XLOC_040610 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040610
Unique NameXLOC_040610
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000041_pilon:978110..994437+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040610 ID=XLOC_040610|Name=XLOC_040610|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16328bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:978110..994437+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGACCTAATTATAGCATTCTGAGCGattgtaaaataataaattacaaaat caaaatggcgaacCCAGTTGGAGGACAAGGAGTTACTGATCCTCCTACTC TTGATTCTGAAAGTGATGATGAAGAGGTTATAGAAACAAGCCCTTGTGGA AGATGGGAGAAACACAAGAAAGAGgtattttatttcatattaCTACTGAC TTCTAAAGGTTCAAATCAACGCAATAGAATACCAAACATCAAGTTCTGGA AGTTCAAGAGCAGAGGAGAGGCCAGAATCTCTACTCCTGCTCCTCCTCTC CTCTCCTACTTCAGTCGTTGTGTTTAACTGTAGTAGCATACTAGGACCTA GACAGGAGACAtatcctgtatttttataatctgatatgGACAGAGTGGGT TCAACCTTTGATGTTTGAGGCAGATTTCTGGCTCAAAAACTTACAGtagg aaatttgaatttagcgCTGTTCAGTCATCACTCGTCAATGGTACAACTAC AAGACAACCCTGCTGAACACACCGGAATGTTCAGTGTTTTTGTCCACAGC AGAGTAGTGAAACAAGTTGAATGATAAACTATAATCAAGACCTTTAATGC TCTGTGTTTTAAAAGAAAGTGTTTAGCTCATTTGGAGAAGGAACTTTGTA CAGTAAAAACATAACATTATTTTAATGGCAGTTCCCAGTTGTCAGAGGCA TCATCAGGTATTAGAACTTGTTCCAGACATTACCAATCGAATGTTCTATT GTGACCAAAGTAATCAATAAAATGATCGATAACAATCAAAGGTGGTGGGC CTTCAAGTTGAGTACCGCTCGGGAACAAAGTTCTTGTACAAacgttcaaa atatttgaacctCGTGTAACATTCCGAAGCTGGACAAAGCAAGttttttt ACCTGTAAGATAGGATCCATCTAAACGATTTTAAAGACGAAGTATAATAT TGCTTATAATCTTTCAAAAGAACGCAGAATACTCAGATATTATAATTCCT AATGTAATTGCCCTGGTAAACTAACTCGCGTAAAACTAGTAGGGTAAAAC TCAAGTTATTGACGTGAGGTTTACCTGAGAAATGTAATGAGcaatttatt cgagtatttcagGTGGAAAGATTCCAAAAATAGAAACCCGTCTTACCCGG GTAAGTTGGGTTCTTACTTGATTTACCCGTTTACTCACGTCGGCTTCTTT ACAGTTCAAACTCAGGTAACTCAGGTTTAAATATCAATGGTTTTCGCGAA ATATACtccaaatagacctttttttaaagaggcagccatgttgaataatt atgtactccagcataaaaacaatgatacagccatgcataatttttaaaat atgcacgatacagtaattatgcaagactgtatcattgtttttatgctgga gtacataattattcaacgtggctgcctctttaaaaaaaggtctatcgttT TGTTaaaataaagcaagaaaaaaaaggAAGCATCACATTTTGTGTTACTT GATATATTTCCAAAATAATCACATAAGAATTCACAAATATAGTTTAACAG CGTAAGAGTAACGgttagttcgaaacacgggtcacggggcacggggtgac ggggcagctcagatcaaagtaattcaaacagaaaatgttttaaaaacact aaaaattatcgaaaaaatcaattttaaggtattttatccacgtatgacta tttaaaaAGCTAAAACCTAATCACGTGCTTTCCACGTACTTTCGAAGTTT GCGTcgtgtataatgcagaccagaaaacaccgcaacatattacatacata taataagcttatattatcaataatacacttttagtgttatatgcatgtta tatgttatacgtaagtaatatacatattacaattcccatcgcctgaaaag