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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:528906..535245- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042921 ID=XLOC_042921|Name=XLOC_042921|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6340bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:528906..535245- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACACCTGATGTTATGGAAAGTAGAGATGATTCAATGACTGATTT
ATCAAAGGTAAATCTTTTTGGTCTTAACCCAATCAGCTTGAAGTCCGAAG
AACATTTTTCTACTCAATCATTCAGCTGTCCTTTGTTTACTGTATAATAG
TCTGTTATCAGTTACTACTTATTACATTCATGTAGTGCGATTTTGACACT
GTTTTCACCTAATTATTTTTATAATTTTACGATCTGTATTTTTGTTTAAC
TTTTCAGCTTTTCAATGCAGTATTAATTTTATTTTCATTAACTTCTGCTC
TAGGTGCCAGAAACAGCAGATGAATTTGCCCATCCTCCTCCTATCAAACA
AAATCCACCAGATGAACAAAAGCTACCACAATACGACGGTCAAGATGCTC
GCATGTATTCTTTCAGCTCTGACGACAACTTGCATCAGCAAGGGGAAAGT
CCATCAAAGTTACCAAAAAATATGACACCTCTTAATCTGCATTCTTACTC
GGTGTCACCAGATAATAAATATATTGACACTAGAAGTTTTGATTCACAAA
GTGGAGATGAGCTGACTCCACGTCCAAAGGTATTTTTGATTGTTTGAATT
CTCAAGACCGATCTGAGAAACCTTTTTTATGGTTATTAATCGTTACTTCT
ATCAAGATAAAATTTATATGTTTGAGGTCTTTCAAACTTTCAGTTTGAAG
CCATATTTTGACATCAGTAATAGATGATGTGGATAACCCTTTTTTTGTGG
ATAATGCTTTGTATTTTCGAATAGACTTCATTATTATTTTTTACCTACTG
TAATCAGAAATTTGGAATTCAATTTTGCAAACAGGAGCTGAGTTTTCCAG
TGGACGCCCAGTTTTAGTGTTTGAATATTATTGTTTATTGTTGTTTGATG
TTACATGAAGCAAAGCTGTTTTAAAAATGACACTTTTAACCTTAACATCT
TATTCATACCTTCTCTCTGCTGTTGACTTTACTAAAAATAGTTGAAAAAA
GCTTAGGAATGAGATAGCAAAATATTTCCTTCAATATAATGATCATTTTC
TAGTACTCACCGATACCGAACAAAGACAACATCTTGGAGATCAAATGTGA
TGACGATGATGAAATAAATGGTGAATGATTTGTATTTCTTCTGTTTATAT
TTTCTTTACACCTGTGTGGCATATATACCTAAAATACCGTATTACTTCGA
ATAAACGCCTGAGGGCGTTTATTAATTTTTTTGTATTTTATAAGGGGCGT
TTATTTGTGGGGGCGTTATACGGTATAATATAGCAATAATTATAGAAATT
ATTTATTTTGATAGTATAGAATTAGCATGAAATAATCTGTAGAAATCTTA
AGCATTTAACACTATGTAATAACGTAATAGTCAAAATGCATTACCTGTGC
ATGTTTGCAAATCTTCTTGATCTCTTGAAGGAAGACCAGTTGTGTTTTCC
TTCCTGTGCTTGTTATTATATTTCGATGATTATTAATCCTTTCAATTTTC
CTTTCAGATGATAAGAATGCATATAGTTATGCAACTTTTCTAAAGAAACA
CAGCTGCTATGACATCATTCCCAACAGTTCGAAAATTGTCGTTTTTGATA
CTCGTTTAAAGGTACAGAATTATTTTAAAAATTTTCTTCACAATATCAAT
