XLOC_041163 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_041163
Unique NameXLOC_041163
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000145_pilon:171730..183415-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_041163 ID=XLOC_041163|Name=XLOC_041163|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:171730..183415- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAAGCGTTCCGGATTTTACTAAAAGAAAGCCCGTGATCTTAGCTTTCCAG CGGTATATAACACTATGGACTTTTTGAATTGTCTTCTGACGGGAGAAAAA GAATTTGCAACTATCGACGAACAAATGTTTCTGAAAACAGAGGAAAATGT TGTTGAAGGCTGTAACTTTGTATGTTTATCAGAAAAAGGGTGATGAATTC AAAAATCACATTCGCTAATTTTAATTCTTTCATTTTCATGTAGTTTTTTT CTCACTTTTTTGCTTCTTTAACATAGGAATGTCCCAAAAAAAAGTTTATA TTTCTGCCGAAATGGATTTTCTTTTCATTTGGGGTTTCTCCTTTCATAAA AACTTATTCTTTACTTATAACTTTTTGTTCCTCCATTTCCAGAGGCCCCT TGAAAATGGGTCCTACCACCTTTTTTGACTCATTTCAACCTTTTCCAAGC TACTTTTCTTCAAAAACAAAATAAAACAATGCAATGTCTTCTTTTTTCAA AAAAAGATATATCTTTCGTTATTTTCATAAATATACTTAATATTTTACAA ATATTTTTATATAATAGTATTCTAACACCATCAATTAGTTAAGTATTCCC AAAGTTATTCCATTTTCAAAACACAAAAAATCACCTTTTCAAAGAATCAC CTCCTTACACCATGCCAGCAAGAAATAATTTTCGAAAGCACCAAAATCAC GCCAAAAATGGCGGATGAAATCTAGTCTTCCGTGTGGCGAGGTGTGGGGA GTTTTGCCGATGCGGTCTGAAAGTCGGCCCAATGACTGTTAAACTTTAGC TTATTGCAAATGAGCTGGAAATGATAGCTAAAAACAAATTTCACCACTAG AAAGCTGAAGCTAAAATCCTCAGCTTTCAGATGGTGTATGGCACTTAAAT GAAAAAATCTGCAATCTTGTTAAAAAATAGCAATTTCTTCTATTTTTCGA 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TGATTGCTCTCGCATGATGCCGCCATTGTGGAGTTTTTTTTTTGCGTTTG CTAAATGCGATTTTGTAAGACTTTGCATTACCAACTTTTGCTTACGGCAA ACACCTGTGGCGAGGGGTTAGGGAAAGTGGGTTTTCAGCTTCTAACTTTT GATAGCAATCTTCTTTTTGCAAAAGATTTTCAGGGTGGTATAATATCATG AATAGATTGAACATACTAAAATCAAATCAAATGACTTTGGAGGTTCGGTG AAATGGTGGCCGATTTGCCGTCCCATATTTTGTCAGATAGTCCCAAGTTA GAGCAGTTGACGGTATATAGTATATACCCTAGAATCATCTATTATCGACA TCCCTCCTTTATAGTCCACACCGGATCTGTAAGATAATAAAAAAACCTTG AATGAAATTCTTGTTATCATTCTTATCAAGCAAGTTCATCTATCAAACTA AAGTTCAGTAAACATTGCAATTCTTTCAATTAAAAAAGCAGCCAAATCTG GCCAAATTATAAGCAATTTTACACAAAACATGAAACGCATGTAAACTTTC TTGTGTCCATTATTAAAATTTTACAACTTTATTATGCTTCAAGTGACTTG