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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041299 ID=XLOC_041299|Name=XLOC_041299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGACGATGAACTAAAGTATCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTC
TGATCCAGTTGCACATGCAGAATGGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTC
CAAGCGAAGATCATGGTTTCCTTTCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGG
GATAAAGTTACTGTCCAGCTCGATGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAA
GGATGACATTCAAAGAATGAACCCCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATA
TGGCCGACTTAACTTGCTTAAATGAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAA
GACAGATATTTCTCTGATTTGATCTATGTAAGTGTGCTCAATCAGCACCC
AGTTCTTTTTTATTGTCTATTAATATTACTCTGCAATTCTAGTACAGTTT
ACACTTTTCCCAAATTCCTGCCCGGAAATCAAACTAAACAAATATTTTTT
GCTCCTGCATTTTGTTGAGAGAAAGTACAGTTGACAGCAAGTTTAGACAG
ATTCTGTGTCAAAGTCATTTTCACCTAAATTGTATCAGCTACCTTATCAG
CCCTTTTTACGCTGGCGCTAGTTTACACTTTTCCCAAATTCCTGCATGCC
CGGAAATCAAACTAAACAAATATTTTTTGCTCCTGCATTTTGTTGAGAGA
AAGTACAGTTGACAGCAAGTTTAGACAGATTCTGTGTCAAAGTCATTTTC
ACCTTTTAACGCCGGCGCTAATTTAACGCCGGCCCCTTTTTACGCCGGCC
CTTATTACTATGCCACAGCCTGATTTTAGGCTTATGCCAATTATTAGGGC
CGTAAATAACCCCAAAATCTTTAGAACAGCTATTTATGCTTCAATTTTAT
ACATCAAAATATCATTTTTCAGTATAAACTGTTGAAAAATCCATTGAAAA
TCACTGATTTTTGCAAAGTTTTAGATATGCAGTATAACAATGGATAATTT
TTGGACCTACCCCGGTGGGGTAGAGGTCCTATAAATTAACCGATGTCCGT
CCGTCCGTCCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAGGA
TTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAATGATGCAAAATGGTAA
TGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAATCATTTCCGGCC
GAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCAA
GATTTCATCATTAGTTTTTTCAGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTAGC
AATGCCTAAAACATGGCAGAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTTTTCCGG
CCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCAT
CGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTAA
TAGCAATGTCCACGATCAAGCATGGTTCAATTGTCGATAAAACTGATTTT
TAAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAACAGCCGATTTTCTCCGGAA
AAACGGTATTTCTTGAATTTCTTGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAA
TTTTTGCACACTAATGTAAAATGACAATACCTAAAAAGTGACGGAGCCCG
ATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAGTGCCGGAAATATGCCGGA
AAAACTGGTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTCTG
ATTTTTTGCTCTAAGATGCGTATTGATATTGCCCAAAACATGGCTGAGTT
CGATTTTTGAGAATTTTTTTTTTCCGGTTGAAAATGCCGGAAATCGCCGT
TTTTGCAGATTTTCATTAGATTTTTTCCTTGTATTTCTATGTTTTTGACA
CAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTC
AATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTAATTTTTTCCCTACA
ACCCTTCCCTCTCCCCTTATCAACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTAT
GCATTTTCGCTAAACGCTATGTTTTCTGACTGATTTTTTTTCATTTTTCT
CCTTGCATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCT
AGCTTGTTTTATCTTGAAATCATATTCACAAAATCCTTTAACTAGAGAAA
AATGGTAAAAAATTAACGTTACTTTTAAGTAAAATTTGCAAAATTTTGGC
CCTTTTCACACCGCCCCTTTTAATGCCAGCCCTTATTACGCCAAGAGCCT
AAAAATAACGCCAATAAGGGCCGGCGTAAAAAGGGCTGATAAGGTAATTA
TCTAAGAAATAGCAGAAAGAATATGTGCAGCATGAGTTAGTTCCTAACTG
GATTTTACCGAAGCCATTGCTTTTGATATCAAGATATACCATCGTAAGGG
CAAGTTTCGACTTCCCAGACTACTAGTGTGGATTTCGTGAATTTCCTGGG
ATAGTTGGCACAAACAAACCGGGAATTTTTTTTTCTAAAAGAAGGAAACT
GTCTAGCTTTTCAAAGCTCATTTTTCAACTACCCCAAGTTCTGGTCAGAA
AACTGGGAGAGTATTATCTTTCCAAGATAAAGAAAACCAGGGACAATTTT
TCTAAAAATCTAAAATCAGGAAAAATTTCTGAAATTAAAAGTGTTTGAGC
ATTCAAATCATTAAAAAGTTGTGTCAGACTGTCTGAAAGGTATGATAACT
AACGAGCAATTTGGTGCTAATCTAGAACTGTAAAGGTCAGGTGCTATTTC
TTTCAGCATCTCTCTGACCCCTGCCCTAGTGAGTGTCTATTCACTTTAAT
