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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000071_pilon:751108..758983+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040505 ID=XLOC_040505|Name=XLOC_040505|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7876bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:751108..758983+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggcagcacagttgagaacaaaaaaagggaaaagtaAGCCAACATTGTT
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TTGTGGCACTCTTAAGGTCTCTACTTGTAGTAGCAAGTTAAAAATACAAG
GTCTTGGATTCCTTTTTGGATCTGTTGCATATTTTAACTAATGTTCACat
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TTTCCTACATTGGTGCTTGTTACATAACGAGTACATCCTATGACTTTGTT
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ttttgtttttcaataagagtgatatctgcttaatttacaagcttttttgt
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aaacatttttttgcttaaataagcacaatataacaataggtataTACACT
GTGCTggtatgaaacatgtgtctgatatgaaacgggaacgcttatgtaaa
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TATGAAACCCATCTGAAATTTCGattgtaatagaccttttcataaattac
gtcacaaacatcacttgcctcgtattcaaacaattaccacggtgattatg
tcccttgagacattaaataatttttttataaatagaaagtagttttaata
aaatccactgggagttaatcaccatgacaaTTTATGACAATAATTTAAAA
CGAGGCAaatgatgtttgtgacgtaatttatgaaaaggtctattatttaA
CTTTTACCAACACAAAACAGGCTGgatctaaaaataaaatcattattCAG
CTAGTCTGCTTTATCACTCCTGGAGTTTACGTTGTATGGACTATTTTCTA
TATTGTGTATATCTACGATCTATTTTGTTTTGTCAGAGGGTGTGTGCATA
ACGTTTCATTAACAAGCAATACCAAGAAGCTGTTATCGTATGGTGAAGAT
CGAATGTTGGTCATGTGGGATATGACTGTTGAAAGGAAGGAGGTGAGAGT
GATTGCTTTTGAGAAGCATAGAATCACAGTATTGTGAAGTTTACTGCTTG
TGGTTATTGGTATTTGTAATTTAACGTGTCCACCTTTCAGCATATATACT
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TGCAATTAAAAGACtcaaaaacaatgataagaaaatattgGTAAACAAGT
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TCATTGATAGACGACTTTGCTTAACCCAGAAGGTGAATGGGGCTATTATA
CATCGCTGCATATATACTGAAGAGACGAAGTTTATTGATAGTGCTTCAGT
CATAGACCTTTTGTAGAATGCGATGTCATGTTGAATGCAATTAAAAGACT
CAAACTTCAGACAACGATAAGAAAATATTAAGTACACATGTTCACTAATA
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TAAATTCTTCAAAGTCCTAATAACCTGTATTTGTATTTATGCGaattcct
tttttttattttgccttGTATTGTATTTTGTTCATAGCACCATTGTCGAA
AATGTGGGCGAGCAGTTTGTCAGAAATGTAGCGATAAAGTGAGTGTTTTA
CCAAAGTTTGGTTACGAGCATCAAGTTCGGTTGTGCCAAGAATGCTTCCT
