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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1829365..1830579- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039691 ID=XLOC_039691|Name=XLOC_039691|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1215bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1829365..1830579- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTTCAGTTCTTGAAGATTGGATTTGAGAAAATGATTCGCACATC
AAAGACACGAAAACGTTTCTTTCTATTCGTCATAACAACGATATATATAC
TCCTCGTCAACCATCTTTATTTAAATGGAATTTATGTTGTCAAAGAGATA
TCGCCAAATTCTCCTTGGTTGACAATATCTACAGATTTAAAAAGCTTTGT
TAAAAACGTTGAAAGATTATTGTTAACCAAAAAATTTGTGAACCAGCATA
AAAAACATTACACTACACCAAAAGTAAAACCCAACATTAAATTACTTAAT
TCGGAAGATATTCATGTTTTCAAAGGTGAAATTCTAATTTTGGTAACATC
ACATATTAAACATAGCTCGCGAAGAGATTCGATTCGTACTAGTTGGGCTA
ATCATGCAAGATTTATTGATCATAGTCAAAAGTTCAACAACGCAAGATAT
AAAACATACTTTGTGACTGGCTACCTTGAAAGTTTCATACGTAAAGCAAA
AATTGAATCTTCTACTTTCCGTGATGTTTTGATAACGAATCGTACGGAGC
GCTATTGGGACCTTTCACGGAGAATAATGTTTGGTTTTTTATGGGCTATG
GAATATTGTACTTTTGACTATCTCTTGAAAACTGACGATGATGTTTTTGT
TAACATACCAAACCTATTTACATTAATGTATACAGACCCTTTTATATTGA
AACATAAAGATCGAATTTTTGCTGGAAAGATCGTAAAGAGTAAAAGTAGA
ACAATCCGTGATCCATTTTCAAAATGGTATGTATCCCAAGGAGAATGGGA
ACCAGACTATTATCCACCTTTCGCAACTGGTATGGGAATAATCTTATCTA
GATTTGTCCTTGAAAAAATGCGTTCACATTTTGACTGGATAAACCCATTC
CGATTAGATGACGTATATGTCGGAATATTAATAAATCGGGCTAACATTAG
CGGAATCGGGATAAGAAACGTCCCACAATTACGTGCGACATTGAATGAGG
AGTTTTCTGGAGCACATCAACATTATGAATGTCGTTATGTTGATAAACCA
ATTATTTATCATAAAGTTGTGCACCATTGGTGTATGGAAAAATTAACAGC
AAAAAGTATAATTAATTCTGGTACAGAAAATCCAGGCAGATATTTGAATA
TTTTAATTGTTCCTTTTATTTTCCTTAATTTTGTTGTTATTTTTTTGGTA
AAATTTTTGAAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1829365..1830579- >XLOC_039691 ID=XLOC_039691|Name=XLOC_039691|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1829365..1830579- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCATTTCAGTTCTTGAAGATTGGATTTGAGAAAATGATTCGCACATC
AAAGACACGAAAACGTTTCTTTCTATTCGTCATAACAACGATATATATAC
TCCTCGTCAACCATCTTTATTTAAATGGAATTTATGTTGTCAAAGAGATA
TCGCCAAATTCTCCTTGGTTGACAATATCTACAGATTTAAAAAGCTTTGT
TAAAAACGTTGAAAGATTATTGTTAACCAAAAAATTTGTGAACCAGCATA
AAAAACATTACACTACACCAAAAGTAAAACCCAACATTAAATTACTTAAT
TCGGAAGATATTCATGTTTTCAAAGGTGAAATTCTAATTTTGGTAACATC
ACATATTAAACATAGCTCGCGAAGAGATTCGATTCGTACTAGTTGGGCTA
