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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000058_pilon:816569..824980+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040367 ID=XLOC_040367|Name=XLOC_040367|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8412bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:816569..824980+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCGATATTGACATAATAGAGGATGCCTCCCCTTCTCAAGGAAGCAG
CAGCAGCTCTTTTTCATATAAAACTCCTGATCCTATCAAAATATGTGGTG
TAGGGCATCTAACAATGTAAGCCATTTTTTGGAGCttttttttGGTGCTC
TATTTTGTATTCAATACGATCAAAACTGTCTAGCTATTGTGTTTAAATAT
CTAGAAGATGTACCTTTGCTTTTCATAAGATTGTAACCCTACGGGTTGAG
TGTGAGCGAGCAGAGAAATTGACGAATCACCACAACACAAAGGTCTTCTT
TTCCTAGGATTCCACTTTCTCTCTACCCAgatggtgtcaatcgaacgaat
cgaatgCCGAaccaattgaacgcaattgaacacaatcgaataattgcgat
tcgattgtcgaactcaatcgaatcgcaatcgaatattacccaggatttgc
cgttcgattgcttcgattacgttcgattgtattcgattatgttccagtac
gttcgattgatttagattttattcgctttcgtacgatacttaataagcgc
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ttaatcgcaatcaaactcatcgaacataatcgtaatcgaaccaatggaac
atagtcaactaccgtcaactgctctaacttgggactatctgaaaaaacat
gggacggcaattcggccaccatttcaccaaacctccaaagtcatttgatt
tgagttaaggtaaaacttaatccgaaaattgattttgccatGGATCAATG
TGGAGTCAGATCACAAACAACGAAAtttttgagttaaggaacggcgtatt
aaaaaatatacgatttctctttcaattttacagtaagtgaaaatacagac
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ttgacggtattaatcgaaccaatctaaccttactcaaacgcaattgaaca
caatcaaatattacccaggaatcagccgttcgattgagattcgattatgt
tcgacaatcgaatcacaATTATTCTATCGCATTCGATTGCGtccgattgg
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ACCTAACATTCCATTTTCTaaaggaaaaagaccaaggatagttgaaaatt
gaaaattgaaaaaatgagcttgaaagTTAGGTAGTTTCGTAAGTAAACAC
AAGGtttttttCTATCGTGTATCTTTAGGGAAAAAATACCCATTCCAATA
TGGTACAAAAGACCTTTTGCTAAGACCATCCATGGCGTATTGTATAATTA
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aataatgtgaataTACTACTCTCGCCAGGTAGGCTTTCGCACTgcaaaag
gaacaaatctttgcGACGAGAAACTTGTAAATATGATCGGGCACGCGATT
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CTCTGTAACTTTGACATGTCAATCAATAACACACGCTGGAAAAAAGTctc
tagagaaaaacaacacaatGGCGTCAAGATGTGGTAGCGCGGGTGTGATT
AAAATTGTTAGTTACttcttcaaattatgtacttttaaaatcctttaaaa
atacattcggTTGTGATTATGAGACGATGAacgtttgattgataaacttg
gttgaagtataaaaacaaacttgttgtcaaagagatttaaacagtaagtg
aaatACAGTCCAGAAATAGACCGTCCCAAGATttaaccaatcgtcccaag
ttagagcagttgacggttcCAGCAGAAAGAGcttgaaatgctgatgaaaa
ttgaggcataaaatattccttgaaaatcttcctatcaaaagttatagagt
ttgaaagttttgtgatgacatcatcacaagcctttccaggcaaaatttaa
aaaccttgtaattttggaacaaattgaccaaatttgatgttgCCAAACAA
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TCTCATTTCCAACATTGTATATAAGACAACTCTCAATTGGACTTACCCAA