cgagctttctcacgaaaatgatagtacggctattgttaaatcatatctca ttatatcccctccatcactatgagtatgaatataatttcaatggataata acgtagaaatgatggtattttataaatgtgtcaatattttccacctacca ttatgaatttttaataaaagtgacgtaattatactcatatctctaaaacc actatcttgcagcatttaatcgttttaaaacatgtcaatctatatccagt cacatgattagcatcctattgagtatgaaaaaacattttgctgtaaattg gttcagaggccttatatttcatgattttgacaatatttttgtcattcaat atcattttgtcaaaatttgtgggtgacatattatttaaaaattttcatga taatactattcgtatataattgtttcagacatactatactagtagtatta gtactattatatgtgttatgtagtacgtgtaatgaattatacgtcatgat atcgttatattttttccggtctgtaaattgtatgccccgtgccccgtgac ccgtgacctgtaccccgtgccccgtaacctgtgacccgtgtttcgaacta gccggtaAGAGTAATCAAATAGTCTAGCTTCGAATTACACGATTTACAAA CATAGACTATCAACCATCTTCTTGGGAAAAGATTTTGTTGCCTGGCTCTT TTATCAACTTAATGTAACGTCTGTCCCAACTAGTTCAGAAAAGGCATGGA CAAAGGGGgagcaaaaaaattaccttttaaaaaagaagagatttttgtaa tttttttaaaataagggaggattctttatcaagggctgcaagaatctatt aaaacaagaaaaaagaggggactaaaattttaaaattgttgaTTGAATTT CAGATGTTATGTCtttggttttattgataataattttctctATCTAATAT TAATAATATGTTCTTTCCCGTTTTCGTGCTCACAATTTCATGCCCAATTT TTTGTAGACCATGCTATATTGAAACTTATGTACATTATAAGAACAACTTT TAATAGACCAAATAAAACCATAAAAACTGTTATTCTCCCTAATTTaatga gggtgtaaaaagtaaaaaattttcttcgttgccatggtgggcgacatttt ttccaaaatcttgccctccccccccccactcaAAATAGCTCGTAGGGGCC CATGAATCTGCATCCTTTCTTCCCTCTCTatctattgtaaaaaatgtttg cTGAAGTGCTGAAGGGtacaaagattttctttaaatagttggtcgacatc aatgatctttgacATTTGCAGCAGAGACCTATTTTTACAAGTACTGTCAC ATTTAAAAACAATGTCATAAAGTATGAAATCTTACTTGTGTTTTACTGCC TAAATTTTCTACTTGGGAAGACCTCTTGCTTGACCTAACTTAAACTAGGA CTACAATTAGAAGACATTCCCAATTCAAATCTAATAATAAAGATAATTTT CAAGGCCTAAGATATTAGCAAAACACAACTGTATACCAGATACTGCATCT TTTGATtggttttattcataaaaagttttatttgtatcatttgattatAG GATTCAGCTTATTTCcaatttatgatttctttttttttcttgagttttat ttatttagttggATATCATTATAGGTATAATGTTGATGGCATTGATATCA AACCAATCGTTGTACTTCGCTATTgtcaaactttaaagagaaaaatcTGA GGGTGGactcctttttttattttaagggggACATTCTAACAAGGGGAACT ggtaatttttgttcgatttagggagggagttttctttaagggcaaaattg cattttaatgGGGAACTGAAAAAGTAGGCAAAAACCATGAAAGGCATTTT CTAGTTTTTGAACATTGTTttcaaggctcgaaataacaatttcaagtggg ttggacaaaatgtccgatcagggttactttagcttgaaaaattttgattt tttgggtcggacatgaagctatttgggtcggacaatgtccgatgtccgac cgttatttcatGCCCTGGTTTTTAAGGCAAGAACGATGGAAAGCTCAATA TGAAAGTAACAATTCGTCTAAAAGATATGGATTAAGGTATGTCTTAGTGA TATACTGTTAATTTGaatggtcaaaaataatttcaacaaaCCTAGCAAAC TCAAACCAATTcgttcaaaattatcttttcaacgcaaaattactttaaaa tataatatgtaatactaatgtttaaaaatgtgaCTTGCAACTAACGAAAG TCTGCAAAAATGAGaatcttttatgaaaattgatttccttaaggaggccc ccccagcggttggcgtgatggcatgatggagggttttttgtggcgtgatg