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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:898470..906436- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043293 ID=XLOC_043293|Name=XLOC_043293|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7967bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:898470..906436- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTGTCATTATTTGCATGCGCATTTTATATTTTTACATGTCGGCCAACT
TTCTTTTCAAATCGTCAAACGTGGGTACAGAACTTCCACAAAGATTATAT
ACAACATGGACAAACCAAAGTTAGCTCGTGTAAGTCGCATGTTATCAATA
TTCACTCTTTCAAATTTCATATAACGTAATCAAATTCCTTACAACCAGTT
TTTATGCAACTAAACTCATTTCATAGGAAAATTTTAGCTGGTAGGCAACT
AAGGGATCTTTGACAAAAAACTTTCGAATTTTTTATCGACATTGGGCCGA
TAAGTGGGTGGGGGGGGGGTTCCATGTAGTACAAATAAAGAACAAGTATT
GAGACGAAAATCCTTTCAGCCAATTTCTTTCTGATTTCGTCCACAAACTC
CACTGAAAGCATAGTATGAACGCGAAACACGAACGAAGTGTAAACTTTTC
AATATATCTCCAGAACTAACAGATTTTTTGAAATTCTGTAAAAAGGTCTA
AGTTCCTGAATAGTTTTACTATGTTCTATGGAAAAATCATAAGCATCAGT
CAAATACTCGTTCATCTATTTAAGATCGAAGACAAAGGGAACCATGATGG
CCACCCCTACTGAAAATTTCAGATCAAAACAAACAAGGAATTAATTCCTG
TAACTCGAAGAAAATTGGAAAAAACTGGTTTTTGACTGTTTCTGATCCTA
AAGTGCTATTTTTTGGTAAAAGCTATACAATTTATGTTTGGATTTCTAGA
AAGCTTACCCATTCATTGTTAATACATTTTTTATTTGAAAGTAATCTCTT
CATGGAATAAAAAGATATAGTCAAATCTTGTAGGGTCATTTTTCAAAATT
TTTTTGCCAAATTCAATTTTCGCATTTCGCCATTTTACCCTACGCAAATG
CACGTGGCGCGCTTGTTCGCAGCTTTAAAAGTACAGTTTTGAACTAGCTT
TGATAAAAAAACTCTTTTATCATTGGCCAGCGCGCTGCCTTTACCTTCGA
AATGTTGCGACTTCATCTCTTCATTTTAAATTTGTGATTAACAATATCAA
TGGTATGAAAAAACTCAATGTTGGCACAAATAGACAAAAATTCAACGATG
ACGGGTGGGAAGGCGATGGCGGACAATATTGGAGGAAATTGTGTTTTCAA
AGATGTAAAAGTTACATTTAAAAAATTTTGGCCGATAAGAGCAAGGGTGG
GGGTGGGGTCTGAAGCTTATTGGCCCAATGCTGATAAAAAATTCAAAAGT
TTTGTGTCGAAGACCCCTAATACACCTTTCCTGTTATCCATTTTGTAGTT
TCTGGGATGGTGTAAACAAACCTGCTTTTGTCTGCGTATCCTGCTGGGGT
CTCAAATAACTTGTGTGTGTTGTCTGACTTACTGATAATTTGCTAACTTT
TCGAAATCTGTGTGCGCATTATTTTGTTGCTCTCCACCGCTTGGTCTCTG
GGCAGTCTGGGAAATCCCTCATTGCAGTATACTGCAATTGTGGTAGTTTT
