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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000001_pilon:2017199..2025905+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041403 ID=XLOC_041403|Name=XLOC_041403|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8707bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2017199..2025905+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTGTTCCTTGTTTTGTTGTTAGTGGCAGCAGGTAGGTTAAACTA
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CAAGCTAATAACAATTTACTtttggtcttatttttaaaagaattttgaag
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GCGGCCCTACATTTTCAGCCCTCCCAAAACGCACGACATGGGTTGATTTC
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ttttattataaaaaggaattttctttcggtaaacaattcccctatattgt
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TCAAattattgcctgacaatatattgtgtagtgtatatAGCCCTTTAGGG
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GgtaaaaacaaaccaaaagacTTCTAAAGAACACAGATCCACTGGGGCcc
taccactgacctttatataccctggacaaagcttctcaatcccagccaag
caaaatctttgatcggagttttttgaaaattggtaccctaatgtcggcac
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agatattgtttggtccagggttatataaaggtcagtgggccctaccccca
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attgtttagaaatagcactccaaaaccattcccgctagattttttaacct
tgggacgatagaatttttatccccattgagatttcaatcgaggtttttat
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GAGTATCACATTATATTACCTTATGTCATTGGTTCTGTATAATCTTTTTT
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TGCAAACCATGAAAATTCTCTGGTTAAGTTTCTACAGTGGAGTTTCTATA
ACTACGCAAGAGGAAACACAAATTCGTTGGAGTTAAAGGGACATAatagt
actgacgaaatttgtaaacaaactgtatgcagcgggatgcaaaatctaaa
caaatgtcacatgtcaaaataaaaagtaaaaacaaatatCATTTTGactg
tttcaattgttttaaaagtttgttttggacacttGATTTAAATTATTCtg
tttaatgacacgtggtttgcgcaatgtttacattttaatacttttatgtc
cctttaagggaAATTTTACCTACAGAGACTCCACAGCTAAACCAAAattg
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GCGCCAATCTGGAGAATGGCAACTACGCCCATCCAACAGGATGCGAAAAA
TATGTCGCATGTGCCAATCACATCGCTTACACGATGCCGTGCCCAGCAGG
ACTCCATTTCAATCACGTGTTAAACAAATGTCTTGAGCCAGAAGAAGCAC
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CCAGGTTAGTATTCATTTGGCAAATGTAAGCCAACAATTTAAGAGCGAAC
CatggtgcagtggtagagcatccggctacggttcgcaagatTGCGAGTCC
AATCCCCacccgggtcataccaaagattcgcAAAATAGTACttaatgcct
ctctgcttgatacaCAGCAGTTAAGAGAAGTACCAAGGGTAattggagaa
atccagggagaaagagtggcgtccTCCTCTTCCTTTGGGTAGATAGTtat
caaaagaggagcctttgggtcgcctccgGCTGTGGTTGCAGAGTTACTTA
TTTGCTTGGCTGTCATCCATGTAATGTTATGTTCTCGCCCTACTGAACTG
ACTTTTTTctcatttaaattcaaaattcaaaggtaaaaattgcactccCA
AACTATCCTACCTGGACTgaataactatcaaagaacgccTCAGCCTCGTC
CCCGTGATTTCAtacccactcgaaattcaatttttaaaaattgcactcta
