XLOC_043896 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043896
Unique NameXLOC_043896
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:515767..528123-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043896 ID=XLOC_043896|Name=XLOC_043896|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12357bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:515767..528123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TATAAATAGTAATAATATAAATCTATTCCTGCATATTCATTTTCCAAAAG AAATATGAAAAATGTCCCTTTCCTGACTTAAGAAATCTTGATAATGAAGA GAAAGAAATTGATTTATCTTCACAAACAAGAATTTAAACTAATCCTTTAA TTTTTACAGCCAAGAAGGAAGTAAAACCATTGTGCGAAGTGAAAGTGGAT GTTGGATTCGTACTTGACTCATCGGGCAGTTTGAGAAACGATTACGACAA AGAAAAGAACTTCTTGAAGGCTTTGGCAGCTACCTTTAGTGTCAGCGAAG ATGGTGCAAGAGCAGGTGTGGTGACATTCAGTTATGACACGGAGCACAGC ATCAAACTAAATGACCATTATGATTTGTTCAGCTTCAGCGATGCTGTTGA CAAGATTCCACTGATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAGCTCTTCGTC TGACTCAGAGCCAAATGTTTTCGATCGCAAACGGAGGCAGACCTGGTGTG AGCAAAATTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAACACAAGACGTTGG TGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAATGGATATAA ATGTTGGCTGTTGGTATTGGAAGTGGCGTCAACAGTACAGAGTGGCTCAT ATTGCTGGCACAAAGCAATGTTGTATCTGCAGTGACTTTTTGACGAGCTT ATCAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTGGTTGTGACGAAGG TAAGAGAAAATCATCATATCGAAGCGTTTTGACTGTTTTGTTCTGTGTCT TTTGATTTTATGGAGAAACTTTGTTTGATTTGAAAAAGAAGAAAGATAAT GAGTTTCACAACTCACTAATTGAACTACATTTAAGATGGATCTTTAAAGG TTGATCTTGAAGATTGACACGTCCGGAAAGCTTTTGACAATCGAATAGTA 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TGCTGTTGACAAGATTCCACTGATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAG CTCTTCGTCTGACTCAGAGCCAAATGTTTTCGATCGCAAACGGAGGCAGA CGGTGGTGTGAGCAAAATTTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAAAC AACAAGACGTTGGTGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGA TCAATGGGATATAAAGTGTGGCTGTTGGTATTGGAAGTGGCGTCAACAGT ACAGAGTTGGCTCATATTGCTGGCAACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGT GACTTTTGACGAGCTTATCAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAG CTGGTTGTGACGAAGGTAAGAGAAAATCATCATATCGAAGCGTTTTGACT GTTTTTTTCTGTGTCTTTTGATTTTATGGAGAAACTTTGTTTGATTTGAA AAAGAAGAAAGATAGTGTGTTTCACAACTCACTAATTGAACTACATTTAA GATGGATCTTTAAAGGTTGATCTTGAAGATTGACACGTCCGGAAAGCTTT TGACAATCGAATAGTTGTATGTTCTTTTTTTGTTTGTGTTTTAGCCAAGA AGGAAGTAAAACCATTGTGCGAAGTGAAAGTGGATGTTGGATTCGTACTT GACTCATCGGGCAGTTTGAGAAACGATTACGACAAAGAAAAGAACTTTTT GAAGGCTTTGGCAGCTACTTTTGGTGTCAGCGAAGATTGGTGCAAGAGCA GGTGTGGTGACATTCAGTTATGACCGGAGCACACACAGCATCAAACTGAA TGACCATTACGATTTGTTCAGCTTCAGCGATGCTGTGTTGAAAGATCCGC TAATGGGACACACGACAAGACAAGAATCGATAAAGCTCTTCGTCTGACTC AGAGCCAAATGTTTTCGATCGCAAACGGAGGCAGACCTGGTGTGAGCAAG ATTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAACACAAGACGTTGGTGCTGA AGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAATGGGATATAAAGTGT TGGCTGTTGGTATTGGAAGTGGCGTCAACAGTACAGAGTTGGCTCATATT ACTGGCAACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGTGACTTTTGACGAGCTTAT CAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTGGTTGTGACGAAGGTA AGAAAAATTCATCATATCGAAGAGTTTTCACTGTTCTGTTCTGTGTCTTT TGATTTTATGGAGAAACTTTGTTTGATTTGAAAAAGAAGAAAGATAGTGT GTTTCACAACTCACTAATTGAACTAACTTTAAGATGGATCTTTAAAGGTT GATCTTGAAGATTGACACGTCCGGAAAGCTTTTGACAATCGAATAGTTGT ATGTTCTTTTTTTGTTTGTGTTTTAGCCAAGAAGGAAGTAAAACCATTAT GCGAAGTGAAAGTGGATGTTGGATTCGTACTTGACTCATCGGGCAGTTTG AGAAACGATTACGACAAAGAAAAGAACTTTTTGAAGGCTTTGGCAGCTAC TTTTGGTGTCAGCGAAGATGGTGCAAGAGCAGGTGTGGTGACATTCAGTT ATGACACGGAGCACAGCATCAAACTGAATGACCATTACGATTTGTTCAGC TTCAGCGATGCTGTTGACAAGATCCCGCTAATGGGACACACGACAAGAAT CGATAAAGCTCTTCGTCTGACTCAGAGCCAAATGTTTTCGATCGCAAACG GAGGCAGACCTGGTGTGAGCAAGATTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCA CAAACACAAGACGTTGGTGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACT TCGATCAATGGGATATAAAGTGTTGGCTGTGTTGTATTGGAAGTGGCGTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:515767..528123-

>XLOC_043896 ID=XLOC_043896|Name=XLOC_043896|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:515767..528123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTCACAACTCCACAAGAAGATAACGTCGAAATGAAATCAATGTTAAA
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AGCTGCCTATAAGATTTTGGTGGAATTATTAAATGACCCAGATTATGATA
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AGTGATATTCGCCCTTATTCACAATTAGAGATCAAGTTCGACCAATACTA
TGATTTGAAGCCTTTTTTAGAACATGTTGAAAGGCTACCTTTTTACGCAT
ACAGAACCAGGATTGATTTGGCTTTTGAAATTGCAGATAAAGAGTTATTC
TCAAAAGCTGGAGCTTCGGACTAAAGAAGAATGGAACACATGCTGGTGTT
GTGGTATTCAGTGATATTCGCCCTTATTCACAATTAGAGATCAAGTTCGA
CCAATACTATGATTTGAAGCCTTTTTTAGAACATGTTGAAAGGCTACCTT
TTTACGCATACAGAACCAGGATTGATTTGGCTTTTGAAATTGCAGATAAA
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GTCTTACTTTTGACCCAGTTGCTGCATCTCAACCTTTGATAGATCGTGGT
ATTCAAATTTTCTCCATCGGTGTCGGTAACCGTTCAGATAATATCAACTA
TGATGAATTGGTTAAGATTGCCAGAAATGAAAATCAAGTTAAGATTGCAG
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ATCACTTGCAGAATTATACGTATGAGAGATAACGTTCCGAAGGTCATTTT
TCTCATTACCGACGGCTCACAGAACCCAACCATTGATCGCAGAGCTGGTC
TTACTTTTGACCCAGTTGCTGCATCTCAACCTTTGATAGATCGTGGTATT
CAAATTTTCTCCATCGGTGTCGGTAACCGTTCAGATAATATCAACTATGA
TGAATTGGTTAAGATTGCCAGAAATGAAAATCAAGTTAAGATTGCAGAAA
CAGCAGCTGATCTTGCATCAGAGCAATTTGTTAAAGAGCTAGCTGATATC
ACTTGCAGAATTATACCTACTCCTCCACCAAAACCAAGCTGTGATGTCAA
AGTTGATGTTGGATTTGTTTTGGATTCTTCTGGTAGTTTGAGGGACGATT
ACAGCAAAGAAAAGCAGTTTTTGAAAACATTGGCAGCTGCCTTTGGTGTG
AGCGAAGAAGGTGCGAGAGCAGGAGTGATAACATTCAGTTATGACACGGA
GCACAGTATCAAATTAAATGACTATTTCAACATAGTATCCTTTAGTGAAG
CTGTTGACAAGATTCAACTGATGGGACACACAACAAGAATCGACTACTCC
TCCACCAAAACCAAGCTGTGATGTCAAAGTTGATGTTGGATTTGTTTTGG
ATTCTTCTGGTAGTTTGAGGGACGATTACAGCAAAGAAAAGCAGTTTTTG