ATCATGCAAGATTTATTGATCATAGTCAAAAGTTCAACAACGCAAGATAT
AAAACATACTTTGTGACTGGCTACCTTGAAAGTTTCATACGTAAAGCAAA
AATTGAATCTTCTACTTTCCGTGATGTTTTGATAACGAATCGTACGGAGC
GCTATTGGGACCTTTCACGGAGAATAATGTTTGGTTTTTTATGGGCTATG
GAATATTGTACTTTTGACTATCTCTTGAAAACTGACGATGATGTTTTTGT
TAACATACCAAACCTATTTACATTAATGTATACAGACCCTTTTATATTGA
AACATAAAGATCGAATTTTTGCTGGAAAGATCGTAAAGAGTAAAAGTAGA
ACAATCCGTGATCCATTTTCAAAATGGTATGTATCCCAAGGAGAATGGGA
ACCAGACTATTATCCACCTTTCGCAACTGGTATGGGAATAATCTTATCTA
GATTTGTCCTTGAAAAAATGCGTTCACATTTTGACTGGATAAACCCATTC
CGATTAGATGACGTATATGTCGGAATATTAATAAATCGGGCTAACATTAG
CGGAATCGGGATAAGAAACGTCCCACAATTACGTGCGACATTGAATGAGG
AGTTTTCTGGAGCACATCAACATTATGAATGTCGTTATGTTGATAAACCA
ATTATTTATCATAAAGTTGTGCACCATTGGTGTATGGAAAAATTAACAGC
AAAAAGTATAATTAATTCTGGTACAGAAAATCCAGGCAGATATTTGAATA
TTTTAATTGTTCCTTTTATTTTCCTTAATTTTGTTGTTATTTTTTTGGTA
AAATTTTTGAAATGAATGTCATTTCAGTTCTTGAAGATTGGATTTGAGAA
AATGATTCGCACATCAAAGACACGAAAACGTTTCTTTCTATTCGTCATAA
CAACGATATATATACTCCTCGTCAACCATCTTTATTTAAATGGAATTTAT
GTTGTCAAAGAGATATCGCCAAATTCTCCTTGGTTGACAATATCTACAGA
TTTAAAAAGCTTTGTTAAAAACGTTGAAAGATTATTGTTAACCAAAAAAT
TTGTGAACCAGCATAAAAAACATTACACTACACCAAAAGTAAAACCCAAC
ATTAAATTACTTAATTCGGAAGATATTCATGTTTTCAAAGGTGAAATTCT
AATTTTGGTAACATCACATATTAAACATAGCTCGCGAAGAGATTCGATTC
GTACTAGTTGGGCTAATCATGCAAGATTTATTGATCATAGTCAAAAGTTC
AACAACGCAAGATATAAAACATACTTTGTGACTGGCTACCTTGAAAGTTT
CATACGTAAAGCAAAAATTGAATCTTCTACTTTCCGTGATGTTTTGATAA
CGAATCGTACGGAGCGCTATTGGGACCTTTCACGGAGAATAATGTTTGGT
TTTTTATGGGCTATGGAATATTGTACTTTTGACTATCTCTTGAAAACTGA
CGATGATGTTTTTGTTAACATACCAAACCTATTTACATTAATGTATACAG
ACCCTTTTATATTGAAACATAAAGATCGAATTTTTGCTGGAAAGATCGTA
AAGAGTAAAAGTAGAACAATCCGTGATCCATTTTCAAAATGGTATGTATC
CCAAGGAGAATGGGAACCAGACTATTATCCACCTTTCGCAACTGGTATGG
GAATAATCTTATCTAGATTTGTCCTTGAAAAAATGCGTTCACATTTTGAC
TGGATAAACCCATTCCGATTAGATGACGTATATGTCGGAATATTAATAAA
TCGGGCTAACATTAGCGGAATCGGGATAAGAAACGTCCCACAATTACGTG
CGACATTGAATGAGGAGTTTTCTGGAGCACATCAACATTATGAATGTCGT
TATGTTGATAAACCAATTATTTATCATAAAGTTGTGCACCATTGGTGTAT
GGAAAAATTAACAGCAAAAAGTATAATTAATTCTGGTACAGAAAATCCAG
GCAGATATTTGAATATTTTAATTGTTCCTTTTATTTTCCTTAATTTTGTT
GTTATTTTTTTGGTAAAATTTTTGAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000023_pilon | genome | sc0000023_pilon:1829365..1830579 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1215:1216 |
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