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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000037_pilon:790047..799165- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040232 ID=XLOC_040232|Name=XLOC_040232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9119bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000037_pilon:790047..799165- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTCTTTCACACCGTCTCCAAGTTGGAGATCAAGATTGTTTACATGG
CAACTGGTCCCCATGGTCACCCTGTCTTAAAGATGGTAGTCATGTCATGG
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GGAAAGCCTTGTAATACAACAACCGAAGAAAGATCTTGTAATGTTAATAC
TAGACTAGTTACCGAGCACTTTGTATGGTTTTCTGGAAACTGGTCTTCAT
GCTATACTGATAAATCTTCTAACTTTGTTGAAGAAAAATGTCAAATTTAT
AAGAAAAATCGTCCTGTGTTTTGCACTCGTTTAGGAGATGAAACATTGAC
TCCTTTGAGTAATTTAAAATGTGCATCTGTTGTAATGCCCAAAGAAGAAG
AGTTATGTCACGTGGTCTGTTCCCAAGTCTCTTGCTTTTACAGTGATTGG
TCAGAATGGAAGAATTGTTCCCATGGTTACATAAAAAGAAACAGAACACT
CCTTCACGGATCTTCACATGCTTGTATCCTTACAGAACAAAAGAGATCTT
GCAACTCTGAAAGAGCACTGTGGGAGAGAGTTACTGATGGTGTTTGTAAA
CTCTACGGTGGAGATATTTGCGGAGAAGGGGTAATAGATTCTAAAGTTAA
CTGTAAAATGGAAGGGAAAACTGTAGACGAATCAAATTGTGATCGTATGA
CCAAACCCTTGACTTCTTCAACATGTTCTGTACCGTGTAAACCGGGCCAT
ACTTTAAAATGTGTTCTAAGTACTTGGAGCAAATGGAGTATTTGTCAGAA
TGGTGTGAAAAATCGAACACGAATCTTGCTACACGGAAATCAAAACTGTT
TAAAAGTATCAAGGACTGAGAATAAAAAGTGCTACACAAAGGAGTATTTT
TATATCCCTCCTTCGTGGGGTGTTTGTGAAATTATGAATCAGTCAATAGG
CTGCGGTAAAGGAGAACAGACTCGTAACTTCCAATGTGTTGAAAACCTCA
TCGGAAACGTTGTAAATGAAAGCTATTGTTTAGAACGTTTAAATTACACT
CAGCCAATAGAGACAAGAAGTTGCTACGTTTGTAATGATTGTATTATGAC
CCCGTGGAGCCAATGGGAGCCAGACTGCTCTGCCATTTGTGCACCCTCCA
GAGCTCAAGGATCGACGAGTACCCAAAGACGGCGCTACATTCTTTCACAG
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TTGTCTCGATTATCATTGGGTTACTGAGAAATGGGAGCTTTGTACCCATG
ACAACGCCCCCATGATGGGTCCACAGACGGAAATAATGGTCATGCGCAAT
GGATATCAAATACGAGATGTTTATTGTTCGGACGGGCCAAACATTGTACC
GGACAGCTTGTGTCATGACGAGAAACCGATTGAGTCACGTGAATGCCACA
TTGACTGGTTGAACACTTGTCAATTAGAGCCTTGGTCTGAATGGAAAGAA
TGCGACAAACCTTGTGGAAATGGTAAGTGACTTTTAGCTCTCCCTACAAT
TTTCTATCTATATTTATTTATATCTCTTTTATGTTTGAATCATTTCGTAA
CTCGAATTCAAATGATTGGTAACCTCGTTTTCCGTAAGCTGTATATTATC
ATTATCATTAAATTCTTGGTCCATTCACTGTTAGGGGATTTATATATGGT
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CAATTTAATGTTTACAAGGAAATATATCAGCCAATTGTTCTAGAGATAGT
TGGAAACAAACACGTATGGATGGTAATCAATATTTCAAAATTACTACCAT
