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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2232408..2237566- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041642 ID=XLOC_041642|Name=XLOC_041642|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5159bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2232408..2237566- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGTACTAATTAATCAAATAATAGGGATAACACTATTTCCTTCCGC
AATTTTATTTAGAAAAATTTATCATAATAAACAAAAAATGACAACAAAAA
AGAAAGTGAATCTTGATGATATGGTGGATGACTGGGATTCATATATTATG
ATTGAGACTAGTAAAGACGGTACTGTATGCACAACATCTGGATTACCGAC
TCCTAAAAGTTGTAACAAAATGCTGGTATTGGAACTAAATCATGAGCTGG
CTAGTGAGGTACTTTACGCACGTGGACATAATATACCTTGTGATGTTTAC
CTTAAATGTGATGACGGGACAATCTTTTCAGCACATAAAAATGTTTTATC
GGTAACTAGCCTGTATTTTAATGCTATGTTTCAGACTAACATGATCGAGA
AATCACAAGCTATAATTGACATTCGATGCGTGACGTCAGAAGCTTTGAAA
TATTTAATCGATTTTGCCTATTCGTCAACTTTGTATGTCTCGTTTTACCA
GATTTACGATTTACTGATGGCATCAAATATGTTATGTGTTGAACAGGTTG
AGCATCAATGCGTTGCTTTTCTTGGTCAAAATTTGGATATTGAGAACTGT
ATAGAAATATGGAGTCTAGCAGAAATGATCAATTGCGAACCATTGTATAA
TGCTTCTTTCAATTTTGTACAAAATAACTTCAGACGGGTTTCTCAAGAAC
TAGATTTTCTACAACTATCTTTCCAACAAATGGAATTAATATTAAGCAAT
GATTATATAGATGTCTCATCCGAATCTGATGTTTTTGAGGCAATTATAAA
TTGGGTAAGCTATGACTCAATGGCTCGACTACCATGTTTGGCTCGCTTAC
TCCAGTATGTGCGATTTATGCTATTGAGCCGTAAATACTTGGCTGATCGA
GTTTTAAGAGAAAATTTGGTCATGTCAGACGAGAATTCAAGGAACATTGT
TCTTCAAATTTTGGACAGATATATTTTACCGGAAAGGACTTGCTCATTAA
ATACAAATCAATCTTCAACTTCCCCAAGGCAAGCATCGAATCGAAAAATA
TACGTCATTGGCGGAAAAGGTAGGCCAAACTAAACATATTTCATAGGAGA
ACGTCAAGTTATTTTATACACCCCTGTCTTAGTGACCCGGCGAAGTTTTG
ACCCGGCACCTCAATACCCAATGGAAATTAAAATTAGGCCATTTTGGGCA
TTCTTTTTTCCAGGTTATCCAACGGGGTGGATCTCATGGGGTCACTGATA
CAGTGGTATATTTACTGTCAATTCATAAATTATGAAGAACACTAAGATCC
TGCTCATCCTCTAGCGAAAAAAAGTTTCTTATAGAATATATAGGAAGTAT
ATCTAAAGAGGTCTGCGATTCAGACTAGAAGAACACACCCCTGTCTCGGT
GACTTATGGTTTTTTTTCACCTGATCGGAGAAGAAGGGAGTTTGATACCA
ACAGCTGTGAAAATCTATGAATGAGTTTTGCTGGAATAGTTCAGTGGGTC
TGGTTTAACAAAAAAACATTGTCATTTTTTTGCAAACAAATCTTGGCTGT
AACTTATAGTTAACTATATCCAGTGTCCGCAGAACATCCTACGGATCTCT