gcgtgaaattttgaaaaaaacggcgtgatggcgtgaaaatgaagtgccgg cgtgatcgtgaaatcgagtttttttaagcgtgatggcgtgaaatttgcag ttcagcgtgatcgtgaaaattatatttattagttgaatcgtatttctatg tccattttagccaatttagagggtttaaatttaaaaattttcttggtcgg ccccaactggtggggcctcctatagatctcattttaaaacataaaagaaa cggtgcaaacagttctattcatctgccatttatccttgtaacttccgATT GTTTTTTGCAGTTGTTAGCTAGTCTTTAAAATAATAAAGTCGAACGCTAT CAGAGGGtcgaaaattggaaattttccccgccagcgcaaaccatggttgc gcttcctccgtaactaatattttcctctctttcttaCATGCTTATTCTTA TAGATGCATCAAAGACAGgtcctttatttcaggaaaatatacatttgtag caaagccttaaacaaaaagaagcaacaggtttacacgctttttttttata taagaatacactttataagaatgtccatgatgaaaatggccaaaaagtga agaatatgctgagaatatcaccatcatagaattttactactcaagctaag aatgccatttttagaccattttttagttaattaggatcctaacctaagaa tgctgtacgaatattttaggatgattttcccaaaaaagttaagaatatcc atgatgaaatggatttacaccattgttataaaaaaaaagcgtgtattatg aGGTGTAAATTTAAGCAGATTAATCAAAGGAATCCTATGACgtttaaata atattttgggaaaaagagagtaaatgagggcgattttagccatactaaat tgaaaatttctcccgtcggcgcaaaccatggttgcgcctcctcgttccac ttttgaaaactattcatgctaattcacaattaatgcccatgggtcccgtc aacgggggaccagggggcatggcccctcatgttgcttgtacttttaaaag atttccattatttttacatgaattatttttccaattgaattgaaatgggt cctaaaatagcactttgaacccttcataattcaaaaattttctccgttac CCAACCACGGTGAGCTTTGTCAATTTAttcaaatatacctcagccctcaa accggtgtcctttgatgtgaccagttgtccaacaatttttgatatgcaca tgtcaagattacgtcatttttactATCGAGAACACCaaaaaaaactggaa tttgaccCCTTTGTAttgctaaaaatagaaaaacagagatcaaatttctt ccagatttttcgggtgttttcaataggaaaaatgatataatcttgactta tgcatatgagaatgcccaaacacacatatatgtgggcaaaaattaagttt atacaacaaaatatgagcgtgaaaactaaatttctaggcgtaatggcggg aaatcgaaaaaaattggcgtgatcgtgaaaatcaaatttttcagtcgtga tggcgtgaaattgaaaaaaaattggcgtgatggcgtgaattttgggtccg ctgggggggcctccttAAGGCAGTGTCTAGAGGTtaacctttaaaaattt ttgatttaagataaaatttttaggccaaatttcgcgaaatttaataccgt aTGAATTTTATCACCTTGAAGATTAAAACAAATAATGATGTCATGGAAAT TCAGAAAGGTTTTGAAGCGTTGTGTCCTTTATTGTATACATTTAATATAC ATTTAATTTCCCTGTGGAGGGTACTGACGACAAAGTCCTATGGGGGCATG TCACTGGTGTTCAAAAATGGATCCTagacaatttttagcaaaagCTGGAC TTGACAAGCAAAATTTGAACCCTATGAGGTgtgattttcgaaatttagtg aattttaataaaatattcCAAGTACTTTTTGACTTATAAAAGGGACTCTG GCCAGCGACACATCCCCATCTTGCCTGAGTGCCCTAGGGAGTccttcaac aaatattttaaactcTCAGAACTTGAAATGACTTCCCTAAAGAAAAGTAT ACTGGAATATATCACGATATGGTTGACCTGTTTATTCGCCTTGCATTAAA AAATAACACTTACTTGCTAAAGGGGGATGAGTTTTCATCAGCTTCCGAAT TTTGATTCAGTTGGTACTATGGTTGGAAAAGCCATGTCTaaaaaaaTCAT TAGAATTTCTCATTACTACTGAATTGCTTTCACCAAAAACTCCATTTAAA TCTTAAGCAACATtcaaatgacttttttaagaatttacGTAAGGCTACAA