|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000145_pilon:348807..356958+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_041168 ID=XLOC_041168|Name=XLOC_041168|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:348807..356958+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttttaggagGTGCTCAAAAGGATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTC
CGATCAAAACATCCAAAAGGATAGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttct
caatttttttcttgaatttattTCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCG
ATGCTTAAACCAAAGGTTTTGTCAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGA
TGGTGTCATCAGTACAATGTGAGTATTTCAGCTTTTAAATGTTCACCACC
ACAAAGCCAAAGAGCAAAAGctattcaaaaaaaagttttgctgaattttg
ttttttggagGTGCGTGTTGGCTTGACACTCGGATGTATGGCCTGAACTT
TTTCAGGtcacttggaaattttgaacttaaaaAAGTCCCAAACATGACCT
GAACTTGGCTTGCACATATTTGGGGCATGTTTTTGCTTTGGGACACAGGC
aggcagtcaggcacatcctggcaaatgaacggggtatttttcacttgatt
ggtggcaaatgcaaggggtcaaaaacaaaagtgatgtaatagcactgaat
accccacgcaattgaaccgggttggaaatattttgcttcatttcaaagaa
ctgcatagatgaaattttttttccatgggtcaattttttattcgaagatt
gaagaaacttttaacgaaaaaataaagttcccagttttcttccttttttc
ccattttcagtttgaagttcatttttattcattttcacgcttttagcctg
agacgtcctatctcatatcatttacactgggtgacgaataccccatgcaa
atgctcaccccgttcatttgccagaaTGTGCCTGACtggcaggctagctc
taaagctctacaacagcatctaataacatgaaaaccagaatatgagtctt
gcttcaatgggaatcaaaactttaaattgcacttacaaacatcaatatgt
cagatctaacaaaattaataacggcactgtcatcattgacagttttctgt
caagagccttgtaaacatattccaacaacttccatcaaaatgatctatca
cagctaagtctaccatttttagcgcagtccgaggattgagccgagaacgt
tTGCAGAACGCCTGCTAGCTCCCGtacgggtgaaaaactttaatccgtca
atcattttctcaagcaaagagtacgcaaagcgattATAGCTTTACGACAg
agggggggtcaacatttataataccaacccatagcccaaaaacccgactt
ttgaccttttgagctaagttaacaccaccaccccaaaattggtatcgata
ccaacttgaaaatcataattttcagaaaaaggggggacccacccccttaa
tttggtatcgataccaacatgattttttgaatttgacagtggaggctaac
atgcatagccctcaaatgaatgacctggcaggtcattaaaatacaactac
gcagcccTGCTCGCATatttactctaccattttatttttaatttaacttt
gtattttaatgaccagccaggtctttcatttgagggctatgcatgttagc
ctccactgatgcaagttacccaatctcacggtaccaataccaatctgaca
aatttgagtttaaaagctgtttaaaggggacccatcccctcccacacaaa
cagggtactaagagaaacttcaaaaaaactcatttttgaaatactctttc
ttcaacacaacacaaaaaatgtcattatactaaaatagaaaatgactgaa
aactgacaatatgataaaaacaaacccaatgaaacttttgaatgttttaa
aatttcgaatatttttttcgaaaattcgaatGTCTTTCAAATGTACTTTg
cacattcgaaattcgaattttcacaaaaaagaaaaaagaaaaataagatt
taTTTACTCTGGTTTGTTTGATACTTATACTACATCCTACTTGATcaagt
ttgttttggtgttAGAGTTTTACCTTTATACAAAAACGACCAAGATGATA
AAGAAATACAGACTGTTTAATTTTTtcggggtattttctagctataaggg
caataattaggaaagttttgctgtcattttgatatggataccaactttct
gaatcatattatttaaaaaaaggggtacccacccctattttggtatcaat
gcCAACcgaggataactctttttttctaaaaaagggggacccacccccat