TTAGAAGGTCCATTTCGGACGAAAAGGACGTCTGTTGGACGTTATACGGA
CGTTCAAACTGAAGCGTTCTCCGTCTCAAGGAAGTTGTGATTAGACTGAG
ACGGTCTATGGACGAACTGAAATGATTTGCACGTCATAAAGATGTCCACT
GAACTTTCTGTGTTCAAAGGGTGTTGACTGGTGAGGTTAATTCTCTCGCT
AATCGTTTGAAAATATATGAAAATATATTCTTTTTTCACTACGGTTACCA
CATTTCCATTTAGCAAGTGGAAAATGTAAATCGTCAATGGAATGCTACAA
CTTCAAAACCAACTCATGGCGCACGTTATCACGTATGAAGTATCCACGTT
ATAACGCCGTAGCTGTAACACTCGACGGGAACCTCTACGTTTTGGGCGGA
TATTATAGAGGTAAAGATTTGAAAGTTGTGGAAAGGTACAACCCGATTAC
AGATGAATGGAGAGTGGTTTCCAGTCTACGTAAATGCAAAGGTAAAGTAT
GATATATGTTAATTTCGTCTACGTTGTTATCATTGCAAGCAGCCATTGAA
TTTAATAATCAACCCCTTGTTTCTTTAATCCAGTAAATTTTTTCGAATGA
TTTAAAATCTGCCTTGTTTGACTATGCGGTCAAGTTGTCGACATCTCTAC
AGCCGGTGTACTTAATCCATTTTGGACATATTAGAGCAGCAACAATCTGA
TTACATATCTTATAGTGTGAATAATCTTCTTCATATTGAAAATGTTTTCC
ACTCGTCGATTTCTTTGCAACAAGTTATAACATTTTTCATTTTACAGTAT
CATTTTCTTTTCATACAGGACTTGAAATGAAATAAAAATGTTTTTGTTAT
AGACTTCGAAAAATCATTTATTTACTTCAGGTGCTTTATCAGCAGTTTCC
ATCGACGGTTGGATATATGCTGTAGGTGGATCAGAGGGTCACCAAGAATC
ATTAAGACACGCAGAACAGTATGACCCTGTCTGTGATACTTGGACACAAC
TACCTGATATGTTAACACCAAGAAGTCATTTCGGTATCGGACAAATGTTT
GGACAGCTTCACGTTATTGGTGAGTGTACTAACACATTCAAAGTTCTCTA
ATTCTATATTTTTGAGGGATCAAGGAGCTCTCTTTGAATTAGAGAAAAAT
AATGTTGGGAAACAAACATTATCGACTATTTCTATGTCATTAGGCCTTCA
TGCTGCTTCGGTTTTTTGTTAAGATAAAGTATCAATCTCATTTTCTGGAT
TTCTACCTTGGTTAGTTACAAATTCCCAAAAATTCAGGATGCGAAAGTGA
TTTTCAAGTATTGGGTAACACCATAATAACATAGGGTCCTTGTTATCGCA
TTTTAAGGATAAATGTCGGTGTTTTTTACACTTTTGGCAAAAACGTGAAG
TTTTTTAAACAGGTTTTAAAATAAATACAAAATGCACCTTTTCTTAATAT
GATATCCTAGGGGGATTGGCAAAGAATTGAAGATTCCATTCCATTTTCCC
CGAGCCTTCTAGAGAAACTAAACCAGTACTTATAACCTCTTACAGTTAGG
AGCACGTTAGGATTAAACGATTCCATAATGAAAATGGATTATGGATTCCA
TGAGCAATAACTTTTGATCTAATGAGGCTTTAGAACTGAAATTTGGCAGG
ATGGAGCATTTATGTATTTTCTATTCCCAAATAAAAAATCTTCCAGCTGG
GAGCAGTTTGGGATCACTTATTCGTAATTTTTCTTTGAGTTCAAGCCTTT
TTAAACTGAGGATTGTAGTATGTTTATTTGATATAAAGAAGCTCAAATTT
AACTATTTGGAAGGTTCAGGCTCTTAAGAACAAGAAAATAGGATTTTCCA
CTAGAATAGAGCATCTAAGGATTATCAAATCCTTCATTGAAAGTAACATA
CTTTGCCTTATCCGAAATGAGCGTTTTAGTCTGGAATGAAATATCCTACA
AGGCTCTAAACTGATTTTTTACGTTATGCGATATGTCGTTATGTTAATGA
