTTTGAAGGCACTA
ATTTCACAATATCAATATTCATGTTTATGTTATGAATTAAACCCTTATTT
GAAATACTGTCTTTTATAACTTTTTATACTTTTCAGATGTTGTTGCTGGC
GATCTTGTTTCTGTATATTGTGACGTAAAAAAGAAATGTCGAAAAGGATT
TACAAAACATTTTGATGGTGAAAAATTCTATCTTGGTAATGGTAAAGCCC
TATTCAGTCGTTGGCAATTATTTGAAGAAAATGATGTCGACAAAAATGAT
GTTTGGTAAATAATTTTGATTGCAATTTATTTAGCATCACAGCTCAATAT
TTCTGAGCTTGCTAACATTTTAGAGATTTCGGGGTCAGAATACCTGGTCT
GGCTTTGTATTTGCATTGCTTTTGGGATTACAAAAATTGAAAACATACCA
AAAATATGGCGCATTATCCTTGTAGTTTGATCCCTTTTACCTTATTTTGA
TTTCTTTTAATTTTGCTTATTCATTTTAACTTTTATATTCAGTGGTGTTG
CAATAAAGATGGGTGAAAGTAAATTCAATTTACCAAGTTTTCACAACTTG
CAACCAGATTTGTTTTTCCCACAAAACCTACCCTCCATAATAGTTGGTCA
TTTGCTAGACATTGAAGAAAATGATTTGGTATTAGACATGTGTGCTGCAC
CAGGTAGGTAAAACCGCTCTCTCTATTCATACTGGACCATAACTATGCCA
ATGTCAAGCTATTTCGAATGTCAAAATCTTCATTAAAGCTGGCACATAAT
TTCTATGTCAAAATATGAATTTATGCGTTTGTGTGGTCGTTCTTTATACA
AATTTTAATGTAATACTTCGATTTTCGTAACGAGGGTGGTCATCAGACTG
AGAAAAGAAAAATCAAAATCACAAATATCTAGCGTAAAAATTACCTTGTT
CTTTCTTTGTTGCTGAAAGATGATTGCCATTTATATATACTTGGTACATA
AGTCAGTTCAGCAACAAGGGGCGAAACTGAGCTACTTATGTACCCTTACA
ATGTGTATGTCGGATGGAAATAGTTATTTAGGGGTGTGGCATTTGGTTGA
TGGATGCGTAGTAAGTGGTAGTTTTTACACTAGGTATGGATAGTGGTAGT
ATTCGAGCATGTGTTTTGAGCCATTTCTATCAATGATCTTTACCATTGAT
TTTGTCGTATATTTTTTCTTTGGATTGGTTTCGCTAGTTTTGGGTTCAGC
TGTTAAACCTTTTATTTTAGAAAGGTGGGGTTTGGCCTTCATTAACAGTT
CTGCATTGCTTTCTTCATATTCCCTTGACATTTTAAAATTGTCTTTATGT
TTACGTTTTTATCGAAAGATTAAATATTCCACTTTTTTACAGGAGGGAAA
ACATCACACTTGGCTACATTATTGAGAAAGGTAAATTCAGCACAATTTCT
TTTAGATCTTGGCAAAAATATTTTAAATGTGTTTTTCAAAAGATAATGAA
GTAGCCACAAATTCTTTAATGACTGTTCTGTTAAAAACTTAATTTTTTAT
ATCAATTTTAGGGCAAACTAATATCAATAGACAAAACACAAAATAAGGTG
GATAGAATCAAAGAAAATCTCCGGAAACTCAAATTGAATAATGTTGAATG
TCATTGTTATGATAGCACGAAGATCCTATGCAATGAAGATGAAAGTAAGA
TCATGTAGATATTCTGAAACTCTTTTTTCACAATTGAATTGAGGCATTGT
TATATTTTTCTTGGACCCTTTAATGAGTATGAATTGAGTTAGGTAGAGAA
AAAACTTAATTAGTTATCGGGCACTAGCTCTGACCTCAATTGACAGATTT
GTCCTCAAAAATCATTGTCAGTTGAAGTCCAAAATTCCTGGGTTGGAAAT
GAAGCCACTTATTTCCCATCCCAAGCACGTGACTAAGCATGTTTTCACAC
AAAATTTCTAAATGTGGGGAAATCCTAGCCAATCTTAAAGCTTTAGTTTT
GGTTGCTTGAGAAATGTTGAAGATTCATCTCTAGACCCTTCTAGGATCCA
AACTCAATGGTGGAAACATCTTTCTGGCTTGTCTTATGTATATAACTCTT
GATATGAAAAAATTTCTTCTTTTTAGATGAAAGTGACGAAAATGGCCCAC
CATTTCCATCATCTACATTTGATCGGATTCTTCTTGATCCACCTTGTAGT
GGTTTGGGACAAAGACCACAATTACGTTACACATTCAGTGATAAAGAACT
GGCTTCTTATCCAATTCTTCAAAAGAAATTCTTCAAACAGGTAAATCTTT
