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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:800641..809872+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042904 ID=XLOC_042904|Name=XLOC_042904|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9232bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:800641..809872+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATATTTTGCCAGCAGAGATTTGGATTCACTTTATTCTTACAAATCT
AAGTATTATTGATATTTGCAAGCTTCAGACTGTTTCAAAACAATCTTTTA
GCCTGGTGAAGTCGTACATGAAATCAatgaaatgtttatattttgatGAG
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tctgaAATTTATTGAACAGATCTCACTTTCATTATGCTGGAAATCTGCAA
CAGAAACTAATTTACTATTGTTAACAAGCAATTGCTCAagaattcatttt
tttgaagcTGGCCATTCATCAAACATTACAGACAATGTTTTGTTAAATCT
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ATGCAagtggataaatatttttttattaaataagGTAGAGTTCAGAATAC
AAACTACAAACCAAATTCTCTCTTACTGCCAGTAAGTTTAAACCTGTCAA
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atatcgattcgtcatcgatcgttaatcgattcgtcatcgatcgttaatcg
attcgtcatcgatcgttaatcgattcgtcatcgatcgttaatcgattcgt
catcgattataaatcgattatgcatcgattatGCATCTATCATATATCGA
AcccgtaaatcctcgaataagcttatttaatttttattttaagtacCGAT
AAGTAAATCCGGTTTGACGCCATTAGATCGATATGCATCGATTAATCAAT
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AATCGAATAGAATTGGAAGGTTTTGGGCAAATTGCCTCTTCTTGACGAGA
CCTACCACCTAATTATACCGCAGAACTTGACGAGTGAggtctaattcgcg
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ATTTGACGGGGCGCCATTCGGAACATAAACAAACACTCTCTATATTTTGT
GGTGGAGCAAtaccatatttcaaaaattacgttttgCCGAAGTTATAATT
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aaaaatgtaatacCTAAGGGATATATATTTGGGTAGTACGTTTAGTATCA
TTgatgataaaattttgattagtgTGCGCTATGAAAAGTGTTGGTTGAAT
GCACGATAGAAAGTGCAATGTAAGAAAATGAAACGTCTCTGAAAGGTCTG
ACTACATTAGCTAAatccaaatttgtttttttatctaacGCTTGCGTTTC
GTTCCagagaaaatgaaaagggagaagtaaataaatgattaaaaaagaag
aacattagagaaactggaaaaCttacgaaaatatcaaattttcatcgaag
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ATATTCCGCGGTTACGATAGATATCATTGAATTTAAAAGCAGAAATATAT
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CCACACCTCTGTTTCACATTCACAGGCTAGGTTAAGTTAATAGAAAATTC
GCCCAAATACATATCCCGTTGTTTTACGGACGTTATAAAAGGATGTTGTT
TTGACATTTAGCGTCCAtagAatacccctgtctcaagtaTCCACTGGACT
TCTACTAATGCCCCATGGAAAGCTAACTTTTTCCAGTTACGCAGCGATAC
TGGGTGTGATATAGCTGAGCCGATAAAAAGAGTAGAGAAATTAACCTGAT
CAtcgtatatttttgtttcccCGTTATTTCAGGTGGTACTGAACAATCTT
AGATACTTGAGAGAGGGAGAAGATTATCAATAACGCTCTAGTTAACTCTA
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ttgacttcatttaatttcatcgaaagtttgactttcagaggcTCCACTGG
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aaagttatgttttagattctttaacacttttaacaaagaattgcctttat
aaaatgctttttaatcaaaccccacAAGAGtaattaagaacttaattgca
