|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:913470..916812+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_043288 ID=XLOC_043288|Name=XLOC_043288|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3343bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:913470..916812+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaacttcgtGAAGGAGAACCTCCAGATTGGAATGATCACGAAAACTT
TGGACCGTTGTTGCTAAAAGAGTTTGACCATCATCCTGGAGATAATGTCA
TTGATAAAGCAGTCTTTTTTGGCACTAAAGGATTGATCGTTGGTAAGCCT
TTACTTCTATTTCTACTCAAAGTGTAGCTGAAAgctttcctgtttttttt
ttacctccCTTGAATCCCTTTTCCTTTTACAGAGTCTTTCACAAAATGCA
AAATTCCTTTGAAGGAAAAGATCTGACTgcattcttcatttttaattttt
taggcaGTCTTTATGGTGGCTTCCACGCTGCAATCTTTGAACCAGCACTA
GGAGTCAATGGATTAGGTTATGCTATGAGACACATAGCAACTTTCGGTGC
TTTGACTGGTATGTACTCTCAAACAAAGCTGCTTTCTTTAGATATAAAAT
TCGTGAAATGtttacagtgccgtaggaagcattttcatattgagggggct
gaagtttagtgacaccgcgagggccaaccatggtttggcccgaggggggg
gggttttgaaaatttgagctttagattgcttgaaaatgcactcaattgtg
acaattatgacaaattaataaagaaaaactttgtatTTAGCAAAATTACC
Atttgtgaaaaaattattggggggggcatagccccccccccttgcccccc
cagttgctacggcactggttTAAATACCATTTATTGTTTGTCAGCCTTTT
TATTGGTTTTTAACATAATTTGACGTGTTTGAAAGGTTTTACTACTTAGA
AATTAGTGTTGGTTTAATtatcttttgaattttatgaTCGATCAAATGAA
CAAGtgctaaatcaaaaaaaaacttacccTATGATTTATACAAACTTACT
TACCTCAGAATCGTAAAGAGAAACATGTAGATATTTCGTACAACCCGGTA
TTTCATCTCATTGCTCGTTTTGACCATAATTTGTTCCTTCTCTTTATACG
TCAGGTGGTGCAGGTCTTGTGTTAGGTGCAGGAATTCCCATTGCACAAGC
TGTTCGAAAGAAGAATGACCCCATCGCTTGGATGTGGGGTGGATTTGCTG
CTGGGGCCGTCTTCGCTCTCAAAAGTAAGTCCTTTCACCAACTAAATTTC
TAACCAGCTGACACCCCTTTTTACCCCTTGTTAAATGACAGGTCTCAGTG
AGTTGATGAGAATTCTTAAGTTAAGACATCATGAATAATTCAAAAGCGTT
AATTGATATACCAGTCCAGATACAAGTTTCCCAGAGATTCTGGGCCTTTT
TCAAGGAACTTTACTAGCTTTACTGTAAGGACTCGAAATTAAGTTTTCGT
AGCACACCCAGTATAAAAACACCTTGATTTTCGGGTAGGTATTTAAGTAT
AGAAAGCTTCgtaatttcatttcaatgtGTGTAAGAAGCTTTGGAGAGGT
TTATgttgatttatgtaatttttgGCAGGTTTTGATCATTTATTTTCGAG
GAAAATAGCTAAGTAGAGTACTCCTAATACGTTTTGGACAACAAAAGaag
tgtttttcttaaagaaGAAATACTAACCTACTAGTACAAATATTGTTCCA
CTTTTCAACAAATTTACACGATTTCTTTCGTTTACCAAATGGTTTTAATC
GTTTAAGAATCGTACCAATTTAAAGTGATGTCAGGCTGAAACGTTATTAA
acgattttaaacgtttttctttgaacaaaaagtggtaaaacgatttgaaa
agaaagtcttCAAGTTAAAACGATTTCCTAATTAATTAAACGAATTTGAA
ACTATCAAAACGAATTTGAAACTATCAAAACGAATTTCTTACCTCTAAAA
CGAATTTCTTACCTCTAAAACGAATATCTAAACTAGTAAACAAATATCTG
AAATATTAAACGAATATCTAAACTATTAAACGATTACTAGCTAATAGCCA
AGGCTTTTCAAATCCCCAACCATAATAAGCAAGGGATTTTCTACCTTGTT
GACTTTAAGCTCCTCCATTTTATCCTCACTGGCTAATAAAttctcaccgg
gtcactgagacaggggtgtgataaTTCTTCTTGCTCCCCTGTGTGCGCAA
ACTAAAACCAGTTTCTTAGCCCCTCTAAAAAAGTCAAAGCACtcgttata
tatttttggaaagctaaggggtaggggaatcaaagtAGCATGGACTTTCA
CACCGACAATTAAGAGTCCACATATTTTATATATGGACCTATGCATTGTT
TCTCCACTCTTGTACCTTTACTTGGCCATGTCTGGTACACTAACtgattt
