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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:69749..74335+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_044051 ID=XLOC_044051|Name=XLOC_044051|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4587bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:69749..74335+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGATGCTGTCAGAATGATTTTGGTGGCTTTGAGCCTTAGCTCATT
TTGCACAAGTACAGTATATGAAAGTAAGTTGTAATAAGTGTATTTATTCC
CTCCATCTAGTAATGGACCCAAGCTTGaaaaaaggtcactgacaaagtaa
aaatgatttaaaactttataaaaaaattccgAAGTGAGTGAATCgatatg
atgaaaaaaatttctgaaaatttttttggatccGTTAGAACGTTGAATAC
TTTGAAACGCAAATCTTAGATTGAAAGTTTACATCTTTCTGCATATTTCT
CACGAAAGATATGAAATGACTACCCTATAAGACTGGGTGAAGCTGTCTTT
CCGAAATTTCCAAACGTTTTAAAATCTAATGTTTCTCAAATTTGCAATGT
TCTTCGTTTCCGCAGGATGTGGTCAAGAATTCGATGTGATTGGATGTTTC
ACACAAACCACAAAAGCTGAACGTTTCAATAAAACCTTATCTCATGTTGA
CTGGTGGCGCTATGATCATAAGTCCTTTGAAATGTAAgatcacgtttttt
ataagaacaaactttatgaGAACATttggcttcaatggccaaaatcttaa
gaacaagatttaggcttaaaactcagaaagttaagaacatccaaaaggct
ttaaaaaatttagatgttcttataaaaaacgtgataTGATCCTTTTTGCC
TCCTAAAATTTAAACAgatatttcaaggtttttcaTTGCCGCATTATAAT
GTGTTGCATTTTACATTGCAGTCTGCATTCCTCTTAAATCAAAAACCTAA
ATTCTTCGTTTCTGAATAAACAAATTTGATGTATTTTGAGGGTCATTCTT
ATCATAATAAATCATTAATCTCTTGATGATTCAATCGCCTGGTGATCATT
TacttattcattttttcaaaggcttttATGCAAGTGTTCAGCTAAAGCAA
GAGAGAAAGGGTACATCGCCTTTACGTTTCATGATTATGTCGAATGTCAC
GGTACCGATGATTACAAAGAGTATACAGATTTGATAACTAATGAGGATCG
AGCGAGTGATGAATGCATCAATGAAGAATATGAGCTGTGTGataatggtc
aaaaatattgtATGGGTGGACCTTATGAGCAATATATCTACAAGTTGAAT
TATACAGGTATCGACCTCTTTAATTCTAATAAATGTGCTAGAAATGGTTA
AAGCAGTTCCAGGCTCATATCTCGTCAAGCTACtgcagaaaaaaatatga
aactaGTTAATTGGGGCTaaaaaaaCGTTTCCAGAGAAAGTTTTCCATTC
TTTGGATacataaaaactaaatttgacgAAAACTTATGTGATGATATATG
CCCTCCCCATGGGGAATGGGTCCAAGTCCTTACGAAGTGGAAATTCctcc
ttcttttttttcaattagaaaTGTATAGCGCCGTCCAGACACTGCTAGTT
CTGTGCACAAGACACAGGATACCATGATGCATGGCGATGGTACTCGAACT
CGAGCGGAAGAGCATATAGCTCATATAGCAATGTCTACCATAGCACTTTT
GATGTAACAAGGTAGTGGTACCCGATTCCCCTTACATGATATGGGTTAAC
CCAGGTGAAGGTGtgttcacttgccaagcgaGCCGTAGTACTACCGTGGG
AAATCGAACTCAGACCTCCTGGAAAGAAGTCAAGAGAGATGACCACCACA
CCACTACACCTTTTAGAATCCCATCGTGTTTCTTTAGGACTCAAATGATC