ATAAAAATAATTTGCAAGCTTAGTCGACCTGGTTTCCCTTTCTTTATTAT TTATTGCAAGTACACGCTCTATGCGCTAAGAGGCCGCATTAAACTTCTAG ACATCACCTCGCACACCAGCGGTCCCTTTTTAACTTATAGCAGGCGGATA AGGCAGGATGGTTGGCGGTATGGCGGTCACATTAAATTCATAAGGAAACT GGGTTCTTTTTATTATTTTCGATTCACGGTTAAAAGCCCTACTAAAAAAT TCCTAGGGTGCAAAAAGTTGTTTTGATTTTGATATCTATGTGGAAAGCAT GCTAATTACTTAGTATGGACTATATCGTTAAAGTTGTCTTTTTGAAAAAA AAATCACTACATATTTCTTATGTATCTATTTATTATGACTGAATTTTGAT TGGTTGAAAGTTTCAATATATTTCCATGCTCTGAAAACCTCCAACAACCC AGGAGTCCCTTTCATGGGTCATTGTTTTAACGCTGGAGTTTCTTCAAGGA GTATAGCAAGCAATGCAACTGTTACCATACATGATTGAGCTTTTATCAAA CAAGTTAGATGTAAAAGCTAGCCAAAATGAGGATAAAAGGGTCTGCTGAG TAATACTGGCTACCAAGGGTTCAGGGTTTGGAGCCCCTTGAAAGCTAAAT AATATGTTTTAGCGCACCCACTCAGACACTTTTTAAACTTACTCTAGTTT GCTTTCAATTTGAAGTGATTAAAAATGATAGATCAGGAGGTTAAGATGGT GATGAAATTTTACAGCAATAAAATAATTAGTGTATCACATTTTGTGATTT TTAATTTACTGACTAACTAAAATCATAAAATCAAAAATCAATCAATGTTA GGGTACTCGTTCTATGTAAAAAAAATCAGCAAAAACTGTGCTTTTTAATC AATTTAAAGGGTCAGCTGAGTTAAGCGTGGTATTTGATTAGACTTTAAAA GTGGTCTTACCTTAAAGTTAACAATTCTGGCGGGAACTTAATTAGGCAGT TGTGGCAGATTTGTCAAAAATCCATCAAATTAAGTTCTCATCAAAATGTC TTATTTGTCATCCACCAAATTTAATTTCTTTTGCCATCCGCCAAATTAAA TTCCTGCCAAATTATTGTATTCATTCCCCAACTGTATGCATTTTCAAAAT TAAATTCTCATAGAATTTGATTTTACAAGGCATTTGCCAAATTAAATTCC TGTCAAATCAAAATTTTTCTGCCATTTACCAAATTAATTCACACCAAAAA TTCCCGCCAAATTTCTTCCCAAGGTAGATATCTTAAAAGTTTACCACAGG TACTACTGCATTTTATATTCTTGGATATTCTTTCTAGGATGAGATGGGAA AAACTGATTTTGAGTTCAAAATCACTTTCTACCCAGCAATGGATAACTCT AGTAAAACAATTGAAAAAATACATTTTTGGACTAAAACAGGAACAAACAG GTTAGAGGTAGACACTTTTGGGATCCCCAGTAAAATTGAAATTATGTTGG AACTTTTTACCAAAGGTTCTTCAAGCCTCTAAGGGCCAGTAGGGTCAATT TTTATTGCAATCACTTTGTATTGGTAGTCCAATGACTGCATTACCAGAAA CAATTATTGTAAAGCGAATTTATGAGCAAAGCAGTTTTGCTACATTGTGT GCACGTACCTTTAAATTTGCTATGTAAATCACATCTTCAAACCTGTGATT TTGTCAAAATGACCTTGAATGGTTTTGCTTGAAGCCACAAAAATTTTCTC GGTTTGGTAGCTAGTACTGCGAGAAATGCCGTTTTGAAATGGTGTACCCT AGCAGTGAACAGCAAAAAAATTACCGGAAGCCGAAACACAGACTTATAGA ATCTGAAGTTGATCAAATTGTTGCGGTTTTAAATGTTTATTTTGCTGTTA AATGGAAAAAAATTAGTTTGAAAGGTGACAGAAAGGATCTTCATCATTCC TTGACTTTTAAAAGTAACTATCAAGTATCAAATATTTGCAGTTCGTGCCG