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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000247_pilon:372645..378828+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042630 ID=XLOC_042630|Name=XLOC_042630|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6184bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000247_pilon:372645..378828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATCGTGGAATCGAATGGGGAGCTGACTCCAGGAAAGTTAGTCCA
GTTAATCTTTTTCAGCCATATTTTGAACATATTACTTGATGAAAATACTC
CTTCGGAAAAGATAATTAACCtaatagtctagcaagctagacgactaatt
cagaaatagtagaaataaagcaaaaagtaattatcatataacgcctatac
tactgtattacatgcattataaacgactccagtctattaACCTAATAAAC
TGTGATTTATGTTATAGTTCAAACGTGTGCACTCAATCGCACTTTGAGTC
CTACTTGACAACGATCACTCTGTCAAGAACAGTTTATCAGCAATACCAAA
TCTCTTGTGGATGGTGGGGCTCGTCGACCTGTTACAGAACAAGGTACTGA
TAAACTCATTTACTTTGTCTCTCACTACTGTCAGCAGAATTTAAAATACA
AGTTCTCAAATCGCACaggaaaagatattttacaaaagttttctgctttt
taaattttaaactttagcctgctttagcttctctactttttttaaaataa
caaaTCAATGAAATGTAAAGCGAAAATATTAGTTTTCATATCGGGAGGGG
GGTGTTGATTGTTGGAGCACGACAGTACGTTCaacccaaaattaggcctt
tgaaaagGGACCGTtcaaattttagtaaattttgtcgaaaaatcgaccct
ttggtgcattttatgcaaaatgtggttagattttccaaattttacaccct
tagagtgcaatttctctcgtctttgctcatttcgacccttacagtgcact
ttgggaagcttgaaaAAAGGACCATTAAGTGCCGCACGCACAGTAGGTTG
TtcaccttgagtgcccccccccccgggtttttaTCCCCTTATAAAGGTAA
ATCAGCGAAAAAGTGAGCCTTACCTCTGTAAGGCTCACCTCTGTAACAAT
CTTCGTTCTAACCTCAGAGAGAgagttttttgacttttcattgttttcgt
ATCCTTAAAAGTAACAGCAAAATATCCGACCCTTAGATAGACTATTTTGA
ctaattgttgttttttgtaatcGTGTTAGAGACATTGGAAAAgtcaaaaa
ccgacccttaccgtccgcacatacctagcattcattttttccttCCCGTT
CCACTTGACTTGACTTGACTTCACTTTTTCAATGCCTTTTCAGAACTCAA
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TATTTGTTGCCCTGGTTGGGCCCAGCAAGGTGATAGCTGTCCAATTCGTA
AGTAACCAGCATCTTGATATATCTTGATCAGATGAGATTAAAGTCATTTA
TACTGAAACtttttttAGTATGTAATACTTGGCTCAGTGTAATTTAGAAG
ACTCCATTTTTGGTTCTGCTTGATGTGGTAGCTAATTCataccactagat
ccagtccctttttgcgtaaaatgaatagaaaactactagacggttcccgt
cgtcgcaaacgccggttaacggttttgcttgcacatcaaaagcctttaaa
atactataatgtgggttaatgcctgacatcgttttggcttaaaatgccga
atacaataataaaaattatacttctaaactttctacattagtcaaaattt
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aaagaaaaagccttagttgtgaaggagaggctcgcgctttgtggttgagc
actgaaggttttcccgcTTGTCGGCTTCACATgaggacagcttaagaccg
gcgcatatgcaatgcaacacacattgaaacctttttaaataatgttagac
