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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000089_pilon:139897..145300- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044081 ID=XLOC_044081|Name=XLOC_044081|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:139897..145300- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATGTTAAGAAAGGTGGCATCATTCGGAGAAATCGACCTGGAAT
GAAAGCACAGGTTTGCAATAATCTTCTGAGAAGCTAATTTCGATAGTTGA
TTTTTAAGAAAGCGAAATTTGAGTTTTTTGATTTACAAAATCTTTTGTCA
GGTTTAGCAGATCAATTCTTTTTTCAGAAACAGATTGAATCTTGTTTTTA
CTACCTATAAGTTTTTTGCTTTAGGATATGTGCAATTGGCCAGACGAAAC
ATTTGAGGAGATGGATACCACTCTTGCTGTACAACAGGTGTGTAAAGAAA
ACGTGTTATTTCGGAATTACCTCAATTGTGGTAAAGATATGTGTTTTTAG
AGCTTATAATAACATCACTAATATTGAAAGGTAATCTCTAAGTAAGTTAT
ATAAATTAATTCAAAATTTTAGACTTGCAGGCTTTCTAAAATTTGCTAAT
TCTTTCTTCTCATGACCAGGCATGGTGGTTAATGGCCAGTATTTAGTCTT
TACTTTATGAACAGTCATGTGATACCATATCTTTACCTTATCTTTGCAGT
ATATTCAACAGATGATAAGACAAGACAACACAAAAATTGAAGAGATTCTT
GAACCTCCAGAAGGTCAAGATGAAGGTGTTTGGAAGTATGAACATCTTCG
GCAATTCTGCTTGGAATTCAATGGACTGGCCGTCAAACTGCAGGTTACTT
TAATCGTAGAAATTTTTGCGAGACTAATTTTAGCATTTTAGCGAGTTTTC
CCTATTTTCGCTAAAATAAATCTCGCTAAAACACGCCGAATCGACAGATC
GCTAAAATTTATCCACGCGAAATTTCTGGTTATATTGCCTTGATACATTT
TTATCAATAGGAATGGTTTCAGTGCAAAGAAATGCTAGAAAACGAATTCA
GTCAATAATGAAATACGAGTATTCGCTAAAATTTATCCACGCGAAATCTC
AGGGGGGGGTCAACATCCAGATACCAGACCCATAGCCGGGTGGTGGTGTC
TTTTTTTCCTTTAAAAGTCTGAAAAGTCAAGTTGGTATTGATGGGGGTGG
GTCCCCCTTTTTTTAGAAAAAAAGAGTTATCCTCAGTTGGTATTGATACC
AAAATAGGGGGTGGGTACCCCTTTTTTAAATATGATTCAGAAAGTTGGTA
TCCATATCAAAATGACAGCAAAACTTTCCTAATTTTTTCCCGTATAGCTA
GAAAAACCGGGGTACATATAAAGGTTCATTGGGATTTTTTTAGCTTTTTG
AGTATAATGACTGTAATGAGTAATAAGTATAAATGCTTTGAAGTTTGTTT
ATTTGGACTTTTTCGATATTTTAAAGTTTTTTTTTGATCATGATTTGATT
TTTGTGAAAAAATTTTTCTGTGATAGCTTTGGTATGAAATCAGTCTAATA
TAGCTTCTCCTAGTTTTTGCACATCAATTATATTCAGATAATATTGATTC
AGATTGATTTTGCTAGCTTCATTGGGTTTGTTTTTATTATATTGTCTGTT
TTCAGTCATTTTCTATTTTAGCATATGAAATTTTTTGTGTTGTGTTGAAG
AAAGAGTATTTCAAAAATGAGTTTTTTTGAAGTTTCTAATAGTACCCTGT
TTGTGTGGGAGGGGGTGGGTCCCCTTTAAACAGCTTTAAACTCAAATTTG