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ATCTCCATTAGAATTTCGATTTTCGTCTAAGTAATTCCAAAACTCTTGAA
AATATTggatattcttaatattttgagttttaagccttaaaatgttctta
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ATAGGACGTGTCAGTTTAGCCCATCTTCCATCCGGTTTGATCAGTCAAGT
TCGTTTGGAGCACGTATCAGGATCGGTCACGTGTACACAAAATGTCGCAC
CAAGCTACTGGGGTTGTAATAATAACCAGGCCACTTATACTTCAGAGGTA
AGTAAGTatcaaaggttttatttttacataagtgttcccgtttcatatca
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cacatctgtgtcaattcaatgtgaaaaagcttgtgaattgaaaattatga
tcagtaagcaaacaatatcactcttttTTAAACACAAATCCTTTAAGAGG
GAAACCCTccaaaaaagtgttttgataCTCTGAAATTCAACGAAAGTTTA
ACGTGCACCAGTAGAAATGAACGCTTAGAAAAAATCCCCTCGTTGAgagg
ttcaaactttaaagggaAAATCTATTTGTTTTGCGCTGTCAGCTGGTGTT
TTTATATCATTCTTAAATCGCgtgattttccaatatttttcataacaTAG
TTTTGTccccccccccTCCAGTTAATACCGAGTTTACGTATGtctgtttt
tcagcgacggagacggtaaggttctaatttgactagatcatgaccaactg
aggacgacgatcatcacttttaccgtcctcgattttgcggggcagaattg
cgggttattccaaatcgattcagtcactttaccgtcctcaaaagcgcaaa
tacataaactcgctaatgattCCATAGCCAGTCTCCATATTAACTCGATC
GAGCTTGCGACTCGATCTCCATTTTGTGTTTGAGATTCTGTAAATatgat
atattttatatttcgCACCCTAGCACTTAGTTTGTTTTCCTGTGATTCTG
ATGTGGTCACAAAAAGTCCATCAGAAGGAAAAGAATATGGATGACTCTAT
AGGTTGGTACAAAATTGATGTAATTGAATCGGTTAATTTGACAATAAGAT
ATTTATTCATCTTTACAGATCATTGGAACACTCATTACTGACGCTGTTGA
AACGAAAATCTTCGAGAAAGAAAGACTTCCCGGATTTACCGGCAACAGCC
CATTCATCACTTTCAACTCTGCTGTCATGGATATCCCAGCTGTTCATACT
TCGGTATGGTGTAATTCATGTGCTTGTTTTATTCTCCCAttggaaaattg
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CTATCCCCACTCAATTTCctggcttgaaaacaatagaattcaaatcccca
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TCTCCTACCCAGTCTGTGAAAAGGAGGTGTAGCTAGTACACGTCAAAGTG
CATTTTTTGACCAGGCCTAGTTAAATTACACGAATCCTTACGCCGGTCTT
TTGACATAAGTGCGTCAAGTGAATTTTTAGACCTGGAGAACCCTTACGCC
GACCCCTATTCGCCAGCGACGAACACAATACACATAAGGGTCgccgtaaa
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TGACTTAGAATTATTGGTTTGGTATAACGAAGACTTCAACCAAGAGACCA
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TAAGATATATCGCCCTTCATCTTTTACATTACCCTCAATGAATTGTCGAT
GTGAGAAGAATCTgcaaaatatttgacaaaaaatttctatctttAGCGTC
ATTTATATTAAGAAAAACGATCACTTGTTCCATAGTATCCACATACATGT
TGGCAAAATGGGCCTTAATTCATCATAAAAACCATGAAATCCCCATTGCA
AAACTTCACTGAGTTCTCTTACAAAACGAACTCACTTGTAGCTAAGAATT
TCTCATTGGGAAATCCTTGTGCGTAATTCCTAGGTTGAAACGATACAAGC
TGAAGTGTTGCTTACTTACATTGCACCCCTTTGTCACATACCCACTCGGA
CCCCAGTCCCGcttgaaaatttggccaaaatctcGTCCCCAGTTGGAAAA
TACCCTGGTATTTTAGCCCCACTGTAAAGTTatgcaaaaatttcgtcccc
ggtgggaaaataccctgaaatttcagccccaccgggaaattgactttaat
gtcatccccactcgaaatttaATGTTTGAAAGTTGCACTCCATTTCATCA
CTTCCACTgcattttttaaccttgaaacaataaCTTTTATCTCcgctgag