aaaatgacgttatgaactttaaaaagacgttaataatatgttgcatcacc
ttcttttataaaaagtgctaagttttaataggtaattaacctttttgttt
cgaacttttttcaaactttcctcaaagaattgaactattttaaattttgc
ggaaaatttttctaaaaagatgtgtcaaaagttatgactgtttttttaag
gaaaatccagatgaaaaattgatggaaaaccactattttgaaaatttcga
gacaaagaagcatttacaaaaattttccgcaaaaatttttattgttcggt
aaaagatacaccatctactgcgaaaattgtttcaaaatgttttttcttcg
ccgaaactaagctcctcaaagttgaaatactcttcctcgcaaaagtcttc
attttcttcttcgtcaaattttttcaatgcaatttttgaaatttcagatt
caggaatagtttgtctaacagaaaatgtataacatgccatagttttgttg
gttacatcagtcagaaaacacattttaaacacggcaattatgaaaaattc
actatggtcagagcccttaaggaagattccaaaaatacaaaaacgaaGCA
AGCAAAAgtatttgtatcaaaggttatGGCCCTTGGAGAACTGTTGGTAT
TTTGACACCTCTACGGCAACAAGGTCAACtcggtcaaaatcgaaaaaaaa
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TACTCCAGCGAGAATTTAGAGATTACAAATACAGACCCGGTGTGTGTGAC
GTTTTACTTGTTTCATAACTTCTCCGATGGtcgatttcaaaatttcactg
agttactgagacaggggtattacgGTGGCACTCGAGGTGGCACTTAAAGA
ATTCAGAACCAGCGTGGAATCGCCATGAACACAAAGACAGGAGACAGTAT
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tcttagcgaaagaaaatactttataaCATTGTCTCTCTCAGTGCCCGATA
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CCGTGTCATACTTTTTTGCCCCTTTTTCCAATTTCCGCTTGCAGAAATAt
ttgcacccctgtctcagagtCAGAGAtgaattaagggctctgaccatagt
cggaaaattgattttagtatttgaacataaaagttatgttttaggttctt
taacacttttaacaaagaattgcctttataaattgctttttaatcaaatc
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gttttaatgggtaattaacctttttgtttcaaaatttctttacactgtcc
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gtgtcaaaagttatgactgttttttaagcaaaatccagatgaaaaattga
tgaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaagaagcatttacaaaaa
ttttccgcaaaaatttttattgttcggtaaaagatacaccatctactgcc
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tgaaatactcttcctcgcaaaagtcttcattttcttcttcatcaaatttt
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aaatgtataacatgccatagTtttgttggttacatcagtcagaaaacaca
tttcaaacacggcaattatgaaaaattcactatggtcagagcccttaagt
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ATTATGTCTTGCTTCATACTGTACCATGTCTCATTATCAAGCCTTTAGAA
ATAATCCCTTTCGTCAAAGACATTTCCTAGGAAGGACGAGAGATCGAGGC
GTCCATTTCTTTAACAAACGTTCTTatctagactatgctatagtctaaga
cgaggttcatctaagaggaacaaacgtgaagacgggaatttttttcgggg
gtagctgttgtcgtaaacacagactctatccgccgcgaaacatattacgt
tttagataatatacaaactatgttatatcataataatacattatacggac
gatagcatcgtctagttcTAATCCTGTTGTAAAGTGTTTGTAGCCTTACC
CTTCCCACTATCTTCTTCTGGAAAATAATACATAACATATAAACTCCCAA
ATTATCACTATACAAATATACAAAGACATTGTATTCACATGAACAACAAT
GGACAATGAGTGACTATTAACATTTGAACATTTATTCCTAGCTACTCTGA
ACACTAACAAGCCTCTTGGGATAGTGTGGCAGTagtaattaaaaatgaca
tgatgacggcatttgatattttttaattattcaataattaaCTACTTTCC
ATTTCTCGGTTCCGCATCACTTAACAACGCCTTCAACATGGGGCGCAAAT
