XLOC_040734.2 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040734.2
Unique NameXLOC_040734.2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000055_pilon:1352112..1365554-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040734.2 ID=XLOC_040734.2|Name=XLOC_040734.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13443bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1352112..1365554- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTATGTTTTGATTTAGATTTGCTCTTTTTTCAATTTTCTTTAAAATTATT TTGTTTTGTTTTGAAAAGAATTCGAATGTCATTAGTTATTAAATATGATT GTCAATTACATTCGAAAAGACATAAAAGAAAAGAGAAAAAAAGAGCGAGC GAGCAAGTCAAGGCAGAAATTAAAATTGGGCTCTTCCAGAAAAAATCCGT TCATGGGGGGTGGAGGATATTATTTTTTTCATGAATTACCCCTGGACATT TTGATTTTTAACACCATGGACATGGGTTATACCCCTGGACAAACATTAAA TCAACCCCGTGGACACAAAAAATTACCCCTGGACATTGCAATTGTTTGGT ATTTTTTCAATACCCCTGGACAATTCATCCTCCACCCCCATGAACGGATT TTTTCTGGAAGAGCCCATTGCTTAAATGTAGATGGGTGTTTAATTTCAAA ACAAAGGCCGAACGAAGTCTAAACCAGGCTCTATCAACAAAAACATTGCG AAAACGAAAGTAACACACGGACAGACAGACAAACAAACAAAGTGACATAC AGAGTACGGCTATTAATATATAGACTAGACCACTAGACCTAATTTTTGTT TTATCTGTCGAAACATGAAGCACAATTCATTAAAACGAGGACTCTAGAAA CGTGCTTAGTAGTTAAAAACCATAGCCAACTGATAATTTTGTCAAATAAA GCATTGATTATTTAAAGTGACAACATGAATTTAGTAAAAGATGTTATAAA AAACAGAGTATACATCATTCAGGCAAAATATTTTATGAAAAAAATAATTG AGTGCCCTTTTCAATACCGAGGAAAAATTTAGACCGAAAGTGAAATTTGC CACTCAATAAGTTTCTAAATTGACAAATACTAATCAAACCTGATTTATAG TTGGATTAAATGAAAAATACTGCAAAATGCCCCTTGACCGACATTCGAAA 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AACCTCTGTACATGGTATTCGCAGTAACTGTGAGGCGAGCTGGTATAGGT TTGTCGGGTCATAGTTTTCAACATTGTTCCAAAAGTTTCTAGACACTCCG ATTGAGCTGAAGTCAAGAATCATGGTCACATTTCTTGTTTTCAAACAATA AGTCCTCTGTTTTTGACCAGCGGCTTCAATTAATAAAGTCGAATGAAACA TCAACAAAGACAAGAAAAACATCATTCATTTCCCATATGTGTATGTATAT ACTTCGTCAATTTTCAATAAAACGAAATGTGATAGCAAAAAGCGTTTGGA TGACCCAAATCCTCTTAATAAATCAAATCCAAGATCTGAAAAACAGGAAC AATAATTTTATCTCATTCAATATTGGAGTCCACATTTAAATCGTCTATTC AGATTTTGATTCGAAGAAAGTCTGTTTTTATTCAGCTGAGAGAATAATCA TAATCATATCAAAAAAAATCAAACTGAAAACAATGAAAGGTATGGAGCAA