gaaaaaagttccaccgggggtGTGAGTTGTTAAAATGCAAATAAACGCTA
TTTATTTCAGAGACAGCCCAAGAAGAGATCCCAATGGACGAAGAATGCGT
TGGACGCGCTGATGGAAACTATATCCATCCTTATGAATGCGGACTCTACT
TGACTTGCTCTAATGAAAATACCTATGTCATGAAATGCCCTGCAGGTAGG
GtttttttAGAGATTCGTCTTTCTTTTTAGCAGATAACATCTCAACAGGC
Acttaacgttgtttcaacgtgcgagcgttcacaacgtctatataacgtta
gatgaacgctgaaaacaacgttgtgtggcaGCCTGGATAGGCGGTTTTAC
CATGTTGAACTTATTAGAGATTCATCTTTTTGTAACAGATTTAAACGAGT
TTATCCctaaaaattttatgaattttagtaaaatgttttttacgAATAAT
AACACCTCTAGGCAGAAAGCTCTTGCATTTACCATCAGGTACCTAATATA
GGGTATAGTTTAGGAATGTCGTTACTCTtttgaaggaaatattttttatt
tcggCATCTTTTGCCTTGACCTTATATTGAATTTTTGAGGTCCTCCCGCC
TTGAGtaagactacacgttttttctttgataagaacatccagaatttttg
aagccttcagacgTGGCCTTATATTTTCAGGTTTCAAACCaaagaatgtt
cttaatatgttcttattttcagcattttgagtatttttgtccattttcac
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TTTCGTGTATCAATTTCTATTGTTGTAgttcattttctttctctttttgt
aGGACTTCACTTCCACTTCGAACTGAACATGTGTCACTATCCAGAAATCG
TTCAATGCCAAATTTTAGTTGGACAAGTCACATTCGCTGCTAAAGGAAAC
AAACCAGGTATagcaaagatttccaaaatggtacttgatccCTCTTTGCT
TGAtgttcagcaattaagagaaggatcaagggtaagcgggaatccaggga
gaaagagtaaCGCCTTATCCtatcttcgggtagatagctatcgaaagaag
agccttcgggtcgactccgactgtggtcgcagacttacttacttagtaAA
CTTTGTACGCTTAAAGTATTCTCAACGTGATCGTTATGTGAATACTCTTT
ACcggagtgtatctcacgtttatcgcttcatACTCTGTGCGCACTCTCtg
tttattgataaaaaagtccCGTACGGTCAACCTCTGAGGTGAATTATGAT
TATTGTAAATAGCAATACTCCTCTCATTGTCTCCcttctctcaccaacac
tccatcgcagcggtcggtttgaaaaatctcaaattagaAAAGACATTGat
aacagaccctctacggcaatatattttgaatttagaTGCAAGGTCTATGT
ACACACAATATATAGAATTGAAACTTAACATAAGCCCCATTTGGCCGAAC
ACCTCTTTATCATAGAAGCTACCAAAACCCTATTAGAAGTTGTACTCCTT
CATTCTTAACCCGTACTGCGCAaaatgtatatattttcttgatttaattt
tttaaatgaggCTGAAACTAGCTAAAGAGGGCTCTGAAAAGGGATTATTT
GTACcaaaaaagtttgatatttCGAACATTACCAAACTGACTTAAGTTAT
CTCACCTAGTTGCTGAGCCAGGGGTATGGCGGGGTTCTGACATGcttcaa
aattaaaagttcttaaaatattAGCTTTTGCTTCTTTTCATCTTTAGGTA
TCTTTGAAGTAATGATATCTGCTGGTTTAAATTTTAGGTGTCCTTAAATT
GGACAACACTTTGAGCGGCGAAATTACACAAATTCGATTGGACTTTGTTT
CTGGATTTGTCAAATGTTCTACCAACAGTGAGCCAAGCAAGTGGGGCTGT
AACAATTCACCTTCATCCAACTTCCCAACTGAGGTACGTCTGAAAATATT
CCAGCTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:2017199..2025905+ >XLOC_041403 ID=XLOC_041403|Name=XLOC_041403|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2472bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2017199..2025905+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACTGTTCCTTGTTTTGTTGTTAGTGGCAGCAGATGAAACTGTTCC
TTGTTTTGTTGTTAGTGGCAGCAGTTGCAGCTGTACCACACTGTCCACAT
GGAGATTGTGATTGCAAATGTCCATGCCATCGTGAACTGAAATTGAAAGA
ACATTCTGACAACCAAGTCCGTGCTGTGTTGAAATCTCTACGAACCATTG
ATGATGAAGTTGCAGCTGTACCACACTGTCCACATGGAGATTGTGATTGC