TGAAAACCAGAGGGAGGCGTTACAAGGTTACGAAAGGCCTATTATGTTTT
CCAAAAGAAAATTAAAAGCGATAAGGGCCAACATATTAGAATCATGAAAT
TAATCATAAACTAAATATAACATCTTCTCGATTCGTTTTAGGGTCGGCAA
TAAGTCAGTGAGTAGACCCTATTTAACCAGTAAAATGTATTTTTCATTTT
TCGGCATTCATTAGACGTTCAATGAATGTTATAAAAATCAGAAGACGTTG
TTTTGATCTGCTAATGATTTTTTTGCCAACTCTAATGAATATAATTTTCC
GTGAGGGTAGGCTCTGGAAGCTTTTTTTAACATTAGACAATATAATGGCT
AAAGGTTTAGGACACTCAGATTCTCCAGTAATTAGTAACGCCTGGCTGAA
GAAAAAACAGTATAGATTATAATATCTGATGCTTGTCTGATTTATGATGT
CACTTTTTCACTCTCTAATTGAGTATGATTTAACTATATGTTTGTTAGAT
GTAAAAGATAATCCTTAATTATGAAAAGAAAATGATTTAATTAAGTTTTA
AGTGCTTGCAAGGCATAGCAGAATTTACCAATTTTCGGGGTTTTTCTGTC
ATATTTCCTAAATAATGAAGAGCTTTGTCAATTCTTCAGTCCATTCGAGG
ATTCGCATTCCTTAAAGCATATTTAGGTTAGTTTGCCAAGAATTTAGCTA
TTCTATATCCAATTCCACGGTAATCATAATTATAATTATGGGATTAAATT
AATTTCGTCATTTCACCAACGAGATCATTAGCTTGGATAAACAGATTTAC
AGGCCAACTGGAACATAATTTTGATAAAATAACATTCGCGTTAATTTGCA
CCGTAAGGATCTATAATCGCTTTTTATGTGCATTAAAATCACATAATATG
TAATCGGCAGTTTTTGTAAATTTGTTAACATTAGAAAGAAATGACGCAAT
TATGTTTCAGGACAAATATTATGCGTCTCTCTGAAATTTGCATTTTTTCA
TGCCTTCAACACCGTTACCTTCCATTGTTACCCATCTACGTGGAGTAGTT
CGACTTTACAGAGATCGAATATTATTAGGTGTCACGGCTCGCTGCCGGTT
ATGCTTGCAAGCTTTAATTCAAGGTTTTGTTTTTAAATGAGAGGTGATAT
CGTTTGCTTACTCATCAATTTTAATTCACAAGCTTTTTCACATCGGATTG
ACACGGATGTGGAGCTAGATTGGTCAGAAAGAGGACAAGAAAAATATTTT
TTGTTTATATCAGCAGAATATAACAATAGGCAAACACTGTCCTGATATCA
AATTGTGTCTGATATGAAACGGGAACACCTTTGTAAAAATAAAACCTTTA
AGCCTGTATAAAATGACCTTGGTTCTTTAAGCATCTTTTCAATGTCCATG
GAACGTTATAAATATAGGGTTGTGGATAGACTAGTAAACTAGTCGGTTAT
TACTTATAACTTTATAATAAAACTGTCAATCAAATAATGTAAACACTAAT
CAAATATTCAGCGCGTGTGAGAGAAAAGGAACATAACCAAAATTCAGAAA
AGAGACGCAACTTCACCCCTTCGATTCTTTTTATTTGGAGCTTGATTTTT
TGTATATATATATATTGTATATGACTAGTTTACTAGTCTAGGTTGTGGAG
ATTAGATAGACGTTGTTTCAACGTTCTATGTTAACTAGAATGGTTCTCAA
ACGTTCTTGTGGCTTCTCTTGGAGACAAAATTATCTTATATAATTACAAT
CACTTCATGATGCCGGAAAAACAAGCTTGATCAAAAACCGGAACAAATAA
AGTTTGATGGGTTTGACAGTTATTTTGGAGAGAAAGAATATACCTAACTA
TAATTGGTTTATCTAAAAATATTAATTTCCTGGATACAAAATTTTTTTGA
ATAAGTTGTACATGGGTTTCAAGAAAGTCGAGCGTTAGGCGTTCTGTTTG
TCAGGGGAACTTTAAGTTACTATATTATCCGAAGTAGTCACCATATATAG
TCGGCCCATAGTCGCACGGTCAGGCGCGTGCCACTTTATTATTCAATTAT
CTCCCTAAACTTGATCCAATCCTTTTTTATACCTTTTTCTATTGTCTATA
GGTGCGAAAAAAAGACTGCGACGGTTTTAGGGTGGTAAAACGGACAAAGA
AATACGCCGCGCGTTAATTGGCGTCTACGGCTGTATTTACCTATACTATT
TATCTAAAAGTTTTTCAACGGCTAAACATTCATTCCGTCCGAATCACGTG