AGTGATAAAAATTGAGGAGGTGGGGTTCCAGACATGCTTCCATAGCATAA
ATTCTTAATCATCCAAAATAAGGATTTAACAGCCTTTCCAAGCAATAATA
GACTAATTTATCTTAATTGTGTCGTTGCAATTACTATCCAGAAGCCAGCT
TTATTTGAGTCAGAACGTAAAGCTCTAAATTGTGACTCTAACATACTTGA
TAGCAAAAAGTGTTTATTTCTTTAATTTAGACCTATTCTGGTTTGTTCTG
TGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGACTTCCCATTTACTCAGAGAAAGTTG
TAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGACATGAAGTCCCACCACATGTTTAT
GCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAGCATGTTACAAGATCGTGAAAATCA
ATCTATTCTTTGCACGTAAGTCTAATTATTCAGATTTCTTGTTTAAGAGG
GTTATTGTTGTATCATGTCTCTGAAAACTTTTTAGAACTCAACTGTACCA
GGCAAGAGTTATTAAAATTAAATGGTGCACTTCACTCAATCTCTTGAATT
CACGCCAGCATTTTGAAGATGAACTAAAATGGCCCAAACAGACCCAAAAT
TCCTTATTTCTGTCATCCTCATTCAATCTGAATTCACAGGGCTGCACTTA
CCTTAAAAACCTTGTTGGGATAACTTGAACTACTCTTAAAAATCTTAACT
GGGAAAACTGTTTCATTTATTGTGTATATTTTTGTTTTTCAGAGGAGAAT
CTGGAGCAGGAAAAACTGAAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACT
GCTGTTGCTGGCCGTAACCAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCA
AGGGAAATTGGAAAACCAACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTT
TTGGTAATGCTAAAACTGTTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTGTAAGT
ATTATAGTTTTTTGCTGTATATTTTGTGTAATAGAATGAAACTAATTAAT
AAGTAGAGACTAGTACAATAAACTTTAGACTTTTCTTAGACGAAATTGGA
AGTTCTCTGAGTGTTTTAATAAAATATTGTTTTTAAATATTTCTCACTTC
TGCTTTAGGGTAAATTCATCAGAATCATGTTTGACAGCTCTGGTTTCATC
TGTGGAGCAAACATTGATCAATACTTGCTGGAAAAAGCGAGAATTGTTCG
TCAAGCACCTGAGGAACGTACTTTCCACATCTTCTACCAATTGTTATTGG
GAGCTAGCCCTGAAGTCAAAAGTAATTAATTCATATTCATATTATATCTT
GAATATCTTTTTTTTTTTTTAATGTACTAATGCTCAATGCATGAAAAGAT
GAATTGTGTCCATTGCAATGCTTTTCTTGGTTATCACCCTTCAATTGCTA
TACTATTATGAATTGTGAAGACTTATCATGTTTCAAGCATTATTCATCAT
TAGTGACATTTTCTTCATTTTTAGAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACT
GCTTACAATTTCATGTCCAACGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGA
CCGTGCCGAGTTCAAAGCTACTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCA
CACAAGAAGAATTGGACCCCATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTT
TTTGGAAACATGGAATTCAAACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTT
GCCAGACAACACCATTGCTCAAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTG
TCACTGATTTCACAAAGAGCTTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGT
GAATTCACACAAAAAGCTCAAACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGA
AGCCATTTCTAAAGCTACCTATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTC
GCATCAACAAATCTTTGAACAAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATT
GGTATCTTGGATATTGCTGGTTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGA
ACAACTTTGTATTAACTACACCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACC
ACACTATGTTTGTTTTGGAACAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGGTATGAAT
TTGTGCTGAAACCTTTTATTATTGAGTTGTAGGGTCAATGACAGTGTAAA
CTGCATCTTGTAACTTTCATTTTATGCCATGATCTCTTTATCTCTGAATC
TTGCCAATATATTTATTGATTATGTGAAAAGTGATCTACTTTTAAACAGA
ATCTTTAATACTTCTCTAATTTTGCTCTTCAGGTATTGATTGGAAATTCA
TTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTGAAAAACCA
ATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCCAAGGCTAC
TGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAAACATCCTA
AATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCGTTATCCAT
TATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACCAAAAACAT
GGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATCCAAAGATT
CATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGGTGAGTAAATCACAATTTAT
GATCAACAAATATTGGTTTCAAGTGAAGTTATCAAGACTTTTCAGTAATA
GAAATAGTTTAGGATTGCTTTCTTGATGGTTATGATACGGAGTCGCAACT
TTCAGAATACAGCATCATAAAATGATTTTTTTTGCTTTTAGACAACATTG
TCGGTATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGA
ACCAAAAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGGTAATTAA
AAACTTTCATTTTCTTTATAAAATGAGAAAGTTGCCTCAAATCACAAAAT
CAGTGTTCTACTTCCTAAGAATTAAGTTTCATTGCCAAAAAGGCTTTCTA
TTGATGATTTATGAATTACTGTTTTATGTTGTTCAAAGCCATAAAAAATT
ATTTTGATATTTAAGGAACAATTGGCTGGTCTTATGAATACATTGCACAG
CACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTATCATTCCAAATTACGAAAAACGTG
CTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCCTTGATCAATTGAGATGTAATGGT
GTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGTCAAGGTTTCCCCAACAGAATCCT
CTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGAAATCTTGTGCCCTGGTATTGTAC
CAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAGCTGCTCAACAAATGGTATATTCT
TTTTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- >XLOC_041299 ID=XLOC_041299|Name=XLOC_041299|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4470bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000186_pilon:412918..419073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGACGATGAACTAAAGTATCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTC
TGATCCAGTTGCACATGCAGAATGGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTC
CAAGCGAAGATCATGGTTTCCTTTCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGG
GATAAAGTTACTGTCCAGCTCGATGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAA
GGATGACATTCAAAGAATGAACCCCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATA
TGGCCGACTTAACTTGCTTAAATGAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAA
GACAGATATTTCTCTGATTTGATCTATATGGGTGACGATGAACTAAAGTA
TCTTATGGTGGATCGCAGACAAGTGTCTGATCCAGTTGCACATGCAGAAT
GGGCTTCAAAAAAATTATGCTGGGTTCCAAGCGAAGATCATGGTTTCCTT
TCTGCCAGTATCAAGAAAGAAGATGGGGATAAAGTTACTGTCCAGCTCGA
TGGAGGAAAAAGTGCCACCTTCCACAAGGATGACATTCAAAGAATGAACC
CCCCGAAATTTAATAAAGTTGAAGATATGGCCGACTTAACTTGCTTAAAT
GAAGCTTCGGTCTTGAACAACTTGAAAGACAGATATTTCTCTGATTTGAT
CTATACCTATTCTGGTTTGTTCTGTGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGAC
TTCCCATTTACTCAGAGAAAGTTGTAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGA
CATGAAGTCCCACCACATGTTTATGCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAG
CATGTTACAAGATCGTGAAAATCAATCTATTCTTTGCACACCTATTCTGG
TTTGTTCTGTGTTGTTGTCAATCCTTACAAACGACTTCCCATTTACTCAG
AGAAAGTTGTAGCCTTGTACAAAGGCAAAAAGCGACATGAAGTCCCACCA
CATGTTTATGCAATTGCTGACTCTGCTTTCAGAAGCATGTTACAAGATCG
TGAAAATCAATCTATTCTTTGCACAGGAGAATCTGGAGCAGGAAAAACTG
AAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACTGCTGTTGCTGGCCGTAAC
CAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCAAGGGAAATTGGAAAACCA
ACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTTTTGGTAATGCTAAAACTG
TTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTAGGAGAATCTGGAGCAGGAAAAAC
TGAAAATACCAAGAAAGTTATTCAATACTTGACTGCTGTTGCTGGCCGTA
ACCAAGGCAAAGTTGATACTGAGGACAAAACTCAAGGGAAATTGGAAAAC
CAACTGCTACAAGCTAATCCAATCCTTGAAGCTTTTGGTAATGCTAAAAC
TGTTAAGAATGACAACTCATCTCGATTTGGTAAATTCATCAGAATCATGT
TTGACAGCTCTGGTTTCATCTGTGGAGCAAACATTGATCAATACTTGCTG
GAAAAAGCGAGAATTGTTCGTCAAGCACCTGAGGAACGTACTTTCCACAT
CTTCTACCAATTGTTATTGGGAGCTAGCCCTGAAGTCAAAAGGTAAATTC
ATCAGAATCATGTTTGACAGCTCTGGTTTCATCTGTGGAGCAAACATTGA
TCAATACTTGCTGGAAAAAGCGAGAATTGTTCGTCAAGCACCTGAGGAAC
GTACTTTCCACATCTTCTACCAATTGTTATTGGGAGCTAGCCCTGAAGTC
AAAAAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACTGCTTACAATTTCATGTCCAA
CGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGACCGTGCCGAGTTCAAAGCTA
CTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCACACAAGAAGAATTGGACCCC
ATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTTTTTGGAAACATGGAATTCAA
ACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTTGCCAGACAACACCATTGCTC
AAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTGTCACTGATTTCACAAAGAGC
TTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGTGAATTCACACAAAAAGCTCA
AACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGAAGCCATTTCTAAAGCTACCT
ATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTCGCATCAACAAATCTTTGAAC
AAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATTGGTATCTTGGATATTGCTGG
TTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGAACAACTTTGTATTAACTACA
CCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACCACACTATGTTTGTTTTGGAA
CAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGAACAATTCTTGTTGTTGGAGCCAACTGC
TTACAATTTCATGTCCAACGGAACTGTCTCTCTTGCCAACATGGACGACC
GTGCCGAGTTCAAAGCTACTCTTGAAGCTATGCGTGATATGGGAATCACA
CAAGAAGAATTGGACCCCATTTTCAAAGTTATTTCTTCCCTCTTGCTTTT
TGGAAACATGGAATTCAAACAAGAACGTAAATCAGACCAAGCTACTTTGC
CAGACAACACCATTGCTCAAAAGATTTGCCATCTTTTAGGAATGCCTGTC
ACTGATTTCACAAAGAGCTTATTGAAACCAAGAGTTAAGGTTGGTCGTGA
ATTCACACAAAAAGCTCAAACCAAAGCACAATGTGAATTTGCTATTGAAG
CCATTTCTAAAGCTACCTATGAACGTCTGTTCAAGTGGTTGGTTGGTCGC
ATCAACAAATCTTTGAACAAAGGAAAACGTGATGGCAACTCTTTCATTGG
TATCTTGGATATTGCTGGTTTTGAGATTTTTCAATTGAACAGCTTTGAAC
AACTTTGTATTAACTACACCAACGAGAAATTGCAACAACTTTTCAACCAC
ACTATGTTTGTTTTGGAACAAGAGGAGTACCAAAAGGAAGGTATTGATTG
GAAATTCATTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTG
AAAAACCAATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCC
AAGGCTACTGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAA
ACATCCTAAATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCG
TTATCCATTATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACC
AAAAACATGGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATC
CAAAGATTCATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGGTATTGATTGGA
AATTCATTGATTTCGGGCTGGATCTCCAACCTACCATTGACCTCATTGAA
AAACCAATGGGTCTTTTGGCTCTCTTGGATGAAGAGTGTTGGTTCCCCAA
GGCTACTGACAAATCATTGGTAGACAAATTGAACAAACAACACTTGAAAC
ATCCTAAATACTTGAAGCCTGACTTCAGATCCAACTCAGACTTCTGCGTT
ATCCATTATGCTGGACGTGTCGATTACTCAGCTACCCAATGGTTGACCAA
AAACATGGACCCATTGAATGACAACATTGTATCGTTAATGACTCAATCCA
AAGATTCATTCATTTCAGGATTATGGAAGGATGTTGACAACATTGTCGGT
ATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGAACCAA
AAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGACAACATTGTCGG
TATGAGTGTTGCTGACAGTATGGATACTGCCTTTGGTGCTTCCAGAACCA
AAAAGGGAATGTTCAGAACAGTCTCTCAATTGTACAAGGAACAATTGGCT
GGTCTTATGAATACATTGCACAGCACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTAT
CATTCCAAATTACGAAAAACGTGCTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCC
TTGATCAATTGAGATGTAATGGTGTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGT
CAAGGTTTCCCCAACAGAATCCTCTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGA
AATCTTGTGCCCTGGTATTGTACCAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAG
CTGCTCAACAAATGGTATATTCTTTTTCTGAACAATTGGCTGGTCTTATG
AATACATTGCACAGCACCAAACCCAACTTTGTTCGATGTATCATTCCAAA
TTACGAAAAACGTGCTGGAAAAATTGACAACCACTTGGTCCTTGATCAAT
TGAGATGTAATGGTGTCTTGGAAGGTATCCGTATTTGTCGTCAAGGTTTC
CCCAACAGAATCCTCTTCCAAGAGTTCAGACAGCGTTATGAAATCTTGTG
CCCTGGTATTGTACCAAGAGGATTTATGGACGGACGTAAAGCTGCTCAAC
AAATGGTATATTCTTTTTCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000186_pilon | genome | sc0000186_pilon:412918..419073 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1945-2235:292 |
| Aaloc | 1846-1944:564 |
| Aaloc | 1498-1842:1073 |
| Aaloc | 880-1494:1881 |
| Aaloc | 715-876:2249 |
| Aaloc | 514-714:2614 |
| Aaloc | 328-510:3127 |
| Aaloc | 1-327:6157 |
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