XLOC_042902 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042902
Unique NameXLOC_042902
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:643586..644329-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042902 ID=XLOC_042902|Name=XLOC_042902|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=744bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:643586..644329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGCTGGCATGTGCTCTCCAAATTGTGCACCAGCTTGCAGTGCTCA ATGTTGTGCTGCTCCACCACCCATGCCTGTAGCTATGCCATGTGCTGCCC CACCCTGTGCCGCTCCAATGCCCGCCCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCC GCTCCAATGCCCGCCCCTTGCGCTGCTCCACCCTGCGCCGCTCCAATGCC CGCCCCTTGCGCTGCCCCACCATGCGCGGCCGCTATGTATGCTCCCTGTG CTGCCCCACCTTGCGCCGTCCCGATGCCTGCCCCTTGCGCTGCTCCACCT TGTCCAGCCCCTTGTGCAGCCCCGCCCTGCGCCGCTCCAATGGCTGCCCC TTGCGCTGCTCCACCCTGTGCAGCACCTATGATGATGGCTGCCCCTTGTG GTGGAGCTGCTCCATGTGGAGCAATGGGACCATGCGGAGCACAAGGAGCT ACTGGAGCAGTAGGAGTTCCAGGACCAATGGGTCCAGCGGGACCAATGGG AATGGGTGGACCACAAGGACCTATGGGACCATGCGGGCCTCAGGGACCAG CTGGAGCTCCAGGTGCCCCAGCTCGACCATGTGCTCCAATTTGCTTACAT TGGATGGCTATCATCTCCCAACAACCAACTGCATCTTGTCCACAAGCTTG CCAACAAACAGGATGTTGTCGACCTCCAGTACAAATGGCAGCACCTATGC CAGCTTGTATGCCATCATGTGCTCCTTCATGTTGTGGCCGCTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:643586..644329-

>XLOC_042902 ID=XLOC_042902|Name=XLOC_042902|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1410bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:643586..644329- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGCTGGCATGTGCTCTCCAAATTGTGCACCAGCTTGCAGTGCTCA
ATGTTGTGCTGCTCCACCACCCATGCCTGTAGCTATGCCATGTGCTGCCC
CACCCTGTGCCGCTCCAATGCCCGCCCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCC
GCTCCAATGCCCGCCCCTTGCGCTGCTCCACCCTGCGCCGCTCCAATGCC
CGCCCCTTGCGCTGCCCCACCATGCGCGGCCGCTATATGTGTGCTGGCAT
GTGCTCTCCAAATTGTGCACCAGCTTGCAGTGCTCAATGTTGTGCTGCTC
CACCACCCATGCCTGTAGCTATGCCATGTGCTGCCCCACCCTGTGCCGCT
CCAATGCCCGCCCCTTGCGCTGCTCCACCATGTGCCGCTCCAATGCCCGC
CCCTTGCGCTGCTCCACCCTGCGCCGCTCCAATGCCCGCCCCTTGCGCTG
CCCCACCATGCGCGGCCGCTATGCCTGCCCCTTGCGCTGCTCCACCTTGT
CCAGCCCCTTGTGCAGCCCCGCCCTGCGCCGCTCCAATGGCTGCCCCTTG
CGCTGCTCCACCCTGTGCAGCACCTATGATGATGGCTGCCCCTTGTGGTG
GAGCTGCTCCATGTGGAGCAATGGGACCATGCGGAGCACAAGGAGCTACT
GGAGCAGTAGGAGTTCCAGGACCAATGGGTCCAGCGGGACCAATGGGAAT
GGGTGGACCACAAGGACCTATGGGACCATGCGGGCCTCAGGGACCAGCTG
GAGCTCCAGGTGCCCCAGCTCGACCATGTGCTCCAATTTGCTTACATTGG
ATGGCTATCATCTCCCAACAACCAACTGCATCTTGTCCACAAGCTTGCCA
ACAAACAGGATGTTGTCGACCTCCAGTACAAATGGCAGCACCTATGCCAG
CTTGTATGCCATCATGTGCTCCTTCATGTTGTGGCCGCTAAGCCTGCCCC
TTGCGCTGCTCCACCTTGTCCAGCCCCTTGTGCAGCCCCGCCCTGCGCCG
CTCCAATGGCTGCCCCTTGCGCTGCTCCACCCTGTGCAGCACCTATGATG
ATGGCTGCCCCTTGTGGTGGAGCTGCTCCATGTGGAGCAATGGGACCATG
CGGAGCACAAGGAGCTACTGGAGCAGTAGGAGTTCCAGGACCAATGGGTC
CAGCGGGACCAATGGGAATGGGTGGACCACAAGGACCTATGGGACCATGC
GGGCCTCAGGGACCAGCTGGAGCTCCAGGTGCCCCAGCTCGACCATGTGC
TCCAATTTGCTTACATTGGATGGCTATCATCTCCCAACAACCAACTGCAT
CTTGTCCACAAGCTTGCCAACAAACAGGATGTTGTCGACCTCCAGTACAA
ATGGCAGCACCTATGCCAGCTTGTATGCCATCATGTGCTCCTTCATGTTG
TGGCCGCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042902XLOC_042902-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:643586..644329 -
Properties
Property NameValue
Aaloc238-705:469
Aaloc1-234:745