XLOC_042799 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042799
Unique NameXLOC_042799
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000032_pilon:367994..376909-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042799 ID=XLOC_042799|Name=XLOC_042799|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8916bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:367994..376909- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTCATACACCCTAAACAAATTGTCCTGTAAGTTTATTACAATTTTTTT GATATAATTTCTTTTCAACTTACTTCAAAGATTTTGTGGCAACTGGATAA GTACTATAATTATTCCTACTTTAAGGTATAATTTAGGTAAACCCTCATAT TTTAAAAAGAAATTATAAATTAGATCTACCCTAATTTTAGCACAGATTTC AATACCCTATTTTCAAATAAAACAATACCCCATACCTATTTTATTGACTG TCTTACAATCCACCTGAGCAAAAAAAATACTACTAAAGGGGCACTTAATC GCGCCATACAGTCTATAATAAAGTTTTAAGTTGTCTCAGGTGTAAGGTCT CAAGAGAAATAATCACCTCAGTAATGATTTCAAAACGAGGCAGGGATTGT TTGTGATATAAGGGGCCCCCCAGCAGTTGCGTGAATGCGTGAATGGGCAT TTTCGGTTGCGTGAATGCGTGAAAATTGAAAAAAAAAGCGTGAATGCGTG AATTGAAAAAACTTGCGTGAACGTGAAAATCCACTTTTTGATTGCGCGAA TACGTGAATTTTCCCTTTTTTCCACCGATTATGTGCAGTTTTCCCGATTT TCCAATGTTTCCCCGATTTTTCCCGAAAAAATTCCGGTTTCTGAAAAATC GGATTATTGTATGAAACACGAGGAAAATTTGCGGCAATGCGTGAATTTGG AAAAAAAATTGCGTGATTGCGTGAATTGAGTGTCCGCTGGGGGGCCTCAT ATAACCATGAAATCGATAACCTTTGATTTCTAATAAGACTCAGAGTGAGA TTGTTTTTCCAGTATTAAAAATGTATTAAATATAAATAAATGTTGCTAAG TTGCTAACTATAAAAGAAGATTTATCCCAAAAATGACATCGTTGCAGCTG TTATAAGAAAACTGCATTATATTCCTAAACTGAATTGAAATATTTTAAAG 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CCAAAAAAGCCGGATTTTGACCACCGTGTCTTTTAGTACAGAGATCAATC CCAGATTCTTTCGGGTGTTTCCGTTAGAAAAATGAGAAGAGGTTAAATCT AAATCATTTTTACATTGTAGACGTGTCACCAGTCTTTTAGTCCCTAAAAA CACAAGACGGGGTCTCTAAGCCACAAAAAGGATTTATGGCCGGCATAATT TTAGGATGGAAATCCGTAGAGACTTGAATGTTATTTCTGACTGTTTTAAT CTCTTTTGGAAAAGTGATATGTGACATGGTAAAATTTTCAAACAACATAG CGGCACGACCCCTTCAAGGTCTGTTGCCCCATTGAATAGCTACTTGATCA GGCAATAGACCTTGAAGGGGTTGAAGCTTAATGATAAATAGAATTGTACT GGACACGTGAATCTCAATGAAGGAATCAATGATACCTTTCAGATTCACTC TGTTGTAGATGGTTCCTTCTTCATAAGTGACTTTGGCTTTCACATCATAT