XLOC_044282 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044282
Unique NameXLOC_044282
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000020_pilon:1132903..1145936-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044282 ID=XLOC_044282|Name=XLOC_044282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1132903..1145936- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCTCAGCTTTCGACCTTGTGAAAGGCTTCAATGGGCAAAATGTTAAGAA CAAGTTAAGATGGTCATAAGGCTTCGTGGACTCTAAAACACCCAGTTTCT TAGGAAATCAGAAAAAAGGTGAACCATTTTAAGACCGTTTTTAGGCTGAA AACTCAAAAAGATAAGATCATCCGAATATTTAGAAATTTTTTCTTCTAAA AAAACCTATATATCCACTTTCTGATCTGGAAAAAGCTATCAGAGTCGAAA TAGAAATTGAGAGTTTGAATAAGTAATCATGATAATTTTTATGGTTTAAG TTGAAAATTAAAAAAATCAATAAATATTTCAAAATATTAAAAGTATGATT CTAATATTACTGACTTTTAATGACACCTTTCATCATTTGCACCCTGTTTA ATACCACTGACATTACTTTTCCTTTACTTTGTAAGATTTCGCCCATTGCA CAAGTTGAACAACTTTGGGTTCGGTCATAAAAGCTAGGCTAATATAATAA AAACTGAAAATTAGACATAAAAGTTGCGATTCTAGAAACGGCCCAGAGAC AAATAAAATATTTTTTTTCATTAACTTTTTCAACTCTGATAAAATAATGC AGTCTTTTATGTTTACATTCATTTCAAAATGAGTCAACATTTTATTTTTC TCACACACTGCAACCCCAGTTTCCAATAAAAAGTTCGAATGCTTTTAGTA CGCAAAATATAAATGACCGAATTCAAAGAAAAATTTGCCAGTAGAAGAAA GCCGGATATACTTCGTAGAGTAGCATTGACTGATGTCACGTCTTTTATGA TGAGCATAATGCCATGTGGGAAAGTACAAATTACGTAAAATAAAGTGATC AAAATTAGTGTTTTGACACTTTTCATTTTCCTTTCTCTTGATTTATCTTC AGCGACACTATTTCCACTGTTTTTGTTTCGGTTTGGTGGGTTTTTGTTTG TGTTTCGAATGTTTCCATATGAAATTCCATTGATAATAATTGTAAGTGTC ACCAGCAATAAAAAACAATATCCCAGAATTGTTTCAAAGATTGCATATAG TTTGTGATCATACTCTACTACTATTACTATGTATGAAATCAAAAAAACAC TTGTACATAAACCAAAAATAATGATTGTTTTATAAATAGTGGCTGGCTGG ATTGTTGAGAATGGTTTGACGAGAGACCAATTCCTCAAAAATGTGATTAT TAAGAATATCTGGATGCCGAAAATTTGGAAAAAGTTGTTACTAAATATGA TAAAATATTGCATTTCCACGGTAACTTTCACCTTAGTCATAGTTACTCTC AGAATAAGGTGAAAAAGAATAGCCATAATATCACAAACACAAATTGCGAT GAATAATTTTGTCGATATTTTGATCTTCTTGTTGGTTTTGACTAAAGCTA TGATCATCAAAACGTTTGGGATGATTGCAAATATTGGATATGTTGCGTAG ACGTAGAATGGTATTTCCGATTCGTTTGCTGCAGTTGGTTTGGTGGAATT CCTTGTAAAACCATTCGAAAATTCTGAACAATTCTGGTTTTCCATCAGTG CTGGGTCTTTTTTTGTCGTAAATATTGTCTAAGGTCTTCAAAGTCGTTAA AGTCTTCTTTAGCTGAATGATTCCTAAATTTCTTTCCTATATTTCCTTTG ACGCTAAGTATTCGGCAGATGTTTTTCCGCGAGATGTTATTGAAAAACGG TTGGGAAATGAAAAGTGCAAACACGTATGTAGAATATAGCACCGTGTCAA