ATTCTTGTTCAAAGCCTTCAATGTATTGAGCTATACTGACCaaatatttg tgatttttacaGTTTGGCCATCTGTTTAACAGGCATCTTTCAACATCTAA ATAATAGTTAAACAGACATTCGGTACTTACTTGACTTGCAGTGTAATCTG AGTTAATTgtcaattttgaattctttgtGCATTATAGCTCTTGTTGGGGT TGAACCtgtcaaaaaagaatgaatatcaaaaaatatttttcatttcatat cgTTCTTTCCTGAGTGAGGGAAACAGGGTACGCATGCTCTTATTGGATTC TCTTTCTTGAGCTACACCCATCCAAAAACCTATCAGTTATTCGCTTATGA ACCTatataagtaaaaaaaattaactaccTGAATGACACACAACCTAAGT TCAGAGGTTTTTAAAGCATAGTAAGTAAGGAAAATCTAGTTATTAGGCCg gcccaaaaaaaattttgtttcctatccaatgagtgcaataaaaaagAGTT ATTTGAAAGACAAAATTGGAATTGAAGCATTGCGTGGTGCACTTTACGTA tctaatgaaagatttttttattgttccagtgtagaaaaagttgaaatgga gaaaattgtaaacaaaaattgcaataaggtaaaaaagtttttaaaaagtg tGGTCAGATGAtggcaaagaaaattttcattcagcCAGTTAACCAAAAAT ATAGCCAGTAAAATTGCAAGATTCTTgttcatttttatgaaatttttttg caaattttaagtttaagaGTGTTTCAGAGATCACACATCAAATTAATTTC TTCATAGCTTTTatgagtgtttctaagatcattTCTGTAAATGCCGTAGG CCAAACTCATGGACAGAGACATTTAGGTGAGTAGGTTTTCAACGCGTTCT TCTGATAAGTAACGGCtataaaataaacacaaatacaAAGTCAAGAAAAA GCTCATAGCAAATGAAATAACACAAGAAATTGTATAAATCTAAGACTTGG TACAGAAAAAGGTAGCATAGAATATGTacaagaaatatcaaaaatatatc actTACTAAAAACACTGTCACCTCACACCATAACGTACACAAATACAGCT TACAATAAGTGATCCAACATTACACACAAACATTTATAACATACAGAACG GTAGACAAGACTCCCATGAGACTTACGAAACGTTAACAATACACAAAGGA CAAAACATTCCTAATAATAATACATAATTATCATATAATTAATACATCAG GGACATCAAAATATGATCACAAACCAATTATACCTATACATAATACAAgt gctcatcatcatcatcatccttcgacctagGTCCGAATGGAATACAAGTG CTATGATACAAAGGAAACATAAAACTAATATAACAAAAACTACTGTCTAA CGGCAGTAACACATTGTATTAATTTACCACTTTCTTTATTTCTGTAACAA GTTGTTGCAAGGTTACTCTTATCTATTAGCTTCCTATGTAACTTTCAAAA ACTAGCTTCTTATTGCGTTTAGAAAATATATACatgaaaaatgataattt tcaaaaataaagactGAATGACCAAGagaattttgagtttgaccgactgg atttgattGCACTGAGAAATAATGTTGGAGTGACTTATAATAAATAGgat ttttcataaaagaaaagttttattttaaccTCGTTCTgaagaatcaaaat tttgaaaaaatgaaaaaaaatacccccagatattcacccaaggaacaagt atgcaaaatttcagccaaatcggaccatttttgaagtctcaagTGTGCCT CTAAGTTTTTAGCCTTGTTTTAAGGCTAAAACTTGTGACCATgcccctaa aaatcaaaattttgaaaaaatgaaaaaagcgcccccagatattcacagAT ATTCAAAATTACTTTGGTATTGGGTGTCTTTATACAAATTATACATCTGC CCCACACTTCCTTGACTTCAAATTCAAGCCTCCGTGGTCCTTCTTTTaga aacttaaaaacaaaaaactaaaaataactaagatcattattgaaaaaata tatcagTTTCTAACTTTAAGTTGAGTCCTGTCACCATCCTTTTCGTAGGC AAAAATATATCAATTTGGTACCTACCGTCCGGTACTCAAGAAGTCCAGAT GTTGTATGTTTGTGTACACCTCATACCTCCTAATGACTACCCAGGACTTC CTGGAAGAATCCTGGAACCACCCTACAGTACTTGCCCTAATTAATACCAG GTACTACCTAGTAAAATCCTGAAACCACCCCATACCACCCTATTTGCTAC CAGTAAATTTATCTTAAATTGTGTAAATTTTGCGTGTTACAAccgcaaaa