XLOC_044093 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_044093
Unique NameXLOC_044093
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:754519..767513-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044093 ID=XLOC_044093|Name=XLOC_044093|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12995bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:754519..767513- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGATGATTTTTCATAGGTTACTCAGGTGAGTTCTTTTTCCTTGGCGAAGC ATGAGCAGATTCTTCAAGTCGAATTTTCTATACTTTAGGGGTTTCTCTTT GAGGACTCTAATAGAAAGAATTTACTCTCGAACCAATAACATGCGGTTGC GTCCAACGAAATATGCTACGGATCCTAAGGCTTTATCCCCTACTAAAAAG GATGTAAATTTTTGAAGGTCGTCTATTCAAGGGGCAATCTGTGAACCAAT TTTGTTTCTCTCAGAAGTCACTTTCACGCTAAAATTGAGTTTCTCAAAGG ATCTGCACTCACAGGTCCCGTCTGCACATACCCAACATTTCTTAACCTTA GGATCCGCCTCCCCTTGGTACATTATTTGAGTTGAGATTGATTTTTAGAC AGATGTGTTATGTGCGTCACAAGATCCTCCTTCGTAAATCTTACATCTAT CTCGTTTACTGGCTCAATTTTGAATAACTTACAAATATTTTTGAGCTTTT AGGCATTGCCTGTCTGTAGACAGCAATCTCTATGGTGCTAAGAAATTTTT CACCGTAGATAATAGTAAAAAGAAAAAAGTAACAAGACTTTGAGGCTCAT TACATGGTCCTACCAGACAAAAAGTCTCAAGCAATTTGATTATCTCTTTA ACCAGAAAATCTTTGAACCTTCTAGGCTATTACCTGCGTATATGTTCGTC ATTCTTTTCTACACATACATCTTCCCGCATATGTCGAGCGGGCCGTTTTG GTTCCCACATCGTGAAGATAGTTCCCAGGTGTCCGCTTGCAAGAAATACT GGTGGAGTAATTTGCTCTTCGTAAACGAATTCGTTTTTACGAATTTTGAT GAGGGCGTAAGTTGATGGATCAAAATAAAGTCAGTCTGATTGGTATCCTT TGTATAGCAAAAATTATTTAAGACATGTTGCCTTTTTCTAGCTTGGGTTG 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AAACATAATGTAGTCAATGAAAAATGAATTGAATGTTGAAAGCTCGAAAC TTTCTACCCGAAGGTAAACAATCAAATTCAAAATATCATTAAATGCAACT TCCATAAGAAACAACATCAAAAAATGTAAAAATGTTGCCACATCGATTTA TTGAGCTTCTTCGTTGTATTGTCTTTGTTCATCTTCTCCCTTTTTCCTCC ATCAAGGTCAATTCGACTTGAAAATAATTATGTGTCGAGATTGAAAAATC AAGCCACCAATTCGTTAAACGAAACAGATCCAGAAACAACAATTTTCACA CGTAGTATCATGGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCAAATTTACACACGAGCT ACATTTTAGTCTCCATTGCCATATTCCATTTAATCGGTATATATTTGAAA TAATTCTGTGTCGTGTTTGAAAAATCAAGCCACCAATCGTTAAACGAAAC AGATCCAGAAACAACAATTTTCACACGTAGTATCATGGAAAAAGTTCCAA TCTTGTTCCAATTTACACATGAGCTGCATTTTAGTCTCCATTGCCATATT CCATTTAATCGGTATATATTTAAAATAATTCTGTGTCGTGTTTGAAAAAT CAAGCCACCAATCGTTAAACGAGACAGATCCAGAAATAACCATTTTCACA CGTAGCATCATGGAAAAAGTTCCAATCTTGTTCCAATTTACACATTAACT CCATTTTAGTGTCCACTAACAAATTCCAGAATCAGTTTACTTGAAATAAT TCTGTGTCAAGTACGTTGTCGAGTTTGAAAATCATGCCACGTCCCACTGT CACTGTACTGACCGTTGTTTAACAGCCATGGATCCAGAAGCAACATTGTG TCTTATTTAAATTTACACATATCAGTTTATTTATTTCTATATTAGAAGCC ATTATTTCCTAAAAATAAAGTCTTTTTGAAAACAAGAAACTTAAAATGAC 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TTCATCCTGTGCTTTCAAACTGGAGCTTGTTTTCTATAATCTTCTTAGTG