TCCATCAAAGGTTTGACTCTGTAAAGTTGAGCTATCAAAAATAAATATAC CGTCTTCGAATAAACGCCCAGTGTGTTTATTACATTTTAGAAGGGGCGTT TAAAAGAAGGGGGCGTTTATTAAATAATCTTCATCAAAGGTCACTTTAAT AAAGTGAGTGGAAACCTTATTTTGCCTTTTCGTTTTCTTTCAGTTCAAAT ATGTCATTTTCGAGATGAAAAACGGGTCAAAATTTCTCCCTAGAGGAGAT GCGTTAATTAAAATGTTTTCCTTTAGGGAGGGTGTTTATTCAAGGGGGAC GTTTTAAAGAAAATGGGCTTTTACTCAAAGTAATACGGTATGGTATTTTG TTTTGCCTAGGATGTTTGAAAAAGTTATTGCCAATTACTTGCTTTTCTCC ATTCTCCAAAGATATGCTGTTATGCTGGTTTGCAAAGTTCATTTGAATTA AGATTGCTTCAAACGCATAAAATATAAAATAGACTTGGCTCATTTTTCTG GGAAAATATTGTGAAACTAATTTTTTGGCTAAACAATGAAATTGGGGACT CGAAATCTTTTTCTAAATTAAGAAAGGAGATTGAGATAATTTGAATGTAA AAAATGGAATAAGAAACCAAATGTTTCCAAATGATTCTTGAGAAGGTAAT AATCTTCTCTCTTCAGTACCAACAGTGTTGCAAGAAGCCATTCCCAATGC CATACAAAACCTTGACGAAGAGTTAAGAAAAATCACAAGTCAGGTTTTTC TTTATACAGGTATGTTAGAGTTTAATGTTGAATTTTTTATTCAATTGAGT CAATTTTATCTCTAATTCGGCGTCCTAGTTATTATTATCCGTTTACATCT TTCGACCGAAATCATAAACTAGCTTTTCCATTTCGCCTAACAAAAGTTTC TATCTTTTGTTGTTTTTTAACTGCACGGAACCTCGATAATTCAAAGGTCT CCTTAATTCAAACACGGTGTTTAAGAAAGTACCTTTCCAGTGTGTGATGA GTTAGTCCCCTTTTTTATGAAAACTCCACCTTTCCATATTTCATTTCAGC GGTTCTTGAGAATGCTTGTTTGAACCACGAATTCCCGGACACATTGGAAT GGGCCAAACTGAAAGATTCACATTTCAATTCAAGACAACATGAACATTTT CTCAACGTTCTGATGGTAAAAAGATTGAAATATAGCCTAACCTGAAATCC CTTTTTGCAGTGAATCGCTCCACGCTGTCATGATAAGTTCACTCATATAT CACTCTCTATCTGTCTGATAATCGAAATTCCGGTCGTCGTCAAATTGCAG GATGTAAAACGATAAACTCGTATACACAATGGCTGAAAGTGTTGATAATG TCACTTAATAACATTTTTTTATATTCAAACTCATAGCACGATTTGAATGA TTGCAAAGAGCACGTGGAATCGTTACGTTTGAAATACTTGGTGCAAATGG ACAACGTCAAAGATACAGTCTCATCAAAGACAGCTGTCCCCACAGCACAA GTTTACCCACAATTCATCGGTCTTGCACATTTGTGGACTGCATTTCAAGA TGAAATGGTCTTATTGAGTGTTCTAACTAATTTGATCTCTAGCCTGGATC AATTTGCACAGGTGAGTGTTATTGGTATTTTCATTATTGAAATTAAGGAC TTTGAAGAAGTGCAAGGGTTTGGTTGTCGTCCCCGTCCCATAATATGGGA AATTCTAAGCGTTGTTACTACCCTCCACTAAAATATCATGTTTAAACTGT CTTTCAAAATGGGGGAATTAGGCTAAACTTTTCCTTTGCAAATACTTAAA TTAAACAATACCCCCGTTCTTGCTATCCTCCTTAATTCAGTAAAACTTCT TAAATGTCGTCCTTTAAGAGTGGGTCGAACTAAGACAAAGATGCTACATA GGGACACTGGGTTTCATGAAGAAATTTGAATTTTAATTTCAAGGAATTCT TTTGCTGTTTTAGGTTCATGTTTCGATGTTTACAAAAGAAGTTTTGAATG ATTATTTGAATGAAGACGGATTGATCAAGTCTGATATGGACCGAATGAAC ATGGTACTGTTTCTTTTAACCCTTTGCAACCTAAAGATTTAAACATCTTT AATCTCAATCAAGTACTAAATGATTCTTTACTCTAAAGGTCATTGACGGA AAATTTTCAAAAACTAAATATAACTTTTTAAATTTTCCATGTTTTTCTCG