XLOC_043360 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_043360
Unique NameXLOC_043360
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000046_pilon:1497824..1516175-

Legend: polypeptideCDS
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>XLOC_043360 ID=XLOC_043360|Name=XLOC_043360|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1497824..1516175- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000046_pilon:1497824..1516175-

>XLOC_043360 ID=XLOC_043360|Name=XLOC_043360|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3126bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000046_pilon:1497824..1516175- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAGACAACAACTTTAGAGAAAAGTGAAGAATACAAAAAATGGAC
AAAGCTACTCAAGAAAACAACATACATCTCTTATTTACTCAGTTTTCTTA
ATGGCTTGGAAGCCAATGCTGTCCTAATTGTACTTTTATATTATTTGGAA
GAAAGTTTTAAAATGACTCCGGACGAAGTAAGACTGTATTACAGTCTAAC
TGAAGCGTTTAACGCTTTAGGACAAATTTTCAGTGGGTTATTGATGGGAC
GTTATATGGACAGAACAAGGAATTTAAAATTATCCTGTTTATTGATTTTA
TGTGCTACCATTGTTGGGAATTTATTATATTCATTACCCATCCACGTTTT
GTTTATCATTATTGGACGATTTTTATGTGGCTTCAATGAGGCGTTCCAAG
TTGCTTTTTGTGATGGCAGAGACAACAACTTTAGAGAAAAGTGAAGAATA
CAAAAAATGGACAAAGCTACTCAAGAAAACAACATACATCTCTTATTTAC
TCAGTTTTCTTAATGGCTTGGAAGCCAATGCTGTCCTAATTGTACTTTTA
TATTATTTGGAAGAAAGTTTTAAAATGACTCCGGACGAAGTAAGACTGTA
TTACAGTCTAACTGAAGCGTTTAACGCTTTAGGACAAATTTTCAGTGGGT
TATTGATGGGACGTTATATGGACAGAACAAGGAATTTAAAATTATCCTGT
TTATTGATTTTATGTGCTACCATTGTTGGGAATTTATTATATTCATTACC
CATCCACGTTTTGTTTATCATTATTGGACGATTTTTATGTGGCTTCAATG
AGGCGTTCCAAGTTGCTTTTTGTGGCGAATTCAAAAGATGTTATCATAAA
GAAGACGAGTTGATCCAAGTTTTGAGTTGGTATGAACTCTCCAATGCCAT
TGGCATGGCTGCTGGACCCGGTGCACCAGTCTTTTTCTCGTGGGTCCACC
TCAAAATTGGCGAATTCAAAAGATGTTATCATAAAGAAGACGAGTTGATC
CAAGTTTTGAGTTGGTATGAACTCTCCAATGCCATTGGCATGGCTGCTGG
ACCCGGTGCACCAGTCTTTTTCTCGTGGGTCCACCTCAAAATTGTTGCTG
AAATGAAGTCGTTGGTTTTATTTTCAGTGCTACTTTTGGCAACCATCTGT
GTTGCTGAAATGAAGTCGTTGGTTTTATTTTCAGTGCTACTTTTGGCAAC
CATCTGTGCTGACGCTCGGAGGAGCAAGAAACATGACAAGACACTCAGCA
AAACATTATTGGACCTCAAAAGGACTTCTAACCTCTTAGAAGATAAACTT
GAAGCTGACGCTCGGAGGAGCAAGAAACATGACAAGACACTCAGCAAAAC
ATTATTGGACCTCAAAAGGACTTCTAACCTCTTAGAAGATAAACTTGAAG
CATTTAAAAGACAAAGCGGAGAAAAAAGAAAAGGTGGAAAAGCATTTAAA
