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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000070_pilon:1083598..1091663+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039777 ID=XLOC_039777|Name=XLOC_039777|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8066bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:1083598..1091663+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGAATATCTAGCTTCCATTTTTGGAACAGAGAAAGATAAGTAAGT
CtgaatcttttatttcttttcatgaATAGTTTGTTATTTATATGAACATT
CTTCATAGACTATGGCCAGTGAAAGGATAAAGCTTcaaagaaaaatgcaa
aatgtcTGTGACTAACTTTTTAACAACCCTTTCGACGCACCGGACAGTCC
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ttgaaaataatgttcaCACCTCGGACGCACCGAACGGTGTTGAGATTGTC
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GTCCGGGGAAAAAGTTATTTTTTTCAGACCCCAGACATTTGCCCCCGACT
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TTGACTGTTGTGTGTAAAATTCTTTGGGAGGTAAACCAACACGTTTTTGC
CTGCGAGGGGTTTGGGCAAGTGCTGGCAAGTGGGTTTTAAGCTTCTAACT
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aatcgaatctcaagggaacgtcaaaattttgggttatatttgattggttc
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gattgagatcgccTGGCTTTATTTTTGCAGCTTGctaacatccaagctct
caaacatcacaagccgaatgaaattactttcgattatGCAATGAACAATC
TGGGGGTCACTGAATCGAcgatcaaacgcaatcgaacatcaatcaaacgc
aatcgaatatcaatcgaatctgaaaattgcggtaatattcgattgagatt
cgattgcgttcgacaatcgaatttcaatcgttcgattgcgttcgatttgg
ttagACTGGTtagatcgtcgattccgttcgattgagatcgtctggtgatA
TTAAACATAGTTATGCATGACATCACTTATGATTTGGAGATATTTATACA
TTTTACCACCcgcaaattttttgtaaatcaggtttgttttgaaattttaa
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tgcaagttacccgacttcacggtatatacCGTCAACACTGCTctagttaa
tAAACGGCGTATTGAAAAATGTACAATTTCTCTTTCGCACTGAGTAGGCT
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GGAATGAAGAAGAACAGATTACTTTAGGCATACAAACTTTCGCGAGCAGA
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ttatgctcacgaaaaattcttgacaaaatagaaaatctgtaaaacttcaa
actttgaataaaatgtttttagcctgctaaaagactaataagtcaaagga
caaaatgtttcaagccaatccaagaagtatttgtccctctaagccatttt
ttcatgtgaaaattctcaattttacgtcttgattcgcaaaagtttatgct
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tacacactcgttatttgttaatatTTGCGATTAGGCGGCAGccattctct
aattctccaaatCGACGTGGTCccgtcattttgaatgaaaacaaaaaagt
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GGAAAAGTGTATCGAACAAGTTTGAACgaaaatctcaatcgaatgtaatt
