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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000316_pilon:186412..191512- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040406 ID=XLOC_040406|Name=XLOC_040406|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:186412..191512- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAAT
TTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAACTTGGTTTTAAGGTTTGTTTTAC
TTATCCCTTTTTAAATGTTTCTTTTTAAAATATATTAGACCTTTTTTCAA
AGAGGACGTCCTGTTGAATAATTATGTAGTCCAGCCATAAAAACAATGAT
AAAGCCATGCATAATTACTGTATCATGCATATTGTAATAATTATGCATGG
TTTTATCATTGTTTTTCTGCTGGACAACTTAATTATTCATTAAACTACTA
AAACTTTCAACGGTCAAAACCACAAATTTTGGACTTATATAACTCTTTCT
CTCGTCTTTCTTTGGAATGAGTTAATAAATAAAGTGTGTGTGTATGTGTG
TGTGTGCGTGTATTGTGTGTACGTGAACTTAGTGTGTTTTCCCAGGGTGG
GAGGGGGTGGGTGGTGTAACCAGGTGTAACAGGAAGAACTTTATAAATAA
AACTACTCAAAGAAATTGTCATTAAATAAAACTAAAAATATTTCTTATAT
TCATTATTTTGTGTCACTATTAATATTATGATAATCATTTATTCATTTTT
TCTTTAGTTCTGCATAATTTTTTAGTTTCTTCTAGGTTCCCCATTGTATA
TATTAGAGAAATCTATTTTTTTTGTAAGGGGTTATCCTGCTGTGTTGCAG
CAAAAATATATTCAATTCAATTCAATTCATTCCTCTATGCCTCCATGACT
TACTTTTTTATTCTTTTTTATTCTTTTTTATTTTTGATGCATTAAAAGTT
GAAAAGATTATTCAGAAATAAAGTATATACAATATACATAATTATTACAC
TTCATAGCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAACAACTTGCGA
CGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTATCCAGGTATA
ATAACGATATCCATAATTATATGCTCTCAAAACTATGAGTGTGTTGATAA
AGTGATTCAGGCAAAAGTAGAATGTTAAAATTCAAATTTACTTTCTTTAA
TACAAAATCATATATAACATTAATTATAAGCTCTATTTACCTTTAAAAAC
TGATGAAGTGTATTTTAGATATGTTAAACAACAGCTTTTATTGCATGCCC
CCTGCTTCCAGTCCTTAATGTGACTTAGGATGTGTAAATTCTTTCACGTC
AATTTTTAACTTTAAACTAGAAAAAGATTAAAAATTAGTAATTTACTTTC
CTTCCTAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGC
ATGCACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCGCCTCAATACATCTCGGTTAAG
CCACATTTTAATTTACCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCT
AATCTAGTTTGTAAATAGAACTCTGATCACTACAATAATATTTCGATGTT
TAGCAGATCTTTTTCCTTTCACTAAGTCATCATGGTTGAATTAAAATTCA
ATACTGTAATTATAATCACAAACCTGTCCATTACCATTACCAGCATTACC
TTTTTCTGTGGATTCAAATTTCTTTTTGGTTGGTTTTAATTGAATTTTAA
AGACTAGATATGGCCATTATGGTCATATTTTGACATTTTAGTCCCAGTAA
TTTCAAAACCAAACTTCAGTTGTATAACTAAAGGTCAGTTGTATAATTTT
AGTTATTTATTTCTGTAGGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTTAG
ACCCTGAAGGGGTGGAATCAAGAAAAAGAAGAAGATTGAGAAGAAGAACT
TACCATTGCAGAGTAAGGACTTAAAAAATTGTTGGTTTGCCGTCACCCAA
CCCTAGATTTTGGAGCTGGGTCGGTCGGTCGGTCGGAATTTATTTTTATT
TTAGCGATGAAATTCTCGGCCATGGAAGGGTTAACAGTTTGTTTACATTT
AGGTAATTTGGAATAAAAAACAGTTTTTAGTCCAGCCTAATGTTTATGTC
ATTTTATGGAACTTATGTTATGTACTCAAAATGAAATCTCAAACCAAGTA
GAAATTTCAAGCTAATCTGAGCTAATTCATATTTTAATTCAAAGATTGTA
CACTGTTTCTTTTTTTTATTTCTTTTGTGTAATTATGTTCTGACTAAATC
TCCTTTTTTTCAGCCATCCTAATCACCCTAGCCTCTTTCAGTCCGTTGAA
ACCCACATTGGTAATGGTTTTGCCATTAAAAAAATAGTCTGTAAAATAGG
TCAAAATATGAGTACAGCTTGAAACAAATAAGTTTTCTAATGTTTTGTAA
TTTTTTGAAAATTCATTTATAGTAGACTCATCAAAGTTTTTCTTAATATA
TAGGTTTGGGGCTTAAGCTTTAAGGAGCTCTCTGAAAAAGAAATTTGCCC
TGCCCCTACCTCTGGTTGTGACAGTTTATAATCACACAATATCTTCCAGT
GAGATTTGATTTACAAACTTTCAGTGTCAAAGAAACGGTCAAGATCTTCA
GTTTTTCTATCTAAAATTTTTTTCCAAAGAACTTTTTCCTTCAACGATTT
AAATTTTTTTTTCTTTCATCAAGGGACCAAATGATGTATGGCATATTGAT
GGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTCGA
TGGGTAAATTAAATATGATTAATGATGATTTAAATATAATGATGTGTATA
AAAGTTAAACGATTTTACGATCTTTTAAATCAAAAATATAGGCATAGAAG
TAATTACTCTGGGCTATTTTGAAAATATCAGCACTCTTATTATTTTCAGC
TACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACTGTTGGCTCAACAAATAATGATCC
AGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGATTACGTATCAGAGATTAAAGGTA
ATATACTCCTCTAGAAATAAACTTGAATTGCAAATGAAGAAGAGTGAACG
ATAAAGCTGGGTGTCCACCGATAAAAATTTGTTTTTATTTATAATGGAAC
AAAAAAAATGCACGATAGGGAACAAAACTTTTCTTCATTCCCTATTGCAT
ATTTGTCGACCCTATCAGGTAAAACATGAGCATTTTGTTCTGAAAATCTG
TGTGATCTTTGTTTCAGAAGCATGTGATTTTTTATTTGTGGTGAAAGAAT
GAATTACTTTTTTGGTGTACACAAGCTTAACAAACAAACAAAATAACACA
AATCTTTATGCATTACAAGGATCGAACTCTTTTCAGCACTCAGTTATGAC
GTTTTTTAAATCAGCCACACTGATCATTATGAAATCTTTTATTTAGGAAC
TGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGGAACGGAAAATTCAAATGTTGCTG
GAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATGCGGAAGATGAAGACGACAATTTT
TCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGCAAATCGACGTCTAACCAGGTTAA
TAATTGTGTAATTCAAACTTTCTTCAGTTAGGGCATTTCCAATTTTTTAA
AGCCACCTAGCTTTGTAGTTCATTCGTCTTCTAATTAGTTCCAATCCATT
ATAGTAATCTGACTGATCAAATTTTTGTTGTTTTATTCTTGCACGTGTGA
AATGGCAATTTTCTTCAACAAAAGACTTAAAAGTATATTATAAACAATAC
AATACTTTCTCTAACTTGAATAGCTAAGAATTCGTGGTATAGAGGGGTCG
TGAAAAAATCCAGCATTTACAAATTAATAACTTCATGTATTTTCCTCTTT
GATAATTTGGTTTAAGGAAAAAAAGATGTGGCATTATTTTGATAAAATTA
TTTTCTTTTATAGAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGGTGCTG
CATCACAGTTCTGGATTAATCTTTTCAAAGTAAAATATTTCTTTAAATTA
CATTTCAAAAACTCGTGATAGAATTTTACCAGATCATTAAAAATCTTTTG
GTTGGAAGCACAAAATTTGACCTTGCAAAAAGCTCGCTTGACTTGACTGG
GTACTGGGAAATATCTGTGTGCTGGATGGATCCTTTTCAGATAATTGTTA
TTAGAACTAATTTTTTAATGTTTTGCTTCTCTAAGTAAGGGATTGTTGCT
TGTTCAATTTTGCACGTAAACAATGCCAATACCAGTTATAAATAATTATT
TGCCCATGTCGAAATTTCTTCGCTTTGCAACCCCTTTCGCGTTGATTCTT
TTATTATAGGACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATAT
CTACAGGTATTTTTTAGTCTTAACCAGTAACAGTCATTTCACTCTACTAA
ATACGCTGTGGAATATGTTCTTTAATTTCTGATATTTCTTCAAATTAAAG
TAGTGGACCAGGCAATTAATCACCGCCACCTTTTGATAGACTTCATAGGC
TCTAATTGGTCATACAAGCTTGTAGTAATTTTAGATTCCATGGGGTTTAC
ATATTGAAGCAGTCAGGTTTGGGTATTTATTCATTTTTCAATTTTAGAGA
CTGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATG
CAAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAA
TGCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGG
TTAGAATAGCTTGTTTATTTTCTTTTTTATTGGTTTTTGAATCTTAATGT
TAACGATTGAGAACTTAAATCGCTGGATTATTATTGTCGTTTCATTATAG
TTTTAATATATCGCCGAAAAAAGTAGCATTGAAAAATATAAAAACAGTTC
ACAATTATTTTATTAATTTTCAGAACCGCTTCTTATTTTGGTACCTGAAA
TTTTAGGTCACTTATTACAATTATTGATATTTTTAGACACGGTAGACTAC
AAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCACGAGAAGTGACAAA
AGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCTCGAACTAGCTAATT
TTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAAATGTTGACGAGGCA
AAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCCGTCATTCGTAATGGGCATATATA
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000316_pilon:186412..191512- >XLOC_040406 ID=XLOC_040406|Name=XLOC_040406|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2328bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000316_pilon:186412..191512- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACAACTTTATTATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAAT
