XLOC_043607 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043607
Unique NameXLOC_043607
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000128_pilon:159257..173912-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043607 ID=XLOC_043607|Name=XLOC_043607|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:159257..173912- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATGCTGTTATTCAGCAAACGTAGTCTTCTTGAAAATATAACTGTTATGA AAATTTGAAAAATTACAAGTCCTACCATTAAAAAAATCGGAAAAAGTAAA TTACAATTGCTTGAAATATTCTTTTTAGTATACCATGTAAATTATAAACG GATTACAAAGTATCGAAATAATGAGTATTAAAGTCCATTTAGTGCCAAAA GGGAGAAAAACCTTTTTGAAAATCAAGATAGGAACAAAAATTAGGCGCTT ACAAAGATTTCTAGGTGGAAACCGTAAAGATTTTCAAGTTTTATATTCAC TGAAATATAGTTCATGCATTTATTTAGAAAAATATTATAAAACCCTGTAG TTGACAAATAACTTTTTCAAATATTCCAATTTTAGGTCAAAACGCATGAG ATTGAGGACTCTAAGATTGATTTCGGTAATGTTTTTGAAAAGGTATGGGG GCAATAAAAAAGGTTTCCAAACTCTGAGGGGGGGGGGGGTGGTTAAAATT GAGTAACCAAAAGACTCATAGGACACCATGTCTCAATCTAACACAGACAA CTTAATGAATTTACATCGAGGGGTAAATAACTCGAAAAAATCTTGTTCAC TTGTCCAAAATAACCCAAAAAAATCTAAAAAAAACTAAATCTTAAACCTC AGAAGTTTCCAGGTAATCCCAAAAAATACCAAAAACCCTAAAAAATACCA AAAATCTTTCGATCTCTCTTAGGCTTTACTAGTCTAATCTAAAAGACTGG CTCTTATGCAGACAAATCATTACATTATTGATAAAAACAAGAAATATTCA CTGCATATTGACCAAAACGACTATCAAATTGTGTCTCAAATTACACATTA TTAAACCCAGATAATTATCAATTACTTAAATTCGATGTAGTGATTGTCAT CATTGCTCGTGATATTTAGTGTACTGTTTTGAGTTTCATTGATTTCCAAA 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CATTAAATTTAATGGCAATGGAGAACCATGTTGAGTCTTTCATCTCTTAC CATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGT ATTATATGCATGAGAGATCAACAATGATAGAAATCAATTTGACTTTCCTC TTAACTAATATATTTAAATATTTTGACTAAAAGTTCATAATTTTTCTTTA ACTTCTGATAAAAGAGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACC ACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTACAT GCATGAGAGATCAACAATGATAGAAATCAATTTGATTTTCCTCTTAACTA ATATATTTAAATATTTTGACTAAAAGTTCATAATTTTTCTTTAACTTCTG ATAAAACAGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCA GAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTATATGCATGAG AGATCAACAATGATAGAAATCAATTTGACTTTCCTCTTAACTAATATATT TAAATATTTTGACTAAAAGTTCATAATTTTTCTTTAACTTCTGATAAAAG AGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAT GCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTATATGCATGAGAGATCAA CAATGATAGAAATTAATTTGACTTTCCTCTTAACTAATATATTTAAATAT TTTGACTAAAAGTTCATAATTTTTCTTTAACTTCTGATAAAAGAGAATCA TGTTGAACCTTTCATCTTTTACCATACCCATGGTCAGAGATAAGCAAGTA CTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTATATGCATGAGAGATCAACAATGAT AGAAATTAATTTGACTTTCCTCTTAACTAATATATTTAAATATTTGACTA 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TACATGCGGTATTTTTTAGAGTGGCGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTAT GTGTATGTGATGGAGGGATGAACAATGCGTATATCTCAGGTGACACAAAT GTCGTTTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCATTGACGTATATTCA ACGTTCATTTGACGTCCACAGTAGTCTAGCAAGCTACACGTTTTTTTTTT TATAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTTTTG GATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAGCATTTTT TGAACATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAATGCATGTTTTTAAGTCTCCA AAGCCTTAGAATGTTCTTAGAATGTTCTTAAATTTTTGGGCCTCGAAGCC TTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAAAGAACGTGTAGACGAC TAATTTATACATATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATGAATGGAACAAT TTTAGTCGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAACTCCAAACAAAAAAAAAAGA GTCAATTAATATCGCAATTAAAATTTTTTCCTGCTCAAAATAATTCTTGA GAAAAAAAAATATGTGTGGATTTGTGTATTGAAAGTTTTTCATTTGAGTT GATTTCGTTTTGAGAGTTTGTTGTTGCTTGATAAATTGTTTTCTCGCTAC GCAAGTTTCTGCGTAGCTAGCCCCTGTATCTATAAGGCTGGAACACCGGA TTCTTCCAGTCGTTTATACAAACTAAATCCCGTATTATTATTATTATTAT TATTATTATTAGTATTGGTATTATTAGTATTACACGCATTATAAACGACT CCAGTCTACGTCCACAGCCATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAGAACATT TGAATTTGTTAAAGATTGACGTTTTTACTACTGGTATTAATAGAATTAAC 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TAAATTCAAATTTGCCAAAGTTAGTTCTCGCCAAAAATAAGTTCCCTCTT GAGATAATCAAAAGTAGCATTCTATCACTGACCACCTTTAGAGAAAGATA GATTAACTTAGATATCAAAGGACTGACAGCTGCAAGTAGGAATTCAAGTT ATCTGGGAAATTTCTAGCATCTAATGGTATTTTTGTCACGATCCTCAGTC CAATATACCTTTTTGTGGGAAAATTCACCTGGTAGATTGTTTACTTATTA GATTGTACTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTAAAAAAGAACGGCTT GTGCGTCGCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGATGGTAATGGAATGCT CCAAATCGTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTTTCCAAAAAGACATT ACAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000128_pilon:159257..173912-

>XLOC_043607 ID=XLOC_043607|Name=XLOC_043607|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1104bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:159257..173912- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGTAA
AGAATGCCGACAAAAAGATACGAAAGAACAAATGACGCGTGATTGCAAGA
AGACATGCCGTTTTTGCGAGCAAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGT
CACACCAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGATACGAAAGAAC
AAATGACGCGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCGAGCCTTGTATG
AATTACCACAGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTG
CACTGATGATAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCAT
GTGGTTATTGTAACCAAACTTGTATGAATTACCACAGAGATTGTCCAGGT
TACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCACTGATGATAAGTACAGTGCTTG
GATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTGGTTATTGTAACCAAAATCAAA
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TATGCCGATCATTTTGATGACGATTATTGCAATCATCCGAAATACGCCAA
GTGGATGTCGCAAGCATGCAAAGAAAGTTGCTTATATTGCAAAGATCAAA
CGAAGCCGATGGGCGACGACTGTTACGATCTTTCCGACAAATGTCCCGAT
TATGCCGATCATTTTGATGACGATTATTGCAATCATCCGAAATACGCCAA
GTGGATGTCGCAAGCATGCAAAGAAAGTTGCTTATATTGCAAAGATTGTA
CTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTAAAAAAGAACGGCTTGTGCGTC
GCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGATGGTAATGGAATGCTCCAAATC
GTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTTTCCAAAAAGACATTACAAAGA
TTGTACTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTAAAAAAGAACGGCTTGT
GCGTCGCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGATGGTAATGGAATGCTCC
AAATCGTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTTTCCAAAAAGACATTAC
AAAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043607XLOC_043607-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000128_pilongenomesc0000128_pilon:159257..173912 -
Properties
Property NameValue
Aaloc400-552:154
Aaloc250-396:804
Aaloc124-246:14016
Aaloc1-120:14657