TGGCCATCGTTATCAAACTTAATAGTTCTCTCTTGAGAATAACCGTCGGG TTGTGTGCTCTTGAAAAAGTCGGCAATATGACGTGGGTATTTGGCAAAAC ACCTAAATAAATAAAAAAGTTTCTAAAAATAAAAAGATTCTATTCCTCTT GGACGAATTCTCGACTGTCCTTTAAAGCAACGTTTTAGAAATTTTGTTAT AGATTGCTCATAATACAGTAAAACCTTTAATTAACAGACACTGTAAAAGG CAGAAACCTCCAATTAGCGGACAATTCTTTTTTCCCCAGGCCATTTCCTA GTCAAATCCTCATGGAACAAAGTTTCCAAAAGACAATTTGGGGACCCTCC AATTAGCGGACAATCTTTTATGCACGGAATGGCCAAAATCCTACTTTTTC TCTCCAATTAGCAGACATCAACGGTCAAACTGGTCACAGACTTTAAAAAA TTAGACATGATAGATTTATCCAAGCTATTTATTGCTTAAAAACTTCAAAG TTTCATTGAACAAATTGCTTATACTTATAGACGTTTGGAGCGCTCCCTTT ATCCAGTCGAATTTGAGCACGTCAAAAAAATGATAAATTACAGGGACCTC AAGACTACTATGATTCATAAAAACTAAATTGTTGCATATTCTCTTTTTTG AGAGACATTCTCCCATGTCCTTATGTCTCTAGAAAAGCACTTCGTACCAA AATTTTACATCTTTAACACTGATTCATCGAGGCACCGATCCCCAATACAT AACAAAAAAAACAAACTTACAAAACACCATAAGACAAACTACTCAAAATA GTAGCCCAAGGTACGGGAAGATCACCAGTGGTGCAAATATATTTGGATTT GACAGTTCCAGTGGTGGCATCACCAGTACCTTCGCCTTTGATGGTGAACT TCATTCCTTCCACATCTCCTTCTAACTCTGTTATGTATGTCAATTCTTTT TGGAAGAGTTTAGCTCCTTCTGTCAATGCGTCGTCAGCCATTTTGATTTT TGGTTGGGAGAAGAAATCTCTGATAAAATAAAGCTAAGAAATATTAGTTA TTGGCTAAAACTGACTCTGACTCATTTATCTGATAGAAAGATAAAGCGTT TTTGTTCAAGTTTTTGTATTAGCTATCAACAAAAACTGGACTTGGTGTTC ATCTAATTAAAATCTTTTTTTAAGAAAGTCTTTTTTGCCGTCTTTAGCTA AAGGTTTTATTTTTACATAAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATATT TCATATCAGGGCTGCCTAATGTTATATTATGCTGATATAAGCGAAAATGT TTTTCTATTCCTCTTTTTGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGTCCATCCA ATGGGAGAAAGCTTGTGAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAACGATATCAC TCTTATTTAAAAAACAAAACCTTTAAAATCCGTTGTAAAACAGAATCTGA GTAAAATGCCTTCGGTTGGATTGGCTCAGTGTATTCTATCGGTTTCTAGA TGTTAAGCCTTATATTTAAATATGAAGCTATTAACTCCAAATGTTGAGGC TAGTAAGAGGTTTACAATATCAATTTACCTTTTTCAAGCTAAGCTTCTGT GGTGATGTTGTTGTAGATAGAATTGTAGTTGAAGATGATTTTGAACTGAA GATTTCCATCGTTTATACTACTTTTCAAAAGTTTCTTTCGTAATCTATTA TTTTTGTTTCGCAGCTGAAGATCTTCTTGTGTCAACGAATGACTATTCAA TAGATATCCCCACTTGAACCTTTTGAGTAGGTCTATTGGCCAGTGTGATA GGTTACTAGGCATTCGTGACCTCAGGCTAGCATATGGAAGTGTTTTGTTT