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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000304_pilon:351860..359238+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040258 ID=XLOC_040258|Name=XLOC_040258|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7379bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000304_pilon:351860..359238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGCTTCAACAAATATTCAACCAAGCCAACAGATGATATCATCTTCATT
TGGAGCTGTCTTGGTTGCTCTATTTAGTAAGTTCTTATTATTTCAAAGAT
TGTCGTAgttattaaaattttataaaagaagaatatttttgtgaatTGTA
CACTATGTTTCAACTCGGTTTGTCTTTTTAGCTACACCTTTTGAAGTTAT
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AAGTCACATTTATGCAATGTCAAAAACTCAATTCcttattttattaatat
aaCACTCGAAActaaataattaattttaattattaGCTGTTTAATCAGGA
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TGAAATGTTCAATCTTTGAGAATGTTGTAGATACACTTTGTTACTGCACC
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TGTCAAAATCGCCATCTTTcatttcttcaatataaaagtTTCACCAATTT
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GGGTTATTATTtctaataaaaattatttcgttGAATACTTGGCTGCTACT
ACCCTcttcaaaattacaaattatTATTCTTTCAGGATGCTTTTATCAAG
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TCATTGGCTGAAAGATTGGCTTTATCTGAAAGAGTTAACATTGAATTTGA
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GGCTTTATGGAAGGAAAACAAAATGTTTCCTCGACGCTTGTGGCAGGTGT
AACCTCTAGATGTAAGTCTTATATGTTTCTCTGGGCAGTTTTCTCTATTA
GTGGCACCCCCAATCTCTTATTCAGATTGGAGGGGTACTGCCCATTATGT
ATGAGGATAAAATTGTTCGGTAGTTATCTCCTGATAACATTTGtcatttg
ccaaaaaaaatagATTCAGCTATTGCCTTTATTTTGCAAATAACTACACC
CTCGTCCTCTTGTAAACTATAGTACGTaaagattcaaaaaaaatttttaa
acccCCTCAATGAATTCTAATCCCTCAAAATTACCCCAATATTTTGAAAT
GCAAATTGGAACCTTCGTCTTTCCTTTTTGTACACCTCTTTATTAACTGG
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GTGACGTCAgaataaatcaaagaaaatattgggtaaaaaagaaacgaaaa
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ATTATTGTATTAGTAGTCATTGTTGAATAGAAATTCATGTTGtctgacaa
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TGTGGAGAGGAGTTGGACCTACTCTACTCAGAGATGTACCATTTTCAGGT
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ATGGGTTATTATAAGTACAAACTTATGATGCTAATTCTTAAATATTTACG
GATATGATGAAGCAGACCAGCAGACAAGATTTTTGCTGTGAGACAAAGCA
AAATTTCTCATACCCAATAAAGCATCAACATTTTGAGCTTTATAtcccaa
aacaaaattttttgtacCTTCTAAACACCATAAACGCTAtttaattgaat
aaaaacaGGTTTAAAATTTAGTCTGCAAAAAAGAGAGGAGTCATGATCCC
CCCTCTGCCTTCTatacatagcttcagccaggtttctagctccccccaac
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tcttcttaaaaataaaaatctttctcttgttctcctcttctAGCATTATA
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ATTTTTCTCGCTAgctattgatattttttatccCAGAAATAAAGGGTTAT
AGTTTTTAGCATTACTGCAATCTGTAGTCATCTTTTGAAAGTCACATGTT
ATagtattttgattaaaatattGGTTTAGTCAGCTTTCTAAGGCATGTGT
CGTTTTTCGATACATTTTTAGCTTTGATCAAGTGTCTTAGGCATGAGTCA
TTGCTAGATGCATTTAGTGTCATGTGTTTCTTTAGAAAGGAATGTAGTTC
TaaatatttgttttcttttttagttcaattatTGAGTTTAAAAGAAAGTC
AACCATTAGTCTTTTCGATCACTTTCTCTCGACAGCCATTTCAACCAAAG
GCCTGACCTTATCTATTATTTTCAATGCATTTCTTATTACTCACGAcctt