CATTCATGGTTAGCCTACAAAGGCTTGTAATGGCTACATATAGTGCTGGT
CAATAAAGATAAACAAACATCAACTGTAAAAAATCGAACGAGAAGATAGC
TTTTCTTTATTAAAAGAATCTGATCTACAGCAAAAATATTTTGTCTGTGC
GTTAAAAAGGTATGATCAATCATGTACCAAAATTGCCTGTTTTCTCCTTC
TGTTTCTTGAATATACTGGAATTGCGGTACTGCTATTGCAGTAAAAAATT
GCTATGTATATACCGCAATTGAGGGATTTCCCTGACTGCTGGAGGTACCT
GTTTTTGCTTGCGTTTCCTTAGGTTAAGTTAGTTTGAGCTTTTCTTAAGT
TCTATCAATTAAAATCCCTCAAATTTAGGTATGTTCTTTCTATTCATTAT
ATTAGGGGCCATTGACAAAAGAAAATCCTTATTTTAGCCTCAGGCTCAGC
TTAAACGGTGTACTAATTCCAACTTTTGTTCTTGCTTTTGAAACTTATGT
AAACATTCCGGTATGTTTCTGATGTACTTGACTACCGGTTGTCAAACCGG
GATAAAACAGGGGTACTGCAATAAAAAGTTATGTAAGAAAGACCATCATC
TCAACGTTCTTAACCAATAACCTTTGATAGAATCGTTCCCCTAATTGTCT
TCCTCTATCTTATGTACTTCAGAAAAACCAAAAACATTTCCCTTAAAAGG
TTAGCCTTACAAAGCCCTAGCTATTAATATAACCCCCTGGTTGAATCTTT
GTTTTCTTATCCTGTAAATATAACGAACAGCTATTCTACAATATTGCTGT
CACATGACTTTTTTCTACCGTGTGATGCAAATCGCACATTTTCATTGGAT
TGAATTCAGTTGATTTGATTTGATTTTGATTATTTCTTTTTCTTTTGCCA
TTATGTAATAAAAATTCTACAATGTTTGGGGAACTCAAATATCTAAAAGT
TTTTCTATTTTCATGGAAAAATGAGCTTTATAGGCAATTACTTTGCCAAA
GGTTTGACTTTTCTTTGTGAATTTTCATCTTCAATCTTTATTTTAATCTT
GGTATTTTCTAGAACTATTTGGGAGTAGAGAGCTTTTTACATATCTTAAA
AAGGTTTACTAATTCTTTAGATATAGTCAAAAGTTTGACATCGGTGAAAA
CTTATTTCTTTGATCGAACATTGACACATGTTTTTTCCAAATCATCAGAC
ACATGTGCTCTCACCTAATAATGAGTTCATTTCCCTCCCAAACAATTTTG
TTGGCACACATTTTCCAAGGCCATATCTGAGAAGTTTGAATTTCGGGAAA
GGTGTATTGTGCAATTGGCGTTGGCCTTCCCTAACCCCTTGCAGGCAATA
GATTGAACATGGTAGTTAAGTCTAGGAATACTACTAAATAAAGGGACATT
GCTTATAATGAGGGACAGTCATTATGATAACAGGTTATGTTTTATCTTCC
ACTTTAAAGGCTGTTTTTACCAAAATTTTAGTGATTTCATGAGGGGCAGC
GTCAGTGAGCCAGTTGTTAAAAAGGCATGAGAAATGATGTAAGAAAGGGA
ATCCCTAGATTATTGGACACTGTCCCTAAATTCAGGAACTAAAAAACTCT
AAATATCTTATGAAAGGTGCACAAGAGGTTTCTAAATTGGCACTTCATTG
GAATGTGCACAAGAGGTTTCTAAATTGGCACTTCATTGGAATTGTGTTAT
TACAGCCATCTTTGTTAAGTTAGAATTCAAAAAATTAACGCAGACAAAGG
CTCAATCAGCAAATTTGATATACTTTTGTTTATTAAAAAAGTGCATGTGA
AATGTGTAAAGTCTATTCTTGATTCTCAGAATTTTTATTTGTTAAAAGCA
CAGGAAAAAGTAGCTGTAACAAAAATAACTCTAGCATAAACTCCCTTATT