ttttttcgaaGAAACATGTTTTGTgtgtattaaattttgcaattGCCGCC AGTTTCTGGAAATTTTTAAGTGTATATATTAAATTTAGCAATTCACTAAA TcgggcattttcaaaaagtggaaATTTGGTACAGACAATCTTTTACATAA CACTGAACATCCCTCAATATTTGACCTGAAATCAGATTGTGATAGTTTTC tacccaccacgctgaagctctaaagcgatgagtgaaaacataacaatctg aaaaaaaaaaaaattttagatgataATCCTCATTGTGTTCATTGGAGcca ggggataaaaatttgatatattCTAATTATTCATTTATGATGTAGAACTA GTAGACCATGGCCAGTGGATTGCTAAagcttcaaaaataaagaaaaaatt caaaatgtctgtgaccaactttttgatatgtttcttactcaatttgaggg tgctgattccgaatttaaatgttaccaagcttgaaaacccgcagtttttg cgtaatttgcgattttttgcgttttgaGGCAACATTATAAGCCCTggaaa atcataccacgtcatagagctcttcaaactgagctaaaaattgtattaca tcaaattctcaacttttctagatcaaaagttacagacgattttgtggtca aaaattgattgaaaacagggaatttccccacaatctgcataatttatgca aaattatagcactttttttaccacaaaaatgCCCATTGACGACTTTATAG CAAGATTATAGGAAGACCCAATCGATCTTTATGAAGCAACAGACCCAACC TACACTTATCATCATGCAACCCTCTCAAACAAATCCTATATCGACCATAT GATTGTTTCCATCAACATTATGGACAAACTTACAGACACAGCTATTCACC CACCATCCTACCTAAACACTGGAGACCATCTTCCCATCTCAGCGATTTTA CATGTCAATCACAGCAATGTAGATAGAGTACCCACAACAAAACCAAATTA CAGACGAATTCTTACCGAATTACGTATGGAAGAGTCAGCAATTCCTTGaa catttcaaaaacattacaGACAATAGTTTTGAAGACTATACTCAAAGCAG TGACCTCTCGAAATGTGTTGCTGATATACAAACCACCCTTAAACAATCAG CACTACAAGCTCACACTGAactaaacaattcaaaaaatggTGGAATCCGA AACTCTCTAGGAAGAAAGAAACTTTACACTACTTTTTCAACATTTGGCAT TCTGATGGATTCCAAAAAGATACCCACATTCACGCAAGGTACTGTTTCGT CAGGAAAGACTTCAGAAAATGCATTAAAACGAGCCAAAACCAAGCGACAA GAAATCATTACATTAATGCTGAAAAGATTAAGAACTTTGAGCCAAGAGGG GAACACTATAAACACTATAAATATGCATCTCAAAGCTGAATTCCATCCTA GCTAACATTACCAATCGAGTCATGATGACCAGAGATCTACCAGTCGAATT GACCACTTCTGTCATTATCCCTCTGGTAAAATCTCACAAGAAATCCCTTC GTGACGTAACAATTACAGAGGTATCAGTTTAACCCCCATTATAACGAAAA TCATTGAAAAGACTATATTGAATAAATGTCCGAACGTTAAACATCATAAT GATATGCAGTTTGGTTTCGCTGAAAATGCTTCCACTGTTCATGCGGAATT ATTCTTCAATCGAAAAGTACAGTTCCGAACACAGTCCAGTTTATCTTTGT AGTTTGGACGCCGAAAAGGCATTCGATACATGTAATTGATTCAAGCTATT TCAGACATTGTATGAACAGAAAACTGTTCCGAACATAGTCCTCAAGTTTC TCATCCAATCGTACCTCCAGGGGGATGCTACAGTGAAGTACAGGAACCAC TACTCAGACAGATTCGTTTTCTCACAGGGTGTTAGACAAGGCTCAATCTT GTCACCCTTCCTTTACAATCATTACACCAAGTCTTTactagaaaaaattc aaaacatgaaCGTAGGAACAGTAATTACTGGCAAGGTTAACACATCAGTT GTTACTTTTGGTTTGCTGACAATATTATTTTGTCCAGTCCAACTCTAAAA CAACTTTAAGAAATGCTAGACATGTgtgttgaatttggaaaaaatcacag ACTAAAGTTTAACAAAACAAAGACACAATTTATTATATCCAGACCCTGTC CCTTACCAAGAAATCCATAGTACTGGACAACAACCATATCCGACCCCAAC TAGAACTTAAACACCTTGGCTTCAAGTGGACCCAAGCAAAACAACTGACC CTCGCTAACCATATTCAAAGcgaagtaaaaagtaaaaatcaaaatcaatt