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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2019296..2026148- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041639 ID=XLOC_041639|Name=XLOC_041639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6853bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2019296..2026148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTACATTTTATCTGTGGTGTTGTTGCTGGCTTTGATTGCCATTGC
TGAATCGAGATGGTAAGTGAAATTTCCTCAAATTTTTAATCGCGATCAAG
TGGGACCTAATAAACTAATAGGCCTTGGCATCAAAACATCATTACTATGC
GTGTGTGTGTCCCAAATAGGGACAGCCTTTGAGATGTGAGAATTTATAGT
CGGATTTAGTTATTTACTTATTTACTTATTTACCAACTCTCTAATCTTAG
GCTGTCCCGAGAGACTATTCTGGATCTTTTAAAATTATTGAGAGACATCT
AGACTTTTCATTTTTAGCATACAGTGTTCAAACTTCTTCCGTCAGGACGG
ATTTCTGTCTCAGTGAAGTAAATATAGAGGGATTTCCGTCTCAAAATTCT
GTTTAATTCACCGAAATGCCAAGATTATGTCCTAAAACTGCTATGTAAAA
TCCGTTTCTGTCTCAGACGAGAAACCTTGGTTTGACCACTGAGCATAAAT
AGTCCTGAGTAAGGGGCGGCTTTGCTTGGACAAACTTAATCTTAATTTTT
CTCCTTCACTAGGCATGGGCACCACCGTCACCGCCATCACCGCCATCTTG
AAAAGCTTCACAGTAAACAACGCGAACGTGATCACACTTCACGCAATATG
GAGTGGGATTTCTTCATGTTAGTCACTGAATGGCCTTTCTCCTCTTGTGA
GAAAGAAAACGTAAGTTCCAAATAGGCTATTCCAGAAATAGTGTTTTACC
TAGGGGGTAAACAGGAGGTGTGACGTCCAGGGTGGTCTGGAAAATGAAAA
ATCCAGGTTAATCTAGTTTTTCGAGTGTAAAAATTCATAGTGGTCAGTCA
GTATAATGAGTTGGAAAATCCGGGGTGGTCACTAAGACGGAGTCGATAAT
TCAGGGTGCTCCAAAAAAATTAGAAAAAAAGTCCAAAGAGGTCTTGAAAA
ATTTAAATAACAATCCAGGTTACCTTTACTTAACTAAGACCTCCTTCCTC
AACACAGGGGTTCAAATTATTCCTGGAATAGCCCAGCAATAATAAATATA
TAAGTTTTTTATTCTTTTAACGAAAATTCATTTCGAAATATTGTCAACTG
TTGGTTTTTATCGCTTAGTACAGCTTTTAGTATGATAATAAAGACCTAAA
TATATTCGTTAAGTGACTATACTCTTTTAAAACTACATGACTCGAGAATA
ATGGTTTTGGAAAAAAGTTTTGAATGTCTTTTTGTTATAAGTTTATATAA
AATTATTTACAAAAGTATACAGTTGATAAATTAATTGATTTGATATTTAT
ATTTCGACGTTGTTGTTATTGCTTTTGGAGAAGCAATTGAATGGTCGAAG
TTTCTTGATGAACCAAGTTTTGGTTCGTTTGAGGAAACCTGTTCGTTCAA
CTCCTTGATTTTCAGTTATTTTTGGTGACTCTTCTTGTTGCTGTTGTTCA
AGAGTTTCATATTGATTCTTCGTGACCAAAGACTTGACACGTTTGAAGAG
