XLOC_043816 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043816
Unique NameXLOC_043816
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000213_pilon:582785..594951-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043816 ID=XLOC_043816|Name=XLOC_043816|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12167bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000213_pilon:582785..594951- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGGTTCTTATTTTACTAGATCCTGACCAGCTGAAGACGACGGTAAATCA GCACTTTTACCGTTCTCGATTTTGCGGGTCAGAACTGTGGGTTATTCCAA ATCGCTTCAGTCACTGTGAAATGGAACCCTACAATCATCTGCATAATATT GTGAGACTGACACATTCCCCCACTCCCTCAAGTCAATGTTGTTTGAATTC GAGAAGCGTTGATGGTCAAATTTCCTCCGATATCGACAACATTGATTTGG GGGAGCGGGGGACCCTGAATTAACTGAAAAGTCTCACTATTTTCACAGAT GATTGTAGCGTGTGGACTTGGTGAGACGTTACAAAGCAAAACAGATCGAA ACTGATCCTCTCCACTATTTTCATCGGAACGGAACTGCTCCGTTCCGTTG CTCCGAAACGTTCCAAAATCAGTATGAACATTTCCTACCCATAACAAATA CTATACCGGAGCGATACAAAATCGTAACGTCTTTAATCATGTCATAACTC CTCTTACTTTAGGTCATTCGAAAGACTGAAGCTGGTACAGCAGGGACAAC TGACGTCAAAACACTCATCTTGAAATGTGAAGATTTCCGAACCATTCGAT TCACCTTTTTGAAGAGTAAACCTAACTGGCATACTTATCTAGAAACGAAA TTTCACATTATTGACGAGGTACTTGTAAAGTTTATTCGTGTTATTCATGA TGTAATATTTTAATACGGAAGTACTCAAAAAAGATCGGGTGTTGCCACTA ATTTTGAATTTAAACAATAAAACTAGTGACAAACGCCCGGACTATTCTGG GTGCTTCCGTATAAAACATTACATCATGAATAGCAAAGGCTAATTAAAGT TAACGGCATTTTCTACTCAGACATGATTAGGCTTCCATTGCTTAATCTTT TCCTTGAAAAATACTTAAATCGCCCATGTCTCTGAACTCATCTGGAATTA ACTCCCATATTTTTGGCCCTAAAAACGATAGTGGCTCTGCAGCTTGAAAA ACGAAGAGTTCATTTCTCGAACTAATTGTTAATAGGGCTAATCGAATTCG CCCATCTTTTTCATGATTTGTTGTTCAATAATTCTATTCCTAGTGCTATA TAATCGAACGGTTATCGAAGAAAATGGAATAACCTCTTAATAACCAAATG ACTAATTCATTCGAAATTTTGTCGAATAAATGATAATCGACAGCACATCA AATGGTTACTGTGTTGATGCTAAATCATTAGCATCTCTTTGGTATTATTC GATTCAATAATTATTCACTTAGTTCAATCCTTACAAATAACTTTTATCGA TAAAATTCCGTGATCAAGTTTTCTGATCGGTTACGTCTTGTTATTTTGAA TTTGCTACCCTTTGTTATGAAGATTCCAATAACATTATAACTCCATCAAT CCCCCCCCCCCCCCTAGAGGCAAACAAGAAAAATATGTTTTTATTGCAAA AACTAATAAAAACCAGCAATAAAAAGTATCAGAAAATTCAACATAAACAA AAACTTGAGCAAACGGCTTTAAACCTTCAAAAGATGTAGTAAAAGAATCC CCTTGATGAAAATCATGTGTTTGATTTGCCGAGTTAAAAAAACAAATGAC AGAAATTGAAGCTTGCAACAGATTTACACTGGAAATACTTTGGTACAACA CTGACTTATCACATCTGACTTATCGCTTGAGCCGCTATCTTGAAACACCA