TCAGATTGGTATTGGTACTAAATTAGGGGGTGGGTCCCATGATATTTTGT
CAAATTCAAAAAGTCATGTTGGTATCGATACCAAATTAAGGGGGTGGGTC
CCCCCTTTTTCTGAAAATTATGATTTTCAAGTTGGTATCGATACCAAAAT
AAGGGGGTGGGTCCCCCTTTTTCTGAAAATTACGATTTTTCAAGTTGGTA
TCGATACCAATTTTGGGGTGGTGGTGTTAACTTAGCTCAAAAGGTCAAAA
GTCAGGTTTTTGGGCTATGGGTTGGTATTATAAATGTTGACCCCCCCCTG
GAAATCTTTTGAAATCGTGATTCGCTAAAATAAATCCAAAAAAAATCAAG
ATTTTTCTGGCTCTCTAATATATGCTAAAATTAGTCTCGCTAAAATTTCT
ACGATTAAAGTATTGAAATTCATTCTCTGTTATTTATAAACTGTTTCATA
TCGGTCAAAGAGTATTGATTAACTGATAAAAGAGTTTTTAGATTATACCG
GGTGCGCCACAAAAAAGTTTCTCTCTTTTAAACTAAATTTCTCGAAATCT
AAAATTTTTAAAAGAACCATTTCTATTTCATTGGAAAGAAGAAAGATAAA
CTTAAATTTTGATGCGTCATTTATTAAATTCGAATCATTAGATCAAAAGT
TATGTTCAATTGAATAAAAAAGTTACTTTCAAAAAGTGCTTGAAAACGTT
AAAAATAGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATGATTACATGATACATCAG
TATTTTCGAATCAGTCATTAAAAAATGATAATTAGCTGTCGAAAATCTTT
TGTTATATAAAGGAGTTGAATTCAATAAAAGAAAATTCGTCGAAAAGGCC
AAAAATCTGGTAAAATTTTAAAAATACAAATATGGGTTTTCGAGGTTAAT
CCAGCCTTACATAGACTTTTTCCGGTCTATAACCAAAAATCTGAGGAAAA
TTTCACTAAAAGTAAATTAAATTGATTTTGATGAATATTTTAAACTCTTG
TTGACCCTTCAGTTTCAAAATTTATGTGTTTAGTTACTGAAAAATGCTCT
TAATCATGTAAAGGCTTTTGCGACCACCAAATTTGAAATAAAAATTTGAT
AGGTCAATTTTCAACGTTTCCGTGCACTTTCTGAAAGTAACTTTTTTATT
CAATTGAGCATAACTTTCGATCTAATGAACCGAATTTAATAAATGACCCA
TCAAAATTTAAGTTTATCTTTTTTCTTTCCAATGAAATGGGAATGGTTCT
TTTAGAATTTTTCGATTTTGAGAAATTTAGTTTCAAAGAGAGAAACTTTT
TTGTGGCGCACCCGGTATTTCATTAAAAAAAATTGATTTTAAAATCTCTA
GGAATATCTGGAACATGCCTTTCCATTTTATAAATTTTTTGAATATTTTT
TCTTTCCAGCAAGAATGTAAACCTGACACATGTACACAAATGACAGCCAC
CGAACAATGGATCTTTTTATGTGCTGCTCATAAAACGCCAAAAGAAGTAA
GTGAACAAGATTTTACATTACATTACTGTACATTACATTATATATTTTGC
ATTCTCGCAAATAGCATCTCATAATCCTCCGTTTTTTAACCTTCTCATTC
CTTCTTATGTAAAATGTCACTTTCACAGTTTTCTTTCATGTAAGGCTCTT
GGGGTGCATTAGGGAAAATAAACCCATTGCACGATCGACTTTAGGTGAAA
TATGGTATAATAGCACGCCTGGCCGCTAATACGATTTTAACTGACCTCAT
ATAAATTGTATCCCACCTCGATATGACAGTGTAAGTAATAGTATCATTTG
CAACTTTTTTTATGGTTATGATGTTTTTTGATTTCAGTGTCCAGCAGTTG
ATTACACCAGACATACATTAGATGGCGCAGCTTCTTTACTAAACAGCAAC