AAATGTCCATGCCATCGTGAACTGAAATTGAAAGAACATTCTGACAACCA
AGTCCGTGCTGTGTTGAAATCTCTACGAACCATTGATGATGAAGCCATTG
TGAATTTTTGCGCCAATCTGGAGAATGGCAACTACGCCCATCCAACAGGA
TGCGAAAAATATGTCGCATGTGCCAATCACATCGCTTACACGATGCCGTG
CCCAGCAGGACTCCATTTCAATCACGTGTTAAACAAATGTCTTGAGCCAG
AAGAAGCACATTGTCTGATGTTTGCTGGAGAAACTACTTTTGCTGCTAAG
GGAAGAAAACCAGCCATTGTGAATTTTTGCGCCAATCTGGAGAATGGCAA
CTACGCCCATCCAACAGGATGCGAAAAATATGTCGCATGTGCCAATCACA
TCGCTTACACGATGCCGTGCCCAGCAGGACTCCATTTCAATCACGTGTTA
AACAAATGTCTTGAGCCAGAAGAAGCACATTGTCTGATGTTTGCTGGAGA
AACTACTTTTGCTGCTAAGGGAAGAAAACCAGGACGTGTCAGTTTAGCCC
ATCTTCCATCCGGTTTGATCAGTCAAGTTCGTTTGGAGCACGTATCAGGA
TCGGTCACGTGTACACAAAATGTCGCACCAAGCTACTGGGGTTGTAATAA
TAACCAGGCCACTTATACTTCAGAGGACGTGTCAGTTTAGCCCATCTTCC
ATCCGGTTTGATCAGTCAAGTTCGTTTGGAGCACGTATCAGGATCGGTCA
CGTGTACACAAAATGTCGCACCAAGCTACTGGGGTTGTAATAATAACCAG
GCCACTTATACTTCAGAGATCATTGGAACACTCATTACTGACGCTGTTGA
AACGAAAATCTTCGAGAAAGAAAGACTTCCCGGATTTACCGGCAACAGCC
CATTCATCACTTTCAACTCTGCTGTCATGGATATCCCAGCTGTTCATACT
TCGATCATTGGAACACTCATTACTGACGCTGTTGAAACGAAAATCTTCGA
GAAAGAAAGACTTCCCGGATTTACCGGCAACAGCCCATTCATCACTTTCA
ACTCTGCTGTCATGGATATCCCAGCTGTTCATACTTCGGAATTGACTGAC
TTAGAATTATTGGTTTGGTATAACGAAGACTTCAACCAAGAGACCACCAG
TGATGATAGCGGTGAACACGTGATCAGAGTCCTTGTTACCATGGATACCG
ATGTTGACTTGGAGTTGGCCACGAGACAAAGTGAACAGAAAACAAGAATT
GACTGACTTAGAATTATTGGTTTGGTATAACGAAGACTTCAACCAAGAGA
CCACCAGTGATGATAGCGGTGAACACGTGATCAGAGTCCTTGTTACCATG
GATACCGATGTTGACTTGGAGTTGGCCACGAGACAAAGTGAACAGAAAAC
AAAGACAGCCCAAGAAGAGATCCCAATGGACGAAGAATGCGTTGGACGCG
CTGATGGAAACTATATCCATCCTTATGAATGCGGACTCTACTTGACTTGC
TCTAATGAAAATACCTATGTCATGAAATGCCCTGCAGAGACAGCCCAAGA
AGAGATCCCAATGGACGAAGAATGCGTTGGACGCGCTGATGGAAACTATA
TCCATCCTTATGAATGCGGACTCTACTTGACTTGCTCTAATGAAAATACC
TATGTCATGAAATGCCCTGCAGGACTTCACTTCCACTTCGAACTGAACAT
GTGTCACTATCCAGAAATCGTTCAATGCCAAATTTTAGTTGGACAAGTCA
CATTCGCTGCTAAAGGAAACAAACCAGGACTTCACTTCCACTTCGAACTG
AACATGTGTCACTATCCAGAAATCGTTCAATGCCAAATTTTAGTTGGACA
AGTCACATTCGCTGCTAAAGGAAACAAACCAGGTGTCCTTAAATTGGACA
ACACTTTGAGCGGCGAAATTACACAAATTCGATTGGACTTTGTTTCTGGA
TTTGTCAAATGTTCTACCAACAGTGAGCCAAGCAAGTGGGGCTGTAACAA
TTCACCTTCATCCAACTTCCCAACTGAGGTACGTCTGAAAATATTCCAGC
TAGTGTCCTTAAATTGGACAACACTTTGAGCGGCGAAATTACACAAATTC
GATTGGACTTTGTTTCTGGATTTGTCAAATGTTCTACCAACAGTGAGCCA
AGCAAGTGGGGCTGTAACAATTCACCTTCATCCAACTTCCCAACTGAGGT
ACGTCTGAAAATATTCCAGCTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:2017199..2025905 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1069-1236:8540 |
| Aaloc | 964-1065:7555 |
| Aaloc | 829-960:6713 |
| Aaloc | 670-825:5893 |
| Aaloc | 535-669:5269 |
| Aaloc | 394-534:4207 |
| Aaloc | 175-390:3088 |
| Aaloc | 40-171:1099 |
| Aaloc | 1-36:1 |
|
