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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000061_pilon:82945..90186+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043948 ID=XLOC_043948|Name=XLOC_043948|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7242bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:82945..90186+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAAAATTGTGATTCTGATGACAATAGCAGTTGCTGTACAAGGTAA
ATATTTGGTCTTAGGGAGGGGCTTGATAAATGATTTAGCAACACACGTTG
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ttttcataaaaaaattctcgTACTTGGTCTAGATATATTTGTAAGTTGCA
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AGGGCACCACTCCTTTCCTTGGATTCTCCATTTTCCCTTGATTCTTCTCC
ttaaggctggtctccacttgtgcgcgctgcaatcgcacctttcggcttca
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cgaaaaaaagttgaacacatttcaacattttccaacccttacgtcacatc
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TTGCCGAGTAATAagcattttgggaatctttagtATGATCTGGCCGGTCA
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CCGTAGTCGATCATCCAAGACCTCTTATACTAGCAAATGTTCCTGTGGTT
AAAAATGACGTCAGCTTCACAAACAAAAGGATTAATCTTAggtgtagaac
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ATTATTCTTACGTTATCTTATAAATCACCACACCTCATAAATTATAATTT
GTAATCTCAAACAAGAATGCCCAACACGCGATATTTATATGTACTGTTGT
CAAGATAGCCTTATTAATTTTGGTGAAGTAAGAGCCAATATGAAAGGGCC
TCTAGTTAATAACTTTGAGTGAACTCAGCGGAGTCCCCAATCACGctatc
acgcaaaaaaaaattttaatcaccccagctggcacacaacgttgtttcaa
cgtttatctaacgttaatAGCATCCATACAACTCGCCGAAAATTCTCTAA
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ATTATGCAGGCCTCTCACGCATTGAACCCTAAAAGCACAATCCCGCAATT
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CGATTCATTTCAACATAGCATATCAACTGCATTTGAAACTcatctttttg
ttgtttttttagcaCGCATTGAAATTCTTTGTGGAGAAAAAGCGCTTTAT
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CGTCGGAAAATGCCGTTTAAATCCAGAATACACTGTCAGTGCGGACTATG
AAGAATGCGGACTCATGGTTGCAGAATCAGGTAAAGCTCCtttaaaaaca
acaatgttAGTATTGCTTGCAACTGTGTTTTTACTGTTCAACTTCAACGT
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atacattaggcttaaataaaaaaatctagtttttccggaatgcgggtgaa
ggaaaaaagctttcatgCGGCCGGAAAACCTttgtttttttactattttt
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tcgcctcgttgaatattacatcacctcagGTTAATAAGTCTCAATAACCA
GCTTTTACCTttcgaatatctgcttattattcaatggctgttttttgCCT
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ATTGGATATTGATATTAAATATGTTGATAAGAGTGGCGAAATACATGGAA
ATGATGAAGAGAACGTTAAGAAAGAATTAGGTAAGGACAAATTTCTTCGT
TTGCGGCCGACTTCGCGTATTCacgtaccttatcggccaaaaattagtcg
gccttaattttagtcggccttaattattagtcggccctaattttagtcat
ctcgtcaaaatttagtcactaagggccgactaataactaAAACCGATATA
TTcataaattctttgttaaagtaataccgatatgaaaagtgggttaagga
aagcttaattataaacttaaTTTTATTTGGCCCGAATTTTTAGCCGGCCT