TTATAAAGCAACAGTCTAGGGCTATAAACAGTGTTGACAGGTCGACATAT CAATGATTAAAAAAATAAACATAGGTGTAAACGCATTATGAAATTTGAAC TTTGAATCGTTTGTAATCAACGCTTTTAGACTAATTTCATCAAGACAAAA TTTGCATTCGATCTTTGGGATACATGAGAGCCCGGTGGGGATCATTTAAA AATAAATAGGGGTCGGAAGTTACTGCTGGTCAGGGTCACCTTTTTCACTA AGTTTTGAAAATTGTATCCAAAAGGAATATGACTTTAGTTCATTTTCACG ACTTTTTAAGGTATGGATTTTGGGAAAAATAGAGAAAATTCCATTTGATA GTCGCTCCAAACCTTCTTCTTTCAGATTACTTTAGTCGAATTTTCGCCAT AAGAAGATTCCTCTTCCGATGAACAGAACAGGCCCTATCCAGGACATCAT TCACTATCTTAGGATAGGGAAATCACTGCGCAATCCCCCTTTTTAATAGG GGGATGCCAAATTTGTAAGTGATAAAATCCCCTTTTATACTGATGGTTAC ACAAAGGTCCATTAATTTTATTTCAAACGGTCACAAAACTACCTATAGAC TAAATCTCTGTCAATGTTACAAGAAAAATTACCAAAACGTGTTTGTCCTT GAAATTTCGAAAAGGAAATAATGGTAGTAAATGCTTAGTCATTCAGCCCC TTTGGAAAATACCTACTTAAAATCCTAAACGTCCTGAAACGATATAAAAA GTTCCTTAAACTCTCTGGATATCCCTTTGTGTGATACCCCTTTTTAATAG GGGATGCCAATTTTTTTTGGGGGGAGGGTACCAAGATTTGTCTAAAAAAC TGGGGGAATAGGAATATAGGAGGCGTCAAATAAGAAAGGGGGCGTTGAAA ACTATGAGTTTGATTCTAGGTAGACCTTCATCTTGGTGGCAACAAACAGG GCCGGTGATTTGGTTACTACTATGTAATAACAAAATGAAACCTATAAGTA AATAAAGCGGAATTTTTCATAAGTAAAAGTAGATTTAGAGTATGCTTTTA ACAGACAGTAAGCATACGGTAATCAAAAGTAAAATTCTCCAAAGTAATTA AAGCGATGCTCTCGAGTCGACACAAACTCTCTACCAACTTCATCTAAATC AAGTTATCCGTTAGATTCTTATGGATATGGAGCAAATTTGCTTCATTGTT GAATGTAGCCAAGTCTTCATACTGCGTGCTGTAGAAAAAGATTTTTCAGG TGTGCACGAAGAAGAAGCTTGACGACATAGACGATATTTGGAGTTCTCGG TTTGCAGAAAAAACAACTTTTGAGGACTTTATACACCTCTTCATGCCCTA AAATTATTCCTTTCGTTTTTTGTGAATATCATGCGCACTATCTGTCTTCT TTTCATAGGATAGGATAGTCGTTGTAATTTGGTAAGTAAATAACAAAATT ATAGAAATCAATATAACGAAATGGAGTTACAGGACCTTCTCTAGTTATAT CCCCTCTCCTCGGTCCTAGTTCTTTTACTAGTTCTTTTCGCTGTTTTAGT TTTCATACGCCCGTAGTTAATAAGATATCTGTTACGTTGAGGTTTCTCCC ACGTAGGTGGTGCCGATAATGTCTTTCTATATCGCGCCGTAAATACGCAC GTGGAAAACATGACTACTTTTTTTTGGCACAAAAAGAAATTTCAAGGAAA TGCACTCTACAGTAAGAGTCGATTCAAACCTGTTTTACTAGGTACACATT TTTTTTATAAGCAACTCCGATTTTCGGGTCAGGGCTGGGGTTGCTTAGAT TCTGGCTTATTTCTGAAAAATTTGGTTTGACCACCCCTATTTATCAGTCT GTGCCACTAACTCGATCGGGAAGGTAATGAATGGGCAAGAGGTAAAAAAC GGACTTTCAGATCGGGAAGAAGCGGGAAAATAAGGAAAACTCGATCGGGT