TTTCATGTGAGATATTTGGGGTAGTTTTTGATTATTTTCTTTTTCTTTTT
TCTTTCCAGGTTATGAAGATTCTTGGAAGAACTGGCTCACAAGGTCAATG
TACACAGGTAAAAAGTCTATCTATATTTCTTGCCAGTCTTTTTCTTTCTC
GTGGGGATCTACAGTGATATGTTTGAATACTCTTGGTTGTGTATAGTTCA
TTTTAGTAGGCCTGGGTTAATGAAATTTCATTAAAATTGTACAAATTTGG
AACAAAGTTGACAGTTGGGCAAACCTATAATTTCAAAAGCCAAGGCATGA
AGGCACAATGAAAGTTAACATTTTTGGTGGTAGTTTTTAACTGGGGTCCG
GTTGTCCGAATCAAGTTTTGATTATTTTGTGAAACGTGTCATAAAGCCCA
GCTAGAATCATTTACAATTCAAATTTCTAAAGTGCTGATAACTTCTGAAC
TATTTATGCAATCATTTTCAAATTTTGACACATGCCAGGCATTGACAATG
TGAATAGCACACCGCTATGCAAACGTCATAATTATTACTTTTAACATTTG
ACCGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTCATCTTGATTCGTAATGCGTGCA
AGTTATTACTTTTGTATCGTCAATAAGTGTAATTGACTTGCGAAAGCAAT
TAATGCAAAGGATGATGGGATCAAAACTCGGACAAACAGTAAATTTGATG
TCTATTTTTAGAATCACTATGGTATGCTATTGAAAAAATAATTTTAAAAG
TTGATGTCATCATTTATGACGTTTACTCATCTTTCGCATGGATATTAAAA
ATTCTTAATGGAAATGCAAACCGGCAATTACACGCTTTTTCTTTTATAAG
AATAACTTCTATAAGAATATCAGGGTGAGATTTCGGGTTTAAAACGATAG
GCCTATTGTTTAGAACAATAGAAAAATAAGAATAATGCTTACCCTCAACC
AAAGTACACTATTCTTATAAAAAAAAAGCGTGTATGTTAAGCAACAATTT
TTATCTTTATGAATCTTCAAACAAAATCTGAATATTTTTATTGGATTGAC
ATTTTTGTTATATTTTGGTGGAAATTTTGCTTTTTGGATGATGTCATCAA
TTTCTTTTTCTTTCTGGAATTTTGTGTCATGATGAAGAATATCTGTACCA
ATTTTCATGGCCATAGCTCTTCTTCCCCTGGGGCTATAAAAATCAAATCA
GTTTGGGGTTAATAGGGTTAAGGTACTCTTCTCTTGTTAAATATTTAAGA
GCTGTGGGAAAGGTTGGAAAATCTATTAAATGCTGCATTGGTGTCAGTAG
TACATACAGTCCTGATAAGCAGGAATCACATAGTGCATTGCCTACCAGTC
TGGAAACTTCGAAAGTTAAAAGAAAAGTTCGTTTTTGGATGGTATAGCCT
TTTCCTTTAGTCTGACTAATGAGACTGATGGGTGCTTAATGCAAATTGAG
AAGGATGAGGAAAGTGTGCTGTGCCAGTCTAGATCCTTACACTTATCGTC
CTTCTTAATTTGCATTTCAGTGTTGAAGCATCTTGTGAATGAAAATGAGT
GCCAAGAAGAAGCAGAAAAGTGGATGGTTGTTATGTGACCAGTGCGATAA
TAATGTGTTAACAAAGTCAGAACACAAGTGTGGTGTTGATACTGGATCGT
ATTTTGATGGAGAAAGACTGGTTGCTTTGGTTAGAAGCAATGATGCTATA
AATGAACCAATGCTTGAATCGCAAAATCACTTAGTCTTGATACATCCAAC
GACCATCAAGTTGTGTTCATTTCAAGTAGCTGGTTCTATCCTCGTCACAA
ATGGAGTTCAGAAGACCTTTTGTATTGTATGGCCTTCAACCAAAGTCAGT
CTGGGTGATGTGGTTATCAGTCCAGTTAAGCTTCGTTCGATTCAATGTCA