CTACGAAGAAAAGAAATATATAGGGCTCTGCAAGTCCACCTTCAAAAAGT
GATTCAATGGGCATAAAACATTATCCACAGAGGTTTGGCGAGTGAAAGAT
AGCAGAGGAACACCATTAGTCAAGTGGTGTGTGTTGAGAAAGTCGAAATC
TTTTAACCTGATTCAGGACATTATGTGCTTTGCAAGAccaagaaatttga
aattgtcaattaccctgaaaaaaatcttttaaaaataaacgTTCTGAAAT
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GAAAAATTGACGTCATATAATAAGATGATATTGCAGGGCTCGAAATAACG
GTCGGACATCGGACATTGTCCGACCCAAATTGCTCCTTGTCCGACCCAAA
AATCATAATTTTCAAGCTAAAGGAACCCTGATCGGACATTTTGTCCGACC
CACTTGAAATCGTTATTTCGAGCCTTGATATTGAATTGTTTTTTCACAAC
AAAATAGATAATGTAAGGTATATTTTTTAGTTGCCTGAAGATTTTCACCA
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AAATTGGAACTGCCACtaattttttcattgttaaaaaattggTGGCTCTG
ACCCTATTAACcttaaaaagaaatattgaaaatgttggATAAAACTTGAC
AATTTTTAGGGACTTGTTCTTGTTTTAGAAATACTGAAGTTTAGTCCAGT
ATGGTGTCGTGGAAGTTGAAATATAGTATAAACCATTGAATGAGTTAATT
AACAGCTAAATATATGttcgataaaaatcaagaaaacaaaaatttgttca
atttattgTAAAAGCTTTTCGACTATTGTCATCGTCAGTacagtaaaaaa
tacataagCATATGAAAAAGTATCTACAATTTATaaagaaatgttaaaaa
gttgagaaaacACATCAATTGTCACGGGAGCAACGATGCCATGACGATTA
ATgtgttttcttttgttccaGAGTAAAATAATTTACGTTATGCCGTTTCT
AAATAAGTTTAATTGCTTAGTCTCTAGTTGATTGTTTAGTGAAGGCTTTT
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GGTGCCGAAATTAGAACCTTCCAGTTAAATACATGACTATTATCATGACT
CTCTAAATGTTTTGCGGGCTCCGAATTACCTTTCACCGAGTTGTGTTCAC
TCCAGCGAACTTCGACATTTCTAGCCGTTTCACCGATATAAGTTTCTCCA
CACGAACATTCGCCAACGTAGATCTTGCAACTCGGGTGTGGATTTTTACT
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CAACTCGCTGAAAGGTAATTCGGAGCCCGCAAAACATTTAGAGAGTCATG
ATAATAGTCATGTATTTAACTGGAAGGTTCTAATTTCGGCACCACTTAAG
AGcaaagaaaggaaaaatttaGAGGCTTTCCAAATCGCATTGAAAAAGCC
TTCACTAAACAATCAACTAGAGACTAAGCAATTAAACTTATTTAGAAACG
GCATAACGTAAATTATTTTACTCtggaacaaaagaaaacacATTAATCGT
CATGGCATCGTTGCTCCCGTGACAATTGATGTgttttctcaactttttaa
catttctttATAAATTGTAGATACTTTTTCATATGcttatgtatttttta
ctgtACTGACGATGACAATAGTCGAAAAGCTTTTAcaataaattgaacaa
atttttgttttcttgatttttatcgaaCATTACTTTGCATGGCATTAATC
ATTCATCAAGCTAAATATACTTTGGCTGAAAAGGATGGTATGAATAAGAA
CCATCTTACCTAAATATTATAAAATCTTTCCGCTTTTCAGGTTTGGCATG
ACAAacaaatttgatactgatttCCCATCCGGGTTGACAGGGAAACTTGC
ACCAGAGGAATTTGAATCCACACTAGTGAGAATAAACAAAGTGTTGGGTA
GAAGTTTGCCAATGAACTTGCGATGGTTGTTGTGTGGCTGTATATGTTGT
TGTTGTACAATGGGAATGTCCATGTGGCCTGTCCTCTTCTTGAGCAAAAG
GGTAAATTATTCTTCGCTTTCAATAAGCATTATGTAATgaactttcaaat
attttgctgTTTTCAAGAAAGGTGTGCGTACAAAATTGTTTCTGTCTGAT
aggtattattattattaatttatttggtaaagaAGGTCAATACAAACTAG
CAGACAGTGAAAAACCactgatgtggacctactataaatctaagataaaa
tatactatattattattgtttaaataagttaaaatataaaatgatttaGA
ACATTAGAGGCCGAGACCAAAATCTTAGTgtcctcaaaattttgaaaaat
tgatttattgagaTTTAAGTATTAACTTAGATTTTGTTAGGATGCATGAA
TAGGTTGATAGAGACTAGAGAAATTTGTGAGAATTTTAAATGTAGGTTTG