AACCATCAAAGAAGAAGAGTAAGAATCCTTTGGTTGAATGTAACCTTTCT
ATATGGAAAAACCTTCCAGAAAGCTTCTTGTTTCCTAAGTACTTGGCATT
TATTTTGTCACTGAAGTATAATGATAATGCTAGCAATGAGAAAGGTGAAG
AAATGAAGAAACGGGTCCTTGAATAAATTAgggtcatttttttcaatttc
acatATATCAGGCCATTCGTTTCGAATTTTATTCTACATTTTTAACGCCA
AAGCGTTCTATAAATTAACAGTCTGCAAAGAAAGACTTTCCGTTGCCAAA
TAAAACATTCAACGGACATGGCACacgctgttttgttttgttcattatGA
AACATGTTTTTGCATTTCCAGTAAAGTGAGTacaacagcattttatgagc
tgAAACACGGTGCGTCACATCTGCAGATCGATCATTCACGGGGAAGAATG
CTGACGTGTGGTTCTGACGATGTTGTGATGGTATGTATGTTatgtggccc
ccaatatgtaaatggcccccataatgtaaatggcccccaatatgtaaatg
gcccccaatatgtgaatggcccccaatatctgaatggcccccaatatgta
aatggcccccaatatgTAGGTTACAAGAGTCTTTTCAAATTTAACCAAAA
TATTGGGGGTCATGTACTGTAGCTCAATTCTGCCAGGCTGTCTTGAATAG
GATCTTTAAAGAGCGCTGCACCTAGAATAAATTTCCCAAAGGGCCTATAT
GAGACGGAAAGGTTTTCCAACTATAATAACCgtttttatggttttttttc
CCTTAGGAACTTctaataagaaaagaaaaactaattaaaaCGGACCTTTT
TAATTATCAATCAATTTTAGTCATCAACTCTCAAACGACCTAAgctttat
aattttgaaaaatgaagtctTTCAAATGTTTCTAATTTTAAAGCTAATAA
GTTCACCtaaaaccttgaaattttgaagatgCCTGCAGTACTCATTTAAG
AAAATACGGTAAATTAGTTATAAAGCTTACCTGACGCAAACACTTGATCC
GTTGTCAGAAAACCTGTAcattttcttgcctgggaaggGATAAGAAAGAG
AGATCTTTCAAGAGGTATACAAATATCATTGATCAAgtttatatttttga
tgaagAATCACTAAAGAAGCAGGCTGGGCTGGTCAGTTCAACCTGTACTA
GGAAGTCAGGGGTGATGCATGACACAAAAAGGAAATGACTAGAGaagcaa
tatttttaaataaactgaaattcttttcaaattctaGATATGGGACGTGa
aagaatttttgaatgaacattCATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000071_pilon:751108..758983+ >XLOC_040505 ID=XLOC_040505|Name=XLOC_040505|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000071_pilon:751108..758983+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggcagcacagttgagaacaaaaaaagggaaaagtaAGCCAACATTGTT AAATAGATTAGAGCTGAATGGTGATATAATATTTGCTGCAGTTTTCATAC CACATGAAGATTCGATTATCACACTTGGTGCAGATAAatggcagcacagt tgagaacaaaaaaagggaaaagtaAGCCAACATTGTTAAATAGATTAGAG CTGAATGGTGATATAATATTTGCTGCAGTTTTCATACCACATGAAGATTC GATTATCACACTTGGTGCAGATAAaaGCATAAGGGTATGGGTGATGCGGG ACAATGGCAAATATTGGCCAAGTGTTTTTCATCATATGCCAGaaGCATAA GGGTATGGGTGATGCGGGACAATGGCAAATATTGGCCAAGTGTTTTTCAT CATATGCCAGatGTTGGGCATTCACTTGACTTCAACAAAGAAAGTGGGAA AGTTTTTGTTGGGATGGCCCAAGGAACAATACATatGTTGGGCATTCACT TGACTTCAACAAAGAAAGTGGGAAAGTTTTTGTTGGGATGGCCCAAGGAA CAATACATgaatacgATTTATCAGATGATGTAAACACATTAACTCTAGCT CGAAATTATTTAGCGCACACAAAAAGAGTGAATGGTACATTTTTCTCACT