GGGCGATTCGCGTTTTAACGCGAACAATTTTCCGCCCTAACTTTAGAATG
AAAATACGAAGAATAGACATTATTTTTCGTTTAGTGAACCAAAGATTGTG
TACAACTGGCTTTCGTAGAACACAATGCCAAAGAAATCTCCAATCACGGT
CGcttcattatttcttattcggcatttcaaaaaagggtccgaaaatcaga
aggttttcttcttcaatttccgaAGAACATGTTCCAAATCTTCGAAACCA
TATTTTTCCGATAGCTTGATCGATCAGTGAACGGGATCTGAAAACAGAAT
GGAAAAAGACATCGTCAGTAAAGTATGAGAGGCGATTAAACAAATTATCC
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AGGTAATCGATAGGTGTCGATAGGTAATCGATAGCGAGAAAGATCAATTA
ATATTAGAGCTCGATTTTTAGAAAGAgtcgatagggtcgataagatcgat
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cggatcgataagtaatccatcgatcacatatcgatccgtcatcgagccgt
tccgatgatcgatcctatcgagcgcgggggtctggtatACATACGTTGGA
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tcatatcttccttcgttttgagcgtaaaactcgtactcttcgggctatga
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ggggtcactagtggccgcctatagcagtgcctatagacgccgcctatagc
agtgcctatagaccaagagtaaggcctaaaagcctggatctgtctattgt
gtagactaggtCTTGAGTCAGTCTAcgccaaaaaatatctggtttATATA
TTACCATCTTTCCAGAGTGTTATTAGACCTTTTCTTATCGCATTGTCATG
TCAAATAGTTAGAAAAAGTAATTGAACTTTACAGGGAAATCTTTAGTTCG
ATATAGAGCTTTTCTAAGTTTAAGGTTTGCTTACATATTGCTATTTGTTT
GATTAATGTTTGGTTCCGCTTATAAGTGCGTCAGCTGTAGCTTAATACAA
AACGCTGTTCAAGAAGCTCAATAATAATTTATCAGCAATAACTGTAAATT
GTACACATCAAACGTCAATAAACTAATCAAACTAACTAACCAAAGGTTTG
ATTGAGTTTGATTAGCTCAACAAATGGAACATTTTCAtcagtttttttcc
aaaacaattTGTCGCAggcaaagattttcaaatttttcattttcaaagta
gaAGTGATGTAAACCTTACAGCGCCGCAtttttttCATTgagatgaaaat
ttcaatttttacctATATTTGAGAGAAACGTAGAAATACCAATAACTGGC
aacccccttaggaaattcataGGGTTCTATCAAAATCCGAGaccccccta
aatgtaggggggtTAGAAATAATGTGTTCACACTACATTATATTTGGGAG
AATGTACTTATACCCTgaatcaaattttagaaataatgCGTTTGGAAAAA
TTACTTTAAGGGAGGGATATGAAATCAGACTATTTAAAGGGAGGGATAAG
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TGTTAGTTTATACCATGAAGtgtgctattttttcaaaaaagatttcctaT
CAGTAAATTCTCTAAAAAGAATGTTATACAGCTCAAAAGTAATTGGAATT
TATTAGTAAAAATATTGGTACagggggggggtccatgtacaaaacagcgg
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AATTGCCAAATATACCCCAACACCCCCCTTACAtagtacaatatactatc
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CCCATGTATAGTACACAAGTACTAAACagctaattttttttgaaaacacc
cacccaccccatgatacatgccgcttttctgtacatggacccccctgatt
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ATAAAAGAGAGGGCTAGATTTATAGGGTGGGTAGAGACCTCTTTTCAAAC
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TTGGTCCATATTCTTCAGAAGAGATACTACAAGGAATGAGAAAAGAAGGG
TATACCTGGCATCTGGTTTAAAAGTTAGAACGATATAAAGGATGTCCTAG
GAAACATCTTGCATACGATTTAGATGAATATCTTATAGTATCTCAATGTT
ATCATTTCAGGTGACAGACACTGGTGTTTTGGCAATCGCCAAATTTTCTT
GCAACCTTAAACACCTCATTATCAGCTCTAACTATGGAATAACCAGCAAA
GGTTTATCTGCACTACTCAAACAATGTACCAATTTGGAAACACTTGATAT