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AAATGATGCGTTTGCttctatttttcataaaaaggcaTCACTTACttttt
tttgtcaggaaacattttctagaaaccttttttcttcaaaccctttttgg
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TATTACGAGAGCACAGTAAAGCCTAAAGTAAAACTAGTCTTCAACGAGTA
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GAAGCCAAAGAAAATTCCTACACcatatttcagttttttctgatatttct
aCATTGTTTGGTACATTGTAAACTGGTAAACTAAATAgtacaaaattcca
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caaagcacttatTATACATACAAAaaagagacctgttgtatatttttgga
aagctctcaaaaaattaagattggAGATATCAGGCCATTTTTTATGCCCT
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CCTTCTATTTCAAGATTGGTGCTTGTCGTCATGGAGACAAATGTTCAAGG
CTCCACAATAAACCTACTTTTAGTCAGGTAAAGTTTTCATTAGGAAATAC
TAGCTGCTAtaatgaaaatcagaaaatcacttTCCATAAACTCTCTTACT
TGGAATAAACCTACCTTATTTGAACCTACCatatgtaaaaataattttat
gaaCTTTTATCTGTAAGTTGCAGACTGCAAACCTtacacttaaaattttg
aacattttataGAATTTCAGTACAACTCGCTACCttAattcaaaaggggc
ctaagtccatttttatgaaatttgagatctttagtttttctcaatctctg
aCTCACTTGCTCTCTTTTGATGTACAtaacaagtagtttttaaagttaaa
aaggttcaaaacttcatactgaagctctgataaaagtgatgtttaattca
aaagaggcctaagtccatcatctttttacaattaagggcctaagtccatc
aactttttacaataaaaaggcctaagtccaccaaaataagtttgttaagt
tttgaagaggcctaagtccaattgaattgcaaatgggcctaagtccatgt
atcctaaaaagtttaattgagtttttctttattttactgagattgtcttt
tctctttatcttgaatctaggtgtaagtggttttattttggaGTGTCATA
TGTGCAGGTTTTGAACTCTAAAAGGCAGAAATTTAACCCTcacacgtttt
tcaaaattcatgtttaattcaaaaaaggcctaagtccactctGCAAGATT
TACTAAGTTGCACCTGTTACATACAAAAATACATTCCTTTCAAACGAATG
CCTTTTCATTGGAAAAACAACTTATAgctatggctttcagaaaacattta
cttcaaagctttaccatcaaaaatggtttcagaatcaaggaaaaacttta
attgcaattttctcaaaatgacccaaatggacttaggccccttttgaatt
aaggctcacaggacttaggccccttttgaattaaggtagcgaactatatt
cactcaggaaatttgggtggcagagcaggtGTATGTATGTCCTTATAGGG
ACTCACCAGCACTGGGTACTGCACCTTGCCTGGTAAGATGGATTTAGCCC
GCATCTCTGAACCACaaaatgtttcttttctctttcaCAGACAATACTAT
TGCAAAACATGTATCAAAATCCTCAAAACCAAGCCACAAATCCTGATGGA
ATGCCTGTAACTACTGCAGCTGCTGCTGGTAAGctaattttttaattcat
tgGATAATCTGCGTACTCTTGGGTAAGTGCCTAATAAATTGAGTTGTCAA
ACGAGTTTTTAATGGGAAAATGTTTCTTAAGTCATTACCAGTCCCCTAAT
GACCTGATGGAGCCGCTAAGGTTTGATAGgtgtatacaccttttcgacca
tagctaccaattgccgcgcgggcattttttgtctgcTTCATCCTGCTAAA
ACTTTCACAGTCCTTTTTTCCCaccaatagacaatagaaaaatgagtcga
aaaaggattgggacggttttagtgggttAAAGCGGACAAAAGCATGCCCG
CGCGACtactacggtcgaaaagttgtatttaTCTTACCATATTATAGCTA
GATTTGGCTGTTTTTGATTGGTTggacctttttataaatttggtcatttt