GGATTAGTCTCAACTCTTATTTTTGAAATGTTAAGCTTGCTGGTTCTGAA
AATGTTTTTAAAAAGGGTTAGTTGGTAGTTCCTGATTATTTTCTTTAATC
TCGGGGTCTGTTGTTTTGAATTTATTCTTATACCGTCAAATGCTCTAACT
TGGGACTACCTGACAAAACATGGGACGGCAATTCGGCCACCATTTCACCG
AACCTCCAAAGTCATTTGATTTGAGTTAAGGAACGGTATATTTAAAAATA
CACAATTTCTCTTTCGATTTTACAGTCAGTGAAAATACAGACCAGATATG
CAACAGTCCCATGTTTCGACCAATCGTCCCAAGTAAGAGCAGTTGACGGT
ACTATGACTGATAAAACAGACGTATTAGATTGTTATCTAGCTTAAAGCTG
GAGTTTTTTTTAAGTTGACAGAAACCTTTCCTCGACCACTTCTTTTGTCT
CTTTAGGCAGTTCCATTACTGAAAACTGGCGGGACACTTGTTTTTTCAAC
TTGTACTTTATGTCCAGAAGAAAATGAAGCTCAAGTTGCTTGGGCATTAC
AATCGTTTTCTGATTTGTCACTGGTTGAACAAGTAAATGCTAAATTTTAC
TGAAGCAAAAAAGTTTTTATCCAGAAAGTACTTTTCAAACCTTTGAAACC
ACTTTTGTGCCTCAAACTGACACTAATGGTTACTCAATTTCAATTTGGGT
CAATTTTTGATTAAATTGAATAATTTCTTTGAAAATGTTTCGACTCATAT
TGAGAAGGGGTAGGATTAGGGTGTAATCAATGATTTTTGTTTGACCGGGA
TTGAGGAAGTGTTTATAAGCAGGAAGGGTATTATAAGGATCAGTGGTGGT
AACAGAGTGAGACAGGGCGCTCAAATACTCAAAACAGCTCAAAAAAAGTT
GTCTAGCCCTATCTAATTTTTTCATAATGACTAAAAGAAGCTCTTGTTTA
ATTTCAGGAAATACGGATAGGAAGCATTGGTTTGGCAGGTTATGGTCTTT
CAGATGAACAACGAGAAAAAGTGCAGCGGTTTGATGCTGTTTTTAACAAC
TATACAAGAACTGATATTTATAATGACTCTATTGGGTTTTTCATAGCTAA
ATTTGTTAAGAGGGAAAGATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000250_pilon:296573..302294- >XLOC_044315 ID=XLOC_044315|Name=XLOC_044315|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2766bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000250_pilon:296573..302294- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGCTTTTATAAAAGTAGAAATTTATAAAAAAGAAAAGGAAGATTTGTC
GAAGACCAAAATAATAATGGATGTAAACATATCAGAAAATGTCCTTGAAA
AATTAAGTAATCTTTACAAGTTGAAAAAGTTAGCTTTTATAAAAGTAGAA
ATTTATAAAAAAGAAAAGGAAGATTTGTCGAAGACCAAAATAATAATGGA
TGTAAACATATCAGAAAATGTCCTTGAAAAATTAAGTAATCTTTACAAGT
TGAAAAAGGATGAAGTTAAGAAAATTCTTTCAACACCACCTCAATCAGCA
GTTATAAGGGTCAATATAAATTTGATAAATATAAATGATGCTATTGAAGT
TTGCAAATCCTTTTTAAAGGATGAAGTTAAGAAAATTCTTTCAACACCAC
CTCAATCAGCAGTTATAAGGGTCAATATAAATTTGATAAATATAAATGAT
GCTATTGAAGTTTGCAAATCCTTTTTAAAGAACTGTGACACTCATTACTC
TGTCAAAATTCATCCACAAATCAAAGATGCATTGATCATTGAACCAAAGA
ACTTTGAAAACAAACCAGAACCACTACAGAAAGAAATCATTGTCGATTCT
AGTTGTGGTACAGCTGTTCTTAGAGGAGCTGATATCTTTGTACCTGGAGT
ATTAGCAGCAAATTCAAAACTGTGACACTCATTACTCTGTCAAAATTCAT
CCACAAATCAAAGATGCATTGATCATTGAACCAAAGAACTTTGAAAACAA
ACCAGAACCACTACAGAAAGAAATCATTGTCGATTCTAGTTGTGGTACAG
CTGTTCTTAGAGGAGCTGATATCTTTGTACCTGGAGTATTAGCAGCAAAT