CATTATGATCTGCAAAAACAACGCACGCTAAAAGTGCCCAAAAAGTTAAC CCGATCGGAAGAAAGTTTAGCAATCAAAATGAGATCGGGAAATCGGATTT TTTTTTTTGCCGTCTTATGGAACCGAATTTACCTATTTGAATGCCCAGCT TAGGCTGACCAATTACACAGTTTTAAATTAAGTCCTTGCTGCGGTGTATA 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TGTTAAACAGTTTTTGCTGATAAAAGTAAAAAATCAATAATGTTTCTCTA ATCACTGCACGTGATGATATTTCCCTCTGGTGTACCTCACGCAAGGGGGG TTGAGGCCTTATATTATTAAAATTTGATTATTGAAGGTTTTGTCTTATCT AATTTCTGCACAATATCTCCTCTACCAGAACGCAGACATCGGATTTTTAT TTGAACGGATGGGATGTTTATCTGCCGGAAGAAGAATTCAAACGTCAACA GGTTTGCCTTATTCTCTTAATATTCTATCTATGTCAAGTCACGGAGATGC TGTCCTGTACCAAACTCTTTTTCGATGAAAAGAATAAGGGATACCCGGAA AGGTTTTTCGAAAATGGTACAGGGTACTTTTCATTCATTCTGCTTTTCAT TGATCTGTGTTTTCTTATGATTTGCCTTTGTTTGACTGCCGCTATAGAAG TCACTTTACATATTTTTAAAATTAGTTTCCATTACATTTTAGATCAACTC AGATTGGAAGCTTTCGACGTTAAACGGAGATTATTCGCTGTCGGCTACTT ATCCTAAATATTTGTATGTGCCAGCTGCTGCCAAAGTATGTTTAGATACG TCTCATAAAATACTCTTTAGCCCTTGTCATAGTTAATCATATGAATCTTC CATAAACCTTGATAAAATACTGGACACTAGAAAGTAATACACGCGTCTAT TTTTTGGCACAGGCTTTGTTTTATCTCTTACTTAGGGCAGAAACTTTCGC GTTTTTCGCGATTTTGATCCTTTTTCGCGAAAGTTTTGTCATGTAAACCT GAGAAACGCGAAAGTTTTTTTCACGAAAAATAAACTTTCCTACTCAGTTT TGCACTGTTTGCTAAATTTTTGCGTGTTTTATGAGTTTTTGTTACCAAAA AAATTTTATATGAATTCGCGAAAGTTCTATCTGTGAAATTTCGGATGAAC 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GAGCTCTGCCGAAGCCGGATAAATTCAATTTTTTTAACAGATAAATTGCT CGACATCAATTGTCGAGCAAGCGCACCGTCCAACTAATGAGCCTTCAGGT CTGCTACATAAAGGCTGACTGCTGCATTTGGATTTTTTGTCTAGTACAAA TAATCAGAGCGTACTTTCGGACCTGTGGTATAGCTTCGTTTTTCTTTTGA ACAATAGTGCAGAATCTTTGTTGGAAAAATGCGATCGCCAGCGCGCTAAT GGAGTCTTGGTATTACAATTCAATTTCAACAAGTCGTATACTATTCTACA ATTACCAGGGAGCCACTTTGATTGCTCGCTATTTGACGGAGAAAAACGTT TCAGTACTGGTCCATTGCTCAGATGGTTGGGATCGAACACCTCAATTAAC CTCAATCGCTCAGGTTCTATTGGATCCATTTTATAGGACAAGAGAAGGTT TCAAGGTTTGTTATTTACACGTTTTATAAGTTTTTCTTAAACTGGTTTAA ATAAAACGCCGAAAGTAATTTATCGTATTTACATATGGCCTTTTATTCTG ATAGAGCTTATCTGTACGATCAATTGAATCTGAAGTCTGTACTCAAACCT TTTTTTTAAGTTTTAATTCAAAAATTGTAAATCATTCCCTAGCTCTTTCA TTACAGTCCCACTACATTATTTTTCGTATCATCAAATCAAAGGTGACGTG GCCCTGGTTGAGTTGTTAAGGCTAGTTTTTGATGTGTTTAACTTTATTTT TAGATTTTGGTCATGAAAGATTGGATATCTTTTGGTCATAAGTTCAACCA TCGTTTGGGTGATCCAAGCGCTACACAAGAACGATCGCCTGTATTCTTAC