TGGAGCTTCGCGAAAATTAAATCCTAATGAAATTTGGAAGGTCCTCTTCC GCGAAATATTTCTGAACAAAACTCAAAATATGTCAGATAAATACTATTTG AATGGTTACTTGCATCAAAGAAGCGCTAATAATGTGTATTTCAACAACCA ACATGCATGATTTGGAAGTAAAAGCCACAAAACCGTGAAAATATTGCCAC CCAATAGTGCCACCCGCGAAATTAAGTCCCCGCGAATTTTTTGAATTTCG CGGATAGGCCCAACCGCGAAATTTAATCCCCGCGAAAGTTTATCCCATTA AAGTATCTAAAAAGCTTTTACTAATTACTTTGGCTAATTTCAGGGCTGGA GCCTTAGCAGCCTGGTTGCTTATAAAAGAATGTGTACTTTTTTGGTATCT GGATGCTCTTATTTTTAGTTTTAGCCAAAACTAGAGATCGTGAATGTCCA CTATATTATCACTTATTCTTTGCCGAGTCTTTATGTTATTTTTCATGAGT GCTGAAAATAGGAATTCCTACCACTATTTGCCTTAGATATCTCAACTTTT GAGATTAAATCTTTAATGCTTTCAAAATTCCACGAAAAATTCTCAGATTT TAATAAGCGGGGGGTGGGGGTGGGGCTGGAATAAAAATGTCCAAAAAGGA AAATTTTTGAAAAGGAAGCTAATACAACAGAATTAGGGCAAAAGAGGACA ACATTTTTCCCAAAAAAATTTAAGAGGGGGTTGGAATAAAAATGTCCTAG GTGGAAGATTTTCGAAAAAAAATTAATTAGCGGGGGGATGCTTATTAGGC AGAGAGTATTTGAGATACTCTGATACGGCAACGTGAAGAAGAGTAACAGA AGATTCAATTGTGGGAGCGCTGAAAGAAGGGGAAAAGTGGAAACTTAAAT CAAACAAAGACATCTCGAGAAGCTCTTCCAGCTATCGTTGGAAAAAGTAG GAAATTTTGAGTAAGATAAGCATAGGTGTCGTATCCACTTAAACGAAACA ATTATCAACTTTTTGTTGAAAATATATTTCTCTTTTTAGCTCCCAGGCAT TCTTTTTCTTTGATATCAATTTCAGGCCTTTCTTGAGATTTCTAAACAAT TAAAATACGACCAGTTATGTTTTAAAGCCCCATTCCGCTGCGCGCTGTTC TTACATAAGTTGAGTGTATTCAAATTTAACCGACATATATTTGGGGCCAT GATACTATACTGTATTCTGTGACCATTATACAAAAACAGGAATTGAGTTA GCTGTCTAAGTGCAATGTATCTTCAAAAATAAATTCTTGTCATGTCCGAG GCTCTTCTCCAGCCAACTTTATGATAATTACTTGACCAAAACAGTGCTAT TATTTTGATATGTGATTTTTAATTTCTTTTAGAATTAATATAATTAAAAA ATCATCTTTTAGCAATGAAAACTGCACTGCTTGGTTTAAATGATGATTCA TTACCAAGAGTTCGATTGATACCAGAAAATACTGGTAACATTACCCCAAA CCATTTTGTTATCGAAGGGAAGATAGTGGGCAATTTACGTAAATCAATGG ATGCATCGTTTAATAATAACACTTTTACAGTATCTGAATGGACCAGTCAA AGTCATTTTATCAGAAACATTGTTTGGGTTTACAATCGAATCGATAATAG CAATAAACTGACTTTAAAGTGTCGCAAAGGTTTTTACTATTCACCAAAGA ATTCATTGAGTAGTGCCATCAACGCAAGTCATGATTTTGTTATTTTTGCA GTTGAACATAAAAACAGACGATCTATATCTTTGACTTTATGTCAGTTAGT TGATGATTTTAACCCCGCCATGGATAGAACAGGAAGAGACCTGGGAACTA TTTGTGAGTTAGAAGAGGAGCACTGTTACGCGAAGGACTTTGATATAAAG CTATCAACGAATGAAAAGACTTTAAGTCTTATGGTCAAAACCTTCAACAA