CCTAAAATTTAAGCTCAGATAGAGCCCCGAAGGATTAACAATTCCATTTT
ACGACAAGTTGGGGTTGGGGTAGGTTCACCACTTTGAAATTAAAGTTTTA
AAAAACCACACTTTTTGGTATCTAAGAATGTTTTAAAGTTAAGTGGAAGT
GACTTTTGATTAATTTTAGATTGTGATCAGTCCATTTTAACGATGAAATG
CATCTTTTATAATTGTTCAAGTTCAGGGATGTTTTTCGGATGGAATTTCG
GATCCAAAAGTGCTTTTCATCATTGTTTCATGAAATATAGAGATCATGTA
ACAAGTTCAGACCATCAGAATCAATCCAAGAGCCACTTAACTCTCATAAT
TCCAAAATTCTAAAAATCTAATATTTTGGAATATTGGATCCTTCTTCGCT
CCTGGGACCAAAACCAAAAGTTCTAAGCACGTGTTTTACACTTTTTTGGA
AGATTTCATCCCAAAATGCTCGTTCATTTTATTCAAGAAAAACCGTTTTT
TAGAAAATTTAATGTCACGTTTTTGCCAAAAGTGTAAAAAACACCGACAA
ATGCACTTCGTTAGTTAACTATTGTTGCACTTCTACTGGCTGGTAACTCA
GGCCAACTCATAATACTAGATTTCACTGATGAACATAGGGGACCATTCAA
AAAGTACTTACGCTCAAAATCGGTGAAAATTGACCACCCCCTCCCCCCTT
TGACATTACCCCCCCCCCATTTCGCGTACGTACGCTTTTTTAATGACCCC
CCCCCCCTCAAAAAATTTTTAGATCGTATTAAACAGTCTATACAAAGGTA
AATTAGGGGATTTTGAGAAAAATTAAAATAAGTTCAACTTCTGTTTGTCT
TTGTTGAGGATATAATCAGAAGATCTAACCAAACTTTGACTGAAATTTCG
TTGTATTGAAAAATGTCAAAGCGTACGTACCTTTCTACCTGACCTCCCCC
TCCCCCTCGTACGCTTTCGTACGCTTTTGGTAGTACCCTCCCCCTCTCCC
TCAGAGCGTACGTACTTTTGGAATGGTCCCTAATACAATTGATTTGTTCC
CGTTCTCCGAATCAAAAATGTGAGGTAAGCTTTTTGCGCAAATTCCAAAA
TCTCTTTACAATTTGTTAATACTCTTAGGTGGTTTCTCAGGAATATGCGC
GCTCGACCAGTGTGAATGTTTTGATCCTTCTCAGCGTGAATGGAGAAGAT
TCAACAGTTTGAATACTTCAAGAATGAATCATAGCATTACTACTTTCAAC
AACCGGTTTTACGCTTTTGGTGGGAAAAACTCAACTGGACTCGTTCATTC
AGTTGAAAAATATAACCCTGAGCTTAACATGTGGTTAATAATCAAGACTA
ATCTTGACGTTAAGCTTGGTATGGTTTGTGTTGGCAGATCGAACGGCACC
GGAAATAGTGTTTTCATTATTGGCGGGAAAAAGGAGAATGGTGAGGAGTC
AAACTCTTCAACCGTCTTGACGTTTAAGCCAATCGGATCAGATCTGAATA
ATGAACAAATTGTTCCAATGAAGGAAAAAAGAACTTACTCTGCTATAGCT
TATCTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2232408..2237566- >XLOC_041642 ID=XLOC_041642|Name=XLOC_041642|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3834bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2232408..2237566- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGTACTAATTAATCAAATAATAGGGATAACACTATTTCCTTCCGC
AATTTTATTTAGAAAAATTTATCATAATAAACAAAAAATGACAACAAAAA
AGAAAGTGAATCTTGATGATATGGTGGATGACTGGGATTCATATATTATG