TTTACCTAAATAAAGTTTTGAAGTAACTCTGGTGTTATCATTTGTGCCTA
GCGGTGCGGTGGGGAAACATTATACATTATTTTTATATAATGTTTTGTAG
TATCGGTTCGGAGCTCAAAGGATTATAACAATAAAGTTAAATTAGTTTTG
TTCTTGAAAGATTTTAAATGTGTAGTTTACATTTATATTTTTTATAGGTC
AAAAAAGCTTTCTTCGCACTCGTACATAATTGTAAGTTTGTTTTTTTACA
AACAAGCTGCACGTGGGAAGTGTTTGTCTGGGGTTTTCAACAAGAAACAT
ATCAAAAATTGTCCTTGTAAATGAGCTAATGCCCATTTTGAGCGTGTACA
GTCATTATGGCTACCATGTGGAAACAACTCAAGTCAATTAGTCTTCAATG
ATGGTGAAACGGTTTCGTTTCAATTGCAAAAAAGAGTTGCACAGTTAATT
AAATCGAATAATGAAATTTGACTTTACACATTTTGAGAAGTATTAAACAT
AAGTTAATCCTGTTTTCTTCAGCTATACGATCAGCACCATTATGGGACAG
TAACGAACAAGACTTTGTTGGTAAATTTCAACACTTTTAAGATAATTGTT
TCTGGTTGTTTCTTCAATTTTATATGTCTCAGGAACAAAAATATTGACAC
TGATTAAAACCTTCATGGCTCAAAAAAGGAAGTTACAGAAAGCATGAATG
ACCTTTAAGCATTTTTTCATTTCTTTTTTTATGTTGCAGGAATGTTGACC
ATTACAGACTTTATCAATATATTAATTCGATACTATAAATCACCACTGGT
AAGCAGACATACTATACTAAACTATAAGGGTCAAATAAGAGCCAACAACA
ATGGGCTGTCCATACAAGGGGGGATGGGTGAACGTTTTCAATTCAAAAAT
AAAATCTTCGAAATGAGTAGATAACCCTTGGAAAAATTATTTTCATACCT
TTAAAGTGTGACGGTGGACGAATCTTTTACCCCCTGGAAAAATAAAAATC
ACTCTTTTAGACCCCCTGGAAAATGTTCGCCCATCTCCGAAATATAAAAT
GGAATGGCCCAATGTATGTTGTGTTAGAACTAAATTATGCACAAATGGAT
TATTCATTCTGTTGTTATTTGACTGTGTTTATCTGGACTTTGATTATCAC
AGGAGAAAATGTGGGAATTAGAAGAACACCAAATCGAGACTTGGAGGAGT
AAGTAATTATTTGTATGTTAAAGTAAAAATGAAAATTATTATAAAATGTG
AGAAATATGTCAAACGGTGTCCTCAAATTCTTCATTTGGAAGTTTAATAC
TCTCTCTCCTCTTTGCTTTAGACCTTTTCAAAAAAAACATCCACTCAACA
TTATTAAGGATATCACCGACTGAAAGGTAAGTGCAAATAATCGAATGCTG
TTTCTAAATGGAAGAAAGATAGCGTTTATTTTTATTCTTCTAAGCTTAGC
TTTATGATGCGCTTGAATGAATCGTCCTAGTGTAGAATCCTATAGCCTAA
AGTTTTACTTTTAAGTTTCTGATTTTTGACAGAAAATTACGGTTGAATCT
TTGTATTTCGGTCTTGGCGAGTAATGATAGTTTTATTCCCTGTTTCAGCT
CAATTTAGAAATTTTTAGATTTGTTTTCTTCTTTCAGCCTATTTACTGGT
GTACAGACACTGATGAAAAACAAAATTCATCGTTTACCAGTCATCGATGA
AGAAACTGGCAACGCTATGTACATATTGACACACAAGAAGATACTTGCAT
ATGTTTATCAACATGTAAGAAGAGAATATATTCATGATATGTGCCATTGC
AATGTCTTCTAACATTACATCGTGGACCCAACAGCTGATTGGTACATCCA
TGGAAGACATTGCAATGGTGCATATCATGAATTAAAATCTATCAATCCTA
ACGGTTCAGAGGGTTTGAGTTTTATACCAGAGTTGAATGACCTCAAATAT
CTGTACCTTTGTTTGCCAATGCAAAGACTTCAGATATTTAACTTCATTCA
TCACTGATAAGCTGCAAAACAGATCCTCATACAGACATTTGATATGAAAC
