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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000238_pilon:116738..117802- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_042379 ID=XLOC_042379|Name=XLOC_042379|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1065bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:116738..117802- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGACTATCAACATGAAAAATAAAAATCAAAAAAATGGTGAAACTTC
GAAACCCGAAAAATTTGATCGTGTAGTTGGTATTACGTCAGCATTTTTGA
CAGCTTTTTTCTTTAATTTCCTTTCTTGCTGTGCAAGGTATGTATTCACA
AAGAATCCTACAGTCCAGTTGTCTGGTCCACAATTAACCTTCATTCGTGG
ATTTGTGCAACTGATAATGATTGGTGTAGTGATGGCCTTTACTAAAACAT
TCCCTTTTCAAAACCCAAACGATTTATTACCACTATTTCTGTCTGGATGT
ATAAAAGCTACAGCCTCTATATTTTGTTTTACTGCATTAAAAGGTGTTAG
CGTAGGCACCGTATGTATCATTGAATCGACTACCCCTGCTGTTGCATTTT
TATTTGGATTCGTATTCCTTAAAGAAAAGTGTAGCATGTTAAATGGTATT
TTGGGCCTTCTTACATTTGTTGGTATCGTTATTGTTATGGTTCCGAATAT
CATCTTTCCTGTCAAAACCAATTATATCAAAGGCTATACTAGCTCTGTGG
AGCGATATTTACTTGGTGCAGCGTCTGCTTTTGCTGGTGTTTTACTTCGG
TGTACATTCAAGACTGTAAGTAGAATTCTAATGATGAAAACTATGGACTA
TAAATTGTTTGTCCTGTATCCAAGTATTGCTATGTTGGTTCTGTCACCAT
TGACGATGTTAATTCAGCAAGACTATTTGATCACAACTGAATTGCCACTA
TCAAGTTGGTTGATATTAATCGTTATTGGAATATCTGGATTTCTTGGTAA
TTTGTTTAGTGTAATTGCTTTGAAACATGAACACGTTAGTATTGTGGCTT
TCGTGGCATCAACAGAAATTCTGTTTGCTTATTGTTATGATTTGTGGCTT
GCACACGAGGCTCCAAATCCTTATTCATGGATCGGAATCATAACAGTGGT
GTTGTGTTCAACATTAGTTATGCTGAACAGAATATTTGACTTTGAGAATA
AAATAGACTGTTGTAAAAGAAACAGCAAGATTCACAAAGATGCGAAAAGT
GTGGAAAATACTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000238_pilon:116738..117802- >XLOC_042379 ID=XLOC_042379|Name=XLOC_042379|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2130bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000238_pilon:116738..117802- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGACTATCAACATGAAAAATAAAAATCAAAAAAATGGTGAAACTTC
GAAACCCGAAAAATTTGATCGTGTAGTTGGTATTACGTCAGCATTTTTGA
CAGCTTTTTTCTTTAATTTCCTTTCTTGCTGTGCAAGGTATGTATTCACA
AAGAATCCTACAGTCCAGTTGTCTGGTCCACAATTAACCTTCATTCGTGG
ATTTGTGCAACTGATAATGATTGGTGTAGTGATGGCCTTTACTAAAACAT
TCCCTTTTCAAAACCCAAACGATTTATTACCACTATTTCTGTCTGGATGT
ATAAAAGCTACAGCCTCTATATTTTGTTTTACTGCATTAAAAGGTGTTAG
CGTAGGCACCGTATGTATCATTGAATCGACTACCCCTGCTGTTGCATTTT
TATTTGGATTCGTATTCCTTAAAGAAAAGTGTAGCATGTTAAATGGTATT
TTGGGCCTTCTTACATTTGTTGGTATCGTTATTGTTATGGTTCCGAATAT
CATCTTTCCTGTCAAAACCAATTATATCAAAGGCTATACTAGCTCTGTGG
AGCGATATTTACTTGGTGCAGCGTCTGCTTTTGCTGGTGTTTTACTTCGG
TGTACATTCAAGACTGTAAGTAGAATTCTAATGATGAAAACTATGGACTA
TAAATTGTTTGTCCTGTATCCAAGTATTGCTATGTTGGTTCTGTCACCAT
TGACGATGTTAATTCAGCAAGACTATTTGATCACAACTGAATTGCCACTA
TCAAGTTGGTTGATATTAATCGTTATTGGAATATCTGGATTTCTTGGTAA
TTTGTTTAGTGTAATTGCTTTGAAACATGAACACGTTAGTATTGTGGCTT
TCGTGGCATCAACAGAAATTCTGTTTGCTTATTGTTATGATTTGTGGCTT
GCACACGAGGCTCCAAATCCTTATTCATGGATCGGAATCATAACAGTGGT
GTTGTGTTCAACATTAGTTATGCTGAACAGAATATTTGACTTTGAGAATA
AAATAGACTGTTGTAAAAGAAACAGCAAGATTCACAAAGATGCGAAAAGT
GTGGAAAATACTTAGATGGCGACTATCAACATGAAAAATAAAAATCAAAA
AAATGGTGAAACTTCGAAACCCGAAAAATTTGATCGTGTAGTTGGTATTA
CGTCAGCATTTTTGACAGCTTTTTTCTTTAATTTCCTTTCTTGCTGTGCA
AGGTATGTATTCACAAAGAATCCTACAGTCCAGTTGTCTGGTCCACAATT
AACCTTCATTCGTGGATTTGTGCAACTGATAATGATTGGTGTAGTGATGG
CCTTTACTAAAACATTCCCTTTTCAAAACCCAAACGATTTATTACCACTA
TTTCTGTCTGGATGTATAAAAGCTACAGCCTCTATATTTTGTTTTACTGC
ATTAAAAGGTGTTAGCGTAGGCACCGTATGTATCATTGAATCGACTACCC
CTGCTGTTGCATTTTTATTTGGATTCGTATTCCTTAAAGAAAAGTGTAGC
ATGTTAAATGGTATTTTGGGCCTTCTTACATTTGTTGGTATCGTTATTGT
TATGGTTCCGAATATCATCTTTCCTGTCAAAACCAATTATATCAAAGGCT
ATACTAGCTCTGTGGAGCGATATTTACTTGGTGCAGCGTCTGCTTTTGCT
GGTGTTTTACTTCGGTGTACATTCAAGACTGTAAGTAGAATTCTAATGAT
GAAAACTATGGACTATAAATTGTTTGTCCTGTATCCAAGTATTGCTATGT
TGGTTCTGTCACCATTGACGATGTTAATTCAGCAAGACTATTTGATCACA
ACTGAATTGCCACTATCAAGTTGGTTGATATTAATCGTTATTGGAATATC
TGGATTTCTTGGTAATTTGTTTAGTGTAATTGCTTTGAAACATGAACACG
TTAGTATTGTGGCTTTCGTGGCATCAACAGAAATTCTGTTTGCTTATTGT
TATGATTTGTGGCTTGCACACGAGGCTCCAAATCCTTATTCATGGATCGG
AATCATAACAGTGGTGTTGTGTTCAACATTAGTTATGCTGAACAGAATAT
TTGACTTTGAGAATAAAATAGACTGTTGTAAAAGAAACAGCAAGATTCAC
AAAGATGCGAAAAGTGTGGAAAATACTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000238_pilon | genome | sc0000238_pilon:116738..117802 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1065:1066 |
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