XLOC_040054 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040054
Unique NameXLOC_040054
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000392_pilon:4054..20803-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040054 ID=XLOC_040054|Name=XLOC_040054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000392_pilon:4054..20803- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GATTTCAATAGCTTAAAGAGCAAAAATCATGATTTAGTGAAAGGTCTTTG TGGAAAAGTACTTCGTTCCTCCCTCTCAGTTGAATTTAATATATGTTAGA TCTGGTACAGACAAATGGAATCACATTATCAAATCCCCGTCCATTTGTGA TTACATTATCGTTTTAGCTCTATGACAAGAACCAGGAATGGAAAGTTATC ATGACATGGGGTGTCTTCATGGCCAATGAAAGTGGAATATTCGAAGGCTC AAATGAACAACTTTTGGATCTCGTAAGAAAATCAAAAACCAAGTTATTTG TGTGTGTTATTTAACACACCAAAACTAGATTAAATGAATTGTTAATAAAG CTAAAAAAAACGTGTCCAGAATCTTCCCTTATTTTTAATAAGATGCTTTG AATTAGTTGTCACGATTGAAATATGAAGATTTAATCTTTCTGATTCGTCA ATATCTAAGAAAGGAAAGAATACTTTGTGGCGACGACAAGCATCATTTTG TCGGGACATTATTTAAGTCTAGAGACAAGGACCAATTTTGCTTTAGTTTT ATTGATTCTAATTGTGTTATGGCTTTTAAATTGTTTTCTATACCTATTAG TTCCTTAAGTGACTCATGTTTGCCGTTGATCTTGGCAGCAGTGTACTTCT TTTCCGGAAATTCTTCTTTAATTTTGTAAAATTTCGGCTTTTCATCTACA TTGTCAAAATGATAATAATTCTCACTTCCTTTTTCCTGAAAAAGTGCGAG AACGGCTTACCTACCGTAACTGAAAAGTCAAGGTTAAAAAACGAGTAAGA TATCAAAAAAATAATTATCCTTGTCCTGGAACGGGAGCTAAATGCCGTTC ATTCTTGAGATTATTCAGCATAACTCATCGCCCATTCATGCATGCTCTTA CCCGTGTAAAACTTTTCTTATTGTCTTTTAGATGAGCCAAGAACTAAACA TCACTCCACGCGGTGAAGACTACATCAATCCTTACAAGGAAGAAACCAGA AGGGTAACTTTATAATCACCAATCATAAGAATCACGTTCTTATTTCCATT TTGTCTCTTTGGTAGTATTTCTTCCTAACCTTTTTGCTGCATCTGATTCG ATATCGGTACGACCTGTAGCATGTAATTTCAGCGTATAGTCAATTTCACG GTCAAAGAAATCAAGGGTATTCAGGACCGCCGTGCTCTGATAACTACTTT CTGTTGTTCTAACTGGTCCTTGCGTCTAACCAACGGTAAGCCGTAGTAAT ATGGGCGCAATTAGTTCTGGTTACCCATGATTCATTTCGACCATGAAATG GCCATTGATGGGTTTATTAAGAAATATGTTCCATTGATTTTTCCACGTTC GAAAATTACCCCTCGTGCTTCCTGTTTATTTATTAAAATTTTTTACTCCA ATTCAGAAAGAAGAAGCTCGAAAAGAGAAAGAGAAATTGAAGAAGGAGCG CCAAGCAGAACAAAAGAAGAAAGCAAAGCGAGACAAGCGGAAGAACAGAA AAGGTCCCAAGTTAGGTGGAGGAGGTGGTGGAAGACGAACTGATCTGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000392_pilon:4054..20803-

>XLOC_040054 ID=XLOC_040054|Name=XLOC_040054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000392_pilon:4054..20803- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGAGTAATAAAACCAAACAGAAATTTAGGCAACTAAAGATGTTAAGAAA
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CAGATGAAGTTGTTGTGAAACGTGAAGAAACTGCAACCAGTTTGAATATC
ACCAAGAAAGAATTATAGGAGTAATAAAACCAAACAGAAATTTAGGCAAC
TAAAGATGTTAAGAAAATATTTACTGTTATATTGGCTGCTAGCTTTTACA
GCTAATTATGTGAGTACAGATGAAGTTGTTGTGAAACGTGAAGAAACTGC
AACCAGTTTGAATATCACCAAGAAAGAATTATATAAATATGGTTTCCAAG
TGAAACGTGCAGAACAGATTGAAGGGGTGAAAAGAATAATGAAGATTGAC
AACTATGAAAAACAATTCAAAATGGTTAAATTGCTGGTTGAAAAATTATT
CAATATAAATATGGTTTCCAAGTGAAACGTGCAGAACAGATTGAAGGGGT
GAAAAGAATAATGAAGATTGACAACTATGAAAAACAATTCAAAATGGTTA
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TATATTCCTGGTGGTGAGTTTCCTGATGATCAAAGTCAACTAGACGCGTT
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TGTTTGGAGATCTCATCTTAAGGCTTCCGGATATCACACATAAGCTCTAT
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CAATGAAAGTGGAATATTCGAAGGCTCAAATGAACAACTTTTGGATCTCC
TCTATGACAAGAACCAGGAATGGAAAGTTATCATGACATGGGGTGTCTTC
ATGGCCAATGAAAGTGGAATATTCGAAGGCTCAAATGAACAACTTTTGGA
TCTCATGAGCCAAGAACTAAACATCACTCCACGCGGTGAAGACTACATCA
ATCCTTACAAGGAAGAAACCAGAAGGATGAGCCAAGAACTAAACATCACT
CCACGCGGTGAAGACTACATCAATCCTTACAAGGAAGAAACCAGAAGGAA
AGAAGAAGCTCGAAAAGAGAAAGAGAAATTGAAGAAGGAGCGCCAAGCAG
AACAAAAGAAGAAAGCAAAGCGAGACAAGCGGAAGAACAGAAAAGGTCCC
AAGTTAGGTGGAGGAGGTGGTGGAAGACGAACTGATCTGTAGAAAGAAGA
AGCTCGAAAAGAGAAAGAGAAATTGAAGAAGGAGCGCCAAGCAGAACAAA
AGAAGAAAGCAAAGCGAGACAAGCGGAAGAACAGAAAAGGTCCCAAGTTA
GGTGGAGGAGGTGGTGGAAGACGAACTGATCTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040054XLOC_040054-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000392_pilongenomesc0000392_pilon:4054..20803 -
Properties
Property NameValue
Aaloc625-768:145
Aaloc553-624:620
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Aaloc1-165:16751