GATTCAATATGGACGTCAAAGAGATTTCAAGAGTCGGGTACACGTTTTTT TTATAAGGACATCCTAAATTTTTGAAGTCTTAGGATGTTTTTAACTTTTT GAGATTTAAGCCTTAAAATGTTCTTATAAACATTTTCTTATTTTCACCAT TTTGTGAGTATTTTTGTCCGTTTTTCTAAGAAATTAGGTGTTTTAGAGTT CCCAAAGCCTTAAAATGTTCTAATATGCCAACGAAGCCTTATGTTCTTAT ATTGCTTGTTTTTATAAAAAAACGTATACACGTTTTTTTTTTTATAAGAA TACACTTTATAAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAAATTAAGAATA ATGCTAAGAATATCACCATCATGGAATTTTGCTATTCAAGCAAAGAATGT CATTTTTAGAGCATTCTAAATTATAAATTGCCAATTACCCCCAAGTAATA 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CAATATGTACGACATTGTGTTGTGGAGTAGTCTCTAGTAGTCCTACAACC ATATATTTTTAATAAAGAACCTTTTGCCTTGAGTGCTAGAAATTTAAGAG GTCTTATGTTTGAATGTCAATAAATATTTAGCTACCTGGGTTATCCCTAT GATTACCATATTATGTAAACCATGAAAAAGAAAGGTTAAAAAAAAAAAAA CTTTCTTCCTATGCTTTATACCTAACTCCTACGTTCACTTTTCCCGCGTG ATACCGTCCCAGCCCTACTGGCGTGCCAATCTATCCTTTTACCTAAGTAA ATGAAATTGTGACGGAATATTGTCGGACTTTTTAAACCAAATTTGATAGC CAATACTGATAATTTTGTCAAATAAAGCAAAAAAGCAGTGATTATTTAAA GCGACAACATGAATTCAATAAAAGATGTTATATAAAACTATATTTCGTTC ATCGAGCGTATACATCATTCAGGCAGGCACCAATCACCAGATGATTGGTG CCTGAGCACCATGAAACTCGCTGAGTTTGAAACATAGATATTGTGTCAAC TCTTTATTGCGGGCTTTTCCAGAAAAAAAATGAATATGGGGGATGGAGGA TACAACGATTTTCAGTGATTTACCCCCCGGACAAATTGACTTTTGGCCCC CCGGACAACGGGTTTTACCTCCAGACAAGCATCGGTTGACCCCCACGGAC AACCCAAACTACCCCCGGAGTGAGCAAATTTACCCCCCGGACAAAGCAAA TTTGATGATTTTCGCTAACCCCCGGACAATATATCCTCAACCTCCCATGT ACGGACATTTTTTGGAAGAACCAATTATAGTAACGCTCTATTTACTTATC AAGCACTCTACGAGGAGAAGATAAACACCCTCTACTACATCATTCAGGCA AAATATTTTATGAAAAAAATAATTGAGTGCCTTTTTCAATACCGAGGAAA AATTATGACCGAAAATGAAATCTCACACTCCAGATTTAAACCCAGCAGGC ACACAACGTTGTTTCAACGTTCAAGTAACGTTTTATGGACGTTATGAGTG TCAAATGGACGTTGTTTTGACGTTGTGTACCGGCTGGGAATCGTCTATGT ATTCAGGTTTGATTCGATGAAAGTCTGTTTCTGGACATGAAGAATACACG TAATTCGAACTTGATTGAGTAAATTTTACGTAATAAACCTACATTAAAGG AACTTGTTTTGGCAAGAACTAATTTCGGTGAGGAGCAAAAACTCCTTTTT ATATTATACTTATTTTATAATTGCGCTTCCATGGTAACTTGATTGATCAA TTATAAATAGAGAGACACAAAATCAGAGTGAATAAATCACGAAACAATTT TTAATAAAACTTGTTTCTATCTTCTTAAATTTGACCCTGTAAGAAGAAAA