AAATATTTCCCAAGCAGGTATGTTCAACTAATTTGTTAATGGGCTAATTC
TAAAAATGTTCTCCAATGTTGAGAGATTGTTTTTAGTAAGTTGAAGCCTA
TGGATTTTTGATCCTCTTGATTTTTGACCACCCTGGATTTTACATATAAA
TTTCACTGAGTCCCTGGTAAGAAAAATGTTACCTTCTTAACATGAGCAGG
GGGTGTTTAAATTCTTTAACAAAATTAATAACTTTCTAATGAAGATTCCT
GTAACTTCAAGAGATAATTATATCAAATGAAAACATACTACATTCTTAAA
GGTTAGAAAAGATTGAGGAAATTTTCCGTTTTGTAATCTTTTATCGATCT
TTGACTGGGTCTTTAGTGATTGAATTAAAAAACATTACATTTTCTAACAG
AATAGTGGTTTTTTGATACCTTTGAAACTTGAACTTTTGATTCAGTGCTT
CTAATTACATCCAATGCTCAGTCTGATTGTTTTTCTTTAAACTTTAATTT
TAGAGTCAGTATAAAAGAATCTTCTGTGATGAAACTTGGTTCAGTGTGTC
GTCGTGTGTATAGGGTCTTCTCGCATGCTTATTTTCACCATCCAGCTTTG
TTCAAAGATTTTGAGGTATGTAAAAGCTTAATCCCTGTCATTTCTTTTCG
AAAAATATATTCTTTGCCTGATGGCTATCCATTTACGTAGGTAAAACCAC
TTTAGGAAATATGAAAGAAATTGTTTAAGATTTGAATTTATTTTGTGGAA
TGGGCAGGGGGGTTCAAGCAGTTAATCCAAAACACTATGCCTGTTTTGAC
CGTGGTGGTCCATTTTCAAATTTTGCCAAAAACTGCCAAAGGGGTGGTCT
CTGAAAGAATTCTGGGAAAAAAATGGACTAACTGCATTTTCTGTCATTCT
GTAAAATTCATTTATTCTGATTCATGCTCGTTTTTGCCTCTTCTTCTGTC
TTTAAAACGTCAAATTGCATCAAAGTCTTGCTTTAACTTTCTCCTGCTTT
GTTTACGAATTCCGTTTTCACTAATTTTCAAGCTGTTATAAAATCGGGTG
ATTCGCCCCTTTTTTTGTAAACAAAAATCCGATTAAAACAGATTAAAAAT
GGTAGACAATTTGCGAAATACATTTCAGGTGGAACAGCCTGCTTGCAAGC
TTGTATAACCTTTTTATCAAAATGGTTTGTTTTAAACCAGCTTTTACTTA
AAAATTTTGATCACAAATTGTGATCGTCACACAGAATTGTGCTCCAAAAA
AAGTTAAAATTACTTAGAAAGTCGACCAACATCAATTAAATAACTTAATG
CATGCCAAAATGCCGCGATGGACTTTTAGGGGGTGGTATACAAAGATTGT
GGCTGAAAAACAGTAAATCCAGTGTGGATTAAGTGTCAGAATGGGTGGGT
GGTCCTAAATATCATCCAAAATCAGTTACTACGGATGATGTTCTGGATTA
ACTGCTTGACCCCCCCCCTGGAATGGGTTGATATTGACTTTTTGAAATAG
ATCACTTTAAACAACTTTTCTTGTCGCCTCGCCGCCTACCAAATATCTTT
ATCAGGTTCCCAAAACCTGGATGATGAAAATCGATTTATAAAGCAGTTAT
AAGTCTTTTTTGATGACGTTGTTATCAGCAAAGCTGAAAACGTTCATAAT
TTGGGAGTAAATTTACATAAATTCTGTCTTTTTTAGAACGAAACACACTT
ATGTAAACGTTTCACGCGGTTTGTAATGAAATACAACTTGATGTCACGTG
ACAATTTGATAGTTCCCATCCTTGAAGAGGAGGATGGTGAGGGAGAAGGT
TACATGATCAATAACGAAGCTAACGAAGAATTCGGAGATGAATCCTACTC
ATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000089_pilon:139897..145300- >XLOC_044081 ID=XLOC_044081|Name=XLOC_044081|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1428bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000089_pilon:139897..145300- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGATGTTAAGAAAGGTGGCATCATTCGGAGAAATCGACCTGGAAT
GAAAGCACAGATGGCTGATGTTAAGAAAGGTGGCATCATTCGGAGAAATC
GACCTGGAATGAAAGCACAGGATATGTGCAATTGGCCAGACGAAACATTT
GAGGAGATGGATACCACTCTTGCTGTACAACAGGATATGTGCAATTGGCC
AGACGAAACATTTGAGGAGATGGATACCACTCTTGCTGTACAACAGTATA
TTCAACAGATGATAAGACAAGACAACACAAAAATTGAAGAGATTCTTGAA
CCTCCAGAAGGTCAAGATGAAGGTGTTTGGAAGTATGAACATCTTCGGCA
ATTCTGCTTGGAATTCAATGGACTGGCCGTCAAACTGCAGTATATTCAAC
AGATGATAAGACAAGACAACACAAAAATTGAAGAGATTCTTGAACCTCCA
GAAGGTCAAGATGAAGGTGTTTGGAAGTATGAACATCTTCGGCAATTCTG
CTTGGAATTCAATGGACTGGCCGTCAAACTGCAGCAAGAATGTAAACCTG
ACACATGTACACAAATGACAGCCACCGAACAATGGATCTTTTTATGTGCT
GCTCATAAAACGCCAAAAGAACAAGAATGTAAACCTGACACATGTACACA
AATGACAGCCACCGAACAATGGATCTTTTTATGTGCTGCTCATAAAACGC
CAAAAGAATGTCCAGCAGTTGATTACACCAGACATACATTAGATGGCGCA
GCTTCTTTACTAAACAGCAACAAATATTTCCCAAGCAGTGTCCAGCAGTT
GATTACACCAGACATACATTAGATGGCGCAGCTTCTTTACTAAACAGCAA
CAAATATTTCCCAAGCAGAGTCAGTATAAAAGAATCTTCTGTGATGAAAC
TTGGTTCAGTGTGTCGTCGTGTGTATAGGGTCTTCTCGCATGCTTATTTT
CACCATCCAGCTTTGTTCAAAGATTTTGAGAGTCAGTATAAAAGAATCTT
CTGTGATGAAACTTGGTTCAGTGTGTCGTCGTGTGTATAGGGTCTTCTCG
CATGCTTATTTTCACCATCCAGCTTTGTTCAAAGATTTTGAGAACGAAAC
ACACTTATGTAAACGTTTCACGCGGTTTGTAATGAAATACAACTTGATGT
CACGTGACAATTTGATAGTTCCCATCCTTGAAGAGGAGGATGGTGAGGGA
GAAGGTTACATGATCAATAACGAAGCTAACGAAGAATTCGGAGATGAATC
CTACTCATAGAACGAAACACACTTATGTAAACGTTTCACGCGGTTTGTAA
TGAAATACAACTTGATGTCACGTGACAATTTGATAGTTCCCATCCTTGAA
GAGGAGGATGGTGAGGGAGAAGGTTACATGATCAATAACGAAGCTAACGA
AGAATTCGGAGATGAATCCTACTCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000089_pilon | genome | sc0000089_pilon:139897..145300 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 547-714:169 |
| Aaloc | 436-546:1351 |
| Aaloc | 355-432:1918 |
| Aaloc | 268-354:2346 |
| Aaloc | 124-267:4856 |
| Aaloc | 61-123:5181 |
| Aaloc | 1-60:5405 |
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