GCGGGAGGAGTGTTCTTTTAAGTGAACTAAACTTACCTTGCAAAACCAAG TGGATATTCAATGACAAAGAGGTACGGAGGTAATCTAATTTATCAAATTT GTCAAGAAAACAAATCAAAATTAGCCAAGAACCAACAATAAGCTATCTTT GTAGTTTTTGCTTTTGTTTACTTTTGATGATTTCGACAGATATTTCGAAT AAAAATGTTCAAACGTTCGACAACTATCGTTTGATTTTTTTAAGGTACCA TTTACATTAGAAGAACTATAAGGAAAGAAAGAGCGTTGCGCGCGGGGTGG CGGGTGCTGTTCTGCCACGGTTTGTGTGGTGTGTTTGGGGTATTATAAGC TTAAAACCCTGTCTCTTTTTGGGCTTTATCAGAGTGGCTCTATTTTGCTA GCAACTTGCGAATTGAGGTGGAGTTTGGATCGATTCGCAACCCTTATACA ATACGGCTAGTTTTGAACAGATAAAAAATTCCCCTGGGGCTGGTCACGTA GCCCAAAGTACCCCTAAAATCAAGTTTGTAGTGTTTTTAGTGACTTCAAA GCTCCAGCTACCATTTTGAAAATTTTTTGGAAAATTTTATTTCGAAAATA TTCCCTACCCCAGTTTATTTCAACCCCCTTTTTATGAGGCACCAGGGAGT AGTTCCCTTAAGGTATCTGTTACTTTAATAAGTTAATCACTATTATTTTT ATTCTTTTTACATAGGTATTTGAAAGAATTTCGTGTTGAGCAGTGCCAAC TATTTCTTCAACACAAATGCACTCAACATAGACCGTTCACTTGCTTCTCT TGGCATTTCCTCAATCAAAAAAGAAGAAGGCCAAGAAAGAAGAAAGAAGG AACTTTCAACTACAGTCCTGACGTTTATTGTCAACATTATAATGAAACGA CTGGTGAATGCCTTAGTGGAGATGAGTATGTGATCTATTTTTTTTCTTTA GACGAGGCCAATTTAATCTGTTGTTTTATGGGCCAAGCTACCCAAAAAAA AGGGTTGGTTGGTGAAAAAAAATAGAAAATCTCCAAAAAAGGCAGTACAG CTATACAAAAATGTGAAATTGAAAGCAAAAAAAAACAACACAAAAAGCTC GAATTCATGGATAAAAAAAATTGAACATGAAATTCTCAAAGTCTTGGAAA ACTAACAAAATTTTGAAAATTTGGCAGTCTGTAAAGCAATGAAAATTGAA ATGTACTACCAAAATCAATCTTACATTTCTGGAATATCAGGGTCGGTCAG GTCAGTAAAACAACTAATCAAATTAGTGTCACCTTACCTAAAATTCTAAA AGAGATCAAAGATCCAAATTCACTCCCAATGATAGTGTTTCTTCTGGAGG TATCACCTTCTTGCGCTGCTTAATTTGGGTAGGATGCGAACCACTTTGAT GATGCGTCATTATTTTGTATCACTTTTTATGTTTGGTTATGAGTTTAAAG TCACCAAGTCAATTTTTTTGAAGAAAAAAGTGCACATGAATTTTCATTTA CAAGATAAATATTATATACTTTTGTTTCATTACTAGCTGTCCTTTTCTGC ATCGTGTAGCTGGGGACGTTGAGCGTAGATACCATTTGCGATATTACAAG ACATCACCTTGTGTTTACGAGACAGACCAAAGGGGATATTGTGTTAAGAA CGGCCCACATTGTGCTTTTGCACACGGTCCACACGATTTAAGACAACCAG TATACGATGTAAGAGAATTACAACTAATGGAGAACGAAGAAAAAGATGAG AGCGGGAAACAAATTGTACCGGAAGACCCGAGATGGAATGGTGAGAAGAA CACTTATACTATTTGCTTTTCCACATCTCTTGGGGAAAAAATTCTAGAAG ATATCCTTAGTTTTAGTTTTAATTGCAAGTCTTTTCATTAAAAGGTTTTG GGCTGATTTATCAGTTTGCGACTAATCTTTGTTTCGAAAGCATCAGTCCA CTTTAGCAGTATTGTCTTTGATTTTCTACATTTTTCTATAATAATATGTA