ACATTGTTGTTTTTCTTTTTCTTCTTCATTATCTTCAAGTTGAATGTCAA
CAAAAGAATTCAAGTCTTCTTCGGAGAGCGAAATGAACAGCGAACGATTT
TCCTTGGTGTTTTTTCTCACTCTTTCATGGTTTGGTTGGTTTGAATCAAT
TTCTGATGAAGTGTCCTTCACAATGTTGGATGGAAAAACTGAAGGACTCC
AACCGCATAATTTTCTGTAAAAGTTAAGTTTCTCATCTTCACTTTTTAAC
GAAGGAACGATGGGACTTTTGCTTTGAAGGAAGGTCGAATGTTTATCATT
GAAAACGTAGAATTGGTTTTCCAAATCTTCGGATGAATAGTTGATGGAGG
TTTGATCTTCTTCTTCGCCGTGTATTTCTTCTACCGAAAGTTCTGTTGAA
TTTATGAAGGTCCCGAGAGTGTCCATAAACTCCTCATTGTGTTGGGAAGT
TGAACTTTCCAAGGTCTCTTCGAAGGTTTCTGTAATGATTTCTTCTGTCA
ATGAGTCGCAATCTACCGTGTATGAGTGCAGATTCAACTCTTCAACAGAG
CTCGTTTGCAAGGGATAAGAATCAGTTTTGTCGAAGAATGTTTTCTGGCT
ACTTGACGCCAAAATATCCAAGCTGTTACCAAACACTGATGATGGTCGTG
GATCGAACAAAGGTCGAAGATAATAAGTCACATGATCCGTATTGTTCTTT
TCTTCTTGGAATAACGGACGTAGATCGTAAACCAGTTGAGGAATTTCATT
TCTTGTTTCTCGGAACAAGTTTTCTAAGTACAACCGATCGACCCTTTCTT
TGATAACTGAACTGTCAGTTTCTTTGAAGAGTTTACGTAGGCTGTACGTT
GTTTGGTGAGTTGAGATATTTCTCTTGGAAAAAAGTCGTTCCAAGTATAA
CTTCTCTTCTCTTTGCTTTTGAAGCTTACATTCTTCTCTGAAAAGTCTTC
GAAGACTGTAAGTTTGTCGATGATCCATACTCTGATCTTCTCTGAATAAA
GATCTGATGCTATGGATTTCATCATGAATTGCTTTTTCACTAAATGAATG
CTTAATATAAGATCTGTCAAATTCTGCTAAGGACGACATCTTGAATCCGA
AAAATTCAAGACTATAATGAATTTTCTTTTTATAAAGATTGGAGATTTAG
ATGAATGAAAAAATTATTATTTGACGTCAATTCTCTAAGTGACGTCATTT
TTTTAGAAAATAATGAAATGACGCGCTGCGCAAACCAGAAGGGGGTATTC
TTCGTTTCGGCAGTCAAATCCTTAGATGATTTTTGTCTTGACTAGTAGCT
AATTTTCTTAGATAGTGTACTTTGTTCTATTTTCTGTAGGCGACACATCA
ACACGAATGCGTGATACCTGATATTGTGGATGGATGGGTCCTTCATGGTT
TGTGGCCTTCATGCAATAACGGAAAATATCCTGCAACTTGTACACAAGAA
AAATTCGACTTCTCTAAAGTTGAGGTAAACACGTAGCGTTTTTTTCAATT
TCTCAAGTCTCGGAATAATTCTGATTTCTGCCTCGTGAAAATTAGTCAGT
ACCAAATTCTTTACCTATAGAAACGGAGGTCATATAACATTTATCAGTCT
AAACTAGTTTTAACAGTTTTAACTTATTCAACTTTTGTTTAATTACTATA
TTTCTCTGCGAGAGTTAAAAAGCTACAATTTGACTTGAATTTTTAATATA
TTCTTAATTTTCAGAGCCGTGTTTATAAGACACATTTTTAAGTGAAATCC
AAAAAGAAATTAAGCCTTTTATTTATTTATCTTATCAATTTTGTTTGAAT
TCGTACTCTTACGTTCCAAATAAACGCCCCTCCCCCCCCCGGCTTGTTAA
TTTTTAAGAACATTTTTAGCTGTCAAAGAGAAGGCCCCTTAATTTGCTCT