TGGGAGAACCTATTTATCAAATACCTCATTCGATGATATGTTGAGGGAAG
GTTAtgccaaaaatttaaaagaaattcgACTATACAAATGTCCAAATGTA
AGTTCATGTTGAACGTTGATAATTGAATTTTTATATGTGCAATCCATGTT
AGTAAAATTTTAGCTGGGTCAAAGTATTTGCTATAGCTTGGTAGCCTTGC
ATTTGTAGAATCTCGATCCTTGACAGTTCAGTGATTCATGCCACCTTCAG
GTAGGGCCCAATAAGGCTTAATACTGTAATGGTATTGATTTTTGTTAGGA
TTGAATTttgcggttgagctcatccgtgaaattttgagcttttgcaGAGA
CTTAATTCCGCAGATGACTCTATTGTCAGTTGTTGTGagaaattatttat
tatttgctatttttgctattttactgCCCAACTATGCATGTTGGTTGTGA
AATACGCATTACTAGTGCTTCGTTGATGGCGGTAAACATGTTAAAAGTGG
TCTTTTGGaattcaatgcaaaaagatttcctagataaaacctttcaaatt
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AAAAATTAGTCCCACTAATGaaaatttagtgaaaatttAGTTTACAGCAT
ACCTAAGTATATTAAAAGTTCATCTATTGACTGAATAACACATAATAGCA
TTGGTATTATATTTTCTAGATTTCAGAAGGAATAATGGAACGTCTGGCAG
CCAAAGGCATTATGATCAACTcatgtttttga Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:800641..809872+ >XLOC_042904 ID=XLOC_042904|Name=XLOC_042904|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:800641..809872+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATATTTTGCCAGCAGAGATTTGGATTCACTTTATTCTTACAAATCT
AAGTATTATTGATATTTGCAAGCTTCAGACTGTTTCAAAACAATCTTTTA
GCCTGGTGAAGTCGTACATGAAATCAatgaaatgtttatattttgatGAG
GAAATTGCTTTGATGTTGAACGAAGAAggtttgaaatcaatttttgcttc
tctgaAATTTATTGAACAGATCTCACTTTCATTATGCTGGAAATCTGCAA
CAGAAACTAATTTACTATTGTTAACAAGCAATTGCTCAagaattcatttt
tttgaagcTGGCCATTCATCAAACATTACAGACAATGTTTTGTTAAATCT
CGCTGAAAATTGCCCCAAACTGGAGTTCTTAAACATTGGTTCCTGCTATA
ATATGGATATTTTGCCAGCAGAGATTTGGATTCACTTTATTCTTACAAAT
CTAAGTATTATTGATATTTGCAAGCTTCAGACTGTTTCAAAACAATCTTT
TAGCCTGGTGAAGTCGTACATGAAATCAatgaaatgtttatattttgatG
AGGAAATTGCTTTGATGTTGAACGAAGAAggtttgaaatcaatttttgct
tctctgaAATTTATTGAACAGATCTCACTTTCATTATGCTGGAAATCTGC
AACAGAAACTAATTTACTATTGTTAACAAGCAATTGCTCAagaattcatt
tttttgaagcTGGCCATTCATCAAACATTACAGACAATGTTTTGTTAAAT
CTCGCTGAAAATTGCCCCAAACTGGAGTTCTTAAACATTGGTTCCTGCTA
TAATGTGACAGACACTGGTGTTTTGGCAATCGCCAAATTTTCTTGCAACC
TTAAACACCTCATTATCAGCTCTAACTATGGAATAACCAGCAAAGGTTTA
TCTGCACTACTCAAACAATGTACCAATTTGGAAACACTTGATATTGGGAG
AACCTATTTATCAAATACCTCATTCGATGATATGTTGAGGGAAGGTTAtg
ccaaaaatttaaaagaaattcgACTATACAAATGTCCAAATGTGACAGAC
ACTGGTGTTTTGGCAATCGCCAAATTTTCTTGCAACCTTAAACACCTCAT
TATCAGCTCTAACTATGGAATAACCAGCAAAGGTTTATCTGCACTACTCA
AACAATGTACCAATTTGGAAACACTTGATATTGGGAGAACCTATTTATCA
AATACCTCATTCGATGATATGTTGAGGGAAGGTTAtgccaaaaatttaaa
agaaattcgACTATACAAATGTCCAAATATTTCAGAAGGAATAATGGAAC
GTCTGGCAGCCAAAGGCATTATGATCAACTcatgtttttgaATTTCAGAA
GGAATAATGGAACGTCTGGCAGCCAAAGGCATTATGATCAACTcatgttt
ttga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:800641..809872 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 640-702:9170 |
| Aaloc | 403-639:8311 |
| Aaloc | 1-402:1 |
|
