|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041299 ID=XLOC_041299|Name=XLOC_041299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTGACGATGAACTAAAGTATCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTC
TGATCCAGTTGCACATGCAGAATGGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTC
CAAGCGAAGATCATGGTTTCCTTTCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGG
GATAAAGTTACTGTCCAGCTCGATGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAA
GGATGACATTCAAAGAATGAACCCCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATA
TGGCCGACTTAACTTGCTTAAATGAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAA
GACAGATATTTCTCTGATTTGATCTATGTAAGTGTGCTCAATCAGCACCC
AGTTCTTTTTTATTGTCTATTAATATTACTCTGCAATTCTAGTACAGTTT
ACACTTTTCCCAAATTCCTGCCCGGAAATCAAACTAAACAAATATTTTTT
GCTCCTGCATTTTGTTGAGAGAAAGTACAGTTGACAGCAAGTTTAGACAG
ATTCTGTGTCAAAGTCATTTTCACCTAAATTGTATCAGCTACCTTATCAG
CCCTTTTTACGCTGGCGCTAGTTTACACTTTTCCCAAATTCCTGCATGCC
CGGAAATCAAACTAAACAAATATTTTTTGCTCCTGCATTTTGTTGAGAGA
AAGTACAGTTGACAGCAAGTTTAGACAGATTCTGTGTCAAAGTCATTTTC
ACCTTTTAACGCCGGCGCTAATTTAACGCCGGCCCCTTTTTACGCCGGCC
CTTATTACTATGCCACAGCCTGATTTTAGGCTTATGCCAATTATTAGGGC
CGTAAATAACCCCAAAATCTTTAGAACAGCTATTTATGCTTCAATTTTAT
ACATCAAAATATCATTTTTCAGTATAAACTGTTGAAAAATCCATTGAAAA
TCACTGATTTTTGCAAAGTTTTAGATATGCAGTATAACAATGGATAATTT
TTGGACCTACCCCGGTGGGGTAGAGGTCCTATAAATTAACCGATGTCCGT
CCGTCCGTCCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAGGA
TTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAATGATGCAAAATGGTAA
TGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAATCATTTCCGGCC
GAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCAA
GATTTCATCATTAGTTTTTTCAGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTAGC
AATGCCTAAAACATGGCAGAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTTTTCCGG
CCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCAT
CGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTAA
TAGCAATGTCCACGATCAAGCATGGTTCAATTGTCGATAAAACTGATTTT
TAAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAACAGCCGATTTTCTCCGGAA
AAACGGTATTTCTTGAATTTCTTGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAA
TTTTTGCACACTAATGTAAAATGACAATACCTAAAAAGTGACGGAGCCCG
ATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAGTGCCGGAAATATGCCGGA
AAAACTGGTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTCTG
ATTTTTTGCTCTAAGATGCGTATTGATATTGCCCAAAACATGGCTGAGTT
CGATTTTTGAGAATTTTTTTTTTCCGGTTGAAAATGCCGGAAATCGCCGT
TTTTGCAGATTTTCATTAGATTTTTTCCTTGTATTTCTATGTTTTTGACA
CAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTC
AATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTAATTTTTTCCCTACA
ACCCTTCCCTCTCCCCTTATCAACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTAT
GCATTTTCGCTAAACGCTATGTTTTCTGACTGATTTTTTTTCATTTTTCT
CCTTGCATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCT
AGCTTGTTTTATCTTGAAATCATATTCACAAAATCCTTTAACTAGAGAAA
AATGGTAAAAAATTAACGTTACTTTTAAGTAAAATTTGCAAAATTTTGGC
CCTTTTCACACCGCCCCTTTTAATGCCAGCCCTTATTACGCCAAGAGCCT
AAAAATAACGCCAATAAGGGCCGGCGTAAAAAGGGCTGATAAGGTAATTA
TCTAAGAAATAGCAGAAAGAATATGTGCAGCATGAGTTAGTTCCTAACTG
GATTTTACCGAAGCCATTGCTTTTGATATCAAGATATACCATCGTAAGGG
CAAGTTTCGACTTCCCAGACTACTAGTGTGGATTTCGTGAATTTCCTGGG
ATAGTTGGCACAAACAAACCGGGAATTTTTTTTTCTAAAAGAAGGAAACT
GTCTAGCTTTTCAAAGCTCATTTTTCAACTACCCCAAGTTCTGGTCAGAA
AACTGGGAGAGTATTATCTTTCCAAGATAAAGAAAACCAGGGACAATTTT
TCTAAAAATCTAAAATCAGGAAAAATTTCTGAAATTAAAAGTGTTTGAGC
ATTCAAATCATTAAAAAGTTGTGTCAGACTGTCTGAAAGGTATGATAACT
AACGAGCAATTTGGTGCTAATCTAGAACTGTAAAGGTCAGGTGCTATTTC
TTTCAGCATCTCTCTGACCCCTGCCCTAGTGAGTGTCTATTCACTTTAAT
AGTGATAAAAATTGAGGAGGTGGGGTTCCAGACATGCTTCCATAGCATAA
ATTCTTAATCATCCAAAATAAGGATTTAACAGCCTTTCCAAGCAATAATA
GACTAATTTATCTTAATTGTGTCGTTGCAATTACTATCCAGAAGCCAGCT
TTATTTGAGTCAGAACGTAAAGCTCTAAATTGTGACTCTAACATACTTGA
TAGCAAAAAGTGTTTATTTCTTTAATTTAGACCTATTCTGGTTTGTTCTG
TGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGACTTCCCATTTACTCAGAGAAAGTTG
TAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGACATGAAGTCCCACCACATGTTTAT
GCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAGCATGTTACAAGATCGTGAAAATCA
ATCTATTCTTTGCACGTAAGTCTAATTATTCAGATTTCTTGTTTAAGAGG
GTTATTGTTGTATCATGTCTCTGAAAACTTTTTAGAACTCAACTGTACCA
GGCAAGAGTTATTAAAATTAAATGGTGCACTTCACTCAATCTCTTGAATT
CACGCCAGCATTTTGAAGATGAACTAAAATGGCCCAAACAGACCCAAAAT
TCCTTATTTCTGTCATCCTCATTCAATCTGAATTCACAGGGCTGCACTTA
CCTTAAAAACCTTGTTGGGATAACTTGAACTACTCTTAAAAATCTTAACT
GGGAAAACTGTTTCATTTATTGTGTATATTTTTGTTTTTCAGAGGAGAAT
CTGGAGCAGGAAAAACTGAAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACT
GCTGTTGCTGGCCGTAACCAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCA
AGGGAAATTGGAAAACCAACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTT
TTGGTAATGCTAAAACTGTTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTGTAAGT
ATTATAGTTTTTTGCTGTATATTTTGTGTAATAGAATGAAACTAATTAAT
AAGTAGAGACTAGTACAATAAACTTTAGACTTTTCTTAGACGAAATTGGA
AGTTCTCTGAGTGTTTTAATAAAATATTGTTTTTAAATATTTCTCACTTC
TGCTTTAGGGTAAATTCATCAGAATCATGTTTGACAGCTCTGGTTTCATC
TGTGGAGCAAACATTGATCAATACTTGCTGGAAAAAGCGAGAATTGTTCG
TCAAGCACCTGAGGAACGTACTTTCCACATCTTCTACCAATTGTTATTGG
GAGCTAGCCCTGAAGTCAAAAGTAATTAATTCATATTCATATTATATCTT
GAATATCTTTTTTTTTTTTTAATGTACTAATGCTCAATGCATGAAAAGAT
GAATTGTGTCCATTGCAATGCTTTTCTTGGTTATCACCCTTCAATTGCTA
TACTATTATGAATTGTGAAGACTTATCATGTTTCAAGCATTATTCATCAT
TAGTGACATTTTCTTCATTTTTAGAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACT
GCTTACAATTTCATGTCCAACGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGA
CCGTGCCGAGTTCAAAGCTACTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCA
CACAAGAAGAATTGGACCCCATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTT
TTTGGAAACATGGAATTCAAACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTT
GCCAGACAACACCATTGCTCAAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTG
TCACTGATTTCACAAAGAGCTTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGT
GAATTCACACAAAAAGCTCAAACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGA
AGCCATTTCTAAAGCTACCTATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTC
GCATCAACAAATCTTTGAACAAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATT
GGTATCTTGGATATTGCTGGTTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGA
ACAACTTTGTATTAACTACACCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACC
ACACTATGTTTGTTTTGGAACAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGGTATGAAT
TTGTGCTGAAACCTTTTATTATTGAGTTGTAGGGTCAATGACAGTGTAAA
CTGCATCTTGTAACTTTCATTTTATGCCATGATCTCTTTATCTCTGAATC
TTGCCAATATATTTATTGATTATGTGAAAAGTGATCTACTTTTAAACAGA
ATCTTTAATACTTCTCTAATTTTGCTCTTCAGGTATTGATTGGAAATTCA
TTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTGAAAAACCA
ATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCCAAGGCTAC
TGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAAACATCCTA
AATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCGTTATCCAT
TATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACCAAAAACAT
GGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATCCAAAGATT
CATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGGTGAGTAAATCACAATTTAT
GATCAACAAATATTGGTTTCAAGTGAAGTTATCAAGACTTTTCAGTAATA
GAAATAGTTTAGGATTGCTTTCTTGATGGTTATGATACGGAGTCGCAACT
TTCAGAATACAGCATCATAAAATGATTTTTTTTGCTTTTAGACAACATTG
TCGGTATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGA
ACCAAAAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGGTAATTAA
AAACTTTCATTTTCTTTATAAAATGAGAAAGTTGCCTCAAATCACAAAAT
CAGTGTTCTACTTCCTAAGAATTAAGTTTCATTGCCAAAAAGGCTTTCTA
TTGATGATTTATGAATTACTGTTTTATGTTGTTCAAAGCCATAAAAAATT
ATTTTGATATTTAAGGAACAATTGGCTGGTCTTATGAATACATTGCACAG
CACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTATCATTCCAAATTACGAAAAACGTG
CTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCCTTGATCAATTGAGATGTAATGGT
GTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGTCAAGGTTTCCCCAACAGAATCCT
CTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGAAATCTTGTGCCCTGGTATTGTAC
CAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAGCTGCTCAACAAATGGTATATTCT
TTTTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- >XLOC_041299 ID=XLOC_041299|Name=XLOC_041299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4470bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGGTGACGATGAACTAAAGTATCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTC TGATCCAGTTGCACATGCAGAATGGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTC CAAGCGAAGATCATGGTTTCCTTTCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGG GATAAAGTTACTGTCCAGCTCGATGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAA GGATGACATTCAAAGAATGAACCCCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATA TGGCCGACTTAACTTGCTTAAATGAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAA GACAGATATTTCTCTGATTTGATCTATATGGGTGACGATGAACTAAAGTA TCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTCTGATCCAGTTGCACATGCAGAAT GGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTCCAAGCGAAGATCATGGTTTCCTT TCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGGGATAAAGTTACTGTCCAGCTCGA TGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAAGGATGACATTCAAAGAATGAACC CCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATATGGCCGACTTAACTTGCTTAAAT GAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAAGACAGATATTTCTCTGATTTGAT CTATACCTATTCTGGTTTGTTCTGTGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGAC TTCCCATTTACTCAGAGAAAGTTGTAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGA CATGAAGTCCCACCACATGTTTATGCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAG CATGTTACAAGATCGTGAAAATCAATCTATTCTTTGCACACCTATTCTGG TTTGTTCTGTGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGACTTCCCATTTACTCAG AGAAAGTTGTAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGACATGAAGTCCCACCA CATGTTTATGCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAGCATGTTACAAGATCG TGAAAATCAATCTATTCTTTGCACAGGAGAATCTGGAGCAGGAAAAACTG AAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACTGCTGTTGCTGGCCGTAAC CAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCAAGGGAAATTGGAAAACCA ACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTTTTGGTAATGCTAAAACTG TTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTAGGAGAATCTGGAGCAGGAAAAAC TGAAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACTGCTGTTGCTGGCCGTA ACCAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCAAGGGAAATTGGAAAAC CAACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTTTTGGTAATGCTAAAAC TGTTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTGGTAAATTCATCAGAATCATGT TTGACAGCTCTGGTTTCATCTGTGGAGCAAACATTGATCAATACTTGCTG GAAAAAGCGAGAATTGTTCGTCAAGCACCTGAGGAACGTACTTTCCACAT CTTCTACCAATTGTTATTGGGAGCTAGCCCTGAAGTCAAAAGGTAAATTC ATCAGAATCATGTTTGACAGCTCTGGTTTCATCTGTGGAGCAAACATTGA TCAATACTTGCTGGAAAAAGCGAGAATTGTTCGTCAAGCACCTGAGGAAC GTACTTTCCACATCTTCTACCAATTGTTATTGGGAGCTAGCCCTGAAGTC AAAAAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACTGCTTACAATTTCATGTCCAA CGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGACCGTGCCGAGTTCAAAGCTA CTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCACACAAGAAGAATTGGACCCC ATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTTTTTGGAAACATGGAATTCAA ACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTTGCCAGACAACACCATTGCTC AAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTGTCACTGATTTCACAAAGAGC TTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGTGAATTCACACAAAAAGCTCA AACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGAAGCCATTTCTAAAGCTACCT ATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTCGCATCAACAAATCTTTGAAC AAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATTGGTATCTTGGATATTGCTGG TTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGAACAACTTTGTATTAACTACA CCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACCACACTATGTTTGTTTTGGAA CAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACTGC TTACAATTTCATGTCCAACGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGACC GTGCCGAGTTCAAAGCTACTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCACA CAAGAAGAATTGGACCCCATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTTTT TGGAAACATGGAATTCAAACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTTGC CAGACAACACCATTGCTCAAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTGTC ACTGATTTCACAAAGAGCTTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGTGA ATTCACACAAAAAGCTCAAACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGAAG CCATTTCTAAAGCTACCTATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTCGC ATCAACAAATCTTTGAACAAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATTGG TATCTTGGATATTGCTGGTTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGAAC AACTTTGTATTAACTACACCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACCAC ACTATGTTTGTTTTGGAACAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGGTATTGATTG GAAATTCATTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTG AAAAACCAATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCC AAGGCTACTGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAA ACATCCTAAATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCG TTATCCATTATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACC AAAAACATGGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATC CAAAGATTCATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGGTATTGATTGGA AATTCATTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTGAA AAACCAATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCCAA GGCTACTGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAAAC ATCCTAAATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCGTT ATCCATTATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACCAA AAACATGGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATCCA AAGATTCATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGACAACATTGTCGGT ATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGAACCAA AAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGACAACATTGTCGG TATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGAACCA AAAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGGAACAATTGGCT GGTCTTATGAATACATTGCACAGCACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTAT CATTCCAAATTACGAAAAACGTGCTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCC TTGATCAATTGAGATGTAATGGTGTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGT CAAGGTTTCCCCAACAGAATCCTCTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGA AATCTTGTGCCCTGGTATTGTACCAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAG CTGCTCAACAAATGGTATATTCTTTTTCTGAACAATTGGCTGGTCTTATG AATACATTGCACAGCACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTATCATTCCAAA TTACGAAAAACGTGCTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCCTTGATCAAT TGAGATGTAATGGTGTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGTCAAGGTTTC CCCAACAGAATCCTCTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGAAATCTTGTG CCCTGGTATTGTACCAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAGCTGCTCAAC AAATGGTATATTCTTTTTCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000186_pilon | genome | sc0000186_pilon:412918..419073 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1945-2235:292 |
| Aaloc | 1846-1944:564 |
| Aaloc | 1498-1842:1073 |
| Aaloc | 880-1494:1881 |
| Aaloc | 715-876:2249 |
| Aaloc | 514-714:2614 |
| Aaloc | 328-510:3127 |
| Aaloc | 1-327:6157 |
|