|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000002_pilon:3142485..3146133- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043912 ID=XLOC_043912|Name=XLOC_043912|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3649bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142485..3146133- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGCGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTAA
TTATTGATTTTTCATTATTTTAATCCAAAAAGTTGTCAAATGGGAGGATT
ATCATAATTTTGATTTATAACAAGACATACAGTCTCCATAAGGCAATATA
TTTTTACTTTACTACAATTTTCTGGTTTCCAGTCGGTCTACTTGGAAATC
CGTCATCATATTTTCTCTCACTTGTTTTTTTCCTCCATCTTGAACAAATG
AAAATGATAAAATATGATGTGTAATGTCTCGTCAAACTAACAACGTTCGT
ATTACGTTGGTATTAGCACCCCAGTTAGAAATGCATTTGTTGCTCATATC
AAAGTCAACCTGTCTATTGACTTTGCTTACATCTTGGCAACTTCAAAGGA
AATTTTCCCCTCATGTAAAAGCACAGCTTTATGACTTATTTGATTTTTGT
ATCTATTTTTTACTTCCTAGGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAAC
GGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCA
TCATCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCA
GCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAA
GCTGGGATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCT
CCATGTCCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAAT
GCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTC
CCATGGGTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCA
ATCTGCTCTAACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGG
AGCTGCCCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCT
GCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCA
AGACCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGA
CATTCCAGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTG
CCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCA
GGATGCATCGCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACC
ATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAAC
CATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCA
GCTCCTTCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGG
GTGCATGCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCT
GTCAACCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCT
CCATCTATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTG
TCAACAAACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGT
GTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACC
ATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTG
TCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGT
GTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACC
ATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTG
CCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGA
TGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCA
ATGGGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACC
ATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGA
TGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGC
CAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCC
AACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTC
AAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATG
CCACCACCTCAGCCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTG
TCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCAC
AGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCA
ATGATGGCTGCTCCACAGATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCTTCTTG
TCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAA
GACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCT
ATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACC
CTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAG
CTCCAACAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGA
TGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCC
ACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCC
CGCAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCA
CCATCGTGCCCCTCAGGATGTTCCCAGGGTGCCGCTATGACGATGCCAAC
TTCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAG
GGTGCCCTATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCCGCACCTTCAATGTGT
CCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCCTCTGGCTGTCAAGAGTCGCC
ACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGCCACCACCTC
AACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGT
TGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTAT
GCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTG
CTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGA
TGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCAT
GCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGC
CTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCA
CCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGAT
GTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAG
GTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGC
CCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGG
CTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000002_pilon:3142485..3146133- >XLOC_043912 ID=XLOC_043912|Name=XLOC_043912|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4862bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002_pilon:3142485..3146133- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGCGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGATGA
TGCGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTGACAAT
GCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAG
CTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTT
CACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTC
ATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAACCACC
ATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAAAGTC
AGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCA
ATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTGGTAT
CACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCACCAT
CATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTGCCCA
CAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTC
TGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAA
CCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGCTAAT
CCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCC
TTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACAGTGA
ACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAA
TGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGG
ATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCATGTC
AACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGCTCCA
CCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGGGATG
TCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGCCAAC
CACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTTTTCA
CCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTG
CCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCAC
AGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCG
ATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTG
TCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAA
GACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCT
ATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACC
TTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCG
CACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGA
TGTGCCCAGGGTGCCGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAAT
CGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATC
GAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAAC
CTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGG
GATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATG
TCCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTA
TGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATG
GGTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTG
CTCTAACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTG
CCCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCA
AGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACC
CTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTC
CAGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCT
CCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATG
CATCGCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTC
CTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGC
CAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCC
TTCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCA
TGCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAA
CCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATC
TATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAAC
AAACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCA
CAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGC
TTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAA
ATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCT
CAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGC
TTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCT
CAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCT
GCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGG
TTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCA
TGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCACCATGCATGCC
ACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGATGATGCCAC
CTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCA
GGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATACC
ATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGTCGCTATGA
TGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGC
CAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCC
AACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCCTCTGGCTGTC
AAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATG
CCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTG
CCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCAC
AGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCA
ATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTG
TCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTCCAA
GACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCT
ATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCACAACC
TTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAG
CTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGA
TGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCC
ACAGATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCG
CAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACC
AGGCTGTCCGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCCTCTGGCT
GTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAA
ATGCCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGG
TTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTC
CACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCT
CCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTC
TTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTC
CAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCG
GCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCACA
ACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTT
CAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCA
GGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGC
TCCACAGATGTGCCCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGC
CCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACC
ACCAGGCTGTCC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000002_pilon | genome | sc0000002_pilon:3142485..3146133 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 2338-2433:97 |
| Aaloc | 2332-2334:100 |
| Aaloc | 1729-2331:704 |
| Aaloc | 1570-1728:1199 |
| Aaloc | 49-1569:3178 |
| Aaloc | 1-45:3650 |
|