TGATTACAATTGGTTATTGAGTTGTGGTAACGACAAACAGTTTCAATGGC ATTGCACAAAAAGTGGGAGAAGGATTGGTGGATATAGTGCCGCCAAAGCC CCTTGCACTTGCTTACAgaatacgATTTATCAGATGATGTAAACACATTA ACTCTAGCTCGAAATTATTTAGCGCACACAAAAAGAGTGAATGGTACATT TTTCTCACTTGATTACAATTGGTTATTGAGTTGTGGTAACGACAAACAGT TTCAATGGCATTGCACAAAAAGTGGGAGAAGGATTGGTGGATATAGTGCC GCCAAAGCCCCTTGCACTTGCTTACAATTTGACTCACATTCATGCTATGC CTTCATGGGAGATCGAGGTGGAGAAATACATGTTTTCAAGCTGAGTGAGA ATTCCTTGAAACCAGTAACCATACTCAAAGGACATTCAGATTTGACTCAC ATTCATGCTATGCCTTCATGGGAGATCGAGGTGGAGAAATACATGTTTTC AAGCTGAGTGAGAATTCCTTGAAACCAGTAACCATACTCAAAGGACATTC AGGAGGCATACTGAGCTTAACCTGGGACGAGGAAAGAAAACTCTTATTTT CTGGCAGCGCAGATCAGTCAATTATTATTTGGGATATTGGAGGCCAAAAA GGGTCAGCTGTAGAACTGCATGGTCACAGGAGGCATACTGAGCTTAACCT GGGACGAGGAAAGAAAACTCTTATTTTCTGGCAGCGCAGATCAGTCAATT ATTATTTGGGATATTGGAGGCCAAAAAGGGTCAGCTGTAGAACTGCATGG TCACAGAGGGTGTGTGCATAACGTTTCATTAACAAGCAATACCAAGAAGC TGTTATCGTATGGTGAAGATCGAATGTTGGTCATGTGGGATATGACTGTT GAAAGGAAGGAGAGGGTGTGTGCATAACGTTTCATTAACAAGCAATACCA AGAAGCTGTTATCGTATGGTGAAGATCGAATGTTGGTCATGTGGGATATG ACTGTTGAAAGGAAGGAGaCACCAAACTGGTCACAGAGCGACATGTGTGA GAAATGTGCTTCTCCTTTTTTCTGGAATTTCAAACAAATGTGGgatcaaa aaattgttggtgTTCGACAGaCACCAAACTGGTCACAGAGCGACATGTGT GAGAAATGTGCTTCTCCTTTTTTCTGGAATTTCAAACAAATGTGGgatca aaaaattgttggtgTTCGACAGCACCATTGTCGAAAATGTGGGCGAGCAG TTTGTCAGAAATGTAGCGATAAAGTGAGTGTTTTACCAAAGTTTGGTTAC GAGCATCAAGTTCGGTTGTGCCAAGAATGCTTCCTAACCATCAAAGAAGA AGACACCATTGTCGAAAATGTGGGCGAGCAGTTTGTCAGAAATGTAGCGA TAAAGTGAGTGTTTTACCAAAGTTTGGTTACGAGCATCAAGTTCGGTTGT GCCAAGAATGCTTCCTAACCATCAAAGAAGAAGATAAAGTGAGTacaaca gcattttatgagctgAAACACGGTGCGTCACATCTGCAGATCGATCATTC ACGGGGAAGAATGCTGACGTGTGGTTCTGACGATGTTGTGATGTAAAGTG AGTacaacagcattttatgagctgAAACACGGTGCGTCACATCTGCAGAT CGATCATTCACGGGGAAGAATGCTGACGTGTGGTTCTGACGATGTTGTGA TGATATGGGACGTGaaagaatttttgaatgaacattCATAGATATGGGAC GTGaaagaatttttgaatgaacattCATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000071_pilon | genome | sc0000071_pilon:751108..758983 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1177-1215:7838 |
| Aaloc | 1069-1176:6923 |
| Aaloc | 937-1065:6438 |
| Aaloc | 835-936:6207 |
| Aaloc | 730-834:5438 |
| Aaloc | 604-726:4595 |
| Aaloc | 490-600:4245 |
| Aaloc | 280-486:3723 |
| Aaloc | 208-279:3485 |
| Aaloc | 139-204:2535 |
| Aaloc | 1-135:1 |
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