ATTGAGACTAGTAAAGACGGTACTGTATGCACAACATCTGGATTACCGAC
TCCTAAAAGTTGTAACAAAATGCTGGTATTGGAACTAAATCATGAGCTGG
CTAGTGAGGTACTTTACGCACGTGGACATAATATACCTTGTGATGTTTAC
CTTAAATGTGATGACGGGACAATCTTTTCAGCACATAAAAATGTTTTATC
GGTAACTAGCCTGTATTTTAATGCTATGTTTCAGACTAACATGATCGAGA
AATCACAAGCTATAATTGACATTCGATGCGTGACGTCAGAAGCTTTGAAA
TATTTAATCGATTTTGCCTATTCGTCAACTTTGTATGTCTCGTTTTACCA
GATTTACGATTTACTGATGGCATCAAATATGTTATGTGTTGAACAGGTTG
AGCATCAATGCGTTGCTTTTCTTGGTCAAAATTTGGATATTGAGAACTGT
ATAGAAATATGGAGTCTAGCAGAAATGATCAATTGCGAACCATTGTATAA
TGCTTCTTTCAATTTTGTACAAAATAACTTCAGACGGGTTTCTCAAGAAC
TAGATTTTCTACAACTATCTTTCCAACAAATGGAATTAATATTAAGCAAT
GATTATATAGATGTCTCATCCGAATCTGATGTTTTTGAGGCAATTATAAA
TTGGGTAAGCTATGACTCAATGGCTCGACTACCATGTTTGGCTCGCTTAC
TCCAGTATGTGCGATTTATGCTATTGAGCCGTAAATACTTGGCTGATCGA
GTTTTAAGAGAAAATTTGGTCATGTCAGACGAGAATTCAAGGAACATTGT
TCTTCAAATTTTGGACAGATATATTTTACCGGAAAGGACTTGCTCATTAA
ATACAAATCAATCTTCAACTTCCCCAAGGCAAGCATCGAATCGAAAAATA
TACGTCATTGGCGGAAAAGATGAATGTACTAATTAATCAAATAATAGGGA
TAACACTATTTCCTTCCGCAATTTTATTTAGAAAAATTTATCATAATAAA
CAAAAAATGACAACAAAAAAGAAAGTGAATCTTGATGATATGGTGGATGA
CTGGGATTCATATATTATGATTGAGACTAGTAAAGACGGTACTGTATGCA
CAACATCTGGATTACCGACTCCTAAAAGTTGTAACAAAATGCTGGTATTG
GAACTAAATCATGAGCTGGCTAGTGAGGTACTTTACGCACGTGGACATAA
TATACCTTGTGATGTTTACCTTAAATGTGATGACGGGACAATCTTTTCAG
CACATAAAAATGTTTTATCGGTAACTAGCCTGTATTTTAATGCTATGTTT
CAGACTAACATGATCGAGAAATCACAAGCTATAATTGACATTCGATGCGT
GACGTCAGAAGCTTTGAAATATTTAATCGATTTTGCCTATTCGTCAACTT
TGTATGTCTCGTTTTACCAGATTTACGATTTACTGATGGCATCAAATATG
TTATGTGTTGAACAGGTTGAGCATCAATGCGTTGCTTTTCTTGGTCAAAA
TTTGGATATTGAGAACTGTATAGAAATATGGAGTCTAGCAGAAATGATCA
ATTGCGAACCATTGTATAATGCTTCTTTCAATTTTGTACAAAATAACTTC
AGACGGGTTTCTCAAGAACTAGATTTTCTACAACTATCTTTCCAACAAAT
GGAATTAATATTAAGCAATGATTATATAGATGTCTCATCCGAATCTGATG
TTTTTGAGGCAATTATAAATTGGGTAAGCTATGACTCAATGGCTCGACTA
CCATGTTTGGCTCGCTTACTCCAGTATGTGCGATTTATGCTATTGAGCCG
TAAATACTTGGCTGATCGAGTTTTAAGAGAAAATTTGGTCATGTCAGACG
AGAATTCAAGGAACATTGTTCTTCAAATTTTGGACAGATATATTTTACCG
GAAAGGACTTGCTCATTAAATACAAATCAATCTTCAACTTCCCCAAGGCA