TCAAATGTTGTTGCTGGCGATCTTGTTTCTGTATATTGTGACGTAAAAAA
GAAATGTCGAAAAGGATTTACAAAACATTTTGATGGTGAAAAATTCTATC
TTGGTAATGGTAAAGCCCTATTCAGTCGTTGGCAATTATTTGAAGAAAAT
GATGTCGACAAAAATGATGTTTGATGTTGTTGCTGGCGATCTTGTTTCTG
TATATTGTGACGTAAAAAAGAAATGTCGAAAAGGATTTACAAAACATTTT
GATGGTGAAAAATTCTATCTTGGTAATGGTAAAGCCCTATTCAGTCGTTG
GCAATTATTTGAAGAAAATGATGTCGACAAAAATGATGTTTGTGGTGTTG
CAATAAAGATGGGTGAAAGTAAATTCAATTTACCAAGTTTTCACAACTTG
CAACCAGATTTGTTTTTCCCACAAAACCTACCCTCCATAATAGTTGGTCA
TTTGCTAGACATTGAAGAAAATGATTTGGTATTAGACATGTGTGCTGCAC
CAGTGGTGTTGCAATAAAGATGGGTGAAAGTAAATTCAATTTACCAAGTT
TTCACAACTTGCAACCAGATTTGTTTTTCCCACAAAACCTACCCTCCATA
ATAGTTGGTCATTTGCTAGACATTGAAGAAAATGATTTGGTATTAGACAT
GTGTGCTGCACCAGGAGGGAAAACATCACACTTGGCTACATTATTGAGAA
AGGAGGGAAAACATCACACTTGGCTACATTATTGAGAAAGGGCAAACTAA
TATCAATAGACAAAACACAAAATAAGGTGGATAGAATCAAAGAAAATCTC
CGGAAACTCAAATTGAATAATGTTGAATGTCATTGTTATGATAGCACGAA
GATCCTATGCAATGAAGATGAAAGGCAAACTAATATCAATAGACAAAACA
CAAAATAAGGTGGATAGAATCAAAGAAAATCTCCGGAAACTCAAATTGAA
TAATGTTGAATGTCATTGTTATGATAGCACGAAGATCCTATGCAATGAAG
ATGAAAATGAAAGTGACGAAAATGGCCCACCATTTCCATCATCTACATTT
GATCGGATTCTTCTTGATCCACCTTGTAGTGGTTTGGGACAAAGACCACA
ATTACGTTACACATTCAGTGATAAAGAACTGGCTTCTTATCCAATTCTTC
AAAAGAAATTCTTCAAACAGATGAAAGTGACGAAAATGGCCCACCATTTC
CATCATCTACATTTGATCGGATTCTTCTTGATCCACCTTGTAGTGGTTTG
GGACAAAGACCACAATTACGTTACACATTCAGTGATAAAGAACTGGCTTC
TTATCCAATTCTTCAAAAGAAATTCTTCAAACAGGCAGTTCCATTACTGA
AAACTGGCGGGACACTTGTTTTTTCAACTTGTACTTTATGTCCAGAAGAA
AATGAAGCTCAAGTTGCTTGGGCATTACAATCGTTTTCTGATTTGTCACT
GGTTGAACAAGCAGTTCCATTACTGAAAACTGGCGGGACACTTGTTTTTT
CAACTTGTACTTTATGTCCAGAAGAAAATGAAGCTCAAGTTGCTTGGGCA
TTACAATCGTTTTCTGATTTGTCACTGGTTGAACAAGAAATACGGATAGG
AAGCATTGGTTTGGCAGGTTATGGTCTTTCAGATGAACAACGAGAAAAAG
TGCAGCGGTTTGATGCTGTTTTTAACAACTATACAAGAACTGATATTTAT
AATGACTCTATTGGGTTTTTCATAGCTAAATTTGTTAAGAGGGAAAGATG
AGAAATACGGATAGGAAGCATTGGTTTGGCAGGTTATGGTCTTTCAGATG
AACAACGAGAAAAAGTGCAGCGGTTTGATGCTGTTTTTAACAACTATACA
AGAACTGATATTTATAATGACTCTATTGGGTTTTTCATAGCTAAATTTGT
TAAGAGGGAAAGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000250_pilon | genome | sc0000250_pilon:296573..302294 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1219-1383:166 |
| Aaloc | 1093-1218:667 |
| Aaloc | 931-1092:1295 |
| Aaloc | 796-927:1862 |
| Aaloc | 760-795:2029 |
| Aaloc | 598-756:2880 |
| Aaloc | 430-594:3285 |
| Aaloc | 241-426:3698 |
| Aaloc | 130-240:4920 |
| Aaloc | 1-129:5723 |
|
