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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000348_pilon:238247..245588+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043908 ID=XLOC_043908|Name=XLOC_043908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7342bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:238247..245588+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCCTAAAAATGAAGCAGAGTTTAAATGGACTTGTAAACAATGTACTTA
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TCTTACTAGGTGTTTACCTACCGATGTTGTGGGATGAAGATTTTACGTGG
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TGGAGTGGAATGAGGATGATGCTCACGTGACCTATCTTCCAATGGTGGAT
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TTCTTCTTTCTATCACAATTTAAGGAGCGATGACCTATTGGCCAAAAGCG
TCAGCGTTTTAAACCAAGGGTTCGTGGTTCGAATCcctgctccttccaat
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CGAGTGCTCAAGTGtttcttttataaatagagTGAACTTCTCAtagcaaa
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TGCCTCACAGAGGACTGGACGACTTTTAGATCGAATGACTGACCGGGACA
AGCTGCAGTAATCGGGCtcagttttgttttaaaaattcactttttgtttc
aaaacatcACCTAGGGCTTAAGTTTTCTTGTAATTAAATCATAAATCCAT
CCAAATAGTACTTGCATTaattgatttacaaaatttctcaATCCTTCTAG
GTTGGCCAAGAGGAAAAGTTACTACAGAAATATTTCGATTGTTGCATAAC
GGATGGTGGAATCCTTGCAGCCAAGCAAGTGATCACACCAAGACCTCACC
TCGTCAACCAAATGATCGACGAGTGGATCAATCGGTATAAGACCAAACAA
CATATTGAAACGTTTGACATGCGTGGAGCTGCTAAGCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000348_pilon:238247..245588+ >XLOC_043908 ID=XLOC_043908|Name=XLOC_043908|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4254bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:238247..245588+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCCTAAAAATGAAGCAGAGTTTAAATGGACTTGTAAACAATGTACTTA TGGCAATTGGCCATCAGCTACCAAATGTGTTATGTGTAAATTTGACCCGA GGAATAGTATTAATAAAAACCACATTGCAGAAGGTGGAAATCATGAAAAC AGTGAACGATGTCACGTGATCGATTGCTTAGGTGAGAGCACGTGTGAACA TCAAGGGAGTGGAGACGAAACGAGTAGCTCCAATGAGAAAAATGGTGAAG CATGTAGttctttgaataaaattaataaatggCCATGTTCTTTGTGTTCG TATACAAATTGGACGAAATCTGAATTTTGTGTCATGTGCAAAACAGAGAA ACCAAGTGAATTTAAATTAGTTGAATCATTGAGGAACATTgaaaagaatg aagagaaaaaagagaaaaataaattctcaagTCTGACTAGAGGTCATAAA TGGTTATGTGTGAAATGTACTTATGAGAACTGGCCAAAAGCTTTCAAATG TGCCATTTGTCAACATCCGAAGAATAAGAGTTATAAACAAGATGACggcc agaaaaatgaaaaaacatgtttaaatgagaagaaaactttaaaggaaaag aaCAGTAGTTATTCAAGGAAGATTCATTCACCCAAAAGGTCACCACCCAG GTCGCCAAATACTATTTCTAGGAATAACAGTATAAACAATATTTTCGACA TCTCTAAACAAGACGATGATAAAATTATGGATATTGCTTTAAGTATGGAG AAAATCACATTCCCATCGGAGAACAAACGTTTGAATCAGATTCGTAATCG TATGCAACCAAAAGATTGGGTGTGGTTGGCAGCCTGCAAAGGAGTAGCTG ACCATGATATCACGGCTGTATCCAATTATTTAGCTTTGGGTGGTGACCGC GCAAGACAATTATCCAATGAAGATGTGACTGTTTTAAATCAACCAGGACG CTTTGAGCAAGGACATACATTAGTCCACTTAGCAATACGCTTCCAACGTG AAGATATTTTAAGGATGCTTTTATTACCAGAGACACCGCATCGTTCAAGA AAGAGACTACCGTGTCATGAATGTCCCGAACTAGCAACTACTATACGCAA AAATGTAGCTCATTCTATACGAAGTCGTAAAGGGGAATTTGGCTGCCCTT TCTTTACCGAACTCGTCACCTTCTCACTGCCAGGAGATGCCTAAAAATGA AGCAGAGTTTAAATGGACTTGTAAACAATGTACTTATGGCAATTGGCCAT CAGCTACCAAATGTGTTATGTGTAAATTTGACCCGAGGAATAGTATTAAT AAAAACCACATTGCAGAAGGTGGAAATCATGAAAACAGTGAACGATGTCA CGTGATCGATTGCTTAGGTGAGAGCACGTGTGAACATCAAGGGAGTGGAG ACGAAACGAGTAGCTCCAATGAGAAAAATGGTGAAGCATGTAGttctttg aataaaattaataaatggCCATGTTCTTTGTGTTCGTATACAAATTGGAC