GTATAATCAGAGTGTCCTTCTAGGCAGATTAACTTTACCGCCCGTCATTG
CTGATTCTGCTCAAATTACGGTACCTGGAATTAAGTCAGTAAATTTTGAC
GAACTCAGAATATCAATCATTGATATCCTGGACAAGGCTTTGATATGTGC
TGGAGATCATCTAGATGTTCTTTTTAACGGAGTAATCTATAACATTGTAA
TAGACAACGTTGAAGTGGATGTTTGTCAACAACTTTCTTCCTTGCAAATT
GACATTGAATCCAAAATTGGTTACGTGTTTAGTAAAGAGCATACAGTTTT
GGAGTTTGGTAAGGGTAGACCAGACTTGGAAGTTGAAGTACTACCTCTTC
AACCTGCAAGACCATTTGGTGGCCTCCACAAGCAAGAACGTCATTTGAAA
GACTTCATTCTTCATTCACTTGATAACAAGCTTTATAAGGAATACGGTAT
TTCCTTACCTAAAGGACTCTTAGCTTATGGTCCAAGTGGTACAGGTAAAT
CACTTTTAGTGAAATCTTATGTCAAACAATTTCCTGGTATATATACAAGG
GAAATTAATGGACCTGAACTCACAAGTAAATTTTTTGGGGAAACAGAACA
AAACCTGAGAGACATATTTACCGATTGTCAAGAGAACGCACCGTCAATAC
TTGTTATTGATGAATTTGATACATTGTGCCCTAAAAGAACTGACAACAGC
AATGATTCAGAAAGGCGTATTGTTGCCACAATGTGTACCTTAATGGATTC
GGTCGACCAATCTATGCCATTTGTTGCCATTGCATTAACAAACAAGCTTA
ATGATATCGATTCTGCATTACGGCGTGCTGGTAGATTCGAAAAGGAAGTT
GAATTTTCAGTTCCTAACACCACAGAAAGAGCTGACATTCTTGTTAAATT
GTTAAATGATACAAAGAATAACTTGACGGATGATGATATTTTACAGCTTG
CTAGTACCACTCATGGATATGTCGGTGGTGATCTGAGTGCTCTTTGCAAG
GAAGCTGGCTCTACTTTCATCAAGCGTAAGAATCGTGATCAATTGTTACC
TGATTTGGTGACTAAAGATGATTTTTCCGACGCATTGTGTGTAGTTCGTC
CAAGTGCACTCAAGGCAATGACAGTTGATGTACCAAAGGTCTATTGGAAG
GATGTCGGTGGCCAGGATGAAGTGAAGCAAAAATTGAAAGAAGCTGTAGA
ATGGCCTCTCAAGCATTCTGCATCATTCAGTCGTCTCGGTATTAAGCCAC
CTTCTGGTTTGTTGTTATATGGACCACCAGGCTGCTCCAAAACTTTGACA
GCTAAAGCCCTAGCCACTGAAAGTGATATTAATTTTATCTCGATCAAGGG
ACCAGAACTGTTCAATAAATACCTTGGAGAATCGGAACGTGCAGTGAGGG
AGCTTTTCCATAAAGCGAGAATGTCAGCACCTACTATCGTATTCTTTGAT
GAAATTGATGCCCTGGGTGTTCAGAGGAAAGGCAAAGAGAATAATGCAGG
AGATAAGGTTCTTGCTCAACTCCTTACAGAATTAGACGGCGTGGAATCCT
TGACTGGTGTGATCGTAGTCGCTGCCACAAACCGACCTGACATTATCGAT
CCAGCACTGGTCCGACCTGGTCGTATTGATCGAATGGTTTACGTACCTTT
GCCCAATGACAAAACCCGCCGCGAAATCTTTCAAATCCAGTTTCGGTCTA
TGCCTATCACTAGTGAAGTATCTATTGAGAAACTTGTTCGTTCAACGGAA
GGTTACTCTGGCGCAGAGATATGTTCAGCTTGCCAAGAAGCAGGACTTGT
GGCGCTTCGTGAAGATATAAACGCGACGAGCATTACAGAAAAACATTTTG
AAAAAGCCTTAGAACAAGTTAAACCAGGAACCACAAAAGAAACTGTTCAA