ACTAGATAGACATACTCTGTCTTTCTCATGCAAAACCATACGCCATTTTT
GCTGAGTAGACCACAGCTCGGCACTGGCAATTTGTTTAATATGAACGAAC
AAACAACTCAAATGGTGGAAAACGAGGAGACAAGAGGATTGTCTTGATCG
ATCAACTTGCCGGCACAGAACTGTAGTCTATTTATTAAAGATGGCGCATT
ATTTAGCTCCAGTCAGGAACGAAGTGGCTCATTTAGTGTTTTATTTAAGG
TTTCTGTTGACCCTCTGCAATACATCTAGAATTAATTGACAATACTATTG
ACAAAAAATGTTCACGTTCGATACAAGACAAGGGGAAAACAGCGGGAATA
TTTTTGCCTTGCTTCTAAGCGAGGGTCTAATTAAATTAGATTTATCAAAA
TTTCATACCATGACCATTCTACCTTTTGTTTCTTAGTTGGACGATCTTGT
AATGCCAGACTTTCTTGGCAAAACTATCGAAGAAATTGGTATAGGAACCT
ATGGAGACATTGCAACGGTACCCTTTGTTTTAATTTGTTTTGTATCCAGC
AAATCATTGTGTTTTATTTCTTACCAAGAGTATTCAGACACAAAACGGTT
CAATTTTCAAGGTTTTGTTGATTATTAGTAAAACATTTAAAAAAAATCAT
ATTTAATTACAAAAACTTTTTTCCCAGCATAAGGTATTGAGGTACTGAAA
GCGACTGAGTTGTCGCCGAATATTATGGTAATTTTGATTTACATTTTAAC
TGTGATTTTAACATGCTTTGTTTCTTACTATTAGATAAGTCCAACAGCAA
AACTGATCGAAGCATTGAACATGTTTCACGAAAGGAAAGTGTCAGCACTG
CCAGTTGTCGGAGAAGATCGAAAATGTGTTGATATCTATTCAAGGTTTGA
TGTCATGGTATGTCTCTCTCCAAAGATTTCTCCAAATTGTTCTTCAGATA
GTTTATTGTAGTACGTAGGTGTTACATCAGGTTCCACTCCGCTCAGAATT
ACACCTACCTCTAACTTTAGCTGCTGTATTTCTCTAAATGTTCTTCTATC
TGCTCAATAGTATGTATATTTTCGCTTTGATATAATATTTCATAATATTT
CAATAAATGACTACATCTTACTATACTAAATGAGTTTATGAAAAATGTGT
GTAACGCAAGATGGTAGCTGTTTCGACGACGGGAACCGTCTAGTGACCAC
TAAAAAGTTTTTGTTTATTGAATATATTTTTAGTCACGTCTCTAGGTTCT
AATATCTTGATATTTCTTACCTTTAGAACTTGGCAGCCGAAAGGACGTAC
AATAATTTGGACATAACCGTATCAGAAGCACTGTCTTACCGTCAAGTCAG
GGTGGAAGGTATTCACAAATGTTATCCACATGAAACGTTCTACGCAATCA
TTGATCGCATCGCAAATGCTAAGGTATATTGTAATATCTCTCCCTACATA
TTTAATTGACCAATACAGCTATCAACCACTGACCTTTAATACCATGGACC
AAGTTTCTCAAACTCGGCCAAGCCAAATTTTGGATTGGAGTTTTCTTTTG
AAAAGTGGTACCATAGTGGTAGCACTTCTCCTCAATAGCGGTGTAAATGC
ATCGAGAGCGTTAAAACTACTTTTCCTCTGATACTTTAATGATATAGCTC
CTTTACACTTTGTGTGGTTTGTATAAAAGTCATTTTACGGTTGAAATCAA
TCATGTGTAGAATCATGACTGTCTGTATCCAATAACGACTACTTCGCATC
GGTTGGGAAAAAGTTTTGGAGCAATAGGAAGAGGTTTATTGATTCTGATA
AACCATGAAGTTACAGCCTCTATAGTATTCCAATCCTCCTTCAAATATTA
TTCAATAGGAGGATTCAAAGAATTCTGTATCAAAAATGAATTTTCTAGCA
CTAAAGAATACACCGTTTAGGAGTCTCGCTATCTTCACGGTACTCCATTG
CAGAGACCGGTAAAAATGGTAGGTAAAAATGCACACTTTAGTACTGTGAA
AGGTTAGAGGAATGTAAACATTGTGAATTTTTTTCTCTCCTTTAAAGAGA