CTTAACTGATCATAGGTATGccgttttgaatattttgaattttgaatagt
cattttttgtcatcttttttgatgctaattttCAGGGAGTGGTATTTTCA
CACAATGGTCAAGTTTCGGTAATTGCAGTAAGCCTTGTGGTGGAGGAATA
CAGTATCGTACACGAGTATGTGCTTCTGGTGGAAACGATTGCGTTGGTTC
AACCAGAGAGGAGAGAGAATGCAACATGGAGAAATGTCCTCCTCCACCGT
GTAAGACGTTTGTTGCAACGGCCCAGAGCTTGCACACGTTGTCTAtcata
agaacatcaaaaaatttcgaaatcttCGGATgctcttttaattttttcag
ttttaagccaaaaaatgttgtgcttattttcaccaatttgtgTAATTTTG
TCCACTTTCCTAAGAGATTGAGTGTTTTAAAgcccataaagccttaaaat
attcttaactttgatgaattttctttatattttggcCGTCgtagccttat
gctcttatatggtttattcttttaaaaacgtATACATAGCGTTGTTTTAG
TTCTCACTCGCCTCTCTTTATATGTGTGTTACGGATTTtgaatgaacgtt
gaaaaaacgttatgTATCAGCTGTTCGGAATTGTCGAAGAGAGTTTTGAC
GGCTTTGATTGACAAAAAGAAGATCAGATCATTCAACATTTAGAACATGA
TATGAGGAAGGTCATTCATAATGAAGTGCTCGGACGGGACTAAAAAATTG
TGTAATGTAACTTAAATCTtaaacttattttctttttcctagTGACACCA
ATACCTCCAAAAACATGTCGATGGGGAAATTGGACCAAATATTCCTCTTG
TAGTCAATCATGCGGTGAAGGATTTCAAAAGCGAACACGAAAATGTGATG
ACGGTCCCCAGGTTCCTGGTGGTGAACAATGTGTAGCAGAGAGTGAACAG
ATAGAGTCTTGCTTTGTACGAGATTGTCCAGGTGAACTGCTTGCTCCTAA
AGTCGAATTGCAAATTGATTTTTCAGCTTCGGagatagacgatgctatcg
tccgtttttGAGGGTCAATAAACGCAGGAAAATAtgagtcagggcgtcag
ggcggtttacgggaaaatagtggcggtagagttttggaacactgtaaaca
ccttCGCCCCGAACTaaactcgttttcaaatttataccGCCTTCTATGAA
TTATTCCCTTTTTCAGTGAtaatgtgtagacgataggaacGTCTACTTCG
GAGAGGGCTTGAAATGGACTTTTTTCATTACCCATTATGATATTTTACGA
CATTTATGTCCTTTAGTTAGCAACCCCATCACCAAATGTAGATTCTTAGG
TAGTTATGGTCCTTATTCATTGTGATTGGGTTGGCTAAGTCGTAGAGACA
ATTCCCATGTCTTTAATATCATTAATGTTCTCTTTCAGATGTCAATCATT
GGGGACCATGGTCCAGCTACACTACTTGCAGTAAGACATGTGATGAAGGC
AAGAAGTCAAGAAAAAGAGTTTGTATTCAAGCAAATCCTCCAAATAAAGA
TAAAAGCAAAGATACTTGCCATGGTGATCAAATGGAATATACCACCTGCA
ATCTTCGTCTTTGTTTAAGTAAGGTTTTTCTTGAATCTTTAAAAGAGCTT
TTTTGCCACTATCTATGAACACCCCCCTCCCAGCGGaacttcaattcacg
caatcacgcaaatcgTTTCCCAAATTCATCAAATCAAAGCATGTCATCAG
AATCTACAAAAACAATCATCAGAGGATGATACACAAGTAGCACAAGTTAT
GATTTGTCCACTTTTTACTGACACATACCAAAGAGTTGGATAGTTCAAAA
AGCCTGATTCTTCATCACTAATAGCTTCAAAGTAATACAAATGTAAGGAT
ACAACACATCTAGTGTACACATTCTACATTCACTAGCAGTGTTGTTATTT
CGAAATCTCAGTAATGACAATTTTAAACCACCACGACTCACGGTTTTTAC
ATTGAGTTTCGAATAGGGATACAATCAAAGACAGAAAATCCCAGTGGTAA
AGAAATTGTTGAGTATATTTTCCAATGTTGACCAAatttcccaatgggga
tagggATCCTAACGGGTCTATAAGACGGGGGATGTGTCAGGGCCTCaaaa