caataccaacttgacttttcagacttttaaaggaaaaaaagacaccacca
cccggctattgGTCTGGTGGTTATCATTATACTTTTATTTTGATTCCTAG
aactttggaaaaaaaaaggaaaaatagaaaagttgtatttttactGCTCT
TTTCACATACTGTACTAAATAAATACGTGAAAGATCTTAAACTATGTCGT
Gtctttttgcaaacttcaaaaaactgatttttgccctgcttttgcgggac
tttagcttaagtgcttgcgtgcagcatagggtacaaagtccaaatatgcg
tttccttACAGCATTGAGCTTAAAGCCCAAAgtgctagagtagaatctct
aacctttctcaggcaagaaagagtgtttttaaaagccaattATTTCCCAT
CAAGAATGTGCCTAGAATGCACCGCAATCATTACGATGGATTGTATATCT
AgcagttcatttgttttttgaggactgcatttttaaAGTTACTTCATCTC
CCATCCAAGAGTCTCAAGTCTAGCCCTCCAGGCTTTGAAGTCAATTTCTT
ACAGATACTCAACATGGATTTTGCAAAAAGATATCATGCAAGACTCTTCA
AACAATTTGATTCATTAACAAAATCCTTCACTTTTGTTCGATTGGATTAA
GGTTACAGATAGGGCtcctttgaagaaaatcttttttttacatcaaaaaa
tttttttctgctgTAAAAGATTCAACATTTTACAGACCATCGAATGATGC
ATCTCcctaaacctaaaaatgtatcaaaattgcaaaaaatgctaaaaaca
ttATCGATGTATAATCCCTATTGATTGAGCCTTTTATTCGAATTGTAAAA
GAAAACTGTAAAGGGAAGCGACGATTATTTCGATATCCCTATTATAAAGT
CTTACAATGGAATAatgcagggctgcaaataaatatttttagtcaatcga
ataggctaagtaagagacaagggtgtaagagatttattttcaactctcaa
gttaatggtttattccttttttcattcggacatcacgaccgacacaaaag
attttcagtcggtcaaatagctttatcagtcggacattgaccgatgaccg
acgcttatttgcagccctgataatggtctttttacttttcaataaaagag
gGGGAATTTTTCGGtaaagatgaaaatattttaaattttgaaataactca
gaatcacaatttcttcaaaaatccagTGTACATACCAACTTTGAAAGGTT
ACTCTACAAGATCTGGTTGGTCGATATTTCAGAAACCTATGTCATTCTAT
TCAGAAAAGATTGAATAGCAAAACCCTGCCTCCGATTGTTAATTCGAGGT
TTTGTTGTGGAGAAAATCGCTTTAAACgtgaaaaacctgttttttaacaT
CGCATAacatgaaaagtaaatatcttttGAATAGGGCGTGTAAATGATAA
AGCGGAGCATGGTTTTGTAGGGGAGAACAAGGGCTTTCGAATACAAAagg
tttcattgaaaaatattcagtaGATTTGAAGAGTAACTCGTCAAAGTTCA
AAGTTTGTCTTTTGAAATTGCGTCATAATtccaaattagaaaaatatgtc
GAAAAAGTAATTACATATTTAGAAAGCCATTGAATTGCACTTTAACCACT
CCAGTCcaatttcatcaaagaaagGATGCtaaacaattaatgattaaaaa
taatttaaaaaatgatttaaaaataatcaaattgacCTATCTGTAAcctt
aaatttttcttcaattaaAGAAAACTAAGGCAACCTTTTTTCGTAGCATT
ATATACTGGGTGTGATTTGATATTGCAGGCAGTAGCAGAAGAATTTGTTT
CGGAATtattcagaggaaagcctaacttaaaatttggtgtattacttatt
aatttttcttcattggttcaaatattattatgttcaaaaacctaaaatgt
caattttaaaaaatgtcaaaaaaggctaaaaacaaaGGTATCACTTTATG
AGAGAAACGACTTTTCTTTTACCAAAACATTAAAGTACAATGTCTTGCTC
CTTGTAACactctttattttttctttatctcttgtctttttttacttctg
tttttCCCTTGGGCATAAACAAGATGCCGAATGCTTCAAACCCCACagaa
ttttcaacatcttcccaagagtttccaaaagtttttctgTGTGTGCACCA
TCGTTGAGAAAGGTggagatttttgagaaaaatgcttCATTTGAACTATT
GCAGCTCATCTCGACTCACAGATGATGGAATGTATTTACAGGGATGCATA
ATCTTGTAAATAAGTGCTTTTTACATaatgaaaatacattttgtGATGCA
TAAAATCATTTTGGGCCATTTATCACAATCAATTTAATACTCTCGCtttt
cgcctttttctgccattttttaaaattgatattttaggtttttgaacata
acttttgaactaatgaagtaaaattaaaaagtaacacaccaaattttaag
ttaggcttaactttcctctgaatgattccgaaatAATCTTTGAgaaatct
cttttctactgcctacaatatcaaatcaaagagggtaacttattagTGGT