CTCGAAATTTAGATCTTATCCATATGAAAGTTTAACAAGAATAAAAAGAT TGATAAAGAAAAAAGGTTGGTCTTTGTAAGGGTCATAGTAGAGGGGCCAA TCCTTAGGATCCGTGACATCTTTTATGCGACGCAACCGCGTGTAGTTAGT TCGAAAGTAGGAAGGTTTTTAAGACTCTTTGAGAGGGGGCCCGCGAATTA GGCCCGGCTAAAGTTTTTAAGACTAAAAACTGACGTTTACAGGCAAAACT GTAAGGGAAAAAAATGAGTCAAAAATTGACGGTTTTAAAAAGTCAAATCC GAAAGAAATGAATGGGACCATCGGAAAGAGCATGAAATTTTGAGAAAAAA AGTATACTACAACAAGTCTCTTACTTGAACACACAAAGAAATACGGCCAC TTAAAGTTCAAAATTCTGTCAGACTCCGTACGGTTTGAACAAAATTTGAC GTCAATCGTACTCTATCTGACAGAATTTCAAACTTTAGATGGCCGTATTT CTTTGCCGGCGTTAAATTAGGGCCGGTGTAAAAAGGGCCGATAAGGTAGA TAAATTATATTGTAAAAATTATAATAATATTAATAAATATTATAAATTAT ATTAGAATGAATTCATCTTAGACAGTATATTCAACTTTTTCATTGTGATT TTTTTCAGGAGCAATCGCTACCATCAACACATGAGATGTTATCATTTGAA GAGCGTGTTCAACTTCTCAAGCTATCTATCAGATGGTTGAAATGTTGTCA AAATGTCGATGTACATAAAGTTTCCCAATTGGAAAGAACTATCTGGTTGT ACAAAATCAAAGGAGTCAAGCAAATACAGCAGGTGATGAACCCTTAGTCC ATTAATGGGTCATCCTATTCTATATCCATATACAGGGGGGTGGACGAACA TTTCCAGGGGGAATCTGAGAAGAATTTCCAGGTGTTTGATGGAGGCTTCA TTTTCCCAGAGGTTAAAAAGTTTTTCTAAAAAATTCCAGGTGCCTCTTTG CTTTAAGATATGAAAATAATTTTTCCAAAGGTTTCTTTACAAGTTTTGCC ATTTTCCAGGGGTTATCCACACATTTTCAAGAAGCTTTTTTTGACTTGAA AAGGTCTTTGTATGAATTTTTAATGGAATAGCCCAACAGCCAATTCGATT GACTTCAAAATATGCCATTTTTGCCCTAATTGCCAATTATTTTGCATTCG ATTGACAACAATTTGGCAATATGGCAAAATTCGAGTGCCATAAATGCCAA ATAAAAAAGATGTGGTGAATCTGGCATTCTTGGCATTTTTGGAAGTTACC CCCACACTGCTCCATACAGTTTTTTCGCTCCAATTTTGCCACTTTTACCA AAGATTTTGAATTGAAGACCTTCCAATGAAAAGCAAAACAATGCCGATCG GCAATCTGATTGGTTAAAAAAACCGCCCGGGCGTATAAACACTTCGCGCT CTACAAACGCCAACAGAAAACTGCTGACGAAGCATCACAAAATCCATAAC CAACTGATAATTTAGACCAATAAAGGATAAAAGCAAGTCCGAGAAAATTC ATCAAGCCAAGATATTCAAAGCAAAAGATGAAAATTTTTGATTTAAAAAC AGCATCACAAAACGGAAATCATAATGTCAGCGTAGCGATGTACAAATTTG CCATGAAGCTATGATCTTTTGACATTGAAATTGTGGATTTGGCAAAGTTG GTGAGTATGGCAAATTTTGAAGTCAATCGAATTGGCTGCAATATAACAGG CTTTCTGACAGTCCTTTATTGTTTTTGCTTTGTCCACCAACTTGTCTTGC TTAAAAGTGAACGAAACATTAGAAGGATAGGAGATTCGAACCGGTAACTC CTGGTTTGTGTTGGACCATGGATTTATCATAGAGACATTGGATAAACATC GAATGAAACGGTGGAGAGCGAAGTATTATTGTCTTTCCATTTTTTTAGAA