gaagtttaatcatcaaacaacaatgttggattttatTGCGTGTGTTGTTA
Tagaataattcgaaatcgtgcaacaaaaatgccacacctttttatttgaa
actttgtgacgtcgcagtacttttcatgaaattgacgtcagaactttttt
cgtttacaaatagcagtgtagagtcttctttaATCCGAGTTTTCTTGTTG
AGATGTTGACTCcactttcacttttttttttttttggctgttTCGTTCAA
GCATTTTCGGAACGTAATATACTAGAGAAATTAAATACAAGTcggtattg
aaaaatataaaatatactatATACCGGAGCCTGTCCCGGCATGGATCTTT
TcgatttaaataaaattctactaGAATTATGGATTGTGtataagaaagga
aaaaaaaaaattaaacttcatCTTGAGGGAGTCGTACTCTACCTCTCGAT
CCACGGATGCATCTCACTGTAGATCTAACGAGCGAGAAGCATATGATAGT
TCTAATGCTGTTAGTAacttttgagaaagtttcatgTCTTTTGTCTGCTA
TCATTTCAGCTAGACGCTTGTAAAATAACGTACATTCACGTCCCATCGCC
CCATTTGCCGCAAAAACAAGCGGAGAAAAAGTCCCATTTTCGGCTTGCAA
AATACGTTCACCAtattgtctcttcttttcgcgTTCATTGGATGATAAGC
AgttctcaatttttgaattgGTGTACCTTCGAGCAAACGGGTTGAAAACC
ctcacatcaaaaaatgctctttggccAGCAGTCCAAAAACTGAGAGCGCT
TATATCCAGTCTCGCCTCGCGTGAGACATTTGCATGTCTTGGTAGATCTT
CGTTATTAAGTTCGTTTAATAGGGGTTCAGTTCTTACATCTACGCACACT
TCTCTTAGCAATTTGGACGTAATGTCTCTAATTTCATTGTGTCTCAAAGA
CACGAATCCTCCCTTCTTGTCCGATCTTttaatccgagttttctacgctt
gtcaaacttagcgcgagactttttgtatcaaaggtggataggttttccag
ccgcggcgttcaaattttagaaaccttaacatatgttactgggctagcgt
tacagacatttttcataaactcatttagtatagaaGATATCTAAGGGGTT
TTCAAAGTTTGGggagatatttttgtgttttaattatcgtttcatataat
ttgaacggattttagaatattttattgttttgttgtgttcatataaattt
tgataaaccgAAAGTGAAAAGATTCAAGATGGTGATATTTTATCTACTAT
ATATACTTCACttgactcagcgtcatcaaaaaacaactttttatcaAATC
TTTTTCCGTAATACTTTTTCGGCAGGATTCTAAATTTCATCTTATCTCCG
CAAGTAAAACTTATTGCTAGCCGGGGAGGCGAGATTCCCTGGAATTAATA
CGCCGTAATTTCAACTTTGTTGTTTTACCCTGAtttttttCAGCGGTGTG
CAACCCTGTTTGTGTGAATGGAGAATGTGCAGCACCTTCCACTTGTTCTT
GTCAACCTGGCTTTGATGGAAGTCAGTGTGAAAGTGGTAAATTTCTTCAT
GTCATCTAAATTCACTCATTTCTGTTAAAACAAAACTGTTGCTATTATGG
AAGCAATTGTCGCAACAAAGGGCCGTAGAAATAGTTTAAACTTGTTTTTA
TCAGACATCTATTAAGCTTCTTGGAGAGTGCTCGATTCgatcttcatttt
cttatttttcccctTCCTTCCAGATATTGACGAGTGTGCGTTAGGATCCG
ACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAACACTGAAGGCTCGTTCAATTGTACT
TGTAATCCTGGATACTTTTTGTCTTCTGATAACACAACATGCGAAGGTAA
AGGAAGAAGACGTGTCTCTcttgttttaattttacttgtcaacaatacaa
cttttcgaccgtagccggcaattgccgcgcgggcattttttgctcgcttt
atcccactaaaaccgtctcaGTCTTTTTTCCGCACctttagacaatagaa
aaaggtgtaaaaaaaggattggatcgagtttaggtgGATAATTAAACATT
AAAtcggcacgcgcctgaccgcgcgactacggtcgaaaaggtgtattact
aATCGTAAAAACCAAACTAAATCGCATGCACTAATCTATTCACTGCATAA
