XLOC_042030 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_042030
Unique NameXLOC_042030
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000070_pilon:1309224..1321111+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_042030 ID=XLOC_042030|Name=XLOC_042030|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11888bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:1309224..1321111+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcttgttccttttTCTTTACAGTACACCGTCAACAATATCTGGGTTTAT GCTATTCATGGACGTCTTCCTGTGCAACAACAACGCACTTTCAATTACTT TTTCCGTCCTTGCCAACTTGTTTGTACAGGAGTTCGAGAGGGAACAAGGT TTGGATGCGCTTGAACAACACCTTCACCAATCACTTGCGCTACTGGAGCG AGATTTCCCGACGACATTCATGAACATCACCACGCACATCTGCCACCATT TTGTATCTAACATGAGGAAGTTTGGGACATTATACGCATCATGGATGTAT TCCCAAGAACGCATGAATTCTTGGATCACAAGAAGATGTAACAGCAAAGC CCACATGGAGAGTACCGTTATGGATACCTACCAggtatatatttcaaaat agtTTACATTGTAAAGAATTAACTCGAATCTTTGATCGAAAAAGCTCTAA CGGGTTAGAGTAAGCTAGCTACAATTCCATAAGTGAGGATTCTCAACTTC CACAcctggaaaattttgaaatgtagtATTCGAAGGGCAAGAGGACTAAG GTTAACAAATGCTTTCTTTTTAtcagaacaatttcataagaacacaagac tgaaatttagccaaaatttaaaaacaatctgagcctcagatttcaaaGAG TTTAACATATTTTAAACATTGTTATGAGTTGAGTTCTTAAAGGTTTaact tttacataagtgttcccgtttcatatcagacacatatttcatatcaagac agtgtctgcctattgttatattatgctgatataagcaaaagatgtttttc ttttcgtctTTATGATCATCTTGCTcaacatccgtgtcaattcaatgtga aaaagcttgtaaattaaaattgatgagtaagcaaacgatatcactcttaa aACCTTTAAGTAGTTAGCTTATTAAGTAGTTAGAAcgattaaggctgaaa 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000070_pilon:1309224..1321111+

>XLOC_042030 ID=XLOC_042030|Name=XLOC_042030|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=612bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:1309224..1321111+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcttgttccttttTCTTTACAGTACACCGTCAACAATATCTGGGTTTAT
GCTATTCATGGACGTCTTCCTGTGCAACAACAACGCACTTTCAATTACTT
TTTCCGTCCTTGCCAACTTGTTTGTACAGGAGTTCGAGAGGGAACAAGGT
TTGGATGCGCTTGAACAACACCTTCACCAATCACTTGCGCTACTGGAGCG
AGATTTCCCGACGACATTCATGAACATCACCACGCACATCTGCCACCATT
TTGTATttcttgttccttttTCTTTACAGTACACCGTCAACAATATCTGG
GTTTATGCTATTCATGGACGTCTTCCTGTGCAACAACAACGCACTTTCAA
TTACTTTTTCCGTCCTTGCCAACTTGTTTGTACAGGAGTTCGAGAGGGAA
CAAGGTTTGGATGCGCTTGAACAACACCTTCACCAATCACTTGCGCTACT
GGAGCGAGATTTCCCGACGACATTCATGAACATCACCACGCACATCTGCC
ACCATTTTGTATTCTATTTGATTTCTTCACGTCTTCCCTCTATCTTCTTT
GAAATGATTTAATCTATTTGATTTCTTCACGTCTTCCCTCTATCTTCTTT
GAAATGATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042030XLOC_042030-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000070_pilongenomesc0000070_pilon:1309224..1321111 +
Properties
Property NameValue
Aaloc259-306:11841
Aaloc1-255:1