AACAATCAATGCTCTAGTCTTGTCCGCAAAGGACAACTGTCATAGCGGCT CGAAGGACTCTGATTAATTTTTCAAAATACACTAATACACTATTGTCTAA AAATGTCCTTATCTTCTATATACTAAAAGTCTAATGTGAGTGAGCCGTGG GGGGGCCATTATGGATTTTTTTCCCAAGTTTCTTTTTAAATCGAGCTCCG AGCGGGAAAACAGTAGAGTGTTCTTTTTTCGAGGCGGAGTACGTTTCTTT TGAGACACGTCACCGGAAAACATGCCTACGGTTCCTTGCCGATCGGGAAA CGTCGCCCGGTTCGGAAGCGTATCTCCGTTTTCGAAATTCTACTTTACTG GTAATTTTAGTAAAAGTAAATAAAACCAGATAGAAGCAAGAAGCTCTTTG GTTTTTTAATATTGATTGATTGATCTGGTCTCTCTGCTCTGGTCACTGGT GCCATCGTTTGTACATGGATAGGGAATGGTCTAATGGTCATGTTATCCTG TTTCTTGAATAGAGAACATTTTGTTATGGATTTGTACAGTTGTTCTTCAG AAATTATTATGGGGCTTATTGCAACCAACCATCTTAACAAAATGAACAAA GACCAAAGACCGACCAATGGAAACAATTGAGATGGCATATTTTTTGCTGC ATGGTAATACATCCAAGTAATTTGGTAGTCTTTGTAGGCGGCAATCACAA ATATGTTCATTTCCACGGCGGGACCGACCGACCGACCGACTCACTTTTTT TTAGATCGACCGACCGCCTCACTTTGGAGACCGACCGACCGCCTCACTTT GTAGACCGACCGACCGACCGCCTCACTTTGTAGACCGACTCACTTTTTAG ACGACCGACCGCCTCACTTTGTAGACCGACCGACCGCCTAACTTTGTAGA CCGACCGACCGCTTCACTTTGTAGACAGACCAACCGCTGCTTCACTTTGT AGAGCGACCGCCTCACTTTGTAGACCGACCGACCGCCTCACTTTGTAGAC CGACCGACCGCCTCACTTTGTAGACCGACCGACCGCCTCACTTTGTAGAC CGACCGACCGACTCACGTTTTAGACCGACCAACCGACTCACTTTTTTAGA CCGACTGACCGACTCACGTTTTAGACCGACCGACCGACTCACTTTTTAGA CCGACCGACCGACTCACTTTTTAGACCGACCGACTGACTCACGTTTTAGA CCGACCGACCGACTCACATTTTAGACCGACCGACCGACTCACATTTTAGA CCCAACGAGGACGCAAAATGAAGATATTTGTGATTGCCGCCTTATACGTT TCTCTTTGATACTTTACTTTGGTTGCGGGCTGTGCTGCGCAAGAAGAGCA GCAACAATGAATATTTGGTACGTACAATAGTGTACATTATCATTTTGAAA CGTATGGTTGAATATCATTGACAATGACTATATATTAGACTTTTTCCTTA TCACAATGTTGTTGTTTAACCAAGAACTCTAGAACAATGATAAGCAAAAT TAAAAATACACTTTCACTTTATTTTCCATCATTTTTATTATGTTGTAAAT AGGAAAAGGTTATAGTTATTGACACCATCATATCTAATTTCATTCAGATT TATACACATTAAATTTATCAATAGCACCTCTTCAATTAACACTAAACCTC ATTATAAAAATATTGACATTATCCTATCTTCAATTTCTTTGGGTTCCTTT AATATTGAGCGGCTGATATTTTCATTTTTTACCGTACCAGTTTTTTGCCC TCCCTAAATTCATGTTTTCTGTCTAAATGATTTTGGCCTTCGAGCTTAGC TTCTTCCTTTTAAAGTATTCGGTTATTAATCATTATATGTCTATATAAAA AGTAAAATGGTTTTAATCGGGAGGGAAAAATTGGGAAAATAAACTTTTTC TAATTTTTGTTCCTTGTGTTTTGTTTATATCGGGAATCCGCCATTTTTCT