AGCATCGAATCGAAAAATATACGTCATTGGCGGAAAAGCAAGTGGAAAAT
GTAAATCGTCAATGGAATGCTACAACTTCAAAACCAACTCATGGCGCACG
TTATCACGTATGAAGTATCCACGTTATAACGCCGTAGCTGTAACACTCGA
CGGGAACCTCTACGTTTTGGGCGGATATTATAGAGGTAAAGATTTGAAAG
TTGTGGAAAGGTACAACCCGATTACAGATGAATGGAGAGTGGTTTCCAGT
CTACGTAAATGCAAAGCAAGTGGAAAATGTAAATCGTCAATGGAATGCTA
CAACTTCAAAACCAACTCATGGCGCACGTTATCACGTATGAAGTATCCAC
GTTATAACGCCGTAGCTGTAACACTCGACGGGAACCTCTACGTTTTGGGC
GGATATTATAGAGGTAAAGATTTGAAAGTTGTGGAAAGGTACAACCCGAT
TACAGATGAATGGAGAGTGGTTTCCAGTCTACGTAAATGCAAAGGTGCTT
TATCAGCAGTTTCCATCGACGGTTGGATATATGCTGTAGGTGGATCAGAG
GGTCACCAAGAATCATTAAGACACGCAGAACAGTATGACCCTGTCTGTGA
TACTTGGACACAACTACCTGATATGTTAACACCAAGAAGTCATTTCGGTA
TCGGACAAATGTTTGGACAGCTTCACGTTATTGGTGCTTTATCAGCAGTT
TCCATCGACGGTTGGATATATGCTGTAGGTGGATCAGAGGGTCACCAAGA
ATCATTAAGACACGCAGAACAGTATGACCCTGTCTGTGATACTTGGACAC
AACTACCTGATATGTTAACACCAAGAAGTCATTTCGGTATCGGACAAATG
TTTGGACAGCTTCACGTTATTGGTGGTTTCTCAGGAATATGCGCGCTCGA
CCAGTGTGAATGTTTTGATCCTTCTCAGCGTGAATGGAGAAGATTCAACA
GTTTGAATACTTCAAGAATGAATCATAGCATTACTACTTTCAACAACCGG
TTTTACGCTTTTGGTGGGAAAAACTCAACTGGACTCGTTCATTCAGTTGA
AAAATATAACCCTGAGCTTAACATGTGGTTAATAATCAAGACTAATCTTG
ACGTTAAGCTTGGTATGGTTTGTGTTGGCAGATCGAACGGCACCGGAAAT
AGTGTTTTCATTATTGGCGGGAAAAAGGAGAATGGTGAGGAGTCAAACTC
TTCAACCGTCTTGACGTTTAAGCCAATCGGATCAGATCTGAATAATGAAC
AAATTGTTCCAATGAAGGAAAAAAGAACTTACTCTGCTATAGCTTATCTT
TGAGTGGTTTCTCAGGAATATGCGCGCTCGACCAGTGTGAATGTTTTGAT
CCTTCTCAGCGTGAATGGAGAAGATTCAACAGTTTGAATACTTCAAGAAT
GAATCATAGCATTACTACTTTCAACAACCGGTTTTACGCTTTTGGTGGGA
AAAACTCAACTGGACTCGTTCATTCAGTTGAAAAATATAACCCTGAGCTT
AACATGTGGTTAATAATCAAGACTAATCTTGACGTTAAGCTTGGTATGGT
TTGTGTTGGCAGATCGAACGGCACCGGAAATAGTGTTTTCATTATTGGCG
GGAAAAAGGAGAATGGTGAGGAGTCAAACTCTTCAACCGTCTTGACGTTT
AAGCCAATCGGATCAGATCTGAATAATGAACAAATTGTTCCAATGAAGGA
AAAAAGAACTTACTCTGCTATAGCTTATCTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2232408..2237566 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1489-1917:430 |
| Aaloc | 1300-1485:2678 |
| Aaloc | 1072-1296:3295 |
| Aaloc | 1-1068:5160 |
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