TTTGGCCTGTCTATTGAAGTCATTGAACTTGGTTTTAAGAACAACTTTAT
TATAAACTCGTTCCATCAAGGATTATCCTATAAGGAAATTTTGGCCTGTC
TATTGAAGTCATTGAACTTGGTTTTAAGCTTACGACAACTAAAAAGAATA
TTGCGAGATAACAACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCAT
TGTAAATGCTATCCAGCTTACGACAACTAAAAAGAATATTGCGAGATAAC
AACTTGCGACGCAGAGGAAACAACAATCAAGTGGCCATTGTAAATGCTAT
CCAGTCAGAGCTTCGTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATGC
ACCAAAAATTGATTCTTCGCCATCGCCTCAATACATCTCGTCAGAGCTTC
GTGGAGATGGATGTAACCTTGGTTACAGAAGCATGCACCAAAAATTGATT
CTTCGCCATCGCCTCAATACATCTCGGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCT
GCACTTAGACCCTGAAGGGGTGGAATCAAGAAAAAGAAGAAGATTGAGAA
GAAGAACTTACCATTGCAGAGGAACAAGTAAGATTGTTATTGCTGCACTT
AGACCCTGAAGGGGTGGAATCAAGAAAAAGAAGAAGATTGAGAAGAAGAA
CTTACCATTGCAGAGGACCAAATGATGTATGGCATATTGATGGTTATGAT
AAGCTCAAGCCTTATGGCTTTGCAGTCCATGGTTGTGTCGATGGGGACCA
AATGATGTATGGCATATTGATGGTTATGATAAGCTCAAGCCTTATGGCTT
TGCAGTCCATGGTTGTGTCGATGGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAA
CTGTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTG
GATTACGTATCAGAGATTAAAGCTACTCAAGGAAAGTGTTATGGTTAACT
GTTGGCTCAACAAATAATGATCCAGAAATTATTGCAAAGCATTATTTGGA
TTACGTATCAGAGATTAAAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTG
GAACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCAT
GCGGAAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGG
CAAATCGACGTCTAACCAGGAACTGCAAGACGAATTAGGGCTGACTGTGG
AACGGAAAATTCAAATGTTGCTGGAGTGCAGCGGTTTTTCCGATTGCATG
CGGAAGATGAAGACGACAATTTTTCGGGTTTAGAAAGTTTTTTGTATGGC
AAATCGACGTCTAACCAGAGAATAGAAGCATATTGGAGCAGGCTTAGGGG
TGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTTCAAAAGAATAGAAGCATATT
GGAGCAGGCTTAGGGGTGCTGCATCACAGTTCTGGATTAATCTTTTCAAA
GACATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATATCTACAGGAC
ATGCGCGATGCAGGAGAGCTAGACGAAACAGATGATATCTACAGAGACTG
CCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATGCAA
GACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAATGC
CCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGAGAC
TGCCTTCGATTCAGTTTTATGGGATTGGTACAACAATCTTTAGATGATGC
AAGACTACTGCATAACACACACCGAATTCGGCCATATCCTTTGCAAGAAT
GCCCAAATGGGAAGCCAAATATCATTTATGGAATACCAGAAGCTTATGAC
ACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGAAATCGGCATCGCACG
AGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTTCAGTTGAGTTTCTCG
AACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTACAAGCTCCGGAAAAT
GTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAACTGCCGTCATTCGTAA
TGGGCATATATAAACACGGTAGACTACAAAGTTGAAGTGGAAGAAGACGA
AATCGGCATCGCACGAGAAGTGACAAAAGAGCCTTTGGAATTAGGATGTT
CAGTTGAGTTTCTCGAACTAGCTAATTTTATAATGGAAGAAGAAGGCTTA
CAAGCTCCGGAAAATGTTGACGAGGCAAAAATCCTATACTTTACCTTAAC
TGCCGTCATTCGTAATGGGCATATATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000316_pilon | genome | sc0000316_pilon:186412..191512 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 961-1173:214 |
| Aaloc | 808-957:604 |
| Aaloc | 760-804:893 |
| Aaloc | 694-759:1289 |
| Aaloc | 547-693:1804 |
| Aaloc | 448-543:2302 |
| Aaloc | 367-444:2529 |
| Aaloc | 274-366:3383 |
| Aaloc | 187-270:3844 |
| Aaloc | 100-186:4244 |
| Aaloc | 10-96:5102 |
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