GTAGTCAGCAGGTACCTGTTTGCCGTGCTGGGTTCACTATACTTATTATA
GTCGCTAAGGGCTGATGGTTTTTGTTATAGTTGTCCACATCCACGGTAAT
CAAATTTGAAAAAGCTTGCGAATTAAAATTTATGAGTAAGCAAACGATAC
CACTCTTATTTAAGAACAAAACTTTTAAACTGTATATTATCAGTATGTAT
GTTATCCAGCGGTCATTACTTTTCATTTTAGGTTCGCAGAAAAGATCGCG
CCCTGTTTTAAACAAAGGTTGTAAAGTCGATACATCCATTAAGTTTAACG
AGACCCGACCTTGTAACACACAAAAATGTTTCGAATACGAAATCAATGAA
GGCGACTGGACCAGATGTCAGCTGATTGGTGCATCCGTGTCATGTGATAA
GAGTTTCAACGTCAATTTCGGCATCCAATACCGTAATGTGACATGCTTTA
CAACTGATGGAAAAATTGTTCCTTTAAAATATTGTGAAGAGTATTTTGAG
GAAGAATTTCCAAATAAGGTATGAAAATTGGGCGTGGCAAGGGCGCAGTT
GCTCCCTCTAGAAAACCTAAATTTTTAGGATGAAGATAAATGACTCTTTG
TTCTTATTTTGAGTAGTTTTGAAGTATTTTCGGATACTTTGATATTTTTA
AGGCTCCGTAATCTTTCCAAAAATATGAACAGCACAAAGTTACCAAATAC
AAAATCCTTATATTCTTCAAACTGATAAAAACTGTAAACTTTTGAAATTT
ACAGAAAAGATGCGTTCTTCCTTGCTCAAATGATTGTCAAATATCACAAT
GGTCGACTTTCTCAGAATGTTCTGCAAAGTGTGGTATTGGAATGTCCGCC
CGAACCAGGCGTATTTATCAGCACGCCTCAAGTGACCGCCCACCGTGTCC
TTCCAGTATTAACGGCCAGTTTGTGATGGAGCAAATCCCGTGCAAAATTC
GGAATTGTCATGACGACCAATGGGTGAAAGGACAGTGGGGTCCGTGTACT
GTTGGAAACAATGCCACTTGTGGAAAAGGTATAAACTTATAGTTATGTTT
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TCCTTAGATACCCCTATCTCGACCATAATTTCGGAAATGCCTATAAATGT
CATTATTTTGTCAGCTAAGTTACTAAAAAAGTAGGTTAGGTAGGAAAAAG
GGCGACAGAAAGCTTAATTTCATCAGAGAATTACCCTGAAGTAGCAGAAG
CCTTTTCCCCGGTTGACAGGGATGTAAATTCGAAAAAAATAGATTTAAGC
TTATTTTTATCTTATAGGTACAAAGAAACGTAGTGTTCATTGCATGCAAA
TGTCTATCGAACGCCCATCCAATAGTTGTCTGGCAGAAATCAAACCAAGA
GCACAAAAACAATGCAAAGTACCATGTGACACAGATTGTCTCGTCTCTGA
TTGGTCACCATGGACACCATGTGAGAACGAATCAACCAATAGAAAACGAG
AAGTCACGCGCCCTGGAAACAACTGTCCTGGATTGTATCAAGAACGACAA
TGCTCAAACGAAAAATACAAATGGAGAATTTCAAAATGGAGCTCTTGTTT
CTTGAATAAAGGTTGGGGAAGTTTTTTTATTTAGAAATTTTGAATTTGTT
TCGATTGTTGCCAGCAACGATGCACCATTGATATTGATGACGGGATTGTA
GACGCTGACAAATAATCCTTCATTGACTAATTATTGATAAAAAGCTATCG
GTTAGAATCGATAACTAATATTATCGATCTTGACCAACTGTTCTTACTTG
AAATATAATTGTTTACTGAAGTGACCATAAAACCTGTTCGGGTTAAGGAG
ACATTCAACTTATAGAGGTATTTAAATTAAAGAGACTCCTCTGTCGTGGA
AATATCCTCAACTTCCCTCGCTATCACCTTTATGCTAACCCGAGAATTGC
ATTTTTTCTTCAAGGTTTTTGTGGAAAAGGAATCAGACAGCGTTTCGTGG
AATGCATAAAAACGGCTTCCGACCTCGTCGTCCCCTCGTCCTATTGTTTA
CACATTGAAACAACACCCTCATCCTTTGAGTTTTGTGAAAAAGCGTGTGA
GGAGAAGTGTCGCTTGACATATTGGAGCACGTGGACGGAGTGCGATTCAA
AGTGTGGTCACGTGTCATATCAAACACGACAGCGAGAAGGGCGTGGTGAC
TGCAGCGGAGTGAAGTTAAAAGGTAATTGTTAAACCAATGCTAGGTACAA