AAACCCGGTAGAATCTCTTGAAAAGTAAGTTTTTAGGCAAGAGGTAACTC
TGAACGTGATGTATCCCAAATATTTCAAGATAGATTGtatctttttatca
ttttgagcATGGTATTTCCAACCACTGAAGTAAGGTTTAAAAAAGCTTTG
AGAAAGTACCAAAATAAATATTCCAAGGATGAAGACAGACAGTCCTTAAT
AAAGAAGAACCTAACCTAACCTTAGTTAATCTATGCTAACACTCATCCCT
ATGACTCAATTTTTAACTTAACATCATCTCATTGAATGATTTTATCAAGT
GCTCCTCAGCTGCTACAATGGAAACTATTATTAAAGATGAATCAAGAACT
TCAAAATCTCTCAATGTAGAAGTCAAAACCTGAAACTTGTAgcttgaaat
atgaaaaaaatactttagaAGTTGAGAtattgtttttagaaaaaatgtgA
CTCTGTTGCACACATTCTGTTTTACTTTGATTGACTTCAGCTGTTTGACA
TATTACTTTCTTGTGTTCTGATCACTTCTTTTGTAATATTATTATCCAAA
GCTCTCACCTGATTCAATTCatttattgattttaatattataaaatatgt
actagttatcgcatgatttcgagtgcaatacgagaaatattttacgagtt
ccgagatttttccgtaatatttttccgagcctttaggcgaggaaaaatat
cggtaaaatctcggaacgagtaaaatatcgagtattgcacgagaagtcat
gtgataactaatttattgtcgactcaaaaaaaatgtcctctttttgtttc
aaaacttacttccgccttcttctgcttctgtgtagtttggaatgttttta
ttcgaaattctaattcgaacgttagattcaaacaaaaacatttgataact
tcccgctgaaaatattcacacaaaaacaaaacttttcgatcattttcgat
ccagAagttttGttttgAaaagttgcagatttttcagagatgtatttgaa
agtttctagattgataattcaaaatgcagatgataCAGTATTGGTTTCGG
AGAAGAAACCCTCCATCATTGGATTCATCGATTGATAacatcagtctttt
tctatttttttgtttcgatgacatATGGCATGGGAAagatagcagaggaa
aggagtcccacgatggaaatgtatgcttgtaataatggttaaagaacaac
attttttcaacagcaaaacaatttggatattttcttgattatcgtcaagc
tctaaatgtttcgaatttgagttgaaaagtcaaggacgtacgttgttgtc
gagaacgagaattaggagagaacttttataaaaatcactcgtcatttggt
ttaatacaagacattacacttcccttgttatgttatgagaaattttattg
gccaacattcaagaatctcaagttattTTGtgtgcattgataaaaaactt
tttggttatcacacggacaaatttgccaaaagttgaaaatatttgggtgg
tgtcaagtagttttataatttcttagttcatcagatttgattttagtgtc
ttttatggaagaactccaaagtaaaagttaatctgaacatatttttgttg
cgttttaacATAATTTGTTGACATAATTTTGGCTTGtacttaatttggca
gatggccaaaatatgatttttggcgggtatttaatttggcaatGATAGAA
TTTGTATAATTTGGTCGGAATTTTGTTTGCAAGATGGGGAAATTTTAGGC
ACTTGTAAATCAAAACTTATTggtattttaacattttttacttcaaaatg
ctttcatagaatttctatcttaaaaagatttttttttcaaatttggggGT
ATTCAATTTGGCTGATTTACCAAAAACCGCCAAACCTGCCAGATTTAATC
CCCaccaaaattaatacacttaaagtttttaaataatattgATATTAGTG
ATCGAGGCTAAGGTACCAGTTtatatattcaaaatatatattatattctt
TTTGTTAGGCTTTTAAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTC
TAATGTGAACAAGGACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCT
GGGGTGCTTATGAGAAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTA
AGAGTTATGTTTATGGATTGTGAGGTTTGTTTTTCTACTTTTGATACAAG
TTTTTGAGGTTTGGTTCACTTATATACATTCCCAGGATGCAGAGGATATT
TTCCCATAATCTACCCAGGACATTTCTATCTTTCACCCGACATGTCTTTT
AACCCTGGAAAAGTATCAAATGGCCCCTTAGATTAAAAATGCTTCTGGAT
ATTGCAAATTTACCCGGTGGATATGATGGTTTTTCAAAGTATTttccctg
gacaatatatccccCAACTCCTATgtacggttttttttttggaattagcC
CAATGCTGAATCAACTAATGTGtaatattaatatttttgtttggatttaT
TTCTAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGCTGTTTTATTATG
TATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAAAGTTTAAGGTGA
GCAAACGTATTATACCCAGTCAAAGTAGCAAATCAGTTCTTTGAGGATTC
ATAATACATTGAAAATTTAGCACGCTAAAGATATGTAAGTGGATGGAAAT
ATTGCTAGTAAAATAAATGTTTCTATCTGTTACTTTCCTCTTGTTGGTCT
CGAGATGTTGCCTCTTGGGAAAACTATTCTCTATTACATCATGCATTGCA
GTGTTTAAATATGCCTTACACTAACGCGTAACATCTGACAACATGTTGTC
GTGAGTAACATCAAGAActattctgataaaaaaaaagtatacaattATTA
CATCTATGatgcagatgagatggagtttttataagatactttaacaattg
gtcatttgaagtaataaagtAGCAaagttgttttattactggttaacgac
caaccaaatcaaataagagcttgtaaaagctccaTCTCGTCCCCTGTGAT
gtgacatacacgtttttttataagagcatccaattttttaaagccatcgg
atgttcctaactttttgagtcttaagcctaaaaatgttcttaacatgttc
taattttcaccattttcctaaaaatggggtgttttagagtccgcaaagcc
ttaaatgttcttaactttttcttaatattttgggcatcgaagccttatgt
tcttataaaaaaacatttttgtgaaTATTCTTTCTTCTTGATTTTCAGAT
GGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAACTCTTTAGCTT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:348807..356958+ >XLOC_041168 ID=XLOC_041168|Name=XLOC_041168|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1056bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:348807..356958+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttttaggagGTGCTCAAAAGGATTTGATTTAGCAATATCCCGTGATTC
CGATCAAAACATCCAAAAGGATAGCCGAGCAGTGAATCCtgaatttttct
caatttttttcttgaatttattTCTCATTTGCTTCAATCATTCATTAGCG
ATGCTTAAACCAAAGGTTTTGTCAGAAGTTTTGGGACAAGCAAACTCAGA
TGGTGTCATCAGTACAATttttttaggagGTGCTCAAAAGGATTTGATTT
AGCAATATCCCGTGATTCCGATCAAAACATCCAAAAGGATAGCCGAGCAG
TGAATCCtgaatttttctcaatttttttcttgaatttattTCTCATTTGC
TTCAATCATTCATTAGCGATGCTTAAACCAAAGGTTTTGTCAGAAGTTTT
GGGACAAGCAAACTCAGATGGTGTCATCAGTACAATGCTTTTAAACAATG
AAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGTGAACAAGGACTCAAAG
ATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTGCTTATGAGAAAGGAGG
AAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTTATGTTTATGGATTGTG
AGGCTTTTAAACAATGAAGGATCTTTGTTGGCGTATGCTGGCTCTAATGT
GAACAAGGACTCAAAGATTACAGCTGCTGTTGCTTCCAATATCTGGGGTG
CTTATGAGAAAGGAGGAAAAATGGCATTTAATAATGAAGGCTTAAGAGTT
ATGTTTATGGATTGTGAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGC
TGTTTTATTATGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAA
AGTTTAAGGAAGGAAAAGTTGCTGTTACGAAAATTTCTGCTGTTTTATTA
TGTATGTATGCTCAACCGACCGTCGGCTTGGGGATGTTAAAGTTTAAGAT
GGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAACTCTTTAGCTT
AAATGGAAAAATTGGCTGAATATCTACACGAACCATTGAACAACTCTTTA
GCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000145_pilon | genome | sc0000145_pilon:348807..356958 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 475-528:8099 |
| Aaloc | 385-474:7307 |
| Aaloc | 220-384:6810 |
| Aaloc | 1-216:1 |
|