ttcagaaaaatgagaaagggtgaggaattaaccgttttcgaaaatccagg
gGAGCGCAGAGCAAAAATTTGCCATACAAATCATCCCTTAATTTTCACCA
TGTCTTTATTTCAGCCCAGTTCCAATTCAAATGTGGCCTTTTATAATACT
TCTTTCTTGTTTCCATTTCAGCGCACATCATGAGTGATGTAGAAGCACAG
GAACATTATGATAGCTTCTTTGAAGATGTTTTCCTTGAACTCGAAGAAAA
GGTTTAGTCTattctcaaatcttttttagcTACCCATTCCTTCTTTACCA
ACAATTTCCTTCTCATTTCTGAGTTTTGTGTTATTTGGTGAACAGATGAT
GAATTTTTATAGACCCAGAAGCTACCTGAtgaatgaataatgaataaatg
aacATGTCAAGGTTACAAAATTCCATTACTGAAATGAATTAAcagttttt
aaatttggttttcTTTAGCACTTCTTTATTTAGATATACGTGCTTCATCC
ATGTCCCTCATAATGTTTCTATAGTACGGCGAGATTGAAGAGATGAATGT
TTGCGACAACTTGGGTGATCACTTGGTTGGTAATGTTTATGTCAAGTTCC
GCTATGAGGAGGATGCAGAGAAAGCTTCCAATCAAGTAAACAATAGATGG
TACAATGGTAAGATCTAATCATGTTCTTCGAAGTCtttttttAAGTTACC
TTCTCCTCCAATGATCATTGTTTCTTCTTTGACCGAGACTATCACCTTGG
ACAATTTAAAAAAGCATAGGTGGCAATCGATGATTGATGTTAGAGGGGAT
CCTTAATTTTTTGATCAGGAATGAAGCGTGCTTTCACTTCATTGTAGCTC
CCTTTAATTCACGAAGTATTGTTTTAAACTGTAGTGTGGCTACAGAGGAT
TTAAAAAGAATACTCTGGACTACCCTTTTTGATGGAAGACTTGATTAcat
caagaaattttcaaatctctTTTGTATTGAAGATATACACAACTTACCTG
GGAATTATAATTGAATCTCTATTTCATATTGTTGTTAGGTACATTATTTc
tcagaaaagaaaatttactctTCTACACTTTATCTTTAGGTCAGCCAATT
TATGCAGAATTATCCCCAGTCACTGATTTCAGGTATCCCTATTATCGCCT
TATTTGTATTACAAAATTTGGGAAACACAACTATTGTCAGATACTATACT
TTTActgtttttaaagatttctttgCTCAGAATTAAGGTTTTTATCATAT
ATTTATTTGTTACTGGTATTGCCAGACCCTAGTATACTTGAAATTGATTT
GACATAACATTTCTTTTTACCAGGGAATCTTGCTGCCGTCAATATGAGAT
GGGGTAAgagactttttcaattttctatgcTGACTTTCTTCCACCGTTTG
ATCAGGTTCGAACTATATTCAACTTAAAATAGATTAGCCGATATTTTTAA
TCTAGTCCATTTCAGCCGACAAAATACTAACCAGTTGActttatgaaata
aaaaaataaaagtgaatgTATTTCTTCTTGTTTCTAATAATTGACACTAT
AATACAGCTGAATATGATTTAAAgtgatttcttttcttttttcagtgaAT
GCACTCGTGGtggattttgtaattttatgcACTTGAAACCAATTTCAAGA
GAACTCAGGTGAGAATTACGTTATTTCTGCTGGAAACAAGCCTAAAATTG
ATATAGATGGGCAGCTGGTCATTCCATAGATCATAATCAATAAAATGGTA
TACATTAACCATAAATGAGAAAAGGGTTTTCTAAGTTGGGAGTGTCAGTT
TTTTCTAGGTAAGAACCGGTGAAAACTCCCATTCGATTCCTATAATGAGA
CAAGAATACTCAAAAGCTTCTCTATCTTGAAATTTTATAGGCGAAGATTG
TACGGCCGGCGACGTGGTGGTGCCGGTGTAGGTGGTGGTGCTTCTTCGGG
ACCCCTCGTTCGAAGAGGAAGGTAAAACGATGACTtgtgttttctttgaa
attctcaaTTATTGGTTTTTCTCTCAAAAGTGAGAGgtatttcgtgttaa
taaattGTCTGACTTGATCTCTAGCAGTGCTATCTTTGAATTTTGAGTGT
AGTGTTTCAGTGTTGTACCTCTGGATTTCCGCGTCAAAAGTacatgaaat
gaattttattagaAATTAAATCTAACTTTTCAGCCTTAAAACTGTTATTT
CTAGGATCTGAATGCAAAAAGTTATTGATAGAAAGAAGTAACTTTATCAC
CCTATTTTCATTTCAGATCACGCTCATTTTCACCCTCACCTCCACGAAGA