TCGAAAGCTAGTTTACTACTCACATTTTGAGGTTTAAACGATTCAGCCTG CAGTTTTGACCCGAAAAATCCTCGAAAAATCTAGGCGCCTATTCACCGTT GGCCTCGATCAGTCGAGATTAGAGCAATGAAATACTAGGCGTCTACCTTT GATATTTTCACATGATGAATGCTCTTTTGTACTTCATTGGAAGAGTGGGT GGAATAAGCAAGAGGTGGTTATTTTGGGTCGTTATTTTTAATTTTGTCGA AGTTTTTGGTACTTTTTTAGGAAAAGTTCAGAAAATGAGTTTTAACATTA AATTGTTACTGAGGTAATTTTTTGGACCCCCTCCTTTTGAAATTAAGTTA AAAAGAGTATTATCATGTATTAGATAGTAGCTTTTAGCCTAAGTATCCAA GACGTCTATAGACAGCAAGCTGGTTTAAAACCAAACTGGTATAAGCGATC CCTTTATAATCTCTCTCTCTATCTCTGATTTGTTTTCAGTCCGAAAGCTG CACTGATGAAATATTTGAATCACATTTACATCAAGCCCTATTTTCGTATA TCACCATACTTGGTTGGAATAATGCTTGGTTACGTCATCTTCAAGAAAAT TGAAGTTCCTCGAACCAAATCTCGAAAATTGGTAAATATTCTCATGGAAT CATTTTATAATCTATGTAATACAGTAATATGGTTGATATTTGTTACAGGA CAATAATAGCTGATATGATAATGGCATTCATTTTGTCCTTCTACGATATA CCCCACTCAATTTTGTCGTCAAGCACGCAAACTAAAAAAGTTATCCAGAG AGCTTATCGTTAATGTGCTAAGGGAGAGAATACAATTTTATAAAACAGGT TTAGGGGGGGGGGGCTCGAACCATGATTTTAAATTTTACTAATACGTTAT TACACAAAAATAAGTAGACGTGTCTATGAACTGCACAAGACATTCTAGAA TTAAACCATAATTATAATTTTTGTCCTTTATTATACAGAAAGCTTACTCG GTGACATGGTTGTTGAGTATCGCTTTTTCTTTCCTTGCCGTGTTCGCTCC ATCAATAACGGCAAACACATTTTCTGAAGTCAGCATTGTTTTTTATGGGA TCTTCTTTCGATTGTTGTGGTCAATTGCAGTTGCGTGGATGATTTACGCT TGCCATATTGGCTACGCAGGTGAGTGACCACTAGTGAAAATTACGAACCC AATCAAAACGGACAATGAGATCCTCGGACGCTGCATCAAGCCTTTGATTT TTAATTCAGGTCTTCGGCCGTTGATTTAGGTCTTCGGCCGCTAAATCAGG TCTGCGTCCGCTGACGGAAAAAAGATCTGCGTGGCCACTAGTGAAAATTA CGAACCCGATCAAAACGGACAGGGATATCCTCGGGCTCTAGGAAGAAATG CTTAAACAGTTTTACTATAGGTTCTATATGAGCCGTTCCTTTCGGCCTGA TGATACCCTTGTCTTTTATGGATTTCAACTTTGTAGGGGGTCAATACTTG GATCCTGTAATATCTTTTATATCAATTCAAACCAGGGCTCCCTGTATCTC GATTCTAATTCGTGGATGTCAAATTTTGTCCAAATCGTACTAAGTGGAGG GGGGGCCAAGCTTGAGATCCCGCAACATCTTTCTACTAAGGGAGTAATGT AATGAAAAGAATTTTTTGCTCGAAATTCCATGCTCTTTCAGCTATTGCTA CTTTTCCAATCAGAAAATCATATCTAATGCTCACATTTTCATTGTAGTTA TGCCTATAGCGTCACATTTGTTTGTTCAAAAAAGATGTCGGACCTAATTT ACAATGTTTTGAATACTTTATACTTTCTAATAGAATAAGTTTGGTTTGGT TTTTTAAAAGATGTCACGGGATTTGAAGCTTGGCCCCCTCGACCAATTGA GCCATGACAAAAAAAAAGATATGATATGATTAATTTATTCCATTCCTTCT TCACAGGCATTATTGCAGATATGTTATGCAGTAAATTGTTCATACCATTA TACCGTGTAACTTATTCCGCCTATTTATGTCACGTGCTCGTTATTATTTA CTTCTTCGGATCACTTCAAACCCCGATACACTTTAATGACACAACTTTTG TAAGTATGCAAAAGCATCCGGCGATGACCTTTTTTTTGAATATCTGCTGT TCGATCATAAGTTAACCTAGATTTTTGGATCTGTTGTTCTGAATTCTTTG GAATCCTTACTCCTAGAAATATCTATGTGATGCTTCTTTAAAATGTCAAA CTAAATTTAGGACCCCTTCTCATAGATATTTGAATCTGTTTTTCCAAATC TACGTCTCTTCCTAGAAAAAGTGAATAAAATCTGCAGTTCTGTCTTTCTC CATTCTCTTATCTATTGTACCGCTTGCTGGCTCGCTTTATTGAAAATTCA TCTGTTGGTGTTTTCTCATTTTACCTGACCTAAATACGAGGCTCGGAATT