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ttggccgataaatTAGTAGAGGGGTCAAAATACCGGCAGTACTTCTAAGG
CGGacttttaacttttgatacaaaaaGTTTTGCTTAAGCATCAATAACCA
TACGTTTTGACTACGATTGTGGCTTAAATTCAAGACataatacagttgac
tctttctaattcgatcttcaaattGACTAGGAGGAAAATAACTCAAATTa
gaaaaaagattcgaattactgAGGGTATTTTAAACAACTTTCCAGCTAAG
GGGGACCATTACttcagttcgaattatagaaagattcgaatagcttagta
ccaataccaataTGTTTTGAATAAGATTGTAGCTTGACTCTCtccaattc
gatcttcaaatgGACCAGGAGGAAAATACCTCAAATTAGAATtaacattc
gaattacagagggtATTTTAAACAACTTTCCAGCTAAGGGGGACCATTAC
ttcagttcgaattatagaaagattcgaataaggTAAAGTTGACTGTATAA
ATGGAGCGTATCAATTTTCGATTATCTTATAGGAGAAGACGTGACAGCAA
TAATCGATGGCCCTAATCTCAGCAAACTAGGCTTGATCGCATCTGCTTCT
GATTGTTTCGTTAGCCCTGACGCTGTTCCCGACGAACACAGTCTAAAATA
TTATTTGCTACGGGATATGTAAGTCTAAATTCTTTTCAGGTGTGatgaga
ccccccccccccagaggaCCCAAacttcacgcattcacacatttttcttt
tcaaaattcatgcattaatcttataaaaatatctactttgagcttaatcc
aagatcttggaatGTTGTTATGGCTACTTTTCTCTGGGTTGATTGCGCGG
TGAATGGAATTGTTATTCGTCCTCACAGATCGGAATGTGATTTTCATGGG
TAGAAATAAATTACAGAATGTGCAATGCGGTCACGAAATAAGTATTTCAG
TCACAGTAGAGTCTTTTTATAGAGACTTTAGTTAAAGATACCCAACTGTA
TTTTCATTTACCAAACAGGTGTCCAGAAGATGAAACATTAAAAATTGAGC
GTTACGGTACCGGGCAAAAAATAACCTTCAAAACGTTTAAGTTTGCTCAT
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TAAGACTTCATGCGGTACTTGTATCAAAAGATGGCGCAATATCTCCGCTG
TGTGGATTAAAACATGGAATAACCGTATCAGAAAACAAATGGTTTTTGAC
GTGACTACGATTCAACGTAAGACGTTTTATTATTACACGGATACGTATAT
AATCAAGGAAGAATTTTACACTTGTGATATGCTTGTAAAATATCTAGAGA
ATTTGCGTATCAAATCTGATGCAGGAGCCCGGAAAGATACACCTTGCAAT
ATGAAATACACCTCTATCTCACAGCACTGttggaactttttcctacagTG
GGTAGGGTATAAAAATTCTATCGGAATCCCAATGGGgatcaaaattttat
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TCGGCCAAATATTCCAGTGGGTGGGGGTCCTAGCGGGtgtgtgacacagg
ggtatatAATGTAACTATATAAATTACGGCAAAGTAGTGCAGTGGTCTCA
ATCTTGAATACTTTCCATGAggtcggggttcgattcccactcggtgctgt
gattcacttggcaaatTAATGTACCTTCCCCGGTTCAACCCATGTCATAT
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CATAGGACGGTTCTAACGAGACGGCTCCTAGACCACTCAATACAAAACCG
AGCATCCTCTGTTAGAAGAGGCCAGTCGTCATTATCATGTAATTTCATTT
CTtgctaattttttctttcagcttTGACTCGTGACAACATAAGATGTGGG
CGCGATGGAATCCGATTTATGGCAAAACCGTCCGATTTTCCCCGATGGAA
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TTTTTATTGGTTGACCCAGACTAAAAGACATATCTTCAAATTGATtgaat
taattgaaaatatcttcaaatttctTCGTTTTAGTAGAGTCTCAATAACA
CGAACCCTTATAACTCAAATGTCGCTCTTTTATTCGAACGAGTTTTGGTC
CTGTCAGTtaaaaatgccttataaaccttattacataactcaaaatttcc
ttacttaactcgaacaaatttgcgttccccgtGCGTGAAATTATATGGGA
ATTTTCTTTGCGACTGCTCAGAAgccaaactttttaaatttttagaagtT
TGTAtgtatcaaaagatttttaaaaagagactAAAGAGGCTTATGTTCCC
ATCTTCTTAGGTCATCAAGTCATAATGACAACATATCTTATCGGCACCAC
GACGGAGGAAGGCCGTATCACGAGACGCCGGCCTGTCAAATACATGATTC
GATGTGGATATGATCGTTTCTTAAGAGCATCAACCGTTTCAGCTGTGGAA
ACGGTCGTAAACGCAGCAGCTGGTTCGATCACACAGATTGCCAAACAGCC
TTTGGATCTGTATCTGCAATTGATGGATCAGAAAGGATTCCCTTATACTA