ATGATTTAGATATTTGAACATGATATCAATGATAATTTTATAAGTCTCTC
CTGAAAATTTCACAAAAATTCATCAAGATGAAAGAAAGTTATGATTAAAA
GGAGTTCTTTACATACCGTTTTTCTGCTATGTTTCCTTATGAGAACCAGA
TGTTTACCTACCGTTTTTTTACGGAGGAGAGTGAATTTTCCGTGGTCGCT
AAAATCAAAACAATAGAAAATTGGATTGACGCGTGCGCAGTCGACACTCC
TAAACGGTGTATTAAAAGTTTTTTTCTTCTTCTTCATTTTTCATCTTCAA
AACTTTATGACTTATTATTCTATTATGCTCTTTATAATCATTTTATCTGT
ATATGATTTGTTACATTTGAAGCAATAGGAATAAAAATAAAAATTAGTGC
ACACTGAAAGCGGATGGACTTTAATCTTCTACATAAAACTTTAATTTGAT
TCACTGTCGTATTGATTTTTTAGGTACATCGTTTAATTGTGGAAGACAGT
GATCATTGCATCAAGGGTATTGTATCATTATCAGACATTCTCAGGTTCTT
GGTGGACCCTCCTAAAATGGCAGAAAGTTCTGTTTCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:528906..535245- >XLOC_042921 ID=XLOC_042921|Name=XLOC_042921|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2682bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:528906..535245- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAACACCTGATGTTATGGAAAGTAGAGATGATTCAATGACTGATTT
ATCAAAGATGTCAACACCTGATGTTATGGAAAGTAGAGATGATTCAATGA
CTGATTTATCAAAGGTGCCAGAAACAGCAGATGAATTTGCCCATCCTCCT
CCTATCAAACAAAATCCACCAGATGAACAAAAGCTACCACAATACGACGG
TCAAGATGCTCGCATGTATTCTTTCAGCTCTGACGACAACTTGCATCAGC
AAGGGGAAAGTCCATCAAAGTTACCAAAAAATATGACACCTCTTAATCTG
CATTCTTACTCGGTGTCACCAGATAATAAATATATTGACACTAGAAGTTT
TGATTCACAAAGTGGAGATGAGCTGACTCCACGTCCAAAGGTGCCAGAAA
CAGCAGATGAATTTGCCCATCCTCCTCCTATCAAACAAAATCCACCAGAT
GAACAAAAGCTACCACAATACGACGGTCAAGATGCTCGCATGTATTCTTT
CAGCTCTGACGACAACTTGCATCAGCAAGGGGAAAGTCCATCAAAGTTAC
CAAAAAATATGACACCTCTTAATCTGCATTCTTACTCGGTGTCACCAGAT
AATAAATATATTGACACTAGAAGTTTTGATTCACAAAGTGGAGATGAGCT
GACTCCACGTCCAAAGTACTCACCGATACCGAACAAAGACAACATCTTGG
AGATCAAATGTGATGACGATGATGAAATAAATGTACTCACCGATACCGAA
CAAAGACAACATCTTGGAGATCAAATGTGATGACGATGATGAAATAAATG
ATGATAAGAATGCATATAGTTATGCAACTTTTCTAAAGAAACACAGCTGC
TATGACATCATTCCCAACAGTTCGAAAATTGTCGTTTTTGATACTCGTTT
AAAGATGATAAGAATGCATATAGTTATGCAACTTTTCTAAAGAAACACAG
CTGCTATGACATCATTCCCAACAGTTCGAAAATTGTCGTTTTTGATACTC
GTTTAAAGGTCAAAAAAGCTTTCTTCGCACTCGTACATAATTGTCAAAAA
AGCTTTCTTCGCACTCGTACATAATTCTATACGATCAGCACCATTATGGG
ACAGTAACGAACAAGACTTTGTTGCTATACGATCAGCACCATTATGGGAC