ACTGCAGGATCCATTCTATgtagtttaaaataaaaattaaaaaattctat
gtatatatagtgtataagatatataaactgagataaataaaatattaata
gtatagataatTTTCCGGGTCACGAGCCCTGGATGTCGAATTGTAGCCAA
AGTTAATTTTGggtataacttttgattcaagtaATGCCTTTTTGAAAGTg
gctaaaaagattttttctctctAACACATAGGGGAAGGAGGTTCCACGAT
GTTGAAGCTCTGTAGGCAAAAGAGCGTTTGTATCCGACATAGTTGAAAGC
TGGTTGGTCGATTTTGCATTCGTTTCGTGTGCGTTTTGTTTTGGTTGATT
TGTTGATGAAGTCTTTCAATAACGGTGAAGTCAAGTTGTTGTAGATTTTA
TAAGTTTTGCATGTAAGATGTTACTTATAGTAGAAAGCAAGAGGCTTCCA
CTTTGCTTGAGCGAGAACTTCACagtcttttacttttttcttgacTCGTT
CGATGAAACGAGCAGCTTTAATGTGGATCTTTTCTATATCGTCCAGTAGG
TGACCAGCACAATTCCCCCAGATCAAGATACCATATATTACTGATGGTAA
AATACCGCTATTATAGATTGTTCTAAGCGTAACTTTATCAAGAGTGTTCA
TTTTGTAAAGGTTTTTAAGTTTGTTGCTAAAGGCATTACACACCATTTCC
GTATGAGGGCCCCATGATAGTTTATTGTCAAGAATCACACCAAGACATTT
TGTTTTGTCAGTTATTTTGATAGAATTGTTGTTGGTCTTAACATCTGGTA
GGGGACCAATGAACTTCTGTTTGCTTAATATCAATATTTGACATTTATCT
GGATGGATTGAAAGACAGTTCTCTAACGAATAATTAGCAATTAGTTCTAT
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AAGTCTCAGAGTCATCTGCATATAGGTCGATTTCCTCATCTCCAACATCT
GGCATGTCATTCACGTACATTGAGAAACATTGAGGTCCTAGTATCGATCT
CTGAGGAACGCCGTATTCAACAGAGGATTTGGTCGATGTAACTCCATTCA
CTTTGGTGATTTGCGATCTTTCTTTGAGGTAGCTCATCATGAATTCGAGG
AAATCCCCCGACACCCCACATGCAGAGAGTTTATTCAATAGCACTTCATG
AGACACACTGTCAAAAGCCTTCTTAAAGTCAATCATAAGTATTCCTACAA
CCTTTTTGTCACCTAAGGCTTTATACCATGTTTCAGTCAAGTATAATAGT
AGATCTTCAGTTGATCTAGCTGCTCTAAAACCCCATTGGTGTTCATTTAA
CAAATTAAATGTGACAAGATGATCATTTAGCTGAGAGCAGATAAATTTCT
CAACTACTTTGCTTGGTATGCTGAGTAAAGAAACAGGTCTATAGTTTGAA
CAATCCCTTTTTGAGCCCTTTTTGAATACACATGAGACTCTAGCTATTTT
CCAGTTGTTAGGAAATTTCCCAGTTTGAACACCttgtttcaaaacttgaa
acaGACCCGTAGTTGACGCTGATTCgttaatttttaaatcttcagcAGTA
ATCATATCAAGCCCACACGCTTTTGCAAGGTTGACAGCTTTAGTAAagga
tttttcaaataatttgaaatcgaGCTTCACATCGGAGAGGGCTGGGGTAA
CTTTGTATATTTGCTTATGTGATGCAGTAGTGTGATCCTCTCCAATATCA
AGAGCTAATTTCTTACCAACATTTGCGAAGAAACTGTTCAGGAGTTCCGC
TTTTTCTTTGTCGTCAGTTATGATTCGCTTGTTGTCAGCTAGGGGTCCAA
TAGTACATTTGTTGGTGTCTCCATTGAACTTTTTTACTGTTTTCCAGAAG
CTCTTGGAATTATTAGATTTGTCGAATTCATTTCTCCAGTACTTTgcttt
tgctgctttgattgcaTTTGTACACCCGTTTCTTGATTGTTTATATAGTT
TCCATTCGGGTGATCCTTTTGGAGTGCGATTTGCGTTCTTGAATAGTTTG
TAACGGTTGTTtaataattttctaatttttcccgTCATCCAAGGTTCATT
TTTGGAACGCACCTTGACTTTTCTTGTTTAGACGTGTTCGTTAATAACgc
cattaaaaagttcttcCCAGGCCCATAGAGAGTCGTCAACATCATCGAAT
ATAGAGACAATGTCCCATGGAACCTGCGATAAGTCTTGTTTCAGTTTATT
TTGATCGGCATTTTTGTAATCTttaactgttcttaattttggtgGTGGAC
GGTCAATAAAGTAGTTCATAGTTACGTATATCAGGTTATGATCAGAGATG
GCTGATCCATAACTTCCACTTCGAAGGATCTTGGTGTCGTTCACAGGTAT
TATAGCCAAGTCAATCAATGTTTTAGAGTTCTCTGTAATACGAGTGTAAt
cttttataacattctgtAAAGCAACTTTCGCCAAGCCTCGATGAAGCTGA
GGTGTAagataagcatcatctttagcAAGATCAATGTTCAAATCTCCAAG