ttggacCCTAATCACCAAATTTAGTACACAAAAAACCCGAcattgattga aaattttgagctGAATATATGATAATCAAATCTTTCCTAATTCGTCCCAA ATTTAGCTGATAAATGTTTACTTTCTGTCAGCAAACCTGACTAATTTGAG TTAAAATCGAAGAAGGTGAGGTTGAAAGGATTATTCctgaaattcattta aaataatttaactttttcaatttttttcagctAAGCCAAAAGAATGGGCC TGGAATTGATAGCTCTTTTCTTGCAATGGACACAGAAGAGGGAGTGGAAG TTGTTTGGAATGAAGTTCGTTTCTCAGAAAGAAAATCCATGAAAAATAAA GAGGTAAGCAAATCCCTGTAAAATGAGTTGGTTTTATTTATGTCAGAGTC ACTCTTTTGGTACCTGGAGTTGTATTTTTGACATTAGCCGTACAATAATA GATAAAAAAGAATGATCATTTTTGCAATCTTTGTTTTTAAACCAACAACA GTCATACCACACGTTCTGTTGACCATTCTGGTTTTAGAATCAGCttaaaa taagaataagaaCTTCTAAAAAATGATATTCAAAGACAGTAAAACTAAAA CCTCACGATTGAAATGTCAAATTGTAGGTTTTTATAAAACGCTTTAAATA GATAGATTCAAtagtttttccaaaatattcttgattttgatatgaTATAA TATCATATGATATTATAGATAATTGAAATGGGCCTGTGcccctttatttg aaaatcttttcccgtgtgtttaattttaattttttctgacattttctGAC ACAAGATAATGTTGTAACAAGTACCATCTTGATTTCAGGAAATgttcaag aaaatctttgaacGGTTGACACAACTTGATGTAAGTTTTGTATTAGCAAT TTTGTACTTacagttttcaattttcataattttacatTGTCTTCTATAAT TTCTTTTGTATCTAGCTTCAAACTTTTGCTATCATCATGTTCACAAGTTT CAGACAGCGTTACCCTACAGCTAAGCattaaattttgtctttttttatgg TTAATGTTTAAAATCGAACTTTTCTTTTACAGCATGCCAACATTGccaaa tttcataaatattGGGTTGATTTAAAAGGAGACAACCCAAGGGTATGCta catgttttctttatttcatattttccctaacaaaatgaagaagaacaTTT TGAAGGGCATAAAAGACCCTTAAcccaaatttcattcaaaaagactaatt agatcaaaagttaagaggtggtacaggaaaagtcCCCCTAGTTTTAAACC GCCCCTAAGAGCCTAGTAATCTTAGTCATTTTAGTGTAAATTACCAGGTA AAGAAAGAGTATTTATTTTGGAATCCAAAGTTGACATCTTTATAAAATTA TAGTTAGGATAGGCCTTAATCTGAGACATTAGAGGTTACATTTCTCAAAC CAATGTAAGTTGTAACTCATAACAATAGACATTTTCTTTTGtactatttg aaattttacctcGACTATAGTTACCACTAAATTGGGCCCTACCATttaat ttccatacaggggacTGAAAACCTTTTagtcaaaaaacatttcttataAA TGTCTGGATACCCttttaaaaatggcaaaatttgcaacaattctttttat accttaaagtgacgatggacgaactaaaatcagtgatttactccctggaa aaatgaaaaggcACTCTTTTAGACTCCCTGGAAATTATGCTCGAATTGCC CCCTGGAAATGcttgtccaccccctgtatggatatgaaATTGAATGCCCC ATTTTTGTAAATCCTTTTCTTTTTAGCTTATTTTCATCGCTGAGTATATG ACCTCAGGTTCCTTACGTCAATTCCTCAAGAAAACACGAGCTAATGTCAA ATCATTCAACATTAAGGTATGATGGTTTGGTCCTGTTTGGTCTTTTATTg aagattttctgtcaagaaggAACACTTAATTAATCATTACTTTGATTAGT CACTATGTGTCTATGTTTAGTTTTGGCTAGTGTCTTTATCGTATCTATaa tatgttgaaaataaaacataacacatttttctttaacgatatttcgacct cttacgtgtctttttcaagttcTTGAAGGTAAGAGGTCGAAatatcttta aagaaaaatgtgttatgttttattttgatttggatGCACATcacggccta ggagcctttaattctctcttccgacaacggtcaagacattttttttttgt ttatctaatccgatgatctattccgattaaaaaaaaCGGATTATCCGGAT TCTGATAATATTGTGATTTgaaaaaagatggctgccgaaagtgaatctca