ACCTTTAACTTAAACTAAAAGAAGAGACTTTGATCTATTTATTATATAAG TTTAATGCCGTCGTGTAGACGACAATCATCAGCTAAATGAAAATCGTTTG AAAAATATTGATATGCAATGGCTTCTTCTGTTTGAAATTCTGACGTTCTG ACTTGTAATTTAAGGTTATATTCTTGAAAATTATACACTTGCATTTCAGA AACAAATTATGTACTAGCAAATTACAAGACAGAACCATGTAAAAAGCCTC CAAGATTGTGCAGGCAGGGATATGCTTGTCCACAATACCACAATAACAGG GATAGGAGGAGGAGCCCAAAGAAATATAAATATAGGTAAGTTACAAAGAG TGATGTTACAAAATTTTCTAAAATGAAATAGTTTATAACTTCCTATGATT GACCAACTTGGATTTGACACTATGTACCTTTGCAAAAATTTTTCTTGGGC TTATGACAGATTATGACTGAAAACATCTCTTGACACTTTCGTTAGTTATC ATAAAAACAATACTGTACAGGCTCAGTGAATAATTTTAAATGTCTTGCCT CCAAAGCTCACATTCGCTTATTCATTCAGCTCACGAAGAGGCCTTTCTCC AAATGCAACACAATTCTGCAAAATTTTGAAGAATCTTGCCTGATTTATTG TTAAAAGCATTTTCCGTGAGAGACAAAAGAAACTTTGCCATTGCATACTG TAGCACAATAAAACCTGAAATACAGGTTGACCTTTTTATTTCTGACAACT CTCAAATTATTTCCGCACAATTCTTTTCTTTACAGGTCTACACCATGCCC GAATGTAAAACACAGTGATGAATGGGGTGACCCTGCAGCATGTGAAAATG GTGATAGTTGTGGTTATTGCCATACAAGGACTGAACAACAGTTCCATCCT GAAGTAAGTCAAGAGAAGTGGATTGTGGACTTTCAAAAAAGAAGGGAACC TGCAATAATTCTATACCTATAATATGAATGGGCAAAAAAATCTTTAACCC TTATGTTGAGGAGTTCATATTTTTCGCCTGAGGGGGCCAGTGAAAATCCA AGGGGAAGACCTTTGAAATTTAGATGGAAATTCAAGGGGGTACCTCAAAA ATTTGCTAAATCTAAAACCAGAAAGGGTCTCTGAAATCCTAGGAGACGGG GGATGCAATATATAATAGGGGAGTTTAGACTCATCTGCACATTATGTGTG TATTATAATGTACCCTACAATTATTTCTTTCTTTTTTTTAAGATTTACAA ATCAACGAAATGTAACGATATGCAACAGACTGGACAATGCCCTAGAGGCC CCTTCTGCGCTTTTGCTCATATTGAGCGTAAGACTACAATTTTAAATTTT CATTTCAATGCACAATTTTTCTTGTCAGATCAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000145_pilon:171730..183415-

>XLOC_041163 ID=XLOC_041163|Name=XLOC_041163|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2046bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145_pilon:171730..183415- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACATATCCCATTAGGCTTTGCGCGACTTGTTTTGCAAACAGAAAATA
TGGAGTAATGGCGGCCGATACTAATGATGTGATTTTTGGTACAAATTTAA
CACCAAAAAAGAGCTTAACTGAGCTGAATCAGCCGCAGACTGAAAAACCA
CTACACTATACAAAACATATCCCATTAGGCTTTGCGCGACTTGTTTTGCA
AACAGAAAATATGGAGTAATGGCGGCCGATACTAATGATGTGATTTTTGG
TACAAATTTAACACCAAAAAAGAGCTTAACTGAGCTGAATCAGCCGCAGA