GAATAGCCTGGTTTTAGCCTATATTTACCTTATTTTTGAGTTTCAGAAGT
ACAATTTCTAATCCCCCCCGGCAATTAGGTCCCCCTCTCCATTTATTCGA
ACCCTCCCCCCCCCTTCGTTTATTTGGAACCTAACAGTAAGCATTGAAAC
ACTACTGCTGGCTTCCTCTTTAGGATTTGAACGATCGCTTGATGAAATAT
TGGCCAAATCTATTCGCAGATGAATCGAAAACTAGTTTCTGGTGAGTGCT
GCTGTAACCTTTTCATCTTACATTTATTTCACCATAGTTCGGACCCCCCC
CCCTTCTTAAGGGGGGAGGACACCTTCCGAAAAAAATTAAGAAGGGGGGG
GGTCAGAAATTTTCATGAAAAGGGGGAGGATAGCAAGGAAGGGGGATAGT
TTAAGAAGAGGGGGCTTACATATACATTGTAGATTATTTTCAAGCACTGT
TATGAAATTTGGTCTTCGTGAAAGAACTTTTCTGTTAAAGTAGTCTGAGT
CAAAAAGAAGAAAGAAGTTTATTATTTCGCTTTTTCTCTTTAAAAGATTT
TTCACATATATTTGTTAGCTATTTTTGTCCAAAATCCTTGGGGAATTTTT
AAGGTTCGGGGGATTTTTAAGGTTTGGGGGATGCCAAGAAGGGGGGGGGG
TCAGACATCTTTCCGCGCCATGTTTTACTACCTTTAAAAACATCAACATC
GAAGAAATCTTTTGAAAAATGGTGTAAACAAAAATAACCATTTATAACTT
GTCAACCTTGCCTCGTTTTATTTTCTGTGATAAGATTGCTATAAAAGTTT
TCAAGATTTTAATTCTGAAGGAGAAAAAACAAAACTTCATTTCATACTCA
TACCACAACATACCTGATAATAGTTTTTTATAAGAATGGTGTTTTTCAAT
TCATAATGAATATTCATAACCTTTTGAGGAAAATTGTCCTGGAATATTAT
AAGGGCATTCTTAGGTTTGCATCTAATCCCAACCAAAATTTAGCATGTAA
TACACATCTCAAGCAAAACTTTGGCATTTTTGTTGAATCTTTTAGCATTG
CTGGGTAAAAAATGGCAATTTAACGGTAAAATGCTCTAAAAATGGCATTC
TTAGGTTCGGTTGCCAAATTCCATGATGGTGATATTCTTACAATATTCTT
TACCATAAACAATAGGTGTTTTAAAGCTCAGCTGTATGATTTCTCCGAGC
TAGAGACTCGTCATCTTTGTTGCTTATGATTATTGGTCACTAGAAGAATT
AGGCTTCAAGATGAATATGAGCTCGGATCCTAAACATAAATCGATGTAAG
ATGAAAAGAAAAATTTAAACTATCTTGTTACATTTTTTCTCTAGGAAACA
CGAATATGAAAAACATGGCACATGCGCAGAGACCGTCCAAGGCTTTGAAA
CAGACCATGATTTTTTCAAAGTCACTCTTGATTTGAGAGACAAATACGAC
ATGGGAAGGTAAAGAAATGCTTTTAATATTTCTACAACAATTTCGAGGAC
TCTCCCGTACCATTCCTCCCATCCCATATCCATACTCGAACTTCAATTGT
CCTCCCATTTCTCAATATTTTGAAGTAAGCTTAGTCGATCGAGCATTCGC
CTTTAATTCCGAGGTTTTTGGTTTTGATCTCCGGTCGCATCCGCCGACTT
ATCGAATTTTTAGCTTAGATGAATAGTAAATTTTGATCAAAGTAATAAGC
TCAGCACTCTTAGCCAAAAGATCTGGCTCTGACTCTGTTCTGTAACACTG
TTGGCAAGAGGAGCTAATTGGCAGCTGAGAGAAGGTGTGTTGCTCCCCCG
TCAACATTCGACCTCTTAAGTCGTAATTAGAAAAGGGATAGACTCCCTCA