GACCTCTTGTGAATCCAAGGATATACGTTAATTCAGGATATTTTTGATTT
TTTATCTACCGGAATCATATATCACTTTCCTCCAACTAACTTTCGAGGTT
AACTACTTTATTATGTGTGCTTCAATGGTTGAATTTGTGGGATGCACTGC
ATCAAATGTAAAAGAAATTTTCCGGTAGGAAGTTAAGAAACATATTCGAA
TAGCCAACCTAACTCAATGAAAAGAAATGACGCTTGGGAAAGCTTAGTCC
GCTCCAAAAACAACGTATGTGAATTTACTAGAAGATGTAGAAAATTTGAT
TCAGATATAAAAATCTAAAACGTTCACCGATGTTTGATTTTCCTTTTCAG
AAACCTTACAGTGTGAAGTACTACCATGTTACGCCTTAACAACGGGCGAG
TGGTCGTCATGCCAACCAGATGTTCCGTCGTCATGTGGAGTAGGAACACA
ACGGAGAAGTGCAAAATGTATGCGTGATGATGGGAATACAATGGATCTCC
GTCACTGTGTTGATTTCTTAACAGGTAGGGATTTCAAAAATAATTTTTGT
TGTCGGTCCAACATTTTCCCTGATGATTTTAACAAAAAAAATGAAGATAG
TCGCGATAGATTAAGTTGACGCGAAAATTTCAAAAATAATATAATTAATA
ATAATAGAAAATACGTAAATTTTCATTTTATGACGAAAATAGATGTTACT
GGAAAATTAAACCTCGGGAAATTTAATCCGTCTATAAATAAAAAAAAAAA
ACACCTAATATAACTGCGGAGTGATTGGAAAAATCATCTTTATTTTCAAA
CAATAGTCTAATCGAAATTAACCATTTTACTTGCAGGTCGTGAAAGATTA
GAACGCGAGTGTAATATACCTTGTTGGAATGACTGCATACTCTCCCCTTG
GTCATCATGGAGCTTCTGTTTCAAGACATGCTCTCCGCCTGAGAGTCAAA
GTAGTAGCATACAACTACGCACAAGACATGTTTTACAAAAACCAACCATT
GGAGGAGTGCAGTGCTCATCAAATATGGAAGAACAGAGAACATGCAATAA
AGGAACTTGCTTTAGATTTGATTGGACAATTAACAGTGCTGGGTAAGGCT
AGCAATACCTTTTTCTTTTACATTTTTTACGAGAATAATAAGGCTCAGAA
ACTAAGAACAACTTAAGAACATTATCCAGAACCTCTAAATACTGAATTTT
AAAAGTAAATTGATTAAAACATTCATAAAAGTTGGGTACTATTACAAAAA
TACCTTAATTGTACCTTTAAAACAAGAGCAAGATGAGAGCAACTTGGAGC
TAAAAATGCCAAAAAGACAGCCAATTATCAGCAAGATTTACTTTTTCTCC
CGGAAGAGTGTTTAGTACTACATTAGGCAATCAATCATGTTTTAGACGTT
TTGAAATATCTGGTGGCCACCTGCGCGGAACATTCAAACTATATAAATTC
TTTGCAACAATCGAATTTCAGAAAACTACGTGACATATTCATTACTATCA
ATATCAAATATATATTGCACATTTATCACCCATTATCAAAATCCTGACAA
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AAGCTGAATAGGCCGGCCATACAATACAATACAATTCTATTTACGAACAG
CATCTTCCCAAAGTCAACAAGATTCCTCTCGTGAACTTTCTGGACCACCG
TGGGTTAAGGATATTGAAGAATTCCAGAAACCAGCTGACAAAGTTTAGAG
CGTGTTTAGCACTTTTAACCATTATTTCGGTGCGAAAAATCTATTATAAA
ATTTTTTGAAGACCTTTCAGAAATATATTTTCACTGCGGGTGAAATCATT
GAGTTTCAAGCCCGAAGGGCTAGAGGTCAATCTCTAACCTTTCTCAGGCA
AGAAAAATTGAAGCCTTAAAATATGCGCCGTATTTTTGATGACGGATTGA
ATCTAGCAATTCCTTTGTTTTCGAGTGATATATTTTTCGAAATTAAGCGG
TAAATTTTAGTTTCAATCTGTCATTTGTGTAAAAACCAGGCGGGAGGCTC
AAGGCCGCGCAACTTTGGTAGGATTTGTTGGCTTCAAATCCTACCAAAGA
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GATTTCAACTATTTTTGACAAAATTTTGTTTTATCTTTTCAGTGAATACA
AATGCACTCGGTCTGATGGATTGACTGTGTCCACTGGATGCAAACCAAAA