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TGCCAACTATTTCTTCAACACAAATGCACTCAACATAGACCGTTCACTTG
CTTCTCTTGGCATTTCCTCAATCAAAAAAGAAGAAGGCCAAGAAAGAAGA
AAGAAGGAACTTTCAACTACAGTCCTGACGTTTATTGTCAACATTATAAT
GAAACGACTGGTGAATGCCTTAGTGGAGATGAGTATTTGAAAGAATTTCG
TGTTGAGCAGTGCCAACTATTTCTTCAACACAAATGCACTCAACATAGAC
CGTTCACTTGCTTCTCTTGGCATTTCCTCAATCAAAAAAGAAGAAGGCCA
AGAAAGAAGAAAGAAGGAACTTTCAACTACAGTCCTGACGTTTATTGTCA
ACATTATAATGAAACGACTGGTGAATGCCTTAGTGGAGATGACTGTCCTT
TTCTGCATCGTGTAGCTGGGGACGTTGAGCGTAGATACCATTTGCGATAT
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AACCAGTATACGATGTAAGAGAATTACAACTAATGGAGAACGAAGAAAAA
GATGAGAGCGGGAAACAAATTGTACCGGAAGACCCGAGATGGAATGCTGT
CCTTTTCTGCATCGTGTAGCTGGGGACGTTGAGCGTAGATACCATTTGCG
ATATTACAAGACATCACCTTGTGTTTACGAGACAGACCAAAGGGGATATT
GTGTTAAGAACGGCCCACATTGTGCTTTTGCACACGGTCCACACGATTTA
AGACAACCAGTATACGATGTAAGAGAATTACAACTAATGGAGAACGAAGA
AAAAGATGAGAGCGGGAAACAAATTGTACCGGAAGACCCGAGATGGAATG
AAACAAATTATGTACTAGCAAATTACAAGACAGAACCATGTAAAAAGCCT
CCAAGATTGTGCAGGCAGGGATATGCTTGTCCACAATACCACAATAACAG
GGATAGGAGGAGGAGCCCAAAGAAATATAAATATAGAAACAAATTATGTA
CTAGCAAATTACAAGACAGAACCATGTAAAAAGCCTCCAAGATTGTGCAG
GCAGGGATATGCTTGTCCACAATACCACAATAACAGGGATAGGAGGAGGA
GCCCAAAGAAATATAAATATAGGTCTACACCATGCCCGAATGTAAAACAC
AGTGATGAATGGGGTGACCCTGCAGCATGTGAAAATGGTGATAGTTGTGG
TTATTGCCATACAAGGACTGAACAACAGTTCCATCCTGAAGTCTACACCA
TGCCCGAATGTAAAACACAGTGATGAATGGGGTGACCCTGCAGCATGTGA
AAATGGTGATAGTTGTGGTTATTGCCATACAAGGACTGAACAACAGTTCC
ATCCTGAAATTTACAAATCAACGAAATGTAACGATATGCAACAGACTGGA
CAATGCCCTAGAGGCCCCTTCTGCGCTTTTGCTCATATTGAGCGTAAGAC
TACAATTTTAAATTTTCATTTCAATGCACAATTTTTCTTGTCAGATCAAT
GAATTTACAAATCAACGAAATGTAACGATATGCAACAGACTGGACAATGC
CCTAGAGGCCCCTTCTGCGCTTTTGCTCATATTGAGCGTAAGACTACAAT
TTTAAATTTTCATTTCAATGCACAATTTTTCTTGTCAGATCAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041163XLOC_041163-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000145_pilongenomesc0000145_pilon:171730..183415 -
Properties
Property NameValue
Aaloc880-1023:145
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