ttgacgaattttaatGGGGCAAAAACGATTTAATTTTATTGAAACGTTTT
GCCTCCGGATGGAACGTTTTTCTATTTAAAAGAACGATCTATATAAACCT
AAAACGATTTTGAGAACACCAGAACGATTTTGAGTACACCAAAACGATTC
TGAGAACACCAGAACGATTTTGAGAACACCAGAACGATTTTGAGTAcacc
aaaacgattttgagTACACTTAAACGAAATGTGGATATTTAAAACGGTTG
TaaacgattttcaaaatttaaaacgaaCGAAAACGAATTCCTTTTCATAG
TTTGTCAGTCATCGTTTAGAAAACGatttttcttctaatttttgGCTACT
AAATCGTTTCATACCTTTTCACTGTACGATTTTTTCTCAAACGattaaaa
caatatttgtacACGGTCCCTAACTCTAATATTTAACTTAAAGATCTATA
ATTTCTCAATAGAcatgtatatttatttttgaagacccagttttttgtga
aaaaatctcattttgttcaaaaattcagGGTAGCTTGGGAAAATGATTTA
AGGAAGCCTGTTTGAAGACTTTTATTGTGAGGATGCCTGTTTGAAGACTT
TTATTGTGAATTCCTTAAACGTCCTTTATAGTGAATAGCCAtaaccattt
ttcattttctgattcgtttttctagaaaaatactCGCTGATCTGAATTTC
CTATTAAAGGAATCTTCTTTCCATGTCGCTGACCTTTTCACCCTTTTTGT
GGTGAAGAAAATGGAGTTAATTTGGACATGGACATTGTACATTTGAAGCA
GTATATTTTGGTTTACTAACAAAATGTTGATGTTTCATTTCAGGTGGTCG
CTTCGGACGAGCAATACAATACGGATCTGCTACTGGGTTGTTCTTAGCTT
TCACCAAAACAATGGGCACTTATCAACGCCCGTACGTCGACCCGTGGGCT
AATTTACGGCAGCCGAAACCAGACACGCTTCCTTTGTTCGATAAAGATGG
TAACATGTATACACACAAAAGACAAAGTGCACAGGATTTGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:913470..916812+ >XLOC_043288 ID=XLOC_043288|Name=XLOC_043288|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:913470..916812+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaacttcgtGAAGGAGAACCTCCAGATTGGAATGATCACGAAAACTT
TGGACCGTTGTTGCTAAAAGAGTTTGACCATCATCCTGGAGATAATGTCA
TTGATAAAGCAGTCTTTTTTGGCACTAAAGGATTGATCGTTGatgaaact
tcgtGAAGGAGAACCTCCAGATTGGAATGATCACGAAAACTTTGGACCGT
TGTTGCTAAAAGAGTTTGACCATCATCCTGGAGATAATGTCATTGATAAA
GCAGTCTTTTTTGGCACTAAAGGATTGATCGTTGgcaGTCTTTATGGTGG
CTTCCACGCTGCAATCTTTGAACCAGCACTAGGAGTCAATGGATTAGGTT
ATGCTATGAGACACATAGCAACTTTCGGTGCTTTGACTGgcaGTCTTTAT
GGTGGCTTCCACGCTGCAATCTTTGAACCAGCACTAGGAGTCAATGGATT
AGGTTATGCTATGAGACACATAGCAACTTTCGGTGCTTTGACTGGTGGTG
CAGGTCTTGTGTTAGGTGCAGGAATTCCCATTGCACAAGCTGTTCGAAAG
AAGAATGACCCCATCGCTTGGATGTGGGGTGGATTTGCTGCTGGGGCCGT
CTTCGCTCTCAAAAGTGGTGCAGGTCTTGTGTTAGGTGCAGGAATTCCCA
TTGCACAAGCTGTTCGAAAGAAGAATGACCCCATCGCTTGGATGTGGGGT
GGATTTGCTGCTGGGGCCGTCTTCGCTCTCAAAAGTGGTCGCTTCGGACG
AGCAATACAATACGGATCTGCTACTGGGTTGTTCTTAGCTTTCACCAAAA
CAATGGGCACTTATCAACGCCCGTACGTCGACCCGTGGGCTAATTTACGG
CAGCCGAAACCAGACACGCTTCCTTTGTTCGATAAAGATGGTAACATGTA
TACACACAAAAGACAAAGTGCACAGGATTTGTGAGTGGTCGCTTCGGACG
AGCAATACAATACGGATCTGCTACTGGGTTGTTCTTAGCTTTCACCAAAA
CAATGGGCACTTATCAACGCCCGTACGTCGACCCGTGGGCTAATTTACGG
CAGCCGAAACCAGACACGCTTCCTTTGTTCGATAAAGATGGTAACATGTA
TACACACAAAAGACAAAGTGCACAGGATTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:913470..916812 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 370-567:3146 |
| Aaloc | 250-366:1007 |
| Aaloc | 145-246:306 |
| Aaloc | 1-141:1 |
|