gaattttttatttacattttaggTCGCAGCAGTTGCAACGCAACCGTTCG
ATGTGGTCAAAACATATCGTCAAATTGAATTAGGTGAAATCAAAGATGGT
AAGAACTTTTCAAACTTCGAAGAGACtatgtaccttatcggggaaaactt
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tggtaagtacgcattaaggccggggaaaatattcgtcgggGAAAgatatt
cgtcacttttccccgaagaagttttccccgataaggtatgtatTGAACCT
TCCCCGTTGAAACACAGATCAAACCGAAAAAAGGTTCAATCACGCCACTG
CGCAAACTGCTAGAGGCCTCATCAGTAGTCCGGGTGCTTCAAAAACATCA
AGATCTGAAGTGTCGTCATTTTTGTTAAAGACCATATCATAACATTTACC
TGatcattaaaaaataaaggaatctAGCAAGCATTAAGGGGTTTTACTTT
TGTTCAGGCTCGactgttcttactttttttggcattttcaacTTCTTATT
GTTTctatcattttcttattttagtgcaaataaaggttttttatcctttt
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ctttaaattgttcttattaataAAAGATGGAATACGGATATTACGCTTAA
TAACAGTCACAAAAAAGATGTAAAATTTACAAACGACATACCTTATTTGT
TCAGCATTTCCAGCATTTCAATAATTTCCAACATACTCTCCTTTAACCCA
CATTGACATCATTCCATTAAATCATTTAAACTTACTACTTTTTCCTACTA
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ATTGTTCTGATCGTTTCTATTGAAAACTCCTTTGTTTTGGTTTCAATTAG
GtaattaaaatgataattaatATCTTTTGTAGAGATTGTTTagttgtttt
tctcttgttgAGCATAAATATGAACTAAAAGAGTAATAAACAAAActttg
agaacattttgtttGTTGTGTCTGATGATTGCTGCAGTTAAGCTGCTTGT
TTAGACCTCCCTTCAATTTTACTTTACTACATATACACTGTTTCATCATG
ATAAACGATCAGGTCATCGGACCTTTAGAGTCGTTGCTTTTCTATATACT
AATAGTTGATTCACCGCAGAACTAATGGGAAATGTAGGTATTTGAATATA
TGGCTCGACGAACGGTGAATTTTGCCGGTCCAAGGCACGCAAAAAACTCG
TCGGTCTTAATGTTTGGTTTGCCGCTTCAATTTCTACATAATTCACGTCA
ATCAACATACTgggcttgctaagaattcgccggCTTATAGAATCTAGAAT
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AATTAATTGGTATAATCGCTCCTTTTGGTAAAACATCCAACAAGTAATTT
TGAAGAAATCTCAAACAGcttctaaatttttttcttttttcttatcttca
atTCTCACTATTTCTACAGTGTGATTTAGAAAAACCTTCttcccaatttt
tcatttttcatttcaaaaatgataGTAATCAAGGTTTCTTGCACATGTCT
TATTTACATTTTCCTCTCATGAATCTCCCCCCTTTCTTTTCATTATAAAT
ATGTGTACTTCATTTATTATTCTTTAGAGTATTTTGCGAAACGCCTCGTT
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GATTTTCGCCTGGAGATATTGTAAACTTCAGCTTCAACTTCAACAGATAG
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TTTGTAATGGTTCGTACTGAGATAGATTTGCATTTACGGTTACACCGGTT
ACAACAAGTCGTTTTCGAGTTTTTAAGGTCTCCTTCTTTACTAACCTAAA
CGGAGAATTATTGGTTCACGAGCGAGTTTTTACTTTGTGAAAAACATGCA
ATATTTATCGAACTTTCGATTAATCGACTAAGGGGTTTCTTTTAGTACAG
TTTATACCTCGCTCTTGTAGCGTATGTCAGGATCAACATTGATGGCGAAA
TCGATAGCGTTTTGGAAATCTATGCGAAGAATATCGGTGTTAAATATTTA
ATAAAGTTTCCCTTTTTCGGAAAAATATAACGAAAAAGCACCGAAACTAG
TGACTCAGTAAATCAGTTTGCCTATAGTAAAGATCTCTTTAAACAACATG
TCGCCCAACTTCCATTCCCGCATCTCTTACTTTTAGTGTCGTCAGCCAAA
AAGCTGCCTTTCACATTCTCCATACTCAACGATTTACGGAAAGTGCAAGG
CTTGTCGAGTCTTTATACTGGTAAGTGGTGTCTATTTTTCAACAAGTTGT
ATTACAATTATTTTTTACTAAACTTTAACCGTGCCCCGTGTTTAGTACTA
ATTAAAATATATGAGCCCCGGCTTTACATTATTACGTAGCCATAGATTTA
tgaagcccgaaaggctagatgacgtgctttaagctcttccaagcgaaaaa
aagtgaatatcgcaaaaatatttttgctattgttttcgaaaacctgcgaa
gcttctgattggtcaagagctgaaattctattgtaatgtcacgtgactta
ggtaggatttcctacctaacctcggcacacttttcagcaaaagcactcca
tctagcccttcgggcttttataaatctatggtagGCCCCCTCACTTTTTT
CACCATGTAGCTTATGATAATTGAAGAGTCGCCATATTTTAAACAAGTAC