AACATATCCTTGAGATTGGTATTGATGAAAAGGTAAAGATCTTTCATGGT
ACCAAGTAACAAATTTCATAATgaatcacacccctgtctcacaccTCTGG
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ATATTGTTGTCAGGTCAAAAGATCTAGTatgatggttttggagtgcattt
tttCTATTAAATTATATGTGGatgaagaaaatcaatttgcCAATGgagct
gaaattgtagggtattttttctaACGAGTACGAAATCTTTCAGTGAAGTT
GGGATCCCAGTGCGTTTGTGACACGGGGGTTGTTAATTGAAGCTGGAGAA
AGTTTTGATTAATTAATGGCATTAAAATCATTTACTATCTCTCAAGCTTC
AAGCTTTTatatcaaaatgtcaaaatattcctattttttaaagttttgga
cCAATCGTAAGCTGATATTAAAGATGATTACAAATAATTTCTTGATGCTT
CATTAATAGCTAAGGACATTAAGtagttttttgctttttaactttaatct
tttttaattttaagatcGAGGCAGTGATTGGTGGATCGAACCTTGCGAAA
TCGAACGTATACGCGTATGCTACTGATTGTTTCGTTACGCCCTCAGAAAA
TCCTGATGATGCTCAAAAACATGATCTCCTTGTCAACTCGTAAGTATCAG
CTGAAGAAACAGTTTTGTTGATAAAGGCCGGTCTACAATTTCGAGCGAca
ttcaccaaagatgtatctcactaaagtcgattatttgaaaaaaaatattt
tcgaaattctgattacgtcagcaaaaaataagatttttcctaatttctgc
tgacgtcatcaaaatttcgaaaaatttcatcgtagtacccttcatgttca
gtcatttgtttgatCATTTTCTGTCTACAAATGCGGtataaaaaattatg
gtaattttcagtttttgagacataataataataacttacctgagtttcta
aattgctcgtaccagacaaattaatcgtctcagtataaatagaactacTA
CTACCTCTAtaggacttagaatattttatcgttttctttttatagatgTT
CTGTAGACCCAACCTTCAGCATCAGTCGCTATGGGAAcggtcaaaaaatt
tctttccactCCTTTGCGTTTGTTCAAAACCAAGACGCAAAACTATATCT
ACATTGTGACGTCATTGCATGTTTACCCCAATCAGCATGTGGTATTTGTA
ATGCAACAAAAAGGCAAAGAAGACATGTGAGCCAAAGCGGACATGACAGT
TTAAGACTTGACGCAAACGCCTTTCACATTGAAAAACGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000061_pilon:82945..90186+ >XLOC_043948 ID=XLOC_043948|Name=XLOC_043948|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000061_pilon:82945..90186+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATAAAATTGTGATTCTGATGACAATAGCAGTTGCTGTACAAGATGG
ATAAAATTGTGATTCTGATGACAATAGCAGTTGCTGTACAAGcaCGCATT
GAAATTCTTTGTGGAGAAAAAGCGCTTTATTTCAAAGCTGAAGCAAGTGA
TCTAAACGGATGGCCTGCTCGAAAAATTCGCGTCGGAAAATGCCGTTTAA
ATCCAGAATACACTGTCAGTGCGGACTATGAAGAATGCGGACTCATGGTT
GCAGAATCAGcaCGCATTGAAATTCTTTGTGGAGAAAAAGCGCTTTATTT
CAAAGCTGAAGCAAGTGATCTAAACGGATGGCCTGCTCGAAAAATTCGCG
TCGGAAAATGCCGTTTAAATCCAGAATACACTGTCAGTGCGGACTATGAA
GAATGCGGACTCATGGTTGCAGAATCAGaaaaaacaatcgAAGTCAGAAC
AACAGTATTAAGTGATAAACTCAAATCAGCCATCACAAGGAAACGACCAG
TAGAACTTATTATTTCATGCGAGTACAATATCAACAAACGACAGTCATCC
AAGGTAGCCATACGAACAGTTATTGGGAAGATTGGTGGATATGTTTCAAG
ACAAGGCAAAGTATTGGATATTGATATTAAATATGTTGATAAGAGTGGCG
AAATACATGGAAATGATGAAGAGAACGTTAAGAAAGAATTAGaaaaaaca
atcgAAGTCAGAACAACAGTATTAAGTGATAAACTCAAATCAGCCATCAC
AAGGAAACGACCAGTAGAACTTATTATTTCATGCGAGTACAATATCAACA
AACGACAGTCATCCAAGGTAGCCATACGAACAGTTATTGGGAAGATTGGT
GGATATGTTTCAAGACAAGGCAAAGTATTGGATATTGATATTAAATATGT
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AATTAGGAGAAGACGTGACAGCAATAATCGATGGCCCTAATCTCAGCAAA
CTAGGCTTGATCGCATCTGCTTCTGATTGTTTCGTTAGCCCTGACGCTGT