AAAACATTGGCAGCTGCCTTTGGTGTGAGCGAAGAAGGTGCGAGAGCAGG
AGTGATAACATTCAGTTATGACACGGAGCACAGTATCAAATTAAATGACT
ATTTCAACATAGTATCCTTTAGTGAAGCTGTTGACAAGATTCAACTGATG
GGACACACAACAAGAATCGACTTCAGCGATGCTGTTGACAAGATTCCACT
GATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAGCTCTTCGTCTGACTCAGAGCC
AAATGTTTTCGATCGCAAACGGAGGCAGACCTGGTGTGAGCAAAATTGTG
ATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAACACAAGACGTTGGTGCTGAAGATCC
AGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAATGGGATATAAAGTGTTGGCTG
TTGGTATTGGAAGTGGGGTCAACAGTACAGAGTTGGCTCATATTGCTGGC
AACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGTGACTTTTGACGAGCTTATCAGTCA
AGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTGGTTGTGACGAAGCTTCAGCGA
TGCTGTTGACAAGATTCCACTGATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAG
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AGACGTTGGTGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAA
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GAGTTGGCTCATATTGCTGGCAACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGTGAC
TTTTGACGAGCTTATCAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTG
GTTGTGACGAAGCCAAGAAGGAAGTAAAACCATTATGCGAAGTGAAAGTG
GATGTTGGATTCGTACTTGACTCATCGGGCAGTTTGAGAAACGATTACGA
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AAGATGGTGCAAGAGCAGCCAAGAAGGAAGTAAAACCATTATGCGAAGTG
AAAGTGGATGTTGGATTCGTACTTGACTCATCGGGCAGTTTGAGAAACGA
TTACGACAAAGAAAAGAACTTTTTGAAGGCTTTGGCAGCTACTTTTGGTG
TCAGCGAAGATGGTGCAAGAGCAGGTGTGGTGACATTCAGTTATGACACG
GAGCACAGCATCAAACTGAATGACCATTACGATTTGTTCAGCTTCAGCGA
TGCTGTTGACAAGATTCCACTGATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAG
CTCTTCGTCTGACTCAGAGCCAAATGTTTTCGATCGCCAACGGAGGCAGA
CCTGGTGTGAGCAAAATTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAACACA
AGACGTTGGTGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAA
TGGGATATAAAGTGTTGGCTGTTGGTATTGGAAGTGGCGTCAACAGTACA
GAGTTGGCTCATATTGCTGGCAACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGTGAC
TTTTGACGAGCTTATCAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTG
GTTGTGACGAAGGTAAGAGAAAAGTGTGGTGACATTCAGTTATGACACGG
AGCACAGCATCAAACTGAATGACCATTACGATTTGTTCAGCTTCAGCGAT
GCTGTTGACAAGATTCCACTGATGGGACACACGACAAGAATCGATAAAGC
TCTTCGTCTGACTCAGAGCCAAATGTTTTCGATCGCCAACGGAGGCAGAC
CTGGTGTGAGCAAAATTGTGATTGTGTTAACAGACGGCTCACAAACACAA
GACGTTGGTGCTGAAGATCCAGGAAATGTTGCCGAAGAACTTCGATCAAT
GGGATATAAAGTGTTGGCTGTTGGTATTGGAAGTGGCGTCAACAGTACAG
AGTTGGCTCATATTGCTGGCAACAAAGCAAATGTGTATTCTGCAGTGACT
TTTGACGAGCTTATCAGTCAAGACTTTTTGGGCACAGTCAACAAAGCTGG
TTGTGACGAAGGTAAGAGAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043896XLOC_043896-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000111_pilongenomesc0000111_pilon:515767..528123 -
Properties
Property NameValue
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