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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000350_pilon:229430..235489+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040696 ID=XLOC_040696|Name=XLOC_040696|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350_pilon:229430..235489+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTGCGTTTAAGATCCTTGACGAATCCGATATCAATTTGTATATTTATGC
AAAGTCTCTATCACCCGATTGTAAGGAGATCCCAAATTTTAATGAGGTGA
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CGcgaatatttctaaacaaaactcaaaatatgtcagataaatactatttg
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CGTGACTGGATTTTAGTTACTTTACCTTACTTTACTGATAGAATTCAATT
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TCcgtcccactttcgttttcgtttttacAAAAACCGCGCTCCTTCTAAAT
TGTAGACTAGCAAGTATCCGTATTGCGTATTGTATTCAGTGAAGGGAGTG
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ccaatatgcatgatacagtaattatgcacgtggctttatcattgttttac
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gtTACACCAGGATcaactgtgaaaattttagaattgaactaaccgcaaaa
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CCTTTCATCTGCTTCAAAATGGTTATAAAAttggtaaattttcaaattct
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GACAACTCCTGACCAGTTGTCATCTCTGTCTTACCCATCATTAATGACTG
ATTTATTCAGGTTGGTACTTACTGAGATAGAGGGGGGATCGAAAGCATAG
GTCTAACTTGacatcatttttcattgcttgcAGCAGGAATATGTAATAGC
AAAGCTGGATGATGAACAAGAACTCTTTAGGAAACTGcatctttgtcttt
tctattgttaactgttcataatagaaaccATCTCTGTACCCTTTAAGTgt
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TCTTTCTaaattccttttttatttctttttacagaTTTCAAGACCAAAGG
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TACTAGATTACTCGGCATTACTAGATTACTCGGAATTACTAGATTACTCG
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AAAAAACCATATACACAAAAAACCGTTATATTTAAAGGTTATGTACTATA
GGTTATGTACTAACATAAGTATTCCCGTTTCATGTTGAGCACATATTTCG
TATCAGACCAGATATCgcttattgttcttttttgctGAGATAAACAAATA
GTTTGGATTTCTCTCtgttttctatcaaaaattgCTTCACATTTGTATCT
ATTCAATACGAAAGAGCTTGTAATTTAAAAAAGCTGAGTTAGCAAACGAA
ATCATTATACCTAACTTTATACTTTGCATAGGaaaaactaaactttattt
tacaaaaaccaaacgttattttaataaaaaaaactattgaacaaaaaatt
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GTTGCCCCAGCTAACCCCCgtctttatatttttcttttttgattatgcaA
CATTGTAGAGCATTGTACGATGACCCCTAACACGGTTTTACTACTtttcg
cttttgctgggccttcacggctacttgttttttttaatgtcattcactaa
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ATGCAGGAGCAGAAttattggctaagaggaaatccaaatttcacgagctt
gtaattaaaaaagttttcaaattttaatgtcagggacagagatagaacaa
ggctttttcaaatgtgcgttatccagcttcCGCTAAAACATATCCCTGCT
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CAGTCAAGCGACAAACAAACGTTGATCACTTAAGGATCTACAAAACTAAG
GATGGAAAGTTTTCAATGCTCAGCAGCGATTGCTTCGACTCTATTGAAGA
CATCGTGAATAATTATTATTTAAGACAAgatctattttcaaaagaaggaC
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ATTACGAGAAGTGTGTGAAAGTAGATTGATGGAAACTCAAAACGGAGCtt
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ATTCCCTGCAAGAATAGAACACTTTCGCATCGAATTCAAAAACGACGTTT
CAAAGTATCGGTTTGAcgtatttaaattttttgaaacaatcGAGGGATGC
GTTGAAAGATGCCTCAATGGTCGCACTCTCAAACTCAAGCTTTCAGCATA
TGATAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000350_pilon:229430..235489+ >XLOC_040696 ID=XLOC_040696|Name=XLOC_040696|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000350_pilon:229430..235489+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTGCGTTTAAGATCCTTGACGAATCCGATATCAATTTGTATATTTATGC
AAAGTCTCTATCACCCGATTGTAAGGAGATCCCAAATTTTAATGAGGTGA
AGTTAACAAACAACGAAAGCAAGTTTTCTATTCAAAAAATGACTCGCAAA
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CAAAAGTGAAAGCAGTCGTGCGTTTAAGATCCTTGACGAATCCGATATCA
ATTTGTATATTTATGCAAAGTCTCTATCACCCGATTGTAAGGAGATCCCA
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AAAAATGACTCGCAAAGAAGCCAAAATTGCATTATCAAACAAAAATGAAG
GTTCGTTTTTGATACGCAAAAGTGAAAGCAGTCCTGATGACATCACCTGT
TCAGTCAAGCGACAAACAAACGTTGATCACTTAAGGATCTACAAAACTAA
GGATGGAAAGTTTTCAATGCTCAGCAGCGATTGCTTCGACTCTATTGAAG
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CAAAATGTTCGACTTTTCGTCAAGGGTGAAGACATTGTTGCACGTAATGA
AGACAAGAATGCTAATTCCTTCAAGAATCGATCATATTACGCTGGAAAGT
TATTACGAGAAGTGTGTGAAAGTAGATTGATGGAAACTCAAAACGGAGCt
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GCGACAAACAAACGTTGATCACTTAAGGATCTACAAAACTAAGGATGGAA
AGTTTTCAATGCTCAGCAGCGATTGCTTCGACTCTATTGAAGACATCGTG
AATAATTATTATTTAAGACAAgatctattttcaaaagaaggaCAAAATGT
TCGACTTTTCGTCAAGGGTGAAGACATTGTTGCACGTAATGAAGACAAGA
ATGCTAATTCCTTCAAGAATCGATCATATTACGCTGGAAAGTTATTACGA
GAAGTGTGTGAAAGTAGATTGATGGAAACTCAAAACGGAGCtttttttGT
ACGTGAAGTTAACGAGCCAAACACATGGATGCTCTCAGTAAGATTCCCTG
CAAGAATAGAACACTTTCGCATCGAATTCAAAAACGACGTTTCAAAGTAT
CGGTTTGAcgtatttaaattttttgaaacaatcGAGGGATGCGTTGAAAG
ATGCCTCAATGGTCGCACTCTCAAACTCAAGCTTTCAGCATATGATAAAT
AACCAAACACATGGATGCTCTCAGTAAGATTCCCTGCAAGAATAGAACAC
TTTCGCATCGAATTCAAAAACGACGTTTCAAAGTATCGGTTTGAcgtatt
taaattttttgaaacaatcGAGGGATGCGTTGAAAGATGCCTCAATGGTC
GCACTCTCAAACTCAAGCTTTCAGCATATGATAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000350_pilon | genome | sc0000350_pilon:229430..235489 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 565-750:5875 |
| Aaloc | 223-564:5382 |
| Aaloc | 94-222:88 |
| Aaloc | 1-87:1 |
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