XLOC_039823 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039823
Unique NameXLOC_039823
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:272113..286310+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039823 ID=XLOC_039823|Name=XLOC_039823|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14198bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:272113..286310+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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taagaaacattgaggccgcttggtaaaactagtttcttaaaaaaaaaaaa acgtgtattgatgGAAAGTGAAACTTCAACCGTCCTAGCCTGGCtgaaaa atcgtcatttttaatgctgacgtcaacactttaaaaattaatttcagcac tcaaaaccactttcaacggatgcgtctcgaagagtactatcgaatACAGG TATAGTTTGTTGAGGTACCATTGctagatcttgagatatttacatttcaa attttgctgattcagcatattTGGGcgattttgatggttttttgctgagt catcaaaatttgaaatgcaaatatctcaagatctagCCATGGTACCTAAA CAAACTATACCTGTattcgatagtactcttcgagacgcatccgttgaaag tggttttgagtgctgaaattaatttttaaagtgttgacgtcagcattaaa aatgacgatttttcaGCCATTATGGCTATTTTCTCAGGGTCTGATTggcc aaattttacaaatgaccccattttggacatCTACTCTTCCAGCTCTATCA AATGGAACCATCAAAATTAgctgtttaaaaacttttgaaattgacatttt taatgGGTCACTGCTTTTTGCTTAGAAAACCCCCTTTCACTCTTTggtcc ataactttttttccccatgacaaaaaaattgactctacccctcatttgaa agctgataaaattatctttccaacggtatatagaaaccttttataataat tttttctaggttgaccctATTATGGACGAATTTCTACTGGACTATTGGTG aatccagtcaaaacacagatttgatctgtagcgtcacgcttcacctttac tttacaaaaaaaaaggatATCATAAaataaaccaaggaaaatttcataat ttcaaaagaGTCATTTTACATTCTATATCATATATTATAACTAATAATGT 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acgtcgattttcactcgaaaactgcaggagattcgaagggcaaatttttt ttgtcaattctacaccctattaggagcataatatcaaaaatttgccctga tctaaggggtgccctacgaaaaccatttttaaggctttttctGAACCTTG GACGCTCGCCTACATCGCGATTgtaaaattgtataaatttacTTTAGCGA AAAGCCCCCAATGTTTATGATGAAATATTTCGAAGCcttatttgatcttt ttcagATGCTGTGCGGAGCCTTACCCTCTTCTGGTGTTCGACCTTGTCTT CCAACGACATTCAACATACTACTTCATCAACATCATCATACCAACAGCCC TCATAACCTGTCTCTCCTGCTTATCCTTCGTCTTGCCGTCGGGTGAACGT GTAACTGTCGGACTTAATGTGTTTTTTACCATTACCTTCATCAACTTGTA TAACATGCAAAAAGTACCTCAAACCTCTACAACATCCTTAATGAATCGAT TTCTTCACGCCTGCACTGTATTGACAGCCTTCTGCATGTGCTCAAATGCT TGTGTCTTAATCATGCTTTCCCTGAAGAATGTGCAAGTTCCCTTCTTCAT TAAATATCTCATTTTTGAAGTGATCGCTCCTAGCGTTGGATTACATACTA ACGAGATGTTCTCAAGCACAAAACGAAGGGAAGATAGTAGCTGGAGAATA AAAACTGACTTTCAAGTTGCGCCAAAGACTATTTACACTAGAATTGAAAA AGAACTACGGAAAGATTTCTGGAGGTGCTGCGCTCAGACGCTTGACCGAT GTTGCTTTATAGCTTTTGTAGTTCTCTTCCTTAGTTTGTCGTTAAATTTT GTCACAGTAGACCTCAGGGATAGTTCAAGGGGTAAGCTATCATCTTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:272113..286310+

>XLOC_039823 ID=XLOC_039823|Name=XLOC_039823|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2616bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:272113..286310+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGAGATATTTCATCCAACCATCAATAATTTTCCTGCTACTTGTCACCAG
GGatGAGATATTTCATCCAACCATCAATAATTTTCCTGCTACTTGTCACC
AGGGGGTTTTCAATGTCTACTTGGGAGCACGAAGCTCGTTTGATGACTCA
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GTTGGACGCACAATGGTTTTGAACTGGATGTTTTCGCTCAAAAAGACTCA
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CTCTTCTGGTGTTCGACCTTGTCTTCCAACGACATTCAACATACTACTTC
ATCAACATCATCATACCAACAGCCCTCATAACCTGTCTCTCCTGCTTATC
CTTCGTCTTGCCGTCGGGTGAACGTGTAACTGTCGGACTTAATGTGTTTT
TTACCATTACCTTCATCAACTTGTATAACATGCAAAAAGTACCTCAAACC
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GGTGTTCGACCTTGTCTTCCAACGACATTCAACATACTACTTCATCAACA
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TTGCCGTCGGGTGAACGTGTAACTGTCGGACTTAATGTGTTTTTTACCAT
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TGCATGTGCTCAAATGCTTGTGTCTTAATCATGCTTTCCCTGAAGAATGT
GCAAGTTCCCTTCTTCATTAAATATCTCATTTTTGAAGTGATCGCTCCTA
GCGTTGGATTACATACTAACGAGATGTTCTCAAGCACAAAACGAAGGGAA
GATAGTAGCTGGAGAATAAAAACTGACTTTCAAGTTGCGCCAAAGACTAT
TTACACTAGAATTGAAAAAGAACTACGGAAAGATTTCTGGAGGTGCTGCG
CTCAGACGCTTGACCGATGTTGCTTTATAGCTTTTGTAGTTCTCTTCCTT
AGTTTGTCGTTAAATTTTGTCACAGTAGACCTCAGGGATAGTTCAAGGGG
TAAGCTATCATCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039823XLOC_039823-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:272113..286310 +
Properties
Property NameValue
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