CAGACAAATGGCAACGAGCACCGTATCAATGCAGCCAAAATTTTGAACAA GAAAATTGAAGTATTGTTCCCAGAATCCACCAAGAATTTCACTCATTTAC CTATTTATGCGAGAGTATGTTGTCCCTAAGAGTTCTTTGCAGTTTTTTCT TCTACAGTTTTATGTGTTTTCTTACCACATTTTGGTATTTGAAAGGCCGG CCACGTTTTAAGAAGGCGGCTGTGAGTTATAACTCGAATACGAATGGCTT CAAAAATATGCTTCTAATTGATTACGCGTACTTTTTGGATTGGCGAAGTT ACTTTTGGAATTTAACATCGGAATTATTTTATTGTTCCATTTCTTCAAAA CAATAATATCTTTATCCTAATTAAAATCAACGAAGCAAATTCCTACATCA TCTTTGCTTTTAGGAAACTTTAAAGTGTAAAGCAGCAAATAGATAAAAAA GAATGAAACGACTACTTGTGTTGAAATCTTCGTTATCTTTTTTACGTCAC TTAAACAGCATGTAGCTCAACATAAGGGGAAGCTTAGAGATTTGACAATC TCTTTTACATTTTCATTTAGGGATATTGTCCTTGGTCCCTTTACACGTAC AACGGCCTCTTGGTGCCATCCAACCCAAACATCGGTATCTTGCAACACAG CAATGTTTATTATGCTTTTGCCAGCGCTGAGGGTGCTTACGAATTCGCTT CGGATCCTGACGCCTTTTGTAAAGGAGTAGCAGACGTCGCAAAGAAATCA CCTGAACTCATTCAACTCCTTGAACTGCACAAACAGTTCGCGGCTATCAC GCCTTATACACAGGTAAAGATAAAGTCTATTTTAGATGTTAAAGACAGTG AGAAAATTGCATATTGTTAAAGAAATTTTCGCATACTTATGATTGTTTTT GTGTTATTTGAAACCCAATTTTTGGGTGTAATAAAGATTAAGGGTCGTTG AACCGGCATATTAACAAAAAATGAATTGTTTATCTTTTAGCAAGGGAAAG AGAAGAGTTTCCTTCCTTATCCAGTCACCAAGTCGGATATGGGTACACAG ACCGACACCCATCCAATGGAAACAAACTTGGTCAAAACGTACGAATGGAA TGAATGGGAATTGAGAAGAAAAGCTTTGAAACTGGTATGTTTTTACAAGA TGAGGAATGTTTTGTATTTCATATTTGACTATCCCCAGTCAAAGTTTAAA CGCAAATCCCATGTCACATTCTATTAATAACGATTGACCATAGACAACAG TTCTATTCATCATGGACCAATTGGGAATAGGCTTACTGATTTTCTGGATG ACGTGTAGGTGCCACCTTACTTTTGGAAATTTTTTGACCCCTACCTGAAC ATTTTTCGATCATACTTTCCATGATTTCCAACATTTAGCCTTTTGAGAAG CAAAAATTGAAGAATTTTACTTTTCTATCATTCTTTAAAACCCTTCGAGA GAGTGAAATTTGATATTAGCAATCTTTCTTGTAACTAGACCCTCACCCTC GGAGTTTGAAGAACGTGGTTTTGATGGTTTATTGACAAAAATGATATATT TTCTTTATTGCAGGCAAATCTTCGTAAAAAGATGACACACTCGGTACAGA CAGAACTCAGCAATTACAAACGAGAAAACACAACACAATCTTATCCACCA AAGTAAGCTTACATTTCTTCAGCGATTTGTGAAGATAGAAGTTATGAAAT CAATCTCCCTTTTCAAAATCAGTGGACAGAATAATTTCAGGATTTATTAC AAACTATTCTTACAATTTCAAAATCCGCTCTAGATCAATTTCGTAAAGCA TTTATTGTGAGACAGGTATACCATGTTTAAAATACACGTTTTTTTTTAAG AAACTAGTTTTACCAAGCCTCAATGTTTCTTAAGAAATCGGCCTTTTGAG CCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAATTTTATCAAGCTTAAATGACGC ATGTCGATAATACAATAGTCTAATTGACTAATCTACGGTTGTACTTTCCT ATCTTCTATATTGGTTTTCTGACTTTCTTAAGTGTTTCTAACTGTTATGT ATGTATATTTCTGGAACCTTGATTGGAAGGTTCTTAATAAAAACGAATTA