AGAAAATAAGGAACACAAACGCGATGTTCATATATTCAGATCTCTTTTCT CTTCAGATAATTGTTTATCCGTGGAAAGAGTTCTGACCATTGACGCAATG TCAATGGGAGTTTGGTCGAATGATTTTGTTTTTAACATCAATGCTGATAA AATACTCATGTTCTTAGTAGATGGTGTAGTCGTTTATTCCTTGCACACGC AAAGTGTAATTGCAAAACATTATATCAAAGAAATGTTCTTCCGCTTTGAA TGGGCTCATGATTTGAAGCATGGTGAAATTTTGATTCATTTTGCTGAGAA ACGGACCAAATTAAACGTTTATAGCATTAATTACTTGGAGAAAACATTGT CCTTGATAACTACAGTTAATGTTTCAGATTTCATACCAAAACATCTTAGT TTCAGTTTTCGTTGCCAGAAGCTATTTAATCAAGTGACTTCTGGCACATC TTTATTGATACTGGCAAGGCGAGATGTTTATTTGATCGACCCTTTCACAG GTCATCTCTTACAAAAGATAACATCTGATGTCAGTAGACCAAATATCTCT GTTAGAAATGTCCAGTTGAATTGGTGCTCGAATGAAGTAGTGGTGTTTTA TAGCGACGTTGACAATAAATTGTTTGGACAAGTTTTCAAATTGAAAACAA GACTGGTCGAACGACTGCTACATTCTGCACTTAAAGTTGTATTATTAGAT TATTCCATCAATGATTTGGTACAAATGAACTTACCCAAGTCGATTAAGGA TAGATTTTTTAAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000032_pilon:367994..376909-

>XLOC_042799 ID=XLOC_042799|Name=XLOC_042799|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:367994..376909- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTCATACACCCTAAACAAATTGTCCTATTTCATACACCCTAAACAAAT
TGTCCTCAATGAAAACTGCACTGCTTGGTTTAAATGATGATTCATTACCA
AGAGTTCGATTGATACCAGAAAATACTGGTAACATTACCCCAAACCATTT
TGTTATCGAAGGGAAGATAGTGGGCAATTTACGTAAATCAATGGATGCAT
CGTTTAATAATAACACTTTTACAGTATCTGAATGGACCAGTCAAAGTCAT
TTTATCAGAAACATTGTTTGGGTTTACAATCGAATCGATAATAGCAATAA
ACTGACTTTAAAGTGTCGCAAAGGTTTTTACTATTCACCAAAGAATTCAT
TGAGTAGTGCCATCAACGCAAGTCATGATTTTGTTATTTTTGCAGTTGAA
CATAAAAACAGACGATCTATATCTTTGACTTTATGTCAGTTAGTTGATGA
TTTTAACCCCGCCATGGATAGAACAGGAAGAGACCTGGGAACTATTTGTG
AGTTAGAAGAGGAGCACTGTTACGCGAAGGACTTTGATATAAAGCTATCA
ACGAATGAAAAGACTTTAAGTCTTATGGTCAAAACCTTCAACAAAGAAAA
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ATAATTGTTTATCCGTGGAAAGAGTTCTGACCATTGACGCAATGTCAATG
GGAGTTTGGTCGAATGATTTTGTTTTTAACATCAATGCTGATAAAATACT
CATGTTCTTAGTAGATGGTGTAGTCGTTTATTCCTTGCACACGCAAAGTG
TAATTGCAAAACATTATATCAAAGAAATGTTCTTCCGCTTTGAATGGGCT
CATGATTTGAAGCATGGTGAAATTTTGATTCATTTTGCTGAGAAACGGAC
CAAATTAAACGTTTATAGCATTAATTACTTGGAGAAAACATTGTCCTTGA