TAAAACGATATTTGACCTGTGCGAGTACTTTTCAAGAATTGGTGTCAAAT
TGTTCAGAAACTTCTTATCATCAGGTGGGTGGTAAATACATCCAACTAAA
ATTGTTTGTGATTTTATAATAATTTCTGCCCATACTGACTCGATGGCTTT
CATATGTTTATCATAGTCTAATTCATAAATGTTAATATGCTTTTTATGAT
AAAAAGTGATGGGAATGTATGTCCTTTATGTCCAATGATCTTCGATCAGA
AAAAGTCAACAATATGGTGAATATAATTCATTGGCACTCTACTCATATTT
TACCTTTGAACTAACCGATCTAGTTTGGCAGTATATGATAGTTCTCCTTC
TGTTCTTTTAGACGAGGCATACTTTAGAGAAGATCATTGACCACGAAAAT
CAAACACTTTATCACAAGGTAAGAAGTATAAACCACCAAAAAGGTCTTTG
TTAGGGTTTTTAGGGGAGTAACCGTGAAGATGCTATTGAATCTACCACCA
GGATGTCTTTGAGTTAATTTTCTTTTACTAGCTAGAATATGGTCATGTGT
CCTTTCTTTTTAGGAAACTTGCTGTAAATATTCAGCCTCGTTGATTGAtt
tgatcttttctttttttcagctgAGTTTGCACTTGAAGCTCCAAAAACAG
ATGATTACATCGAGTAACATGATGGAATATGTAAGACATTTACCAAATCT
TCTTCAAACATTTGTTTTTCTACCTTTTTCATTTCCTATTTTCCTCTCAT
ATCCATTTAAGTAGTATAAactcttatttatttttttgtttttttggttg
tttttcttttggGGAGCTTCTAACAGGTCAACAAAATGCTTTCCCAATCT
GCACAGGTATAAAAAGAATTTATTGtgttttgaaattcttcaatgcatct
ttgttttttagattttattgaTGGAGTTTCGTCCCAAACAACCGATCTAC
AAGCCCGATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000058_pilon:816569..824980+ >XLOC_040367 ID=XLOC_040367|Name=XLOC_040367|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=990bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:816569..824980+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCGATATTGACATAATAGAGGATGCCTCCCCTTCTCAAGGAAGCAG
CAGCAGCTCTTTTTCATATAAAACTCCTGATCCTATCAAAATATGTGGTG
TAGGGCATCTAACAATATGGCCGATATTGACATAATAGAGGATGCCTCCC
CTTCTCAAGGAAGCAGCAGCAGCTCTTTTTCATATAAAACTCCTGATCCT
ATCAAAATATGTGGTGTAGGGCATCTAACAATGTTTGGCATGACAAacaa
atttgatactgatttCCCATCCGGGTTGACAGGGAAACTTGCACCAGAGG
AATTTGAATCCACACTAGTGAGAATAAACAAAGTGTTGGGTAGAAGTTTG
CCAATGAACTTGCGATGGTTGTTGTGTGGCTGTATATGTTGTTGTTGTAC
AATGGGAATGTCCATGTGGCCTGTCCTCTTCTTGAGCAAAAGGGTTTGGC
ATGACAAacaaatttgatactgatttCCCATCCGGGTTGACAGGGAAACT
TGCACCAGAGGAATTTGAATCCACACTAGTGAGAATAAACAAAGTGTTGG
GTAGAAGTTTGCCAATGAACTTGCGATGGTTGTTGTGTGGCTGTATATGT
TGTTGTTGTACAATGGGAATGTCCATGTGGCCTGTCCTCTTCTTGAGCAA
AAGGACGAGGCATACTTTAGAGAAGATCATTGACCACGAAAATCAAACAC
TTTATCACAAGACGAGGCATACTTTAGAGAAGATCATTGACCACGAAAAT
CAAACACTTTATCACAAGctgAGTTTGCACTTGAAGCTCCAAAAACAGAT
GATTACATCGAGTAACATGATGGAATATctgAGTTTGCACTTGAAGCTCC
AAAAACAGATGATTACATCGAGTAACATGATGGAATATattttattgaTG
GAGTTTCGTCCCAAACAACCGATCTACAAGCCCGATTGAattttattgaT
GGAGTTTCGTCCCAAACAACCGATCTACAAGCCCGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000058_pilon | genome | sc0000058_pilon:816569..824980 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 445-495:8362 |
| Aaloc | 385-444:8071 |
| Aaloc | 328-384:7812 |
| Aaloc | 118-327:4292 |
| Aaloc | 1-114:1 |
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