TTCCACGTCAGGCCGATTTGACCATAAAGTAGTTCCTAATAATAATGGTC
ATTGGTTCTTCTTTAGGCATGAATCCAAGGCTATTGAAAGTAGCGCCAGC
CTGTGCCATCATGATCAGCACTTATGAGTATGGTAAAAGTTACTTTGCCA
AGAAGAACGATGACAAAGATGTTGGATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000304_pilon:351860..359238+ >XLOC_040258 ID=XLOC_040258|Name=XLOC_040258|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000304_pilon:351860..359238+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGCTTCAACAAATATTCAACCAAGCCAACAGATGATATCATCTTCATT
TGGAGCTGTCTTGGTTGCTCTATTTAatgGCTTCAACAAATATTCAACCA
AGCCAACAGATGATATCATCTTCATTTGGAGCTGTCTTGGTTGCTCTATT
TACTACACCTTTTGAAGTTATCAAGGTTCGAATGCAAGCACAACTAAAGC
CAACAGCTACACCTTTTGAAGTTATCAAGGTTCGAATGCAAGCACAACTA
AAGCCAACAGctGTGAAATGTTCAATCTTTGAGAATGTTGTAGATACACT
TTGTTACTGCACCACAAAACCTGCTTTTAATAGTCCTGTTCTCTGTACAA
TCCATAGTAATATTCAGACTGTACCGCCGTTTAGATCAAGTACTctGTGA
AATGTTCAATCTTTGAGAATGTTGTAGATACACTTTGTTACTGCACCACA
AAACCTGCTTTTAATAGTCCTGTTCTCTGTACAATCCATAGTAATATTCA
GACTGTACCGCCGTTTAGATCAAGTACTGATGCTTTTATCAAGATTGTCC
AAAGAGAAGGAGTATTCAACTTATGGAAAGGATTGTCCGCTACATTGATG
CTTTTATCAAGATTGTCCAAAGAGAAGGAGTATTCAACTTATGGAAAGGA
TTGTCCGCTACATTAGTTCAGATGTTACCTCAAACAGTGATTTACTATAC
AGCGTACGATCAAATGAAAGTTTGGTTAGGCTTTATGGAAGGAAAACAAA
ATGTTTCCTCGACGCTTGTGGCAGGTGTAACCTCTAGATAGTTCAGATGT
TACCTCAAACAGTGATTTACTATACAGCGTACGATCAAATGAAAGTTTGG
TTAGGCTTTATGGAAGGAAAACAAAATGTTTCCTCGACGCTTGTGGCAGG
TGTAACCTCTAGATCTTTTGCTGTGATCTGCGTTTCACCAATCGAGATGA
TTCGAACGAAGTTTCAATCCAAAAGTCGTCTTGGATATAAAGAGATGTGT
TCAATGATACTGTTCACAATCAAACAAGATGGTGTCTTCTCTATGTGGAG
AGGAGTTGGACCTACTCTACTCAGAGATGTACCATTTTCAGCTTTTGCTG
TGATCTGCGTTTCACCAATCGAGATGATTCGAACGAAGTTTCAATCCAAA
AGTCGTCTTGGATATAAAGAGATGTGTTCAATGATACTGTTCACAATCAA
ACAAGATGGTGTCTTCTCTATGTGGAGAGGAGTTGGACCTACTCTACTCA
GAGATGTACCATTTTCAGCATTATACTGGCTCAGTTATGAGAAGTTGAAA
TCACTCAATTCAGCACCAAACTTTCTTTATTATTTCATGGCTGGTGCCTT
GTCTGGAGTGCATTATACTGGCTCAGTTATGAGAAGTTGAAATCACTCAA
TTCAGCACCAAACTTTCTTTATTATTTCATGGCTGGTGCCTTGTCTGGAG
TGgTCGCAGCAGTTGCAACGCAACCGTTCGATGTGGTCAAAACATATCGT
CAAATTGAATTAGGTGAAATCAAAGATGgTCGCAGCAGTTGCAACGCAAC
CGTTCGATGTGGTCAAAACATATCGTCAAATTGAATTAGGTGAAATCAAA
GATGTGTCGTCAGCCAAAAAGCTGCCTTTCACATTCTCCATACTCAACGA
TTTACGGAAAGTGCAAGGCTTGTCGAGTCTTTATACTGTGTCGTCAGCCA
AAAAGCTGCCTTTCACATTCTCCATACTCAACGATTTACGGAAAGTGCAA
GGCTTGTCGAGTCTTTATACTGGCATGAATCCAAGGCTATTGAAAGTAGC
GCCAGCCTGTGCCATCATGATCAGCACTTATGAGTATGGTAAAAGTTACT
TTGCCAAGAAGAACGATGACAAAGATGTTGGATGAGCATGAATCCAAGGC
TATTGAAAGTAGCGCCAGCCTGTGCCATCATGATCAGCACTTATGAGTAT
GGTAAAAGTTACTTTGCCAAGAAGAACGATGACAAAGATGTTGGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000304_pilon | genome | sc0000304_pilon:351860..359238 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 889-999:7269 |
| Aaloc | 805-885:6689 |
| Aaloc | 727-801:4273 |
| Aaloc | 637-726:3746 |
| Aaloc | 460-633:2624 |
| Aaloc | 334-456:1638 |
| Aaloc | 265-330:1286 |
| Aaloc | 133-264:450 |
| Aaloc | 79-129:184 |
| Aaloc | 1-75:1 |
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