AGTTTCTTGACTGTATTTGCCAGGTATAATTTTTCCAAAATCTTTTCGAT GGTCTTTTTCATTTAAGTTAAAAACAACTAAAGTTTCTTTTTGTCCTAAG TTTATATCATGGAGAAAAAATCTGGTGAAACACTAATACAATTTCCAAAT AGATTGGCAATGATTAATTCGACTGCCATCCTTTCTTTTAGATTTTGATG CAATTTCCAAATGCGTTTGAATTCAATAACAAGTATTTGGTGAGAATTGC TGAGCATCTAAACTCCGGATGGTAAGTTGAGGGAGTATGAGGGAAATACT TATTTGATCTTACATGATCGGCTGTAAGCAAATACTTACCTCTTATTGTC TTGGAGTTTTTGAATGAGTAGAAATTTTATACGTAAAACATTAGGGAAAG CTCAGTGAGTACTACTAATTTGATAGCCTAAAATTTAAAACAAGAAAGTC TCTATTTCTGCTTTAGCGCTTTTCTCCCTGATGACGTAATCTTTTCAAAA AACCAATCAGACGATCTCAATTTTCACCATTGAAAGGCTAATGTCTTCTT CCTTCTTCGTCAGGTTTGGCAATTTCTTTTTCAACACACAGAAAGACTTG GAACAGGAGAACATCATGAGAACAGCTACTTCATTATGGGCACACTTGGA TGCTGTAGGAGAGGATTTTGTCAATCCATCTTACGATTCAGCCAAAGATG AGGTTTGTTTGCCCAGCATCGAGCCTTCCATTAGCATGTCGTTGTCCCTG GTGTTATATGTCTGTTTTCCAAGAAGCAGTGCTTTGTCAATTCAAGTTCA TTTTGGAAGAAAGTGTGCCTTGTCTTTTGCGTCGCTGGGCCTTCATGCCC TACAGGCATTGTGTTTTGTATTTCATTTCTATACGTCTTTATTAATAAAC CGTCTGATAGCTTAAAAATGTTTTCAAATAAGTTAATAGTCGGATGTTTT TGTTTGTTTTATAGTAAAGTGTAAGAAGGGAATTAAAATACATAGCAAGA ATCTCTCCCTGATAGCGTTGCCTTGAATAAGACTATTCTAATCAAAACTT CATGCTATTCAAAGCATCTTTAGTTTGGCGAGCTCTAGGTTTTTGAAGTT TAACTGTTCAAAGTCGACTGTTTACGCTTTTTAGTCGCCCACTCATCCAT TCGTCAGAAAATGGGGGTTTAAATCTTTCTTCCAATATACAGGTCCTGTA TCCAATATTCAACTTGCGCCGTTTGTACTTCTGGAAAGAATATTACCTGA GATATGACGATGTTTCCGTGTCATCGGGAATCGGAGATCTGGATGAATTT GAAGATAGAAATGAGGTAAGATTACAACAGGTTTTTGTTATTGAATTTAT AGTATTTTTACTTTACAATAAGAATCAAACATTTAAGAGAGACTTGAAAA AGAGTCAAAACTACTTCAGTTGAGACTACGCTCTAATGTTTCACGAAACT GAACCAGCCGATTGTATTATTTGTAAATCTGTTTTTTAAATCTGAGGACT GCCAACCCATATGAGATGAAATTTTGAGTATGACATTCCCAATTCGCCTG TTTTGCTCAAACTAGTGAATCTGTTTTATGTAATTGGAACTAATTAGAAG ATATTTTTTTCACACTTAGGACTTGGCAATGGCACCGACGAACACGGTGA TTTGGGTACCCGATGAACGAGTACGAGAATGTGGTGATTGTAAACAAAAG TTCACTGGAATACGACGACGGGTCAGTATATTCTTTAGTGGACGGGCAGG AGAATTCATGATGTGCACCATTGCAATGTCTATCATGGACCCAACAGTCT GGTTGAAAGTGACGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000213_pilon:582785..594951-

>XLOC_043816 ID=XLOC_043816|Name=XLOC_043816|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4596bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000213_pilon:582785..594951- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCCTTCTGCTTCGGGGAAAATTGAAATCGCACTCACACTTCGAAGTTTG