CCAAATAAATAATGAGAGGATTTACAAATCTCGGACTTTAATGATCAAAA
TATATATTGAAGGCTCATCTTCTAGCCCTTAATCAACATGTCTGTTTTAG
AAACTAAATTTTTAAAGCTTTCCCCGGAAGGTAATAAGTTTAGTCTGGAT
TTGCATTTCAGAGATTATATTTATCAATTTCAATCGAATGCTTACCGTTT
AGGTCGATGCTCGATTCGATCttcatttcttatttttccccTTCCTTCAG
ATATTGACGAGTGTGCGTTAGGATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGTA
AACACCGAAGGGTCGTTCAATTGTACTTGTAATCCTGGATACTTTTTGTC
TTCTGATAACAAAACTTGTGAAGGTAAAGGAAGAAGACGTGTCtcccttg
tttttattttacttgTCAAGAATACtacttttcgaccgtagccgccaatt
gccgcgcgggcatttttcgTCCGATTTATCCCACCAAAACAGTCTCAGTC
TTTTTTCCGCACCTtgagacaatagaaaaaggtgtaaaaaaaggattgga
tcgagtttaggtggataattaaacattaaattggcacgcgcctgaccgcg
tgaCTACTGTCGAAAAGGTAGGTGTATTACTAATCGTAAAAACCAAACTA
AATCGCATGCACTAATCTATTCACTGCATAACCAAATTAATAATGAGAGG
ATTTACAAATCTCGGACTTTAATGATCAAAATATATATTGAAGGCTCATC
TTCTAGCCCTTAATCAACATGTCTGTTttagcatggaggtataaagaaac
aggagaagtatgctattgtaaccaagctcgccctacgattaaaaaagtta
cgatgtatgcatgctcataatctcatatatcgtgcatttttaatgagctc
ttttatccataggtgaaatcctattggctcatttaagcgttagaaattag
atgagacgagattcattgtttctgacatcagtgtaagaaaatatttggac
taaaaaaaggcctgtaaacttggcaatccttcatcaaatgataagatttt
tcgatcaatgttttccttaaggtgaactctattgcttgatactttcctcc
aaaattctccagcgactttatgtctacagattgagtctgaaatcgtgtgt
gcttataaagaacttttcattttctggcttgagaaaatatcttttcaaaa
caaaattgaacggatagcgaaatggaacataaacttgcttcgtggacgaa
tttttatctaattttcgtatattaaaaggcgagaatcttcaatactgatt
attagaatgttcatagcaaacttgagttctactaaaaagtcttatttcat
cgggcgagcttagaatttcttttgatacattttataaaagaaatcaaaag
actttaacgaccaattaccgacacattcaactcctgtttttctttatacc
tctatggttttagaaacaaaatttttaaagctttcCCCGGAAGGCAATAA
GTTTTGTCTGGATTTGCATTTCAGAGATTATATTTATCAATTTCAATCGA
ATGCAATTTACACCTGTTCATCGTTTACCGTTTAGGTCGATGCTCGATTC
gatcttcattttcttatttttcccctTCCTTCAGATATTGACGAGTGTGC
GTTAGGATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAACACTGAAGGCTCGT
TCAATTGTACTTGTAATCCTGGATACCGATTTTCTTCTGATAACACAGCT
TGTGAAGGTCTGTAATTATGATTCAAATTTCGCCCGTGTTTGAAAAGTGC
TTATTTTTTGCTTAATGTCCCCAGCGAACTTTTCGACGCTCTGTTTAAGA
AACCAGTGTTGCTTCTTTTCTGCGATAAAACCGCTGACGGCTGATTTGTC
CCATATAGAGCCCCTTGTCTttaatttaattattgattCTCTTTTTAGTT
GATATATTGGCTATGATTGCACCATGGTCGAATTGGACAGATTGGGATAA
GCCCTGCGGAGGAGGTTTTCAGTTCAGAACATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000247_pilon:372645..378828+ >XLOC_042630 ID=XLOC_042630|Name=XLOC_042630|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000247_pilon:372645..378828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAATCGTGGAATCGAATGGGGAGCTGACTCCAGGAAAATGGAAATC