aaaaTACTGAATATATCTATATCTTTCTAAGTACATTACTCGTTAAATGG
AGAACTCTCACTTAGAATCAGTGTAATATTACTCTTTCACTTTGtgggat
ttttccaatttttttactttttactttcagTGAAGCCAACGTGTTACCAC
AAATACACTCCATGGTCTTTGGATGAAAGTGGAAACCCAGAAGCCTTATC
TTACCACAAAATCCATTGCGCTGATTGGCATGTTCTTAATCGTGTCCGGT
TAGATCGAAACATGTTTAAGAACAGATATAGATATTACTACCGCTGCTGC
CATTCACAACTACCCTGTGACGATTCCCAAACGAAAAACAAACCCACACT
CAATAACGGTACAATGGTTTCACTTGACCAACAACCAGTCCATTGTGGAA
AATTTGGAGTTAGTTATTTGAAATTGAATACGATTATGgataaaaaacaa
tatttgaGTTACACATTTGAATGTTGTAGACCTAGGAATGAGCTAGCTGG
AACTATATGTTATAAGGGGAACACAGGATTCAAAAAGAGGAAGGCGCTTG
ATGAACATTCGATCTCATGCACCAAGGATGATCGTTACTTCATTGCaaat
tttaacttaaaaattaaCCATACACAAGACAGTGTCCGCTATGATTATGA
ATGTTGTAGAATCGACCCAACcgttaaaaacttttaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:69749..74335+ >XLOC_044051 ID=XLOC_044051|Name=XLOC_044051|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3036bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:69749..74335+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGATGCTGTCAGAATGATTTTGGTGGCTTTGAGCCTTAGCTCATT
TTGCACAAGTACAGTATATGAAAATGAGAGATGCTGTCAGAATGATTTTG
GTGGCTTTGAGCCTTAGCTCATTTTGCACAAGTACAGTATATGAAAGATG
TGGTCAAGAATTCGATGTGATTGGATGTTTCACACAAACCACAAAAGCTG
AACGTTTCAATAAAACCTTATCTCATGTTGACTGGTGGCGCTATGATCAT
AAGTCCTTTGAAATGATGTGGTCAAGAATTCGATGTGATTGGATGTTTCA
CACAAACCACAAAAGCTGAACGTTTCAATAAAACCTTATCTCATGTTGAC
TGGTGGCGCTATGATCATAAGTCCTTTGAAATgcttttATGCAAGTGTTC
AGCTAAAGCAAGAGAGAAAGGGTACATCGCCTTTACGTTTCATGATTATG
TCGAATGTCACGGTACCGATGATTACAAAGAGTATACAGATTTGATAACT
AATGAGGATCGAGCGAGTGATGAATGCATCAATGAAGAATATGAGCTGTG
TGataatggtcaaaaatattgtATGGGTGGACCTTATGAGCAATATATCT
ACAAGTTGAATTATACAGgcttttATGCAAGTGTTCAGCTAAAGCAAGAG
AGAAAGGGTACATCGCCTTTACGTTTCATGATTATGTCGAATGTCACGGT
ACCGATGATTACAAAGAGTATACAGATTTGATAACTAATGAGGATCGAGC
GAGTGATGAATGCATCAATGAAGAATATGAGCTGTGTGataatggtcaaa
aatattgtATGGGTGGACCTTATGAGCAATATATCTACAAGTTGAATTAT
ACAGGGAGTGGTATTTTCACACAATGGTCAAGTTTCGGTAATTGCAGTAA
GCCTTGTGGTGGAGGAATACAGTATCGTACACGAGTATGTGCTTCTGGTG
GAAACGATTGCGTTGGTTCAACCAGAGAGGAGAGAGAATGCAACATGGAG
AAATGTCCTCCTCCACCGTGGAGTGGTATTTTCACACAATGGTCAAGTTT
CGGTAATTGCAGTAAGCCTTGTGGTGGAGGAATACAGTATCGTACACGAG
TATGTGCTTCTGGTGGAAACGATTGCGTTGGTTCAACCAGAGAGGAGAGA
GAATGCAACATGGAGAAATGTCCTCCTCCACCGTTGACACCAATACCTCC