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GTTCACCAATGGGGAAAGGTGTCCTGATTTTCAACTACCGCTCGTTTCTG
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CTGACTGACTTCAGACTTGTGATCCTTTGTACTGATGCTACCTCGACAAA
TTTGGCAAAGACTTCTGACTTATCGATGTACATTCCACTGAACTTGATAA
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AAAGACTGAAGCTGGTACAGCAGGGACAACTGACGTCAAAACACTCATCT
TGAAATGTGAAGATTTCCGAACCATTCGATTCACCTTTTTGAAGAGTAAA
CCTAACTGGCATACTTATCTAGAAACGAAATTTCACATTATTGACGAGGT
CATTCGAAAGACTGAAGCTGGTACAGCAGGGACAACTGACGTCAAAACAC
TCATCTTGAAATGTGAAGATTTCCGAACCATTCGATTCACCTTTTTGAAG
AGTAAACCTAACTGGCATACTTATCTAGAAACGAAATTTCACATTATTGA
CGAGGTTGAAGAGTTGGAAGAGAGCTTGAACGAAGTGAAGGTCATTGATC
GCACTGTAAGTGTGGCCTGTAAGGCTGATGTTACACTAGAACGAGATGTT
CAAAAGAATAAACAAAAACAATTAGTCAAACAAGAAACATTCACTGTTGA
AGCAAATGGCAAAAATAAAAGGTTGAAGAGTTGGAAGAGAGCTTGAACGA
AGTGAAGGTCATTGATCGCACTGTAAGTGTGGCCTGTAAGGCTGATGTTA
CACTAGAACGAGATGTTCAAAAGAATAAACAAAAACAATTAGTCAAACAA
GAAACATTCACTGTTGAAGCAAATGGCAAAAATAAAAGTGGTTGTATCTC
AAGGATGTTCCATGTTCTTCACAAACGTTTGAAGTTTATCGTGTGGAACG
GTAACCGATTGGCTCCCACTCTCGCTTTTGTCAGTGGTTGTATCTCAAGG
ATGTTCCATGTTCTTCACAAACGTTTGAAGTTTATCGTGTGGAACGGTAA
CCGATTGGCTCCCACTCTCGCTTTTGTCAGAACGCAGACATCGGATTTTT
ATTTGAACGGATGGGATGTTTATCTGCCGGAAGAAGAATTCAAACGTCAA
CAGAACGCAGACATCGGATTTTTATTTGAACGGATGGGATGTTTATCTGC
CGGAAGAAGAATTCAAACGTCAACAGATCAACTCAGATTGGAAGCTTTCG
ACGTTAAACGGAGATTATTCGCTGTCGGCTACTTATCCTAAATATTTGTA
TGTGCCAGCTGCTGCCAAAATCAACTCAGATTGGAAGCTTTCGACGTTAA
ACGGAGATTATTCGCTGTCGGCTACTTATCCTAAATATTTGTATGTGCCA
GCTGCTGCCAAAAAAGAGGACATCCGAGGCTCGGCCACTTTCAGAGCAAA
GAAAGAGGACATCCGAGGCTCGGCCACTTTCAGAGCAAAGGGTCGCATAC
CTACCCTAACGTGGTTCAACAGGAATAATGGAACATTCATCATGAGGTGC
TCACAACCAAAAACTGGTGCTACAGGAAAAGGTCGCATACCTACCCTAAC
GTGGTTCAACAGGAATAATGGAACATTCATCATGAGGTGCTCACAACCAA
AAACTGGTGCTACAGGAAAATATTCAGTGGAAGACGAAGCGCTTGTTCAA
GCAGCCAAAAAGATCAGTCCTTCTGAAAGATTGGTTATTTTCGATGCACG
CTCTATGCTTGCCGCTGGTGGGAATAGACTTAAGTATTCAGTGGAAGACG
AAGCGCTTGTTCAAGCAGCCAAAAAGATCAGTCCTTCTGAAAGATTGGTT
ATTTTCGATGCACGCTCTATGCTTGCCGCTGGTGGGAATAGACTTAAGGG
TAAAGGAACTGAGGACATAGTCAATCGTTACCAAGGGATGAAATTACTTT
TTCTTGATATCGCTAACATACACGCCATGCGTGACAGCGTGGATAAACTC