GTGGAATCGAATGGGGAGCTGACTCCAGGAAATTCAAACGTGTGCACTCA
ATCGCACTTTGAGTCCTACTTGACAACGATCACTCTGTCAAGAACAGTTT
ATCAGCAATACCAAATCTCTTGTGGATGGTGGGGCTCGTCGACCTGTTAC
AGAACAAGTTCAAACGTGTGCACTCAATCGCACTTTGAGTCCTACTTGAC
AACGATCACTCTGTCAAGAACAGTTTATCAGCAATACCAAATCTCTTGTG
GATGGTGGGGCTCGTCGACCTGTTACAGAACAAGAACTCAACGTATCTCT
TATTATCAACAAGTAACGAGGTACAGAGTTGTATACCAGGATATTTGTTG
CCCTGGTTGGGCCCAGCAAGGTGATAGCTGTCCAATTCAACTCAACGTAT
CTCTTATTATCAACAAGTAACGAGGTACAGAGTTGTATACCAGGATATTT
GTTGCCCTGGTTGGGCCCAGCAAGGTGATAGCTGTCCAATTCCGGTGTGC
AACCCTGTTTGTGTGAATGGAGAATGTGCAGCACCTTCCACTTGTTCTTG
TCAACCTGGCTTTGATGGAAGTCAGTGTGAAAGTGCGGTGTGCAACCCTG
TTTGTGTGAATGGAGAATGTGCAGCACCTTCCACTTGTTCTTGTCAACCT
GGCTTTGATGGAAGTCAGTGTGAAAGTGATATTGACGAGTGTGCGTTAGG
ATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAACACTGAAGGCTCGTTCAATT
GTACTTGTAATCCTGGATACTTTTTGTCTTCTGATAACACAACATGCGAA
GATATTGACGAGTGTGCGTTAGGATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGT
AAACACTGAAGGCTCGTTCAATTGTACTTGTAATCCTGGATACTTTTTGT
CTTCTGATAACACAACATGCGAAGATATTGACGAGTGTGCGTTAGGATCC
GACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAACACCGAAGGGTCGTTCAATTGTAC
TTGTAATCCTGGATACTTTTTGTCTTCTGATAACAAAACTTGTGAAGATA
TTGACGAGTGTGCGTTAGGATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAAC
ACCGAAGGGTCGTTCAATTGTACTTGTAATCCTGGATACTTTTTGTCTTC
TGATAACAAAACTTGTGAAGATATTGACGAGTGTGCGTTAGGATCCGACG
GATGCCAACAAAATTGTGTAAACACTGAAGGCTCGTTCAATTGTACTTGT
AATCCTGGATACCGATTTTCTTCTGATAACACAGCTTGTGAAGATATTGA
CGAGTGTGCGTTAGGATCCGACGGATGCCAACAAAATTGTGTAAACACTG
AAGGCTCGTTCAATTGTACTTGTAATCCTGGATACCGATTTTCTTCTGAT
AACACAGCTTGTGAAGTTGATATATTGGCTATGATTGCACCATGGTCGAA
TTGGACAGATTGGGATAAGCCCTGCGGAGGAGGTTTTCAGTTCAGAACAT
GATTGATATATTGGCTATGATTGCACCATGGTCGAATTGGACAGATTGGG
ATAAGCCCTGCGGAGGAGGTTTTCAGTTCAGAACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000247_pilon | genome | sc0000247_pilon:372645..378828 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 736-819:6101 |
| Aaloc | 613-732:5787 |
| Aaloc | 490-609:4403 |
| Aaloc | 367-486:3726 |
| Aaloc | 274-363:3446 |
| Aaloc | 169-270:1195 |
| Aaloc | 43-165:269 |
| Aaloc | 1-39:1 |
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