GATGGCATGTATAAATGTGATTGCTCATTGGTTGGGAATGCAATTTGCGT
ACAAAAAGAATTCTGCATGTGCAAAAAAGGATACTCTGCTAACCTAAATG
GAGAGCAACGTTTGGTGTATTGCGAAAAAGCGACTGGTGTTCCGAGCAAG
AATAAAGGTAAAGATTTTTCTTCGCAGACCCTTTTTATACAATTTCTTCC
TAGACTTTAATCCACTTCTTTTGATCTTTATACTCTAAAACCGTGTTCTT
AAATAAAGTACAGCCACTTAAAGCTGTTTTAACTTTAGTTAGTGCTTTTC
GTCGAAAATTTTATAAAAAAGACCAACGAGTAAAATATTTTTTAGAAATA
GATGGAAAGATACTTTCAGGGTATATAATCAAACAATTAAAATTTATAAC
ATCCATTTCAATTTTCAGGCAAAGCAAGTGTCAGTTTAGCTGGTATCATT
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ATTCTTTTTCTACAGAAGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000037_pilon:790047..799165- >XLOC_040232 ID=XLOC_040232|Name=XLOC_040232|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000037_pilon:790047..799165- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTCTTTCACACCGTCTCCAAGTTGGAGATCAAGATTGTTTACATGG CAACTGGTCCCCATGGTCACCCTGTCTTAAAGATGGTAGTCATGTCATGG TAAGGAAACAAAGACGGTCTCGCCATCTACTTGCATATCCGTTAGGTAAA GGAAAGCCTTGTAATACAACAACCGAAGAAAGATCTTGTAATGTTAATAC TAGACTAGTTACCGAGCACTTTGTATGGTTTTCTGGAAACTGGTCTTCAT GCTATACTGATAAATCTTCTAACTTTGTTGAAGAAAAATGTCAAATTTAT AAGAAAAATCGTCCTGTGTTTTGCACTCGTTTAGGAGATGAAACATTGAC TCCTTTGAGTAATTTAAAATGTGCATCTGTTGTAATGCCCAAAGAAGAAG AGTTATGTCACGTGGTCTGTTCCCAAGTCTCTTGCTTTTACAGTGATTGG TCAGAATGGAAGAATTGTTCCCATGGTTACATAAAAAGAAACAGAACACT CCTTCACGGATCTTCACATGCTTGTATCCTTACAGAACAAAAGAGATCTT GCAACTCTGAAAGAGCACTGTGGGAGAGAGTTACTGATGGTGTTTGTAAA CTCTACGGTGGAGATATTTGCGGAGAAGGGGTAATAGATTCTAAAGTTAA 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ACAAATGCACTCGGTCTGATGGATTGACTGTGTCCACTGGATGCAAACCA AAAGATGGCATGTATAAATGTGATTGCTCATTGGTTGGGAATGCAATTTG CGTACAAAAAGAATTCTGCATGTGCAAAAAAGGATACTCTGCTAACCTAA ATGGAGAGCAACGTTTGGTGTATTGCGAAAAAGCGACTGGTGTTCCGAGC AAGAATAAAGGCAAAGCAAGTGTCAGTTTAGCTGGTATCATTTGCATCTC ATTGGCAGCTTGTGTCGGTTACTGTGTCCTGTTCATCGTGCTATTCTTTT TCTACAGAAGGGCAAAGCAAGTGTCAGTTTAGCTGGTATCATTTGCATCT CATTGGCAGCTTGTGTCGGTTACTGTGTCCTGTTCATCGTGCTATTCTTT TTCTACAGAAGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000037_pilon | genome | sc0000037_pilon:790047..799165 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 3283-3381:100 |
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| Aaloc | 1810-2082:4266 |
| Aaloc | 1525-1809:4787 |
| Aaloc | 1-1521:9120 |
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