AAATCAAGATCTCGTTCACCTAAAAGGAGATCACCAAGGCGCAGAAGATC
CAGAAGTCCACGTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000070_pilon:1083598..1091663+ >XLOC_039777 ID=XLOC_039777|Name=XLOC_039777|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1500bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000070_pilon:1083598..1091663+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGAATATCTAGCTTCCATTTTTGGAACAGAGAAAGATAAATGGCT
GAATATCTAGCTTCCATTTTTGGAACAGAGAAAGATAAGGTCAATTGCTC
CTTCTATTTCAAGATTGGTGCTTGTCGTCATGGAGACAAATGTTCAAGGC
TCCACAATAAACCTACTTTTAGTCAGGGTCAATTGCTCCTTCTATTTCAA
GATTGGTGCTTGTCGTCATGGAGACAAATGTTCAAGGCTCCACAATAAAC
CTACTTTTAGTCAGACAATACTATTGCAAAACATGTATCAAAATCCTCAA
AACCAAGCCACAAATCCTGATGGAATGCCTGTAACTACTGCAGCTGCTGC
TGACAATACTATTGCAAAACATGTATCAAAATCCTCAAAACCAAGCCACA
AATCCTGATGGAATGCCTGTAACTACTGCAGCTGCTGCTGCGCACATCAT
GAGTGATGTAGAAGCACAGGAACATTATGATAGCTTCTTTGAAGATGTTT
TCCTTGAACTCGAAGAAAAGCGCACATCATGAGTGATGTAGAAGCACAGG
AACATTATGATAGCTTCTTTGAAGATGTTTTCCTTGAACTCGAAGAAAAG
TACGGCGAGATTGAAGAGATGAATGTTTGCGACAACTTGGGTGATCACTT
GGTTGGTAATGTTTATGTCAAGTTCCGCTATGAGGAGGATGCAGAGAAAG
CTTCCAATCAAGTAAACAATAGATGGTACAATGTACGGCGAGATTGAAGA
GATGAATGTTTGCGACAACTTGGGTGATCACTTGGTTGGTAATGTTTATG
TCAAGTTCCGCTATGAGGAGGATGCAGAGAAAGCTTCCAATCAAGTAAAC
AATAGATGGTACAATGGTCAGCCAATTTATGCAGAATTATCCCCAGTCAC
TGATTTCAGGTCAGCCAATTTATGCAGAATTATCCCCAGTCACTGATTTC
AGGGAATCTTGCTGCCGTCAATATGAGATGGGGGAATCTTGCTGCCGTCA
ATATGAGATGGGtgaATGCACTCGTGGtggattttgtaattttatgcACT
TGAAACCAATTTCAAGAGAACTCAGtgaATGCACTCGTGGtggattttgt
aattttatgcACTTGAAACCAATTTCAAGAGAACTCAGGCGAAGATTGTA
CGGCCGGCGACGTGGTGGTGCCGGTGTAGGTGGTGGTGCTTCTTCGGGAC
CCCTCGTTCGAAGAGGAAGGCGAAGATTGTACGGCCGGCGACGTGGTGGT
GCCGGTGTAGGTGGTGGTGCTTCTTCGGGACCCCTCGTTCGAAGAGGAAG
ATCACGCTCATTTTCACCCTCACCTCCACGAAGAAAATCAAGATCTCGTT
CACCTAAAAGGAGATCACCAAGGCGCAGAAGATCCAGAAGTCCACGTTAG
ATCACGCTCATTTTCACCCTCACCTCCACGAAGAAAATCAAGATCTCGTT
CACCTAAAAGGAGATCACCAAGGCGCAGAAGATCCAGAAGTCCACGTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000070_pilon | genome | sc0000070_pilon:1083598..1091663 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 652-750:7968 |
| Aaloc | 571-648:7592 |
| Aaloc | 508-567:7297 |
| Aaloc | 478-504:7025 |
| Aaloc | 436-474:6792 |
| Aaloc | 301-432:6225 |
| Aaloc | 223-300:5874 |
| Aaloc | 133-219:5191 |
| Aaloc | 46-132:3991 |
| Aaloc | 1-42:1 |
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