TCCCGACGAACACAGTCTAAAATATTATTTGCTACGGGATATGAGAAGAC
GTGACAGCAATAATCGATGGCCCTAATCTCAGCAAACTAGGCTTGATCGC
ATCTGCTTCTGATTGTTTCGTTAGCCCTGACGCTGTTCCCGACGAACACA
GTCTAAAATATTATTTGCTACGGGATATGTGTCCAGAAGATGAAACATTA
AAAATTGAGCGTTACGGTACCGGGCAAAAAATAACCTTCAAAACGTTTAA
GTTTGCTCATTCCAGTGATTCTTTCTTATACCTTCATTGTGATATTTTGG
CATGTACTTCTAAGACTTCATGCGGTACTTGTATCAAAAGATGGCGCAAT
ATCTCCGCTGTGTGGATTAAAACATGGAATAACCGTATCAGAAAACAAAT
GGTTTTTGACGTGACTACGATTCAACGTGTCCAGAAGATGAAACATTAAA
AATTGAGCGTTACGGTACCGGGCAAAAAATAACCTTCAAAACGTTTAAGT
TTGCTCATTCCAGTGATTCTTTCTTATACCTTCATTGTGATATTTTGGCA
TGTACTTCTAAGACTTCATGCGGTACTTGTATCAAAAGATGGCGCAATAT
CTCCGCTGTGTGGATTAAAACATGGAATAACCGTATCAGAAAACAAATGG
TTTTTGACGTGACTACGATTCAACcttTGACTCGTGACAACATAAGATGT
GGGCGCGATGGAATCCGATTTATGGCAAAACCGTCCGATTTTCCCCGATG
GAACGGTGATGAACTACAAATCGGAACATGTAGATTGAGCTCTGATTTCA
CTGGATTCGCTTCATACGAAAAATGTGGCATCAAAACGCAAGAACGGCct
tTGACTCGTGACAACATAAGATGTGGGCGCGATGGAATCCGATTTATGGC
AAAACCGTCCGATTTTCCCCGATGGAACGGTGATGAACTACAAATCGGAA
CATGTAGATTGAGCTCTGATTTCACTGGATTCGCTTCATACGAAAAATGT
GGCATCAAAACGCAAGAACGGCGTCATCAAGTCATAATGACAACATATCT
TATCGGCACCACGACGGAGGAAGGCCGTATCACGAGACGCCGGCCTGTCA
AATACATGATTCGATGTGGATATGATCGTTTCTTAAGAGCATCAACCGTT
TCAGCTGTGGAAACGGTCGTAAACGCAGCAGCTGGTTCGATCACACAGAT
TGCCAAACAGCCTTTGGATCTGTATCTGCAATTGATGGATCAGAAAGGAT
TCCCTTATACTAAACATATCCTTGAGATTGGTATTGATGAAAAGGTCATC
AAGTCATAATGACAACATATCTTATCGGCACCACGACGGAGGAAGGCCGT
ATCACGAGACGCCGGCCTGTCAAATACATGATTCGATGTGGATATGATCG
TTTCTTAAGAGCATCAACCGTTTCAGCTGTGGAAACGGTCGTAAACGCAG
CAGCTGGTTCGATCACACAGATTGCCAAACAGCCTTTGGATCTGTATCTG
CAATTGATGGATCAGAAAGGATTCCCTTATACTAAACATATCCTTGAGAT
TGGTATTGATGAAAAGatcGAGGCAGTGATTGGTGGATCGAACCTTGCGA
AATCGAACGTATACGCGTATGCTACTGATTGTTTCGTTACGCCCTCAGAA
AATCCTGATGATGCTCAAAAACATGATCTCCTTGTCAACTCatcGAGGCA
GTGATTGGTGGATCGAACCTTGCGAAATCGAACGTATACGCGTATGCTAC
TGATTGTTTCGTTACGCCCTCAGAAAATCCTGATGATGCTCAAAAACATG
ATCTCCTTGTCAACTCatgTTCTGTAGACCCAACCTTCAGCATCAGTCGC
TATGGGAAcggtcaaaaaatttctttccactCCTTTGCGTTTGTTCAAAA
CCAAGACGCAAAACTATATCTACATTGTGACGTCATTGCATGTTTACCCC
AATCAGCATGTGGTATTTGTAATGCAACAAAAAGGCAAAGAAGACATGTG
AGCCAAAGCGGACATGACAGTTTAAGACTTGACGCAAACGCCTTTCACAT
TGAAAAACGTTAAatgTTCTGTAGACCCAACCTTCAGCATCAGTCGCTAT
GGGAAcggtcaaaaaatttctttccactCCTTTGCGTTTGTTCAAAACCA
AGACGCAAAACTATATCTACATTGTGACGTCATTGCATGTTTACCCCAAT
CAGCATGTGGTATTTGTAATGCAACAAAAAGGCAAAGAAGACATGTGAGC
CAAAGCGGACATGACAGTTTAAGACTTGACGCAAACGCCTTTCACATTGA
AAAACGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000061_pilon | genome | sc0000061_pilon:82945..90186 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1435-1680:6997 |
| Aaloc | 1309-1431:6465 |
| Aaloc | 1039-1308:5663 |
| Aaloc | 865-1035:5124 |
| Aaloc | 616-861:4120 |
| Aaloc | 481-612:3635 |
| Aaloc | 217-477:2469 |
| Aaloc | 49-213:1865 |
| Aaloc | 1-45:1 |
|
