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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041747 ID=XLOC_041747|Name=XLOC_041747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggGAAACGATGATAAGGTATTCAATTGTTCAATTGGCTTTACATTCAA
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AGAGAattaaattcttcaaaaatttctttatttgtaTTCTGTTATTGAAt
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ATTTGTCTGTCCCTAAAAATGATTCCAAGATTAAAACTCTGttgtgatag
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GTACATGACACTTGTCTGGATGGAACTGAAGCAACCAGTCTTAAGACCAT
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GTCAACTTCTTTAAATATCTttgtatcatcagcaaagagTAGTATGGATG
AGATGATTTTATCAGGAAGATCGTTGATATATAGAACAAAAAGTAGTGGC
CCAAGTACACTACCCTGTGGTATTTTGTGCTCCTTTGCTCTTATAAATTG
GAGTTACATATGCTAATTTCCATTCTTCCGGTAGGACTCCCGTCGATAAC
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GAAAAACGCGTCTCTGAGAGCGTccaaaaacttttcttccttACTTTCCT
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GATCAGCTCGTTGAGTTTATCGTTGTTTTCTTCTGaatgattgttgtttg
ttggactACGGTAAAGGCATCCAAAAACTAACACATCCCTGTCGCAAAGT
CGAATTTCGATTATGCATGATTCATCAAATTCTGTCgccgattttacacc
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TTCTTCGCAGTTATTGTATTATCTCGTGTCTTgtttttttgggttttatt
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CACGGACTCGCCAGATCCCACCTGTTTCGCTTTCATTCTTTCTTTTAGCG
TCAATTACaagatttttgaattctttcctTTGATCAGGGGTTAGATCTTC
ACAGATACTTATCCCTTTATACATATTCACACCCTTCAATACGTGAAGGT
TACCGAATATactttccttttcttcttccttgTCAAATGAAACTAGCAAT
GGGCGTTTCTTGTCGGCTACTTTTGCTCCAAGTCTTGTCATATGTTTGAT
CTTCACCTTAGCATGAAGATTTTGAGTGAGTGTTTTCACCCACTCCTCGT
CTTTCTTCGGTTGATCATCAGTGAATTTTTCAACACCGTGAATGATGATG
TTTTTTGAACGTTTTAATTTGTCCTTTTCTTCCGCAGCTTCCTCTTTGTG
CACCTCTTTCACGGCTATCTTTATATCGTCGTCCGAGGAAAAAATTTGGC
TGTCAGCAGAGGCCACAGCGGCGTAAGATTTTGTGCATTCCTCTTTTATC
GTTGACAGGATTTGTGTTCGGAAGTCCTCGAGCtttttttCCAATTTGGT
TTCTACTTATTCAACAGTATGGAACGCTGGATCgtttttcaactgttttt
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TGTTCATTGTTCTTTAGTTTATCTATcgtttcttccttttctttcacTAT
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TTGACCCAtagaatgttttcatttttaggatCCTGACTCCACATGGACTA
TACAGACATCATTGAAACGTTTTGACGACGAATTCCTGATTGAAATGATC
AAAGATGACGGAGCTACAAAGAAAACCATCACTGGATCATTAACAAGGTA
TTGTAAAACGTTCAAAttccaaatatttttcttcaaatcttcTGTAGATT
GGTTTCCAGTTCTTATTCCTCTTTCTACTTGAGCAACACTTTGTATCATT
CCTTCCGAAATAATAACGGAGCATAGCTATAGAGAGTTGTTATAAGAAAC
TTCTCAAAACAGTTGGGGAGTTGGTCTTTTAAAGGACACTGTCTTTTTAA
AGTCCTAAAGCTGCTTTTGAGTTCAGTTTTATTTTCGACCTCCATATAAT
ACCTCCTTGTTGTAAACATTTCCAACATTTCTTTGACTTTAGATCTTGGC
GTGAATGAGCTGTAGATTTTCACCCGTTTTTCTCTCTTTCAGAGGTTTTA
GGATTTCGGATTCCCTATAGCTTCCATTTACAGATCTTACGCAGCCTACG
TGGATAACGTATACGAAAATAAGATTATCAATTCTCATTCACTTGTGATT
TCATTTTGCTTTTTCAGCTCGGTTGCAAACTATGTTGATGTGAACGGTGT
CATCTTGGTCAATAAATTGAAAACAGATGTTTTAGCGCAACACAAAGCAA
TGGGTAACGAGAAGAAAAACCAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ >XLOC_041747 ID=XLOC_041747|Name=XLOC_041747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1146bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggGAAACGATGATAAGatggGAAACGATGATAAGgTAGAAGAAATCAA GGTTGAAAAGTGGGATGGAAATGCACTGAAGCATGCTTTAGATGATGCGG TTAGAAAGgTAGAAGAAATCAAGGTTGAAAAGTGGGATGGAAATGCACTG AAGCATGCTTTAGATGATGCGGTTAGAAAGATATTCACAGACGACTTGAA ATACATAGAGAAGAATACATATGTTGATGTGAGGCTGTTATTAAGTTTCC TTGGCGTGGCAGTGGCTGGTTATGCACTGATCTACGATTTCCTGAACCCA TTCCCAGCATCCAAATGGGTTTTAGCATTCTGTGTTATCTCATATTCACA GACGACTTGAAATACATAGAGAAGAATACATATGTTGATGTGAGGCTGTT ATTAAGTTTCCTTGGCGTGGCAGTGGCTGGTTATGCACTGATCTACGATT TCCTGAACCCATTCCCAGCATCCAAATGGGTTTTAGCATTCTGTGTTATC TCATACTTCATTTTCATGACAATTCTTACTGGATTTATGACGTTCGTCGA GAAGAATATCATTTTACTGGCCACGCAAAAAGAAGCATCTGGACTGATAC TTCATTTTCATGACAATTCTTACTGGATTTATGACGTTCGTCGAGAAGAA TATCATTTTACTGGCCACGCAAAAAGAAGCATCTGGACTGgatCCTGACT CCACATGGACTATACAGACATCATTGAAACGTTTTGACGACGAATTCCTG ATTGAAATGATCAAAGATGACGGAGCTACAAAGAAAACCATCACTGGATC ATTAACAAGgatCCTGACTCCACATGGACTATACAGACATCATTGAAACG TTTTGACGACGAATTCCTGATTGAAATGATCAAAGATGACGGAGCTACAA AGAAAACCATCACTGGATCATTAACAAGCTCGGTTGCAAACTATGTTGAT GTGAACGGTGTCATCTTGGTCAATAAATTGAAAACAGATGTTTTAGCGCA ACACAAAGCAATGGGTAACGAGAAGAAAAACCAATAACTCGGTTGCAAAC TATGTTGATGTGAACGGTGTCATCTTGGTCAATAAATTGAAAACAGATGT TTTAGCGCAACACAAAGCAATGGGTAACGAGAAGAAAAACCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:89967..100542 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 466-573:10469 |
| Aaloc | 346-462:9879 |
| Aaloc | 253-345:8936 |
| Aaloc | 91-249:8574 |
| Aaloc | 19-90:4173 |
| Aaloc | 1-18:1 |
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