gtgaaaaattgataattttcgtcattattcatgatgttttggacatgatt tatgagaagtttgatgcatactggttctctaacaatgtggaaagactttg gagaaattttgaccatgaatcgtcagctgatcgagtgcttaaatcttgca ttatggctaacttctcttctagacactgaaaatcataaaactctaacttg acaatgaaactccCAAACACACAGCTAttggaattcaaaagaaaatacta aaattacaacattacagtgcacatttgaaaacgatctgagtagtttttgt ggtgttatgtgtatggctgaaaatgatgtaaaatgatcctgttttgtgtA TTCATCATTATTGTTGACTGGCGacccgttccttttgatttttcaaaccc gacacagattttttacaaacataacactatgagaattcaatagagaatac taaaacacaattcctgtgtaaatttgaacaagattggagaaattttcaca gtgttatggctgaaaatgatcgtttttggactttgtcgtaatttcatcgc ggctggcgaccgttccttttgatttttcaaacccgacacagattttttac aaacatatcactatgagaattcagtaaaggatactaaaacacaattcctg tgtgaatttgaacaagattggagaaatttgaacagtgttatggctgaaaa tgattgtatttggactttgtcgtaatttcatcgcggctggcgaccgttcc ttttgatttttcaaacccaacacagattttttacaaacatatcactatga gaattcagtaaaggatactgaaacacaattcctgtgtaaatttgaacaag attggagaaattttcacagtgttatggctgaaaatgatagtttttggact ttgtcgtaatttcatcgcagctggcgaccgttccttttgatttttcaaac ccgacacagattttttaaaattatatcactatgagaattcagtaaaggat actaaaacacaattcctgtgtaaattttaacaagatcggagaaattttca cagtgttataactgaaaatgatattttttggacttcgtcgtaatttcatt ggttggggcgaccgttccttttgaagatttttcaaacccgaaacaggttt tttccaaatataccactatttattacatacacactattgtaccattttat ttggattgTCCTACTCTCCTCcaccaagtattatcccaacagaaaaaata acgcttagctaaaagctgtggcctctaatttaggctatttttctcctcaa aattttatccggacaatcaaatcaacggcgcatcatagctttgctattgg caagtttagaaaaaaataaatttataagaacttggaaatattgacttcta aatgtttatctcctttagctccaattttttagtggaggatgagtgggcga ggggtggggttggttcttgAGGCAAGAAAGtacatgtgtaatcacttaga agagctaaacttccagctggtttatttattcgttaagattatttctcata ctcgctctgcaatagaattattactttgctttctgatctgttctgattac tagtttgtgggcaacgttctaacacaactaactcagcaaactcatctttc acatcttttaatctcttaagccggagcttccagcgcagctggtttattat gtTTCACTTATTATATGGtgaaaagatttataaattgaaTAGCTCAgtaa aattaactttttctttttttagggtgttttagtactgaattattattatt atttttttttttagggcTGGAAACGATGGTGTAAACAAATTCTTTCAGCT TTAGAGTAAGTTGGTTGTTTTCCTGTTATATTTATGGCATTTCTTATTAA ATCACCATGAAACAGAGAGCAGCTCTTTTGATTGCAAAGTAGTATCatgc aaatatttttttaaagattcctgTTTTTCATAGCTACTTACATGGACACA AAGATTATCCGATCGTTCATGGCAACTTGAATTGTGACACCATCTTCATC CAACATAATGGTCTGATGAAAATTGGTACAGGTAAGATATTGAAATGACA TTATTGAGGTTCTTGATAaaattactttttgataaatgtaGTAGAATAAA GGAAATACAGAAAAGCAATGGGTTTTCAACTAGAAAGCAATTTTTCAGCG ATGCATACTGGTTCATATGgtatatctttaaaaaatcaactcATAAAGTG AATGTTTTGGATCTCATTGCAGTTGAGCATACAAGACAGAAGGTTGTCCA GTAGCTTTCTCAGGGGTGTCGGAAAATTTGTGTGGAGAGCACAATTCTGT TATGAAGTAGTTAACTTTTAatgttatgaatagataattacaatGTCATA GAAATTTTCCGACACCCCTGAGAACGCTAATTTTGACCACCTATGTTAGA ACTTAAGTGTTGTGTTGATCTAGCTAATTCTAATTCTTCTTCAATGCTTG CACATGAATCCAATTTGCCATCTTTAGTTGCTCCAGATGCAATCCATAAT TACGTTCGAACATACAAACACCATCGACGGAACATGCATTTTATTGCCCC TGAATATGGTATTATTAATAACGACACc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000041_pilon:978110..994437+