AGACAAAGCGGAGAAAAAAGAAAAGGTGGAAAAGTAAAAGTATGCAGAAC
AAAAGGAAAACTTTGCAAAGATGTTGCAACAGAAGAAGCATGTCAGGAGA
AATTAGACATTGCCAAATCAAACACAACCAAAAAGGAACGCAGAAGGGCT
CGTATGGCTTACAAAAAGTGTGAAGCTTGTGGACAATGTGTAAAAGTATG
CAGAACAAAAGGAAAACTTTGCAAAGATGTTGCAACAGAAGAAGCATGTC
AGGAGAAATTAGACATTGCCAAATCAAACACAACCAAAAAGGAACGCAGA
AGGGCTCGTATGGCTTACAAAAAGTGTGAAGCTTGTGGACAATGTGTGAT
GCCAACTTTACCACCAACAACCCCTCAAGCCACTGATCCAGATGTTCCAG
AACCCACTGTACCTTCAGAAGTTGAGGAAGTGATGCCAACTTTACCACCA
ACAACCCCTCAAGCCACTGATCCAGATGTTCCAGAACCCACTGTACCTTC
AGAAGTTGAGGAAGATTTTAACATGGACATGGCTTTCCAATTCAGAAGAC
AAAATGAGGAAGATTTTAACATGGACATGGCTTTCCAATTCAGAAGACAA
AATGAGGAAGATAAATTCTGTGCACGTAGCAGAGGCAAGCTTTGTAAAGA
TGTTGAGACCGCGGATGATTGTCAAGGAAAACTTGAACTTTCAACATCGG
TAAACGCAACAAAGAAAGAAAAGAAAAGAGCACGAAAAGCTTTCGAACGA
TGCGCTGTTTGTGGCGAATGCAATAAATTCTGTGCACGTAGCAGAGGCAA
GCTTTGTAAAGATGTTGAGACCGCGGATGATTGTCAAGGAAAACTTGAAC
TTTCAACATCGGTAAACGCAACAAAGAAAGAAAAGAAAAGAGCACGAAAA
GCTTTCGAACGATGCGCTGTTTGTGGCGAATGCAAGAAAGCCTGTCGTAC
GAGAGGCAGACTATGCACAAAAGTGACAAGTGAAGAAGTTTGCGAAAAGT
TGAATGAAATTGCTCAAAACGACAAAGTGCCTGAAAAGAGACGAAAAAGG
GCTTTTGCTGCTTATGAAAGTTGTGAAGTTTGTGGACAATGCAAGAAAGC
CTGTCGTACGAGAGGCAGACTATGCACAAAAGTGACAAGTGAAGAAGTTT
GCGAAAAGTTGAATGAAATTGCTCAAAACGACAAAGTGCCTGAAAAGAGA
CGAAAAAGGGCTTTTGCTGCTTATGAAAGTTGTGAAGTTTGTGGACAATG
CACTGTCAAACCGACCAAGCCTCCAACGGCCCAACCATCTGCCTCACCCT
CTGCCAAACCCGAAGGAACTAAAGAACCCGAAAGCACTGCAGAGCCAGAA
GGAACTGAGGCACCCGAAGGAACAGAAGAACCCGAACTGTCAAACCGACC
AAGCCTCCAACGGCCCAACCATCTGCCTCACCCTCTGCCAAACCCGAAGG
AACTAAAGAACCCGAAAGCACTGCAGAGCCAGAAGGAACTGAGGCACCCG
AAGGAACAGAAGAACCCGAAGGCACTGAGGAGCCAGAAGGCACTGAGGAA
CCGGAAGGGACCGAAGAGCCAGAAGGTTCTGGAGAAGAAGAGGAGTGAGG
CACTGAGGAGCCAGAAGGCACTGAGGAACCGGAAGGGACCGAAGAGCCAG
AAGGTTCTGGAGAAGAAGAGGAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043360XLOC_043360-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000046_pilongenomesc0000046_pilon:1497824..1516175 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1486-1563:79
Aaloc1354-1485:247
Aaloc1195-1350:2685
Aaloc1033-1191:3134
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Aaloc607-699:5770
Aaloc550-603:6656
Aaloc415-546:17108
Aaloc1-411:18353