CCCGAGTTATTTTTTCCGAGTTAAAAAACCGAGTTACGAAAAAAACGAGT TATCCCAAGTTATGACGTCATTTTTGGAATTTAGTGACGTCATTTTACAT TTCATAACTCGGTTTAATTTGCTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTCCA TTTTTTAAGGAGGGATAACTCGGTTTTTTCGTTTTTTAACTTGGGAATTC AAGGCCTCCCTAAATACGATGTGCAGTTCATCAAATGCGTCATCATCTAA AAATTATTATCTGGTGATACAGGATTATATCCTTTATCTAAAAAAATATT GTCTGCTATTCTTCGATGATCTCTTCTCCTGTAAACGAACAGCAGATAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:754519..767513-

>XLOC_044093 ID=XLOC_044093|Name=XLOC_044093|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:754519..767513- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTAGCACATTTCTTCTACATTACTGTTGCATTATGGTTATCACT
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GACACGAATGAAATATGAAATTAGCACATTTCTTCTACATTACTGTTGCA
TTATGGTTATCACTTACGATTACATCCCAAGATGCAACGGAACAGAATAC
TTTTCTATGGGATTCGATCTATGACAGTTTGAATTGTTCTGTTCTGAACA
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TGTGAGCATAACACGACACGAATGAAATATTTTGATGCTAATGGGAAGCC
AGCATCAGGTATCTTGGCAGGAAACGTTTATTGGCTTGGTGATTATAACG
AATGTCTTGGAATCCCGAATTCCACTTTTTGCACCATCATTGACTTGAAA
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TTTTTCTTTAAAAATATCGCTGCATCCGGCAATATTGGGCACATGTTTTC
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TACACCAATTATGGAGTACTATGGAACCAAAAACCTGTATTGTGTTTCGA
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GTTTTCAGGGAACAATAATACAATGGTTGTAGCTGATACACCAATTATGG
AGTACTATGGAACCAAAAACCTGTATTGTGTTTCGAATGGGAATACTCAA
ATGCGCATTGGGACCATTTTGGCATTAGTGTTCACAAGCATCATTGTATT
GCTCACAACCATCGGGACACTCGTTCATCTATATGATGTATTCACAGGTG
TTGATTACTCACCATTCATCGAGCAGTTCAACCCAACAGCCAGTAATATA
CAAAGCGTTGCACAAAACGCTAATGATCAAGCTACAGCAGATCCCAACGA
AGAAAGAGTGCCTGTGATCACGATACAAAATCTTCAGTTGCCCATGCGAG
AGTGTTCACAAGCATCATTGTATTGCTCACAACCATCGGGACACTCGTTC
ATCTATATGATGTATTCACAGGTGTTGATTACTCACCATTCATCGAGCAG
TTCAACCCAACAGCCAGTAATATACAAAGCGTTGCACAAAACGCTAATGA
TCAAGCTACAGCAGATCCCAACGAAGAAAGAGTGCCTGTGATCACGATAC
AAAATCTTCAGTTGCCCATGCGAGGACCCCTCCCGAAACAACTGGTATTA
TGTTTTTCACTAATCAGCAACACTGAAGCTATTTTGACCACAAAAACAAG
AGATGGAGTTATGAAAGTACTAAACAGTGTTCGAGTCATCAGCCTGTGCT
GGGTTGTGATTGGTCATATGTTGTTTTATGCACCCCTCTACTCACCCGTT
GGACCCCTCCCGAAACAACTGGTATTATGTTTTTCACTAATCAGCAACAC
TGAAGCTATTTTGACCACAAAAACAAGAGATGGAGTTATGAAAGTACTAA
ACAGTGTTCGAGTCATCAGCCTGTGCTGGGTTGTGATTGGTCATATGTTG
TTTTATGCACCCCTCTACTCACCCGTTGACAACTCAGTATACGTGTATAA
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CTGTCGATTCTTTCTTCTTAGTAAGACAACTCAGTATACGTGTATAATTC
GTGGTTGAAATTATTTCCAGTGCAAATCATCTTGAGCAGTACTTTGGCTG
TCGATTCTTTCTTCTTAGTAAGCGGATGTTTGGCTTGTATTCAACTTTTG