>XLOC_040610 ID=XLOC_040610|Name=XLOC_040610|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1458bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:978110..994437+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGACCTAATTATAGCATTCTGAGCGattgtaaaataataaattacaaaat
caaaatggcgaacCCAGTTGGAGGACAAGGAGTTACTGATCCTCCTACTC
TTGATTCTGAAAGTGATGATGAAGAGGTTATAGAAACAAGCCCTTGTGGA
AGATGGGAGAAACACAAGAAAGAGCGACCTAATTATAGCATTCTGAGCGa
ttgtaaaataataaattacaaaatcaaaatggcgaacCCAGTTGGAGGAC
AAGGAGTTACTGATCCTCCTACTCTTGATTCTGAAAGTGATGATGAAGAG
GTTATAGAAACAAGCCCTTGTGGAAGATGGGAGAAACACAAGAAAGAGct
AAGCCAAAAGAATGGGCCTGGAATTGATAGCTCTTTTCTTGCAATGGACA
CAGAAGAGGGAGTGGAAGTTGTTTGGAATGAAGTTCGTTTCTCAGAAAGA
AAATCCATGAAAAATAAAGAGctAAGCCAAAAGAATGGGCCTGGAATTGA
TAGCTCTTTTCTTGCAATGGACACAGAAGAGGGAGTGGAAGTTGTTTGGA
ATGAAGTTCGTTTCTCAGAAAGAAAATCCATGAAAAATAAAGAGGAAATg
ttcaagaaaatctttgaacGGTTGACACAACTTGATGAAATgttcaagaa
aatctttgaacGGTTGACACAACTTGATCATGCCAACATTGccaaatttc
ataaatattGGGTTGATTTAAAAGGAGACAACCCAAGGCATGCCAACATT
GccaaatttcataaatattGGGTTGATTTAAAAGGAGACAACCCAAGGCT
TATTTTCATCGCTGAGTATATGACCTCAGGTTCCTTACGTCAATTCCTCA
AGAAAACACGAGCTAATGTCAAATCATTCAACATTAAGCTTATTTTCATC
GCTGAGTATATGACCTCAGGTTCCTTACGTCAATTCCTCAAGAAAACACG
AGCTAATGTCAAATCATTCAACATTAAGggcTGGAAACGATGGTGTAAAC
AAATTCTTTCAGCTTTAGAggcTGGAAACGATGGTGTAAACAAATTCTTT
CAGCTTTAGACTACTTACATGGACACAAAGATTATCCGATCGTTCATGGC
AACTTGAATTGTGACACCATCTTCATCCAACATAATGGTCTGATGAAAAT
TGGTACAGCTACTTACATGGACACAAAGATTATCCGATCGTTCATGGCAA
CTTGAATTGTGACACCATCTTCATCCAACATAATGGTCTGATGAAAATTG
GTACAGTTGCTCCAGATGCAATCCATAATTACGTTCGAACATACAAACAC
CATCGACGGAACATGCATTTTATTGCCCCTGAATATGGTATTATTAATAA
CGACACcTTGCTCCAGATGCAATCCATAATTACGTTCGAACATACAAACA
CCATCGACGGAACATGCATTTTATTGCCCCTGAATATGGTATTATTAATA
ACGACACc
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040610XLOC_040610-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000041_pilongenomesc0000041_pilon:978110..994437 +
Properties
Property NameValue
Aaloc631-729:16230
Aaloc532-627:15685
Aaloc490-528:15515
Aaloc400-489:13177
Aaloc340-399:12433
Aaloc298-339:12189
Aaloc175-297:11581
Aaloc1-174:1