AGTAACGAACAAGACTTTGTTGGAATGTTGACCATTACAGACTTTATCAA
TATATTAATTCGATACTATAAATCACCACTGGAATGTTGACCATTACAGA
CTTTATCAATATATTAATTCGATACTATAAATCACCACTGGAGAAAATGT
GGGAATTAGAAGAACACCAAATCGAGACTTGGAGGAGAGAAAATGTGGGA
ATTAGAAGAACACCAAATCGAGACTTGGAGGAACCTTTTCAAAAAAAACA
TCCACTCAACATTATTAAGGATATCACCGACTGAAAGACCTTTTCAAAAA
AAACATCCACTCAACATTATTAAGGATATCACCGACTGAAAGCCTATTTA
CTGGTGTACAGACACTGATGAAAAACAAAATTCATCGTTTACCAGTCATC
GATGAAGAAACTGGCAACGCTATGTACATATTGACACACAAGAAGATACT
TGCATATGTTTATCAACATCCTATTTACTGGTGTACAGACACTGATGAAA
AACAAAATTCATCGTTTACCAGTCATCGATGAAGAAACTGGCAACGCTAT
GTACATATTGACACACAAGAAGATACTTGCATATGTTTATCAACATTTGG
ACGATCTTGTAATGCCAGACTTTCTTGGCAAAACTATCGAAGAAATTGGT
ATAGGAACCTATGGAGACATTGCAACGTTGGACGATCTTGTAATGCCAGA
CTTTCTTGGCAAAACTATCGAAGAAATTGGTATAGGAACCTATGGAGACA
TTGCAACGATAAGTCCAACAGCAAAACTGATCGAAGCATTGAACATGTTT
CACGAAAGGAAAGTGTCAGCACTGCCAGTTGTCGGAGAAGATCGAAAATG
TGTTGATATCTATTCAAGGTTTGATGTCATGATAAGTCCAACAGCAAAAC
TGATCGAAGCATTGAACATGTTTCACGAAAGGAAAGTGTCAGCACTGCCA
GTTGTCGGAGAAGATCGAAAATGTGTTGATATCTATTCAAGGTTTGATGT
CATGAACTTGGCAGCCGAAAGGACGTACAATAATTTGGACATAACCGTAT
CAGAAGCACTGTCTTACCGTCAAGTCAGGGTGGAAGGTATTCACAAATGT
TATCCACATGAAACGTTCTACGCAATCATTGATCGCATCGCAAATGCTAA
GAACTTGGCAGCCGAAAGGACGTACAATAATTTGGACATAACCGTATCAG
AAGCACTGTCTTACCGTCAAGTCAGGGTGGAAGGTATTCACAAATGTTAT
CCACATGAAACGTTCTACGCAATCATTGATCGCATCGCAAATGCTAAGGT
ACATCGTTTAATTGTGGAAGACAGTGATCATTGCATCAAGGGTATTGTAT
CATTATCAGACATTCTCAGGTTCTTGGTGGACCCTCCTAAAATGGCAGAA
AGTTCTGTTTCTTGAGTACATCGTTTAATTGTGGAAGACAGTGATCATTG
CATCAAGGGTATTGTATCATTATCAGACATTCTCAGGTTCTTGGTGGACC
CTCCTAAAATGGCAGAAAGTTCTGTTTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:528906..535245 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1225-1341:118 |
| Aaloc | 1078-1224:1365 |
| Aaloc | 955-1077:1857 |
| Aaloc | 874-954:2205 |
| Aaloc | 748-873:3053 |
| Aaloc | 694-744:3368 |
| Aaloc | 646-690:3539 |
| Aaloc | 589-645:3950 |
| Aaloc | 541-585:4167 |
| Aaloc | 505-537:4494 |
| Aaloc | 403-504:4832 |
| Aaloc | 334-399:5288 |
| Aaloc | 58-333:6038 |
| Aaloc | 1-57:6341 |
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