GAAATCTGAATTTTGTGTCATGTGCAAAACAGAGAAACCAAGTGAATTTA AATTAGTTGAATCATTGAGGAACATTgaaaagaatgaagagaaaaaagag aaaaataaattctcaagTCTGACTAGAGGTCATAAATGGTTATGTGTGAA ATGTACTTATGAGAACTGGCCAAAAGCTTTCAAATGTGCCATTTGTCAAC ATCCGAAGAATAAGAGTTATAAACAAGATGACggccagaaaaatgaaaaa acatgtttaaatgagaagaaaactttaaaggaaaagaaCAGTAGTTATTC AAGGAAGATTCATTCACCCAAAAGGTCACCACCCAGGTCGCCAAATACTA TTTCTAGGAATAACAGTATAAACAATATTTTCGACATCTCTAAACAAGAC GATGATAAAATTATGGATATTGCTTTAAGTATGGAGAAAATCACATTCCC ATCGGAGAACAAACGTTTGAATCAGATTCGTAATCGTATGCAACCAAAAG ATTGGGTGTGGTTGGCAGCCTGCAAAGGAGTAGCTGACCATGATATCACG GCTGTATCCAATTATTTAGCTTTGGGTGGTGACCGCGCAAGACAATTATC CAATGAAGATGTGACTGTTTTAAATCAACCAGGACGCTTTGAGCAAGGAC ATACATTAGTCCACTTAGCAATACGCTTCCAACGTGAAGATATTTTAAGG ATGCTTTTATTACCAGAGACACCGCATCGTTCAAGAAAGAGACTACCGTG TCATGAATGTCCCGAACTAGCAACTACTATACGCAAAAATGTAGCTCATT CTATACGAAGTCGTAAAGGGGAATTTGGCTGCCCTTTCTTTACCGAACTC GTCACCTTCTCACTGCCAGGAGATATGTTGGAACTACCGAACAGTACTCG TCATCAAATCTTCTCCGAAATACTTGATGTTGATGTCAAAAATGATATGT TGGAACTACCGAACAGTACTCGTCATCAAATCTTCTCCGAAATACTTGAT GTTGATGTCAAAAATGTTCTCGAGGCAGAATCAGCCATTAATTGGAGCAG CGAGTTGACCAATCAATACGGGAGTTGTTTGTACCCGCTGTGGAATCGAG CGGCCGGTGATTGTCTTCTGGACAGTGTTCTTCAAGCCACGTGGGGTGTC TTCGATAGAGATAACGTCTTACGAAAGAAACTTCATGAATCACTCTATGA AGGCTACAACAATTCTCGAGGCAGAATCAGCCATTAATTGGAGCAGCGAG TTGACCAATCAATACGGGAGTTGTTTGTACCCGCTGTGGAATCGAGCGGC CGGTGATTGTCTTCTGGACAGTGTTCTTCAAGCCACGTGGGGTGTCTTCG ATAGAGATAACGTCTTACGAAAGAAACTTCATGAATCACTCTATGAAGGC TACAACAAATTTTATCCGCGATGGAAAGAAGCGGAACAAATGCAAGCCAG TGAGATGAATTACACTTTAGACGATCAACAATGGAAAAACGATTGGACTA GCCTGGTTTCACTTGCAGCAACAGCCGGAAATAGCCTGGAACAAGCTCAC GTTTTTGCATTGGCTCACATTCTACGACGACCTATTATCATCTATGCTGT TAAATATGTAAAAGGCTTCAAAGGGGAATCGATTGACCTGGCCAGGTTTG AAgATTTTATCCGCGATGGAAAGAAGCGGAACAAATGCAAGCCAGTGAGA TGAATTACACTTTAGACGATCAACAATGGAAAAACGATTGGACTAGCCTG GTTTCACTTGCAGCAACAGCCGGAAATAGCCTGGAACAAGCTCACGTTTT TGCATTGGCTCACATTCTACGACGACCTATTATCATCTATGCTGTTAAAT ATGTAAAAGGCTTCAAAGGGGAATCGATTGACCTGGCCAGGTTTGAAgGT GTTTACCTACCGATGTTGTGGGATGAAGATTTTACGTGGAAAAATCCCAT TGCTCTCGGATACACTCGTGGTCATTTCTCTGCTCTTGTTCCCATGGAGA GGCCTAATTATGCTAATTATGCCGGTGCTGGTGCACACGTGGAGTGGAAT GAGGATGATGCTCACGTGACCTATCTTCCAATGGTGGATCACGAAGGTCA TCTGATGCCTGTTCATTTTTTAACCCTGGATGAGGTGTTTACCTACCGAT GTTGTGGGATGAAGATTTTACGTGGAAAAATCCCATTGCTCTCGGATACA CTCGTGGTCATTTCTCTGCTCTTGTTCCCATGGAGAGGCCTAATTATGCT AATTATGCCGGTGCTGGTGCACACGTGGAGTGGAATGAGGATGATGCTCA CGTGACCTATCTTCCAATGGTGGATCACGAAGGTCATCTGATGCCTGTTC ATTTTTTAACCCTGGATGAGGTTGGCCAAGAGGAAAAGTTACTACAGAAA TATTTCGATTGTTGCATAACGGATGGTGGAATCCTTGCAGCCAAGCAAGT GATCACACCAAGACCTCACCTCGTCAACCAAATGATCGACGAGTGGATCA ATCGGTATAAGACCAAACAACATATTGAAACGTTTGACATGCGTGGAGCT GCTAAGCAATAAGTTGGCCAAGAGGAAAAGTTACTACAGAAATATTTCGA TTGTTGCATAACGGATGGTGGAATCCTTGCAGCCAAGCAAGTGATCACAC CAAGACCTCACCTCGTCAACCAAATGATCGACGAGTGGATCAATCGGTAT AAGACCAAACAACATATTGAAACGTTTGACATGCGTGGAGCTGCTAAGCA ATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000348_pilon | genome | sc0000348_pilon:238247..245588 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1936-2127:7151 |
| Aaloc | 1702-1935:6312 |
| Aaloc | 1456-1698:5777 |
| Aaloc | 1261-1452:5181 |
| Aaloc | 1189-1257:1360 |
| Aaloc | 1-1185:1 |
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