AAAAATGCTATTTTCTCATTCGCAGCCTCAGCATGTTTCTTAGATGTTTC TTAGATTTTAGGCATTGTGAGCCTCATGTTTCTTAAAAGTGTGTTTCTTA AAAAAAAAACGTGTAGAAAATTACCTTCCCAGGAAGTCCACTAAATGATT ATAAACATTTGAACACTTTAATTTTTACATTTTACTTTTCAGAGATCAAG AAACACAAACGAAACGAGAAAGTTATACGAACGTTCCAAAACCAAGTGTT TATATCGCTGGTTTGCGTGGCGGAAGCACAACACGTACCAAAATGACCAA AGTTGACCTTACGCGTGATGTTAAAGATATTTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000020_pilon:1132903..1145936-

>XLOC_044282 ID=XLOC_044282|Name=XLOC_044282|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020_pilon:1132903..1145936- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCGAGCTCAAGCAGAAAGTGTTATCAAGAACATCATCCGTGAAAT
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CGTGAAATAACCCATGAATGTGCAGGTAAAGGACAAGTTGTCTCAGAAAC
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TGTATTGGAAGGAAGGTTACAACCTGTCATCAGAGAAATCACAGATAGTC
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GAAAGACTCTCCTTCACTGGAGACAATACGAATGCAGGTTTATTTTGATA
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GAAGGAAGGTTACAACCTGTCATCAGAGAAATCACAGATAGTCGAGCAAG
GACTCGAGATGAATTGGAGGTGTTATACACGAGAATAGTATCATGTGTTT
TGTTGAGATCAGGGCTTGGATCACCCACTGACATCAGTGTTGTCAGGGAA
GCAACTGTGTTATACACGAGAATAGTATCATGTGTTTTGTTGAGATCAGG
GCTTGGATCACCCACTGACATCAGTGTTGTCAGGGAAGCAACTGCTGCAT
TACAGAGTGTTTTTCCACAAACTGAACTTGGAACGTTCATGTCACTGGTG
AAGAAAGATAAGGAGCGACAGTTGGTGGAATTGGCCTTGATTGTGACCGG
TATTCGATTGTTTAACCGCGAATGCGGTAAAGGAGGTGATGGCATCGATG
AAACTGCATTACAGAGTGTTTTTCCACAAACTGAACTTGGAACGTTCATG
TCACTGGTGAAGAAAGATAAGGAGCGACAGTTGGTGGAATTGGCCTTGAT
TGTGACCGGTATTCGATTGTTTAACCGCGAATGCGGTAAAGGAGGTGATG
GCATCGATGAAATACCAACAGTGTTGCAAGAAGCCATTCCCAATGCCATA
CAAAACCTTGACGAAGAGTTAAGAAAAATCACAAGTCAGGTTTTTCTTTA
TACAGTACCAACAGTGTTGCAAGAAGCCATTCCCAATGCCATACAAAACC
TTGACGAAGAGTTAAGAAAAATCACAAGTCAGGTTTTTCTTTATACAGCG
GTTCTTGAGAATGCTTGTTTGAACCACGAATTCCCGGACACATTGGAATG
GGCCAAACTGAAAGATTCACATTTCAATTCAAGACAACATGAACATTTTC
TCAACGTTCTGATGCGGTTCTTGAGAATGCTTGTTTGAACCACGAATTCC
CGGACACATTGGAATGGGCCAAACTGAAAGATTCACATTTCAATTCAAGA
CAACATGAACATTTTCTCAACGTTCTGATGCACGATTTGAATGATTGCAA
AGAGCACGTGGAATCGTTACGTTTGAAATACTTGGTGCAAATGGACAACG
TCAAAGATACAGTCTCATCAAAGACAGCTGTCCCCACAGCACAAGTTTAC
CCACAATTCATCGGTCTTGCACATTTGTGGACTGCATTTCAAGATGAAAT