TAACTACAGTTAATGTTTCAGATTTCATACCAAAACATCTTAGTTTCAGT
TTTCGTTGCCAGAAGCTATTTAATCAAGTGACTTCTGGCACATCTTTATT
GATACTGGCAAGGCGAGATGTTTATTTGATCGACCCTTTCACAGGTCATC
TCTTACAAAAGATAACATCTGATGTCAGTAGACCAAATATCTCTGTTAGA
AATGTCCAGTTGAATTGGTGCTCGAATGAAGTAGTGGTGTTTTATAGCGA
CGTTGACAATAAATTGTTTGGACAAGTTTTCAAATTGAAAACAAGACTGG
TCGAACGACTGCTACATTCTGCACTTAAAGTTGTATTATTAGATTATTCC
ATCAATGATTTGGTACAAATGAACTTACCCAAGTCGATTAAGGATAGATT
TTTTAAATGACAATGAAAACTGCACTGCTTGGTTTAAATGATGATTCATT
ACCAAGAGTTCGATTGATACCAGAAAATACTGGTAACATTACCCCAAACC
ATTTTGTTATCGAAGGGAAGATAGTGGGCAATTTACGTAAATCAATGGAT
GCATCGTTTAATAATAACACTTTTACAGTATCTGAATGGACCAGTCAAAG
TCATTTTATCAGAAACATTGTTTGGGTTTACAATCGAATCGATAATAGCA
ATAAACTGACTTTAAAGTGTCGCAAAGGTTTTTACTATTCACCAAAGAAT
TCATTGAGTAGTGCCATCAACGCAAGTCATGATTTTGTTATTTTTGCAGT
TGAACATAAAAACAGACGATCTATATCTTTGACTTTATGTCAGTTAGTTG
ATGATTTTAACCCCGCCATGGATAGAACAGGAAGAGACCTGGGAACTATT
TGTGAGTTAGAAGAGGAGCACTGTTACGCGAAGGACTTTGATATAAAGCT
ATCAACGAATGAAAAGACTTTAAGTCTTATGGTCAAAACCTTCAACAAAG
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TCAGATAATTGTTTATCCGTGGAAAGAGTTCTGACCATTGACGCAATGTC
AATGGGAGTTTGGTCGAATGATTTTGTTTTTAACATCAATGCTGATAAAA
TACTCATGTTCTTAGTAGATGGTGTAGTCGTTTATTCCTTGCACACGCAA
AGTGTAATTGCAAAACATTATATCAAAGAAATGTTCTTCCGCTTTGAATG
GGCTCATGATTTGAAGCATGGTGAAATTTTGATTCATTTTGCTGAGAAAC
GGACCAAATTAAACGTTTATAGCATTAATTACTTGGAGAAAACATTGTCC
TTGATAACTACAGTTAATGTTTCAGATTTCATACCAAAACATCTTAGTTT
CAGTTTTCGTTGCCAGAAGCTATTTAATCAAGTGACTTCTGGCACATCTT
TATTGATACTGGCAAGGCGAGATGTTTATTTGATCGACCCTTTCACAGGT
CATCTCTTACAAAAGATAACATCTGATGTCAGTAGACCAAATATCTCTGT
TAGAAATGTCCAGTTGAATTGGTGCTCGAATGAAGTAGTGGTGTTTTATA
GCGACGTTGACAATAAATTGTTTGGACAAGTTTTCAAATTGAAAACAAGA
CTGGTCGAACGACTGCTACATTCTGCACTTAAAGTTGTATTATTAGATTA
TTCCATCAATGATTTGGTACAAATGAACTTACCCAAGTCGATTAAGGATA
GATTTTTTAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042799XLOC_042799-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000032_pilongenomesc0000032_pilon:367994..376909 -
Properties
Property NameValue
Aaloc31-1332:1303
Aaloc1-27:8917