XLOC_041747 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041747
Unique NameXLOC_041747
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041747 ID=XLOC_041747|Name=XLOC_041747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+

>XLOC_041747 ID=XLOC_041747|Name=XLOC_041747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1146bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:89967..100542+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggGAAACGATGATAAGatggGAAACGATGATAAGgTAGAAGAAATCAA
GGTTGAAAAGTGGGATGGAAATGCACTGAAGCATGCTTTAGATGATGCGG
TTAGAAAGgTAGAAGAAATCAAGGTTGAAAAGTGGGATGGAAATGCACTG
AAGCATGCTTTAGATGATGCGGTTAGAAAGATATTCACAGACGACTTGAA
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GTGAACGGTGTCATCTTGGTCAATAAATTGAAAACAGATGTTTTAGCGCA
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TATGTTGATGTGAACGGTGTCATCTTGGTCAATAAATTGAAAACAGATGT
TTTAGCGCAACACAAAGCAATGGGTAACGAGAAGAAAAACCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041747XLOC_041747-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000233_pilongenomesc0000233_pilon:89967..100542 +
Properties
Property NameValue
Aaloc466-573:10469
Aaloc346-462:9879
Aaloc253-345:8936
Aaloc91-249:8574
Aaloc19-90:4173
Aaloc1-18:1