GGTCTTATTGAGTGTTCTAACTAATTTGATCTCTAGCCTGGATCAATTTG
CACAGCACGATTTGAATGATTGCAAAGAGCACGTGGAATCGTTACGTTTG
AAATACTTGGTGCAAATGGACAACGTCAAAGATACAGTCTCATCAAAGAC
AGCTGTCCCCACAGCACAAGTTTACCCACAATTCATCGGTCTTGCACATT
TGTGGACTGCATTTCAAGATGAAATGGTCTTATTGAGTGTTCTAACTAAT
TTGATCTCTAGCCTGGATCAATTTGCACAGGTTCATGTTTCGATGTTTAC
AAAAGAAGTTTTGAATGATTATTTGAATGAAGACGGATTGATCAAGTCTG
ATATGGACCGAATGAACATGGTTCATGTTTCGATGTTTACAAAAGAAGTT
TTGAATGATTATTTGAATGAAGACGGATTGATCAAGTCTGATATGGACCG
AATGAACATGACAAATGGCAACGAGCACCGTATCAATGCAGCCAAAATTT
TGAACAAGAAAATTGAAGTATTGTTCCCAGAATCCACCAAGAATTTCACT
CATTTACCTATTTATGCGAGAACAAATGGCAACGAGCACCGTATCAATGC
AGCCAAAATTTTGAACAAGAAAATTGAAGTATTGTTCCCAGAATCCACCA
AGAATTTCACTCATTTACCTATTTATGCGAGAGGATATTGTCCTTGGTCC
CTTTACACGTACAACGGCCTCTTGGTGCCATCCAACCCAAACATCGGTAT
CTTGCAACACAGCAATGTTTATTATGCTTTTGCCAGCGCTGAGGGTGCTT
ACGAATTCGCTTCGGATCCTGACGCCTTTTGTAAAGGAGTAGCAGACGTC
GCAAAGAAATCACCTGAACTCATTCAACTCCTTGAACTGCACAAACAGTT
CGCGGCTATCACGCCTTATACACAGGGATATTGTCCTTGGTCCCTTTACA
CGTACAACGGCCTCTTGGTGCCATCCAACCCAAACATCGGTATCTTGCAA
CACAGCAATGTTTATTATGCTTTTGCCAGCGCTGAGGGTGCTTACGAATT
CGCTTCGGATCCTGACGCCTTTTGTAAAGGAGTAGCAGACGTCGCAAAGA
AATCACCTGAACTCATTCAACTCCTTGAACTGCACAAACAGTTCGCGGCT
ATCACGCCTTATACACAGCAAGGGAAAGAGAAGAGTTTCCTTCCTTATCC
AGTCACCAAGTCGGATATGGGTACACAGACCGACACCCATCCAATGGAAA
CAAACTTGGTCAAAACGTACGAATGGAATGAATGGGAATTGAGAAGAAAA
GCTTTGAAACTGCAAGGGAAAGAGAAGAGTTTCCTTCCTTATCCAGTCAC
CAAGTCGGATATGGGTACACAGACCGACACCCATCCAATGGAAACAAACT
TGGTCAAAACGTACGAATGGAATGAATGGGAATTGAGAAGAAAAGCTTTG
AAACTGGCAAATCTTCGTAAAAAGATGACACACTCGGTACAGACAGAACT
CAGCAATTACAAACGAGAAAACACAACACAATCTTATCCACCAAAGCAAA
TCTTCGTAAAAAGATGACACACTCGGTACAGACAGAACTCAGCAATTACA
AACGAGAAAACACAACACAATCTTATCCACCAAAAGATCAAGAAACACAA
ACGAAACGAGAAAGTTATACGAACGTTCCAAAACCAAGTGTTTATATCGC
TGGTTTGCGTGGCGGAAGCACAACACGTACCAAAATGACCAAAGTTGACC
TTACGCGTGATGTTAAAGATATTTAGAGATCAAGAAACACAAACGAAACG
AGAAAGTTATACGAACGTTCCAAAACCAAGTGTTTATATCGCTGGTTTGC
GTGGCGGAAGCACAACACGTACCAAAATGACCAAAGTTGACCTTACGCGT
GATGTTAAAGATATTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044282XLOC_044282-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000020_pilongenomesc0000020_pilon:1132903..1145936 -
Properties
Property NameValue
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