CTTCCGGCTCCTCCGACAGCGACCAGATGAATGAACTTCTACTTAGTGGA
ATTCAGTTTCAATTAATTCCATCTTAATTTTTACTTGACAGAGTTCTTTC
GGACCAAGGGATCACACCTAGAGTTATTCCATATAAGGTATTCAGTTAAA
TTTATACCGCTGCCGTTATTATTTTACCTTTTCCTTGTTTTCTAAAAGAC
GCCCCTGTCTCAGTGACGGGTGAAAACGTCCTAGTCGAGTGGGATGAAAC
GAAGGAGCTACGTCTCAGACTTAAGGATAAATATATGAAGATGCCTTTTG
TCATTGGAGATAAGTTCTGTTCTAATGAAATGAAATGGGTTGTTTTTCTC
AGCAGGATGATTTTTCAGATCCTCGTCAATTTGTCATCATGCGACTGACG
TTGGAAAGTTGTTTCGGGACCCACTGGGTTAATTTCTAATTAATTTCTTA
CTTAGATAAAATATTACTTCTATTCAATGTTCGTGTTTTATAACCAGACT
TCTTCTTGTTAGGGAGCCGACGTGAAAAAAGCAATCGACAATGGGCTGAC
GAAAAAGGGATGTGCGACTTGCCAGAAAGTCAAGGTTTGTCGAGATACAC
ACTCTCAGGGCGTTTTTAAGATAGAAAGAGGGTGAGTCTTTGAAAGTGAG
TGGCACGGGAACAGAAAGATTGCTTAAAAAATTATCATCTTAATTGCAAC
TAAACGTTAAACGTCTTGTGCCAGCCAGCTTTGAATGTAAGGTAAATTAG
TATTGGCTCTACAAAAATTTATTTCAGCAGTTTAGGGTTAGCATCAATTC
TACAATGAGTTAAGTACTCAGTTAATTAAAATTCAGATATATAAAGTCTG
AGATAAACATTTTATTACTTCAAAATTGTGAAATCCTTGCAAATAGACTT
CGTCGATGAAAACACGCGTTTAAGACTAACAAATTTCCAAATATTATTAA
AATCTCTTAGAAACCTTTCTAAATTTAATGTCGTTTACTTTCTTGTTCTG
GCGATAGAGTTTGTCTTGTTGATCCATTCATTTGGCTCTAGTTTTATAGA
AAATAAATTGTGGGGACTCATAATTTTGTAAGATAAAGTTTTTATTTCTG
GACTCAATAGTTCGATATTGACCTCGTGATTATCGAATCAGGGAAAATTC
CCACTTTTCGATACGTTCCCGTTTTGGATAAAATCTAATTTCCCTTACAT
TATTAGACCTTGTTCACACGCTACGGTTCCGTTTCGCCCCGAAATGAAAT
GAAGCCATTCTTTCGGTTAAATTCAATTTTACGTCACTTCTAACCAATCG
AATGGTTTCATTTCGTTTCGGAGCGAAACGGAACCGAAACGGAACCGAAA
CGGAACCGTTACATGCGAACATAGTCTTAGAGAGCGTTTTTTCTCCTTTG
ACAAAAACAACATCTGTTGGAAAAATCAACAGAAATGTCGGTAAATTCAT
GAATTTTCGATTATCTTTTCCAAGGGTGTTGATGGGTACGTATTGATGAG
CACTACCGTATGTCTTAGCAAATCCTTACAATTGATTGATTGTCCTTATT
GTGAACAAGAATGCTATGATAACGATGCTGTCTACTATCAACCAATGAAC
TAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2019296..2026148- >XLOC_041639 ID=XLOC_041639|Name=XLOC_041639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1548bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2019296..2026148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTACATTTTATCTGTGGTGTTGTTGCTGGCTTTGATTGCCATTGC