AAAAACATGTCGATGGGGAAATTGGACCAAATATTCCTCTTGTAGTCAAT
CATGCGGTGAAGGATTTCAAAAGCGAACACGAAAATGTGATGACGGTCCC
CAGGTTCCTGGTGGTGAACAATGTGTAGCAGAGAGTGAACAGATAGAGTC
TTGCTTTGTACGAGATTGTCCAGTGACACCAATACCTCCAAAAACATGTC
GATGGGGAAATTGGACCAAATATTCCTCTTGTAGTCAATCATGCGGTGAA
GGATTTCAAAAGCGAACACGAAAATGTGATGACGGTCCCCAGGTTCCTGG
TGGTGAACAATGTGTAGCAGAGAGTGAACAGATAGAGTCTTGCTTTGTAC
GAGATTGTCCAGATGTCAATCATTGGGGACCATGGTCCAGCTACACTACT
TGCAGTAAGACATGTGATGAAGGCAAGAAGTCAAGAAAAAGAGTTTGTAT
TCAAGCAAATCCTCCAAATAAAGATAAAAGCAAAGATACTTGCCATGGTG
ATCAAATGGAATATACCACCTGCAATCTTCGTCTTTGTTTAAATGTCAAT
CATTGGGGACCATGGTCCAGCTACACTACTTGCAGTAAGACATGTGATGA
AGGCAAGAAGTCAAGAAAAAGAGTTTGTATTCAAGCAAATCCTCCAAATA
AAGATAAAAGCAAAGATACTTGCCATGGTGATCAAATGGAATATACCACC
TGCAATCTTCGTCTTTGTTTAATGAAGCCAACGTGTTACCACAAATACAC
TCCATGGTCTTTGGATGAAAGTGGAAACCCAGAAGCCTTATCTTACCACA
AAATCCATTGCGCTGATTGGCATGTTCTTAATCGTGTCCGGTTAGATCGA
AACATGTTTAAGAACAGATATAGATATTACTACCGCTGCTGCCATTCACA
ACTACCCTGTGACGATTCCCAAACGAAAAACAAACCCACACTCAATAACG
GTACAATGGTTTCACTTGACCAACAACCAGTCCATTGTGGAAAATTTGGA
GTTAGTTATTTGAAATTGAATACGATTATGgataaaaaacaatatttgaG
TTACACATTTGAATGTTGTAGACCTAGGAATGAGCTAGCTGGAACTATAT
GTTATAAGGGGAACACAGGATTCAAAAAGAGGAAGGCGCTTGATGAACAT
TCGATCTCATGCACCAAGGATGATCGTTACTTCATTGCaaattttaactt
aaaaattaaCCATACACAAGACAGTGTCCGCTATGATTATGAATGTTGTA
GAATCGACCCAACcgttaaaaacttttaaTGAAGCCAACGTGTTACCACA
AATACACTCCATGGTCTTTGGATGAAAGTGGAAACCCAGAAGCCTTATCT
TACCACAAAATCCATTGCGCTGATTGGCATGTTCTTAATCGTGTCCGGTT
AGATCGAAACATGTTTAAGAACAGATATAGATATTACTACCGCTGCTGCC
ATTCACAACTACCCTGTGACGATTCCCAAACGAAAAACAAACCCACACTC
AATAACGGTACAATGGTTTCACTTGACCAACAACCAGTCCATTGTGGAAA
ATTTGGAGTTAGTTATTTGAAATTGAATACGATTATGgataaaaaacaat
atttgaGTTACACATTTGAATGTTGTAGACCTAGGAATGAGCTAGCTGGA
ACTATATGTTATAAGGGGAACACAGGATTCAAAAAGAGGAAGGCGCTTGA
TGAACATTCGATCTCATGCACCAAGGATGATCGTTACTTCATTGCaaatt
ttaacttaaaaattaaCCATACACAAGACAGTGTCCGCTATGATTATGAA
TGTTGTAGAATCGACCCAACcgttaaaaacttttaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:69749..74335 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 964-1518:4033 |
| Aaloc | 784-960:3191 |
| Aaloc | 595-780:2545 |
| Aaloc | 430-591:1838 |
| Aaloc | 193-426:923 |
| Aaloc | 76-189:418 |
| Aaloc | 1-72:1 |
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