ACCAGAGAAGCTCTGAATGATAGAAAAACGATCAAAGATTATTTCTTGAT
GATTTTTCATAGGTTACTCAGCGGATGTTTGGCTTGTATTCAACTTTTGA
CCAGAGAAGCTCTGAATGATAGAAAAACGATCAAAGATTATTTCTTGATG
ATTTTTCATAGGTTACTCAGGCTATTACCTGCGTATATGTTCGTCATTCT
TTTCTACACATACATCTTCCCGCATATGTCGAGCGGGCCGTTTTGGTTCC
CACATCGTGAAGATAGTTCCCAGGTGTCCGCTTGCAAGAAATACTGGTGG
AGTAATTTGCTCTTCGTAAACGAATTCGTTTTTACGAATTTTGATGAGGG
CGCTATTACCTGCGTATATGTTCGTCATTCTTTTCTACACATACATCTTC
CCGCATATGTCGAGCGGGCCGTTTTGGTTCCCACATCGTGAAGATAGTTC
CCAGGTGTCCGCTTGCAAGAAATACTGGTGGAGTAATTTGCTCTTCGTAA
ACGAATTCGTTTTTACGAATTTTGATGAGGGCTGTATACCTTGGTCTTGG
TACTTAGCAGTTGATACGATGTTTTATTTGTTCAATCCTCTGTTTGTATA
CCTGGTGAAACGTGTATACCTTGGTCTTGGTACTTAGCAGTTGATACGAT
GTTTTATTTGTTCAATCCTCTGTTTGTATACCTGGTGAAACGGATTAAAG
GTATAGTACTCATGGTGGTCGGGATTGTATTATCAATTGGTTTGAAAGGA
TATGTTCTTTACTACTACCATGCTACACCTCTTTTCAATACTGAAACATA
TCGAGATGGTATTGAGCAAGAAGAGATTAAAGGTATAGTACTCATGGTGG
TCGGGATTGTATTATCAATTGGTTTGAAAGGATATGTTCTTTACTACTAC
CATGCTACACCTCTTTTCAATACTGAAACATATCGAGATGGTATTGAGCA
AGAAGATCCGAAAGCTGCACTGATGAAATATTTGAATCACATTTACATCA
AGCCCTATTTTCGTATATCACCATACTTGGTTGGAATAATGCTTGGTTAC
GTCATCTTCAAGAAAATTGAAGTTCCTCGAACCAAATCTCGAAAATTGTC
CGAAAGCTGCACTGATGAAATATTTGAATCACATTTACATCAAGCCCTAT
TTTCGTATATCACCATACTTGGTTGGAATAATGCTTGGTTACGTCATCTT
CAAGAAAATTGAAGTTCCTCGAACCAAATCTCGAAAATTGAAAGCTTACT
CGGTGACATGGTTGTTGAGTATCGCTTTTTCTTTCCTTGCCGTGTTCGCT
CCATCAATAACGGCAAACACATTTTCTGAAGTCAGCATTGTTTTTTATGG
GATCTTCTTTCGATTGTTGTGGTCAATTGCAGTTGCGTGGATGATTTACG
CTTGCCATATTGGCTACGCAGAAAGCTTACTCGGTGACATGGTTGTTGAG
TATCGCTTTTTCTTTCCTTGCCGTGTTCGCTCCATCAATAACGGCAAACA
CATTTTCTGAAGTCAGCATTGTTTTTTATGGGATCTTCTTTCGATTGTTG
TGGTCAATTGCAGTTGCGTGGATGATTTACGCTTGCCATATTGGCTACGC
AGGCATTATTGCAGATATGTTATGCAGTAAATTGTTCATACCATTATACC
GTGTAACTTATTCCGCCTATTTATGTCACGTGCTCGTTATTATTTACTTC
TTCGGATCACTTCAAACCCCGATACACTTTAATGACACAACTTTTGCATT
ATTGCAGATATGTTATGCAGTAAATTGTTCATACCATTATACCGTGTAAC
TTATTCCGCCTATTTATGTCACGTGCTCGTTATTATTTACTTCTTCGGAT
CACTTCAAACCCCGATACACTTTAATGACACAACTTTTGGAACGGTATTC
GCAGGGATGTTGGTGGTCATTTACATTTCTGGTTTTCTCATCGCAGTGTT
TGTTGAATTCCCTGTATATAACTTAGAGAAAGTTGCTCCAAAATGGGCAG
GCATATATTTTGGCATTTTTCTTGCTTTTTTTTCGATTATTATGCTTAGT
AGCAATATGACCTCCCTCTCACTAATTTAAGGAACGGTATTCGCAGGGAT
GTTGGTGGTCATTTACATTTCTGGTTTTCTCATCGCAGTGTTTGTTGAAT
TCCCTGTATATAACTTAGAGAAAGTTGCTCCAAAATGGGCAGGCATATAT
TTTGGCATTTTTCTTGCTTTTTTTTCGATTATTATGCTTAGTAGCAATAT
GACCTCCCTCTCACTAATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_044093XLOC_044093-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:754519..767513 -
Properties
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