TTCTATACAGAATTTTCTTTGACGCATTAGTTATGAACTGTAGACATGTC
GTTCATAATATGAAATTTAAACCATTTATGGAATATTTTAGTTTATCATT
CTACTTTTTACTTGATCTTATTTTTAGAAAATTGAATCGTATACATCTCA
ATTGATTGCACTTTTTCCATTCTCATCTAACAATTTAACAATTTGATTAA
GCCTCTCCAGGCGGTAATTTCTTATTTGTATACTGATGGTGAAATAAATA
CATCAGATCAGATTTAAATATGAAGACAGGCTCTTCTCTCCAGTTAATTC
TCAATTGATCGTCGGAAGGGATGCTCGAAAATGGCAGTCGAGAAATATTT
TAGGCGAAAAATCATTATTACTCTTGGGTTCCAAATAAACGGCCCTCCCC
GCTTGATAATATTTCGATAATTTTCCAACCCTTCCCGGACCTTATAAGGA
CCCCTTGTTTCTTAATTTTTAAGAATATTTTTAGCTGTCAAATAGAAGGC
CCCTTATTTTGATCTAAATAGCCTGATTTTAGCCTATATTTACCTTATTT
TCTGTTTTCAGAAGTACAATTTCCAACCCCCCCCCCCCCTCGGCAATTAG
GCCCCACGTTTATTTGGAACCTAACAGAATGAGCTAACATTTTTCAGGTA
CGTGTGGAATTTATCGACGATACCAACCGAAGCATCATCCGCAACGTGAA
AGGACCAGTCCGTGAAGGAGATGTTTTGACTTTGTTGGAATCTGAGAGAG
AAGCTAGGCGATTAAGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:898470..906436- >XLOC_043293 ID=XLOC_043293|Name=XLOC_043293|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=594bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:898470..906436- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTGTCATTATTTGCATGCGCATTTTATATTTTTACATGTCGGCCAACT
TTCTTTTCAAATCGTCAAACGTGGGTACAGAACTTCCACAAAGATTATAT
ACAACATGGACAAACCAAAGTTAGCTCGTTTTTGTCATTATTTGCATGCG
CATTTTATATTTTTACATGTCGGCCAACTTTCTTTTCAAATCGTCAAACG
TGGGTACAGAACTTCCACAAAGATTATATACAACATGGACAAACCAAAGT
TAGCTCGTGTTATGAAGATTCTTGGAAGAACTGGCTCACAAGGTCAATGT
ACACAGGTTATGAAGATTCTTGGAAGAACTGGCTCACAAGGTCAATGTAC
ACAGGTACGTGTGGAATTTATCGACGATACCAACCGAAGCATCATCCGCA
ACGTGAAAGGACCAGTCCGTGAAGGAGATGTTTTGACTTTGTTGGAATCT
GAGAGAGAAGCTAGGCGATTAAGGGTACGTGTGGAATTTATCGACGATAC
CAACCGAAGCATCATCCGCAACGTGAAAGGACCAGTCCGTGAAGGAGATG
TTTTGACTTTGTTGGAATCTGAGAGAGAAGCTAGGCGATTAAGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:898470..906436 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 178-297:121 |
| Aaloc | 130-177:4509 |
| Aaloc | 1-129:7968 |
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