TTAAATCCGTTCACATAGCAACGTGATAGACCGTATATTTTATAGCCCGG GCTTTTACGGAAGATAGCTAAGAAACTCAACAAGGCGATATCTCGAGATT GGAAAGGAGTTAAGAGATGTATGACCCCTCATTGGATCGGGAATTTAATA GAGAATAAGTTAGGAAAGGTAAGAGTGGGTATAAAGAGACTTTCGAAAAT AAATATAATCGGGCATCTTTGGCCCGATGACGTCATCAGAACCTAATAAA AAATAGAATATCTAAAGTTTGAGAAGGATTTAAGCAATGGTTGACCCCTC ATATTGTATCGGAAATCATCGAGAGAATCTTTTCGGTAAATGACAAATTG ATTTCAGTCAAGCAAAACATTTATTACCCTTTCAATGACGTCATTTAGGA 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GCAAAACCGTTAACCGGCGTTTGCGACGACGGGAACCGTCTAGTCTTTTA CTATTTGTACTTTTTCTAGCCAAAAGTTTGAAAATAAATGCTATAATTAA TACCTAGCGGATGCATTTATGAAATCTTGTGTGAGAAAAACATCACAAAA AACATCTAAGTAAAATCAAAAAAAATGCTTATAACAACACGATATTTTCA GTCAAGGATATCTGTCCAAAGTTTCTCTGAGAAGAGCTGAGATTGAAGTA TATTAGACGTGAGCCTCGTAGCTCCACTGTGATATGAAAATCTTTTGGTG GCACGTTGTGGCACGATGGCTTTTTGAGCTTGAAGTTTGAAAATTTCCGA TGTCAATATTCAATTTCTTATACATAGAATGTTTTTGCATCTTTCTCACA TCTTAAAAAGTCATAACATATCACTATCAATTAAATATTTGAGTTTGACT CTCGGAGGAATACTACTTAAAGTCTCATTTGGGAAAAATGTGGATGGAAA GTTGTCTGATTGTAATGCTTGGAGATTGAAATTTTATTGTTCAAAAGTTT AAGATCCATAAATGTTAGGGTACTTTACGCACCGATGATTATTTTAGGGG TATTCGGTTTCAAAACTCTTTGAATTAAATGCTTTTGCACATAGCATGTT TGAATCTTAATCATGGCTTAATTTTCTAAAGAACCGGATAGAAAATATAT TATAGCGGAGTCTCTATAAATCGAACACGCACCCAAATTCGTTCGAGTTA AGGAAATTGAAGGGACCAGAATTATCATTCGAGTTAAGGATAATTTGAGT TGTAGAGGTTTGGATTATGGAAACCCCACTGTATATCATTTCATCAAATT TTAATTTTTTATCATTCTCTTCAGACTGGACAACCTTTACCAACGATCAT ATTGGATGAATGGAAGTCAGACACCATATTTAGTTTCCAAGGTAACATTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000055_pilon:1352112..1365554-

>XLOC_040734.2 ID=XLOC_040734.2|Name=XLOC_040734.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000055_pilon:1352112..1365554- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGACTTTCAGACCGAATACAAGGCTTACAGAAACAGAAACAATGTCTC
CAAAACTTTCTCCACAAACCATGACTCATACTATTGTGAAAATTTTGCAT
TCTCTTGCATTACGTTACTCCTTGAGAAAAGTCCGTCCACTTTGCATTCA
TACAAATTACTACATTATTTGGCTGATTCCAAGTTCGGTTTCATGTTTGA
AAGACAAGGCTGACTTTCAGACCGAATACAAGGCTTACAGAAACAGAAAC