TTCAACGTATGCGATTCAGTGCAAGAAAACAAATGGTATTCACAACTGGA
ATCCACTCACTGGATGTCTCATTTAAGATCAGTTCTCAAGGGTAAAGGAA
CTGAGGACATAGTCAATCGTTACCAAGGGATGAAATTACTTTTTCTTGAT
ATCGCTAACATACACGCCATGCGTGACAGCGTGGATAAACTCTTCAACGT
ATGCGATTCAGTGCAAGAAAACAAATGGTATTCACAACTGGAATCCACTC
ACTGGATGTCTCATTTAAGATCAGTTCTCAAGGGAGCCACTTTGATTGCT
CGCTATTTGACGGAGAAAAACGTTTCAGTACTGGTCCATTGCTCAGATGG
TTGGGATCGAACACCTCAATTAACCTCAATCGCTCAGGTTCTATTGGATC
CATTTTATAGGACAAGAGAAGGTTTCAAGGGAGCCACTTTGATTGCTCGC
TATTTGACGGAGAAAAACGTTTCAGTACTGGTCCATTGCTCAGATGGTTG
GGATCGAACACCTCAATTAACCTCAATCGCTCAGGTTCTATTGGATCCAT
TTTATAGGACAAGAGAAGGTTTCAAGATTTTGGTCATGAAAGATTGGATA
TCTTTTGGTCATAAGTTCAACCATCGTTTGGGTGATCCAAGCGCTACACA
AGAACGATCGCCTGTATTCTTACAGTTTCTTGACTGTATTTGCCAGATTT
TGGTCATGAAAGATTGGATATCTTTTGGTCATAAGTTCAACCATCGTTTG
GGTGATCCAAGCGCTACACAAGAACGATCGCCTGTATTCTTACAGTTTCT
TGACTGTATTTGCCAGATTTTGATGCAATTTCCAAATGCGTTTGAATTCA
ATAACAAGTATTTGGTGAGAATTGCTGAGCATCTAAACTCCGGATGATTT
TGATGCAATTTCCAAATGCGTTTGAATTCAATAACAAGTATTTGGTGAGA
ATTGCTGAGCATCTAAACTCCGGATGGTTTGGCAATTTCTTTTTCAACAC
ACAGAAAGACTTGGAACAGGAGAACATCATGAGAACAGCTACTTCATTAT
GGGCACACTTGGATGCTGTAGGAGAGGATTTTGTCAATCCATCTTACGAT
TCAGCCAAAGATGAGGTTTGGCAATTTCTTTTTCAACACACAGAAAGACT
TGGAACAGGAGAACATCATGAGAACAGCTACTTCATTATGGGCACACTTG
GATGCTGTAGGAGAGGATTTTGTCAATCCATCTTACGATTCAGCCAAAGA
TGAGGTCCTGTATCCAATATTCAACTTGCGCCGTTTGTACTTCTGGAAAG
AATATTACCTGAGATATGACGATGTTTCCGTGTCATCGGGAATCGGAGAT
CTGGATGAATTTGAAGATAGAAATGAGGTCCTGTATCCAATATTCAACTT
GCGCCGTTTGTACTTCTGGAAAGAATATTACCTGAGATATGACGATGTTT
CCGTGTCATCGGGAATCGGAGATCTGGATGAATTTGAAGATAGAAATGAG
GACTTGGCAATGGCACCGACGAACACGGTGATTTGGGTACCCGATGAACG
AGTACGAGAATGTGGTGATTGTAAACAAAAGTTCACTGGAATACGACGAC
GGGTCAGTATATTCTTTAGTGGACGGGCAGGAGAATTCATGATGTGCACC
ATTGCAATGTCTATCATGGACCCAACAGTCTGGTTGAAAGTGACGTAAGA
CTTGGCAATGGCACCGACGAACACGGTGATTTGGGTACCCGATGAACGAG
TACGAGAATGTGGTGATTGTAAACAAAAGTTCACTGGAATACGACGACGG
GTCAGTATATTCTTTAGTGGACGGGCAGGAGAATTCATGATGTGCACCAT
TGCAATGTCTATCATGGACCCAACAGTCTGGTTGAAAGTGACGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043816XLOC_043816-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000213_pilongenomesc0000213_pilon:582785..594951 -
Properties
Property NameValue
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