TGAATCGAGATGATGAAGTACATTTTATCTGTGGTGTTGTTGCTGGCTTT
GATTGCCATTGCTGAATCGAGATGGCATGGGCACCACCGTCACCGCCATC
ACCGCCATCTTGAAAAGCTTCACAGTAAACAACGCGAACGTGATCACACT
TCACGCAATATGGAGTGGGATTTCTTCATGTTAGTCACTGAATGGCCTTT
CTCCTCTTGTGAGAAAGAAAACGCATGGGCACCACCGTCACCGCCATCAC
CGCCATCTTGAAAAGCTTCACAGTAAACAACGCGAACGTGATCACACTTC
ACGCAATATGGAGTGGGATTTCTTCATGTTAGTCACTGAATGGCCTTTCT
CCTCTTGTGAGAAAGAAAACGCGACACATCAACACGAATGCGTGATACCT
GATATTGTGGATGGATGGGTCCTTCATGGTTTGTGGCCTTCATGCAATAA
CGGAAAATATCCTGCAACTTGTACACAAGAAAAATTCGACTTCTCTAAAG
TTGAGGCGACACATCAACACGAATGCGTGATACCTGATATTGTGGATGGA
TGGGTCCTTCATGGTTTGTGGCCTTCATGCAATAACGGAAAATATCCTGC
AACTTGTACACAAGAAAAATTCGACTTCTCTAAAGTTGAGGATTTGAACG
ATCGCTTGATGAAATATTGGCCAAATCTATTCGCAGATGAATCGAAAACT
AGTTTCTGGATTTGAACGATCGCTTGATGAAATATTGGCCAAATCTATTC
GCAGATGAATCGAAAACTAGTTTCTGGAAACACGAATATGAAAAACATGG
CACATGCGCAGAGACCGTCCAAGGCTTTGAAACAGACCATGATTTTTTCA
AAGTCACTCTTGATTTGAGAGACAAATACGACATGGGAAGGAAACACGAA
TATGAAAAACATGGCACATGCGCAGAGACCGTCCAAGGCTTTGAAACAGA
CCATGATTTTTTCAAAGTCACTCTTGATTTGAGAGACAAATACGACATGG
GAAGAGTTCTTTCGGACCAAGGGATCACACCTAGAGTTATTCCATATAAG
AGTTCTTTCGGACCAAGGGATCACACCTAGAGTTATTCCATATAAGGGAG
CCGACGTGAAAAAAGCAATCGACAATGGGCTGACGAAAAAGGGATGTGCG
ACTTGCCAGAAAGTCAAGGGAGCCGACGTGAAAAAAGCAATCGACAATGG
GCTGACGAAAAAGGGATGTGCGACTTGCCAGAAAGTCAAGGGTGTTGATG
GGTACGTATTGATGAGCACTACCGTATGTCTTAGCAAATCCTTACAATTG
ATTGATTGTCCTTATTGTGAACAAGAATGCTATGATAACGATGCTGTCTA
CTATCAACCAATGAACTAAGGTGTTGATGGGTACGTATTGATGAGCACTA
CCGTATGTCTTAGCAAATCCTTACAATTGATTGATTGTCCTTATTGTGAA
CAAGAATGCTATGATAACGATGCTGTCTACTATCAACCAATGAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2019296..2026148 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 646-774:130 |
| Aaloc | 574-645:1092 |
| Aaloc | 529-573:1512 |
| Aaloc | 415-525:2109 |
| Aaloc | 346-411:3281 |
| Aaloc | 211-345:4015 |
| Aaloc | 64-210:6291 |
| Aaloc | 1-60:6854 |
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