AATGTCTCCAAAACTTTCTCCACAAACCATGACTCATACTATTGTGAAAA
TTTTGCATTCTCTTGCATTACGTTACTCCTTGAGAAAAGTCCGTCCACTT
TGCATTCATACAAATTACTACATTATTTGGCTGATTCCAAGTTCGGTTTC
ATGTTTGAAAGACAAGTGCCCAACTTTCAATTGTGTAAACAAACGGCCGA
CATTTTGTACCCAACCGGTGTCCAGTTTTCCGTTCAACGGTTGTGTACGA
CCAACATTGAGTCTTTTGATCAAGAAGTCTATGCTTTGTATGAACGCTTG
CTGGATAGTGGTGCATTTGATGAATCATACTCATTTGCAAAACTTCACAG
TCTACCGGAAAGTAACATCACTTTGCAGAAGTGCCCAACTTTCAATTGTG
TAAACAAACGGCCGACATTTTGTACCCAACCGGTGTCCAGTTTTCCGTTC
AACGGTTGTGTACGACCAACATTGAGTCTTTTGATCAAGAAGTCTATGCT
TTGTATGAACGCTTGCTGGATAGTGGTGCATTTGATGAATCATACTCATT
TGCAAAACTTCACAGTCTACCGGAAAGTAACATCACTTTGCAGAAGCTTC
GGCACGAACTGAAATTACTACGCAACAAGGAATGCTGGGTAGATTTGGAA
TCGCGTTGTAATTTTTGGAGATATGCACATCGCACGTTCACAGAAATGGA
TTGTCTTCCTGAACTTTCTGCTCAATTTTTCGAGCTTCGGCACGAACTGA
AATTACTACGCAACAAGGAATGCTGGGTAGATTTGGAATCGCGTTGTAAT
TTTTGGAGATATGCACATCGCACGTTCACAGAAATGGATTGTCTTCCTGA
ACTTTCTGCTCAATTTTTCGAGGAGCAATCGCTACCATCAACACATGAGA
TGTTATCATTTGAAGAGCGTGTTCAACTTCTCAAGCTATCTATCAGATGG
TTGAAATGTTGTCAAAATGTCGATGTACATAAAGTTTCCCAATTGGAAAG
AACTATCTGGTTGTACAAAATCAAAGGAGTCAAGCAAATACAGCAGGAGC
AATCGCTACCATCAACACATGAGATGTTATCATTTGAAGAGCGTGTTCAA
CTTCTCAAGCTATCTATCAGATGGTTGAAATGTTGTCAAAATGTCGATGT
ACATAAAGTTTCCCAATTGGAAAGAACTATCTGGTTGTACAAAATCAAAG
GAGTCAAGCAAATACAGCAGACTGGACAACCTTTACCAACGATCATATTG
GATGAATGGAAGTCAGACACCATATTTAGTTTCCAAGGTAACATTGATCG
CAAATGTAGTGACGTCAGTTATGTAAAGAATCTACCGGTAACCGAACTCG
TTCAAAATGAAGAAATGGATCGATTGTTTGTGAACGAAAAAGAATCTTTG
GAGAATAGCGGTGAATTTGTGTTGAAAGATGTCAAAGTAACTGGACAACC
TTTACCAACGATCATATTGGATGAATGGAAGTCAGACACCATATTTAGTT
TCCAAGGTAACATTGATCGCAAATGTAGTGACGTCAGTTATGTAAAGAAT
CTACCGGTAACCGAACTCGTTCAAAATGAAGAAATGGATCGATTGTTTGT
GAACGAAAAAGAATCTTTGGAGAATAGCGGTGAATTTGTGTTGAAAGATG
TCAAAGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040734.2XLOC_040734.2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000055_pilongenomesc0000055_pilon:1352112..1365554 -
Properties
Property NameValue
Aaloc736-954:220
Aaloc562-735:5686
Aaloc424-561:11701
Aaloc211-423:12611
Aaloc